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文檔簡介
緒論
分子生物學的發(fā)展簡史
Schleiden和Schwann提出“細胞學說”
孟德爾提出了“遺傳因子”的概念、分離定律、獨立分配規(guī)律
Mieschei?首次從萊茵河雄魚精子中分離出DNA
Morgan基因存在于染色體匕、連鎖遺傳規(guī)律
Avery證明基因就是DNA分子,提出DNA是遺傳信息的載體
McClintock首次提出轉座子或跳躍基因概念
Watson和Crick提出DNA雙螺旋模型
Crick提出了“中心法則”
Meselson與Stah用N重同位素證明了DNA復制是一種半保留復制
Jacob和Monod提出了著名的乳糖操縱子模型
Arber首次發(fā)現DNA限制性內切酶的存在
Temin和Baltimore發(fā)現在病毒中存在以RNA為模板,逆轉錄成DNA的逆轉錄前
哪幾種經典實驗證明了DNA是遺傳物質?(Avery等進行的肺炎雙球菌轉化實驗、Hershey
利用放射性同位素35S和32P分別標記T2噬菌體的蛋白質外殼和DNA)
第二章染色體與DNA
第一節(jié)染色體
一、真核細胞染色體的組成
(―)DNA:組蛋白:非組蛋白:RNA=1:1:(1-1.5):0.05
(-)蛋白質(組蛋白、非組蛋白)
(1)組蛋臼:H1.H2A.H2B.H3.H4
功能:①核小體組蛋白(H2A.H2B.H3.H4)作用是將DNA分子盤繞成核小體
②不參加核小體組建的組蛋白H1,在構成核小體時起連接作用
(2)非組蛋白:包括以DNA為底物的酶、作用于組蛋白的酷、RNA聚合酶等。常見
的有(HMG蛋白、DNA結合蛋白)
二、染色質
染色體:分裂期由染色質聚縮形成。
染色質:線性復合結構,間期遺傳物質存在形式。
/常染色質(著色淺)
具間期染色質形態(tài)特征和著色特征染色質\
異染色質(著色深)
結構性異染色質兼性異染色質
(在整個細胞周期內都處于凝集狀態(tài))(特定時期處于凝集狀態(tài))
三、核小體
山H2A.H2B.H3.H4各2分子組成的八聚體和繞在八聚體外的DNA.一分
「H1組成。八聚體在中央,DNA分廣盤繞在外,由此形成核心顆粒。,H1結合在核心
顆粒外側DNA雙鏈的進出口端,如搭扣將繞在八聚體外DNA鏈固定,核心顆粒之間
的連接部分為連接DNA.
核小體的定位對轉錄有促進作用
中期染色體由著絲粒、染色體臂、次縊痕、隨體、端粒(由重復的寡核甘酸序列構成)
5部分組成。
染色單.體
省?”粒丁
核型:指染色體組在有絲分裂中期的表型,是染色體數目、大小、形態(tài)特征的總和。
第二節(jié)DNA
Chargaff定則:(1)同一生物的不同組織的DNA堿基組成相同
(2)一種生物DNA堿基組成不隨生物體的年齡、營養(yǎng)狀態(tài)或者環(huán)境變
化而改變
(3)[A]=[T]、總的噂口令摩爾含量與總的喀咤摩爾含量相同(|A+
GHC+TJ)
(4)不同生物來源的DNA堿基組成不同,表現在A+T/G+C比值的不同
(-)DAN的結構
一級結構:四種脫氧核糖核甘酸dAMP、dGMP、dCMP、dTMP,通過3f-磷酸二酯鍵
連接起來的直線形或環(huán)形多聚體。
某DNA分子的一條多核苜酸鏈由100個不同的堿基組成,其可能的排列方
式有4人100種
圖2-1DNA多核甘酸蜷的一段
A.DNA多核苛酸片段B.線條式縮寫C.文字式
右手螺旋:A-DNA、B-DNA(最常見)
二級結構:雙螺旋結構左手螺旋:Z-DNA
B-DNA:(Watson-Crick)92%濕度下的鈉鹽結構
