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文檔簡介

緒論

分子生物學的發(fā)展簡史

Schleiden和Schwann提出“細胞學說”

孟德爾提出了“遺傳因子”的概念、分離定律、獨立分配規(guī)律

Mieschei?首次從萊茵河雄魚精子中分離出DNA

Morgan基因存在于染色體匕、連鎖遺傳規(guī)律

Avery證明基因就是DNA分子,提出DNA是遺傳信息的載體

McClintock首次提出轉座子或跳躍基因概念

Watson和Crick提出DNA雙螺旋模型

Crick提出了“中心法則”

Meselson與Stah用N重同位素證明了DNA復制是一種半保留復制

Jacob和Monod提出了著名的乳糖操縱子模型

Arber首次發(fā)現DNA限制性內切酶的存在

Temin和Baltimore發(fā)現在病毒中存在以RNA為模板,逆轉錄成DNA的逆轉錄前

哪幾種經典實驗證明了DNA是遺傳物質?(Avery等進行的肺炎雙球菌轉化實驗、Hershey

利用放射性同位素35S和32P分別標記T2噬菌體的蛋白質外殼和DNA)

第二章染色體與DNA

第一節(jié)染色體

一、真核細胞染色體的組成

(―)DNA:組蛋白:非組蛋白:RNA=1:1:(1-1.5):0.05

(-)蛋白質(組蛋白、非組蛋白)

(1)組蛋臼:H1.H2A.H2B.H3.H4

功能:①核小體組蛋白(H2A.H2B.H3.H4)作用是將DNA分子盤繞成核小體

②不參加核小體組建的組蛋白H1,在構成核小體時起連接作用

(2)非組蛋白:包括以DNA為底物的酶、作用于組蛋白的酷、RNA聚合酶等。常見

的有(HMG蛋白、DNA結合蛋白)

二、染色質

染色體:分裂期由染色質聚縮形成。

染色質:線性復合結構,間期遺傳物質存在形式。

/常染色質(著色淺)

具間期染色質形態(tài)特征和著色特征染色質\

異染色質(著色深)

結構性異染色質兼性異染色質

(在整個細胞周期內都處于凝集狀態(tài))(特定時期處于凝集狀態(tài))

三、核小體

山H2A.H2B.H3.H4各2分子組成的八聚體和繞在八聚體外的DNA.一分

「H1組成。八聚體在中央,DNA分廣盤繞在外,由此形成核心顆粒。,H1結合在核心

顆粒外側DNA雙鏈的進出口端,如搭扣將繞在八聚體外DNA鏈固定,核心顆粒之間

的連接部分為連接DNA.

核小體的定位對轉錄有促進作用

中期染色體由著絲粒、染色體臂、次縊痕、隨體、端粒(由重復的寡核甘酸序列構成)

5部分組成。

染色單.體

省?”粒丁

核型:指染色體組在有絲分裂中期的表型,是染色體數目、大小、形態(tài)特征的總和。

第二節(jié)DNA

Chargaff定則:(1)同一生物的不同組織的DNA堿基組成相同

(2)一種生物DNA堿基組成不隨生物體的年齡、營養(yǎng)狀態(tài)或者環(huán)境變

化而改變

(3)[A]=[T]、總的噂口令摩爾含量與總的喀咤摩爾含量相同(|A+

GHC+TJ)

(4)不同生物來源的DNA堿基組成不同,表現在A+T/G+C比值的不同

(-)DAN的結構

一級結構:四種脫氧核糖核甘酸dAMP、dGMP、dCMP、dTMP,通過3f-磷酸二酯鍵

連接起來的直線形或環(huán)形多聚體。

某DNA分子的一條多核苜酸鏈由100個不同的堿基組成,其可能的排列方

式有4人100種

圖2-1DNA多核甘酸蜷的一段

A.DNA多核苛酸片段B.線條式縮寫C.文字式

右手螺旋:A-DNA、B-DNA(最常見)