堿基平面與雙螺旋的長軸相垂直,堿基間符合堿基互
補配對原則,相鄰堿基對平面間的距離為0.34nm,
雙旋旋的螺距為3.4nm,每圈螺旋有10個堿基對,
螺旋直徑為2.0nm。A=T(兩個氫鍵),G=C(三個
氫鍵),具大溝和小溝。
A-DNA:相對濕度75%以下的結構,每圈螺旋有11個堿基對,螺體較寬而短,堿基對與
中心軸的傾角也不同,呈19°大溝變窄、變深,小溝變寬、變淺°若DNA
雙鏈中一條鏈被相應RNA替換,則變構為A-DNA。(基因表達)
Z-DNA:左手螺旋,螺距延長(4.5nm左右),直徑變窄(1.8nm),每個螺旋含12個
堿基對。螺旋骨架呈Z字形。(轉錄調控)
正超螺旋(左旋、雙螺旋圈數增加而擰緊)
三級結構:雙螺旋進一步扭曲形成超螺旋負超螺旋(右旋、減少而擰松,絕大多數)
White方程:L-T+W
L(Linkingnumber):連環(huán)數或稱拓撲環(huán)繞數,指cccDNA中一條鏈繞另一條鏈的總次
數。其特點是:(1)L是整數;(2)在cccDNA中任何拓撲學狀態(tài)中其值保持不變;
(3)右手螺旋對L取正值。
T(Twistingnumber):纏繞數,DNA一條鏈繞另一條鏈的扭轉數即雙螺旋的圈數。其
特點:(1)可以是非整數(2)是變量;
W(Writhingnuinbur):扭曲數,即超螺旋數,指雙螺旋分子在空間上相對丁雙螺旋軸
的扭曲。特點是:(1)可以是非整數(2)是變量;
I型:轉變超螺旋為松弛狀態(tài)
拓撲異構酶(改變DNA拓撲異構體的L值)II型:引入負超螺旋&同I型
(二)DNA主要序列類型
高度重復序列(衛(wèi)星DNA.分散高度重復序列)、中度重復序列、低度重復序列、反向
重復序列。
石婿油
(三)DNA的理化性質
詼白質
溶解度:微溶于水,鈉鹽在水中的溶解度較大??扇?/p>
開環(huán)形及
于2-甲氧乙醇,但不溶于乙醇等一般有機溶劑,常用
線形DNA
乙醇從溶液中沉淀核酸。團環(huán)形
放較DNA
紫外吸收:DNA鈉鹽的紫外吸收在260nm附近有最
大吸收值
RNA
核酸的沉降特性(如右圖)
(四)DNA的變性與復性
變性:DNA分子由穩(wěn)定的雙螺旋結構松解為無規(guī)則線性結構的現象,不涉及到其一級結構
的改變。
伴隨變性,會發(fā)牛增色效應(紫外吸收明品增加)溶液粘度下降等現象.
熔解——DNA加熱變性的過程。
溶解溫度(Tm):核酸加熱變性過程中,紫外光吸收值達到最大值的50%時的溫
度稱為核酸的解鏈溫度。(G+T含量越高Tm越大:DNA分子序列越均一,變形過
程溫度范圍越窄:溶液的離子強度較低時,Tm值較低。)
復性:熱變性DNA一般經緩慢冷卻后即可復性,此過程稱之為退火
影響DNA復性的因素:①溫度和時間②DNA濃度t,更性t③DNA順序的更雜
性④DNA片段的大小⑤鹽的濃度
K1/k值越大表明反應越慢
核酸外切陶
酶解:核酸核酸防:1型和III型限制性內切施(需要消耗ATP)、II型(不需要ATP)
DNA的復制
Meselson與Stah用N重同位素證明了DNA復制是一種半保留復制
(一)基本概念:
半保留復制:每個子代分子的一條鏈來自親本DNA,另一條則來是新合成的,這種復制
方式稱半保留復制。
半不連續(xù)復制:DNA復制時,一條鏈連續(xù)復制,另一條不連續(xù)復制,這種復制方式稱
先導鏈:DNA復制時,連續(xù)合成的鏈后隨鏈:不連續(xù)合成的鏈
岡崎片段:后隨鏈復制中出現的不連續(xù)的DNA片段
復制子:從起始點開始至終止點而獨立進行發(fā)制的單位(細菌只有一個,真核多個)
一個復制子只含一個復制起始點,啟動單向復制or雙向取決于起始點形成一
個復制叉。r兩個。
(三)復制終止點:復制子中控制復制終點的位點。型一一大腸桿菌質粒DNA
(四)DNA復制的幾種方式滾環(huán)型一一噬菌體
(五)線性DNA(單向、雙向),環(huán)狀DNAD環(huán)(D-loop)型——動物線粒體
(六)復制的過程(起始、延伸、終止)
不能從頭開始,必須有引物
參與”制的酶:解旋隨、DNA單鏈結合蛋白質、、引物陋、DNA聚合酶(I、H、HI)
連接酶,拓撲異構酶
單鏈結合蛋白(SSB):防止被解鏈形成的單鏈重新配對或被核酸酶降解
引物酶(RNA聚合酶)引物是一段RNA分子
DnaB+DnaC+DNA復制起始區(qū)域+引物酶二引發(fā)體
DNA聚合酶(I、IKIII)
DNA聚合酶IDNA聚合酶nDNA聚合酶m
聚合活性+++
3J5,外切活性+++
5,-3唆卜切活性+■-
修復不詳染色體DNA的復
校對制
功能去除引物、水解
DNA聚合酶有6個結合位點:模板結合位點;引物結合位點;引物3'—0H結合位點;
底物dNTP結合位點;5'-3'外切陋結合位點;3'-5'校正位點。
連接酶:DNA聚合酶只能催化多核甘酸鏈的延長,不能催化各片段間的連接,復制中的
單鏈缺口由DNA連接酶催化,但是它不能催化兩條游離鏈的連接。
原核生物DNA復制的基本過程
(1)起始:包括DNA復制起點雙鏈解開及RNA引物的合成(整個DNA復制過程中,只
有復制起始受細胞周期的嚴格調控)
(2)延長:DNA鏈的延長主要由DNA聚合酶HI催化
亞制義前進的方向
合成先守鏈
先導敬的引物
見物您合成斯的RNA引物
合成后隨鏈
DNA聚合晦川催化
區(qū)崎片段的令成
合成下一個岡崎片段
引物
DNA聚合酶I切除RNA引物,
合成新的DNA片段城補缺口
連接%日閉缺口
圖1373DNA的半不連續(xù)復制
(3)終止
1.真核與原核生物復制的區(qū)別:
2.原核生物單一起點;真核生物多起始點
3.真核生物復制速度比原核生物慢
4.原核生物催化先導鏈、后隨鏈的酶相同;真核不同
5.原核細胞中引物酶與解旋酶相連:真核中引物酶與DNA聚合酶相連
6.真核生物的染色體在全部完成復制之前,各個起始點上的DNA的復制不能再
開始,而原核生物,復制起始點可以連續(xù)開始新的DNA復制,表現為雖只有一
個復制單元,但可有多個復制叉。
7.真核生物DNA復制的起始需要起始原點識別復合物(ORC)參與
在真核生物中主要有5種DNA聚合酶(a、8、丫、6、£),一半都不具有核酸外
切酶活性。
端粒的復制:依賴于端粒酶(逆轉錄酶,由蛋白質和RNA組成)
端粒DNA
端聚HRNA
5'
V
5'---------TTGGGGTTG-OHV'
3'5'rAACCCCAAC、
y
移位
5'---------TTGGGGTTG-OH3"
3'5'廠AACCCCAAC
3'5',
DNA的損傷和修復與基因突變
(一)DNA的損傷
自發(fā)性損傷:脫噪吟、唯咤;堿基脫氨基作用;堿基的互變異構(烯醇式與酮式)、細
胞正常代謝產物對DNA的損傷
物理因素:高能離子化輻射(X射線、Y射線);非離子化輻射(紫外線)
(二)化學因素:烷化劑;堿基類似物
(三)DNA損傷的修復
直接修復、切除修復、錯配修復、重組修復、SOS修復
直接修復:常見的有光復活修復,作用于紫外線引起的DNA喀咤二聚體的損傷修復,由
DNA光復活酶識別并催化光復活反應。
切除修復:切除修復是指在一系列酶的作用下,將DNA分子中受損傷部分切除,然后以
另一條完整的互補鏈為模板,重新合成切除的部分,使DNA恢復正常結構
的過程。一一修復DNA損傷的主要方式
基本步驟:識別(核酸內切酶)、切除+修補(DNA聚合酶I)、連接(DNA
連接酶)
錯配修復:區(qū)別模板鏈和新合成的DNA鏈是通過堿基的甲基化來實現的。剛合成的子
代分子中,親代鏈甲基化,新合成鏈的GATC中的A未被甲基化,故子代
DNA暫時是半甲基化的,細胞發(fā)現錯配堿基,首先切除未甲基化鏈上的錯
配堿基。
重組修好:
(四)SOS修復:當DNA受到嚴重損傷,細胞為了生存誘發(fā)的一些復雜的反應。其誘
發(fā)了修復機制相關酶與蛋白質產生。
(五)基因突變
概念:在DNA分子堿基序列水平.上所發(fā)生的一種永久性、可遺傳的變化。
點突變(轉換——喀陡與唯呢,喋吟與噂吟、顛換一一嚏咤與喋吟)、缺失、插入
DNA的轉座
轉座子:基因組上可自主復制和位移的DNA片段,可以直接從基因組內的一
個位點移
到另一個位點,發(fā)生轉座重組,從而改變染色體的結構。轉座子的轉移過程叫
轉座。轉座子每次移動時攜帶著轉座必需的基因一起在基因組內躍遷,所以轉座子又稱
跳躍基因。
類型:簡單轉座子和復合轉座子
結構特征:(1)結構中含有一個或多個開放閱讀框,其中
有一個編碼轉座酶的
基因,這種酶催化轉座子插入新的位置;
(2)兩端有20-40bp的反向末端重復序列,末端重復序列是轉座所必需的,因為它們是
轉座前所識別的底物。
轉座機制:
DNA聚合酶填補缺口
DNA連接酶封閉切口
轉座作用的遺傳學效應:1.引起插入突變2.產生新的基因3.產
生染色體畸變
4.引起生物進化
反轉座子:以RNA為中間體進行轉座
第三章RNA的合成
轉錄的概念與特點
轉錄:以DNA中一條鏈為模板,在RNA聚合酶催化下,以四種NTP為原料,合成RNA
的過程。
有兩種方式:
DNA指導的RNA合成一一生物體內的主要合成方式。
RNA指導的RNA合成——病毒。
合成的RNA中,如只含一個基因的遺傳信息,稱為單順反子;如含有幾個基因的遺傳信
息,則稱為多順反子。
?轉錄特點:
?不對稱性:指以雙鏈DNA中的一條鏈作為模板進行轉錄,該鏈稱為模板鏈(無意
?義鏈、負鏈),另一條不作為模板的鏈稱為編碼鏈(有意義鏈、正鏈)
連續(xù)性:RNA轉錄合成時為連續(xù)合成一段RNA鏈,各條RNA鏈之間無需
再進行
連接。
?單向性:合成方向為5'-3,
?有特定的起始和終止位點:RNA轉錄合成時,只能以DNA分子中的某一段作為模
板
?轉錄可同時進行
DNA復制與轉錄的比較
相同點:
?都以DNA為模板
?堿基的加入嚴格遵循堿基配對原則
?都生成磷酸二酯鍵
?新鏈合成方向為5'-3'
不同點:
?復制需要引物,轉錄不需引物
?轉錄時,模板DNA的信息全保留,復制時模板信息是半保留
?轉錄時,RNA聚合函只有5'-3'聚合作用,無5'-3'及3'-5'外切活性
復制過程是整條染色體復制,而轉錄是有選擇的,在某個時期,只有某個特定的基
因或一組基因被轉錄
復制--半保留,轉錄--不對稱
轉錄反應體系:DNA模板,NTP,酶,Mg2+,Mn2+
合成方向:5'f3'
連接方式:3',5’磷酸二酯鍵
原核與真核生物RNA聚合酶蛆成與功能
(一)該酶在單鏈DNA模板以及四種核糖核苜酸存在的條件下,不需要引物,即可從
5f聚合RNA,
(二)原核
核心酶+全酶(a2BB'(。。)
核心酶:不能起始RNA的合成
(三)。:轉錄起始因子,識別轉錄起始開始部位
(四)作用:識別DNA分子中轉錄的起始部位,促進與模板鏈結合,催化NTP的聚
合,識別轉錄終止信號。
(五)真核
功能:識別DNA雙鏈上的啟動子
使DNA變性在啟動子處解旋成單鏈
通過閱讀啟動子序列,RNApol確定它自口的軌錄方向和模板鏈
達到終止子時,通過識別停止轉錄
啟動子與終止子
(一)啟動子
基因轉錄起始所必需的一段DNA序列,位于結構基因上游。啟動子本身不轉錄
原核生物啟動子:包括轉錄起始點、結合部位(?10區(qū))、識別部位(?35區(qū))、及二者之
間的間隔區(qū)。
-10區(qū):位于起始點上游-10bp處,5'-TATAAT-3',AT較豐富,易于解鏈,為RNA
聚合酶結合部位。
-35區(qū):位于-35bp處,5'-TTGACA-3',為RNA聚合酶識別位點
真核生物啟動子:(三類)RNA聚合酶H識別的啟動子包括基礎元件、上游元件、應
答元件
(二)基礎元件:包括TATAbox和起始子,TATAbox與-10區(qū)相似,是轉錄因子
與DNA結合部位
(三)上游元件:作用是提高轉錄效率,并不是所有的啟動子必須的
(四)終止子
在基因編碼區(qū)下游的可被RNA聚合酶識別和停止合成RNA的一段DNA序列
特點:富含GC與AT.形成發(fā)卡結構和連續(xù)的U區(qū),以終止轉錄。
蛋白。因子輔助識別終止.信號,參與終I匕
大腸桿菌中的兩類終止子:
強終止子:發(fā)夾結構,3'端上有6個U
弱終止子一需要P因子
原核生物RNA的合成
分為起始,延長、終止三個階段
轉錄起始不需要引物
RNA按5;3,方向延伸
真核生物轉錄過程與原核生物的不同點
(1)轉錄在細胞不同位置進行
(2)原核只有一種RNA聚合酶,而其核細胞有三種聚合酶;
啟動子的結構特點不同,真核有三種不同的啟動子和有關的元件;
真核生物RNA聚合酶自身不能識別和結合到啟動子上,需要轉錄因子先于啟動子結合
后才能結合上去。
RNA轉錄后加工
rrRNA
原核真核都需要加工
原核:一般不需要加工,邊轉錄邊翻譯
5咖帽
在轉錄過程中
真核:需要加工3咖尾
剪接-轉錄后進行
減少部分片段:切除5,端前導序列,3,端拖尾序列和中部的內含子
增加部分片段:5'加唱,3'加poly(A),通過編輯加入一些堿基
(一)修飾:對某些堿基進行甲基化
(二)原核生物RNA轉錄后加工
(三)轉錄過程中幾個結構基因利用共同的啟動子和共同的終止信號,
轉錄形成一條成NA分子,一條mRNA鏈可編碼幾種不同的蛋白質。形成
的mRNA稱為多順反子Mrnao
(四)真核生物RNA轉錄后加工
tRNA加工:與原核生物不同的一點是先將內含子切除,再由連接酶將外
顯子連接
mRNA加工:一個結構基因轉錄成一個mRNA分子且內含子與外顯子
一起被轉錄
包括:5'末端加帽子、3'端多聚A尾、剪接去除內含子將外顯子連接
5'末端加帽子:脫磷、加GTP、甲基化(細胞核內完成)
0型帽子:7一甲基鳥甘三磷酸嗎n/7GpppN
I型、II型
3'端多聚A尾:poly(A)不為基因編程,由poly(A)聚合酶合成(細
胞核)
剪接:核內不均一RNA(hnRNA):為mRNA的前體,轉錄物中外顯子
與內含子間隔排列,需經剪接加工后生成niRNA。
外顯子:在真核生物基因中編碼蛋白質的序列。
內含子:非編碼蛋白的序列
內含子的類型發(fā)現的位置
GU?AG內含子真核細胞核mRNA前體
AU?AC內含子真核細胞核mRNA前體
5'端剪切點為GU;3'端剪切點為AG
核酶:具有酶的催化活性的RKA稱為核隨
第四章蛋白質的生物合成和轉運
(一)翻譯:從mRNA鏈上一個特定的起始位點開始,按每三個核甘酸代表一
個氨基酸的原則,依次合成一條多肽鏈的過程。包括起始、延長、終止。
(二)參與蛋白質生物合成的物質
20種氨基酸、mRNA.tRNA.核糖核蛋臼體(RNA和核糖體)、輔助因子
(l)mRNA:超玄臺密6馬----AUG
(2)終止密碼--UAA/UGA/UAG
(3)通用性與特殊性(人線粒體中,UGA不是終止碼,而是色氨酸的密碼
子)
(4)簡并性(一種以上密碼子編碼同一個氨基酸)
(5)擺動性(前兩個堿基決定其專一性,第三位堿基可有變異)
(6)連續(xù)性和方向性
(7)不重疊性
tRNA:(1)具反密碼子識別mRNA上密碼子,反密碼子閱讀方向5'~3',
反密碼子第一位堿基與密碼子第三位堿基配對。
(2)攜帶氨基酸,氨基酸結合在IRNA3'端CCA的位置。一種氨基酸可被幾種(RNA
攜帶,一種IRNA只攜帶一種氨基酸JRNA以所運氨基酸命名,如攜帶丙氨酸的叫丙氨酸一
tRNA,結合氨基酸后,成為丙氨酰一tRNA。
(3)連接多肽鏈和核糖
核糖核蛋白體:蛋白質肽鍵的合成就是在這種核糖體上進行的。一類附著于粗面
內質網,參與分泌蛋白的合成。另一類游離于胞質,參與細胞固有蛋白質的合成。
原核生物與真核生物核糖體組分
核糖體亞基rRNAs
細菌
70S50S23S
5S
30S16S
哺乳動物
80S60S28S
5S
5.8S
40S18S
核糖體上活性位點
肽酰-tRNA結合部位延伸中氨酰4RNA結合部位
所以tRN瞄動順序是AA位點到P位點再到E,通渥碼子與反密碼予ffl互作用保證反
應正向進行不會雌。
(二)蛋白質合成的過程
氨基酸的活化與轉運、多肽鏈合成的起始、肽鏈的延長、肽鏈合成終止、折疊與
加工
(1)氨基酸的活化與轉運:氨酰-tRNA合成酶催化氨基酸的活化和與特異的
tRNA結合
(2)多肽鏈合成的起始:辨認起始密碼子,核糖體與mRNA.第一個氨酰-tRNA.
起始因子結合形成起始復合物。
原核生物中:真核生物中:
起始氨基酸是:甲酰甲硫氨酸甲硫氨酸
起始AA-tRNA是:fMet-tRNAfMetMet-tRNAMet
(3)原核起始tRNA:tRNAf真核生物起始:iRNAi延伸:tRNAm
⑷肽鏈的延長一一結合、轉肽、移位
肽鏈合成的終止:當核蛋白體A位出現終止密碼后,多肽鏈合成停止,肽鏈從肽
酰一tRNA中釋出,mRNA.核蛋白體大小亞基等分離
真核生物與原核生物蛋白質合成的異同
(1)起始
核糖體為80S
用于起始的氨酰-tRNA為Met-tRNAMet(甲硫氨酸沒有被甲酰化)
起始因子較多
mRNA的5,端帽子結構和3'端polyA都參與形成翻譯起始復合物
(三)蛋白質合成的抑制劑
<1)抗生素類阻斷劑
,鏈霉素、卡那霉素、新霉素
/抑制G-蛋白質合成的三個階段:
/①阻止起始復合物的形成,使氨基酰tRNA從復合物中脫落;
/②在肽鏈延伸階段,使氨基酰tRNA與mRNA錯配;
/③在終止階段,阻礙終止因子與核蛋白體結合,使已合成的多肽鏈
無法釋放,-而且還加制70S核糖體的解離。
/四環(huán)素和土霉素
①作用于細菌內30S小亞基,抑制起始復合物的形成;
/抑制氨基酰IRNA進入核糖體的A位,阻滯肽鏈的延伸;
/影響終止因子與核糖體的結合,使已合成的多肽鏈不能脫落離核糖體。
/氯霉素一廣譜抗生素。
/①與核糖體上的A位緊密結合,因此阻礙氨基酰IRNA進入A位。
/②抑制轉肽酶活性,使肽鏈延伸受到影響,菌體蛋白質不能合成,因此有較
強的抑菌作用
/喋吟霉素
/代一些氨基酰IRNA進入核糖體的A位,當延長中的肽轉入此異常A位時,
容易脫落,終止肽鏈合成。
/白喉霉素
(2)干擾素對病毒蛋白合成的抑制
(五)干擾素是真核細胞感染病毒后能分泌的一類有抗病毒作用的蛋白質,能
抑制病毒的繁殖。
(六)擾素誘導的蛋白激酶使真核eIF2磷酸化失活
(七)蛋白質的運轉
分泌蛋白一翻譯?轉運同步機制;細胞器需要?翻譯后轉錄機制
(1)翻譯-運轉同步機制
信號肽假說
信號肽:常指新合成多肽鏈中用于指導蛋白質跨膜轉移的N.末端氨基酸序列
?假說的基礎:蛋白質定位的信息存在于該蛋白質自身結構中,并且通過與膜
上特殊受體的相互作用得以表達
(2)假說的內容:蛋白質跨膜運轉信號也是由mRNA編碼的。在起始密碼子
后,有一段編碼疏水性氨基酸序列的RNA區(qū)域,這個氨基酸序列就被稱
為信號序列。信號序列在結合核糖體上合成后便與膜上特定受體相互作用,
產生通道,允許這段多肽在延長的同時穿過膜結構,因此,這種方式是邊
翻譯邊跨膜運轉。
(3)當翻譯進行到50-0個氨基酸后,信號肽開始從核糖體上露出,被糙面內
質網上受體識別并結合,信號肽進入內質網后,被水解,正在合成的新生
肽隨之通過蛋白孔道穿越磷脂雙分子層,當核糖體移至終止子,蛋白質合
成結束,膜上的蛋白通道消失,核糖體重新處于自由態(tài)。
翻譯后轉運機制:線粒體蛋白質跨膜運轉、葉綠體蛋白質的跨膜運轉
(四)蛋白質的降解
泛素——蛋白酶體系統,包括兩個主要步驟:底物蛋白的泛素化標記(2)
蛋白酶體水解底物蛋白
(1)底物蛋白的泛素化標記
A.泛素激活酶(E1)活化泛素形成E1.泛素復合物.消耗1分子ATP;
B.泛素載體蛋白(E2)催化泛素分子從E1轉到E2,形成E2.泛素復合物,
釋放出E1;
C.在泛素蛋白連接酶(E3)的催化下,泛素分子羥基末端與底物蛋白肽鏈
中某些賴氨酸側鏈上的£一氨基形成異肽鍵;
D.第二個泛素分子竣基末端與第一個泛素分子48位賴氨酸側鏈的£一氨
基連接,以后的泛素分子以相同方式連接,最終形成多聚泛素分子的蛋
白鏈標記。
(2)蛋白酶體水解底物蛋白
A.具調節(jié)活性的19s蛋白復合體使底物蛋白去折疊,并通過蛋白醐體受
體端裂隙進入20S內部;
B.具催化活性的20S蛋白復合體將底物蛋白降解為小片段,小片段的釋放
方式還不太清楚。釋放出的泛素分子可被循環(huán)利用。
第五章原核生物的基因表達調控
基因表達:從DNA到蛋白質或功能RNA的過程。
基因表達調控:圍繞基因表達過程中發(fā)生的各種各樣的調節(jié)方式
都通稱為基因表
達調控一基因/染色體水平、轉錄水平的調控、轉錄后的調控、翻
譯水平、翻譯后水平的調控
原核生物基因表達調控的特點
?調節(jié)的主要環(huán)節(jié)在轉錄水平上進行
?。因子決定RNA聚合酶識別特異性
?主要通過操縱子模式進行調節(jié)
?阻遏蛋白對轉錄的抑制作用(阻遏機制)是普遍存在的負調控作用
順式作用:不轉變?yōu)槿魏纹渌问剑≧NA或蛋白質)而只以DNA形式在原來位
置起作用,僅影響與其緊密相連的DNA序列。
順式作用元件:對基因表達有調節(jié)活性的DNA序列,其活性只影響與其自身同
處在一個DNA分子上的基因。通常不編碼蛋白質,多位于基因旁側或
內含子中。包括啟動子,增強子,沉默子等。
反式作用:編碼產物從合成地點擴散到其他場所起作用的過程。
反式作用因子:能直接或間接地識別或結合在各類順式作用元件核心序列上,參
與調控靶基因轉錄效率的蛋白質。調節(jié)基因編碼的產物。多為轉錄因子。
組成蛋白:細胞內有許多種蛋白質的數量幾乎不受外界環(huán)境的影響,這些蛋m質
稱為組成蛋白。
調節(jié)蛋白:是一類特殊的蛋白質,它們可以影響一種或多種基因的表達。(正調
節(jié)蛋白和負調節(jié)蛋白,前者是激活蛋白,后者是阻遏蛋白。)
基因表達的方式
-組成性基因表達
?適應性表達(誘導和阻遏表達)
1.組成性基因表達
指不大受環(huán)境變動而變化的一類基因的表達。如:DNA聚合酶、RNA娶合
酶等代謝過程中十分必須的蛋白質或酶的表達。
2.適應性表達(誘導和阻遏表達)
指環(huán)境的變化容易使其表達水平變動的一類基因表達。
誘導表達(induction)指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被激活,從而使基
因
的表達產物增加。這類基因稱為可誘導基因。
?阻遏表達(repression)指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被抑制,從而
使基因
的表達產物減少。這類基因稱為可阻遏基因。
1.負調控negativeregulation
?在沒有調節(jié)蛋白質存在時基因是表達的,加入某種調節(jié)蛋白質后基因活性就
被關閉,這樣的控制系統就叫做負控系統。
?其調節(jié)蛋白質叫做阻遏蛋白
?兩種類型:負控誘導和負控阻遏
2.正調控positiveregulation
?在沒有調節(jié)蛋白質存在時基因是關閉的,加入某種調節(jié)蛋白質后基因活性就
被開啟,這樣的控制系統就叫做正控系統。
?其調節(jié)蛋白質叫做無輔基誘導蛋白(激活蛋白)
?兩種類型:正控誘導和正控阻遏系統
特殊代謝物調節(jié)基因表達的類型
?1.可誘導調節(jié)
?一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來關閉的狀態(tài)轉變?yōu)楣ぷ?/p>
狀態(tài),即在某些物質的誘導下使基因活化。
調節(jié)分解代謝的操縱子,同時受cAMP-CAP的活性調節(jié)一一乳糖操縱子
?2.可阻遏調節(jié)
?一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來開啟的狀態(tài)轉變?yōu)殛P閉
狀態(tài),基因的表達被阻遏.
?調節(jié)合成代謝的操縱子一一色氨酸操縱子
細菌的應急反應的機制:
應急信號:鳥背四磷酸(ppGpp)、鳥甘王磷酸(pppGpp)
誘導物:空載tRNA降解物對基因活性的調節(jié)
1.葡萄糖效應(降解物抑制作用)
是指當葡萄糖和其它糖類一起作為細菌的碳源時葡萄糖總是優(yōu)先被利用,葡萄
糖的存在阻止了其它糖類的利用的現象。
2.降解物對基因活性的調節(jié)
葡萄糖通過降低cAMP的含量而抑制基因表達
操縱子:由操縱基因以及相鄰的若干結構基因所組成的功能單位,其中結構基
因轉錄受操縱基因控制
乳糖操縱子模型——代謝型操縱子
lacZ:編碼B-半乳糖甘酶,它可以將乳糖水解為半乳糖和葡萄糖;
lacY:編碼半乳糖在透性酶,它能將乳糖運送透過細菌的細胞壁;
lacA:編碼硫代半乳糖甘乙酰轉移酶,進行乳糖代謝。
2.0區(qū)就是阻遏物結合區(qū)
3、lacP(啟動子區(qū)):從I基因結束:到mRNA轉錄起始位點止,有cAMP-CAP
結合區(qū)
?4.cAmp-CAP
?代謝激活蛋白(CAP)是cAmp的受體蛋白(CRP)
cAmp-CAP復合物,是lac操縱元的正調控因子
5.葡萄糖對lac操縱子的影響
??葡萄糖存在時腺昔酸環(huán)化酶活性降低,ATP無法轉變成cAMP,不能形成
CAP?cAMP復合蛋白,RNA酶無法結合在DNA上,結構基因不表達。
?代謝物阻遏效應
?研究認為葡萄糖的某些降解產物抑制lacmRNA的合成,這種效應稱之為代謝
物阻遏效應.
trp操縱子的阻遏調控機制一一合成代謝
trpPtrpOtrp£trpPtrpCtrpBtrpA
I
o
[-------1i-------1
TrpR(無活性)
圖1677TrpR^Trp激活后可阻遏trp操姒子的轉錄
?結構基因EDCBA
?色氨酸
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