二級結構:雙螺旋結構左手螺旋:Z-DNA

B-DNA:(Watson-Crick)92%濕度下的鈉鹽結構

堿基平面與雙螺旋的長軸相垂直,堿基間符合堿基互

補配對原則,相鄰堿基對平面間的距離為0.34nm,

雙旋旋的螺距為3.4nm,每圈螺旋有10個堿基對,

螺旋直徑為2.0nm。A=T(兩個氫鍵),G=C(三個

氫鍵),具大溝和小溝。

A-DNA:相對濕度75%以下的結構,每圈螺旋有11個堿基對,螺體較寬而短,堿基對與

中心軸的傾角也不同,呈19°大溝變窄、變深,小溝變寬、變淺°若DNA

雙鏈中一條鏈被相應RNA替換,則變構為A-DNA。(基因表達)

Z-DNA:左手螺旋,螺距延長(4.5nm左右),直徑變窄(1.8nm),每個螺旋含12個

堿基對。螺旋骨架呈Z字形。(轉錄調控)

正超螺旋(左旋、雙螺旋圈數增加而擰緊)

三級結構:雙螺旋進一步扭曲形成超螺旋負超螺旋(右旋、減少而擰松,絕大多數)

White方程:L-T+W

L(Linkingnumber):連環(huán)數或稱拓撲環(huán)繞數,指cccDNA中一條鏈繞另一條鏈的總次

數。其特點是:(1)L是整數;(2)在cccDNA中任何拓撲學狀態(tài)中其值保持不變;

(3)右手螺旋對L取正值。

T(Twistingnumber):纏繞數,DNA一條鏈繞另一條鏈的扭轉數即雙螺旋的圈數。其

特點:(1)可以是非整數(2)是變量;

W(Writhingnuinbur):扭曲數,即超螺旋數,指雙螺旋分子在空間上相對丁雙螺旋軸

的扭曲。特點是:(1)可以是非整數(2)是變量;

I型:轉變超螺旋為松弛狀態(tài)

拓撲異構酶(改變DNA拓撲異構體的L值)II型:引入負超螺旋&同I型

(二)DNA主要序列類型

高度重復序列(衛(wèi)星DNA.分散高度重復序列)、中度重復序列、低度重復序列、反向

重復序列。

石婿油

(三)DNA的理化性質

詼白質

溶解度:微溶于水,鈉鹽在水中的溶解度較大??扇?/p>

開環(huán)形及

于2-甲氧乙醇,但不溶于乙醇等一般有機溶劑,常用

線形DNA

乙醇從溶液中沉淀核酸。團環(huán)形

放較DNA

紫外吸收:DNA鈉鹽的紫外吸收在260nm附近有最

大吸收值

RNA

核酸的沉降特性(如右圖)

(四)DNA的變性與復性

變性:DNA分子由穩(wěn)定的雙螺旋結構松解為無規(guī)則線性結構的現象,不涉及到其一級結構

的改變。

伴隨變性,會發(fā)牛增色效應(紫外吸收明品增加)溶液粘度下降等現象.

熔解——DNA加熱變性的過程。

溶解溫度(Tm):核酸加熱變性過程中,紫外光吸收值達到最大值的50%時的溫

度稱為核酸的解鏈溫度。(G+T含量越高Tm越大:DNA分子序列越均一,變形過

程溫度范圍越窄:溶液的離子強度較低時,Tm值較低。)

復性:熱變性DNA一般經緩慢冷卻后即可復性,此過程稱之為退火

影響DNA復性的因素:①溫度和時間②DNA濃度t,更性t③DNA順序的更雜

性④DNA片段的大小⑤鹽的濃度

K1/k值越大表明反應越慢

核酸外切陶

酶解:核酸核酸防:1型和III型限制性內切施(需要消耗ATP)、II型(不需要ATP)

DNA的復制

Meselson與Stah用N重同位素證明了DNA復制是一種半保留復制

(一)基本概念:

半保留復制:每個子代分子的一條鏈來自親本DNA,另一條則來是新合成的,這種復制

方式稱半保留復制。

半不連續(xù)復制:DNA復制時,一條鏈連續(xù)復制,另一條不連續(xù)復制,這種復制方式稱

先導鏈:DNA復制時,連續(xù)合成的鏈后隨鏈:不連續(xù)合成的鏈

岡崎片段:后隨鏈復制中出現的不連續(xù)的DNA片段

復制子:從起始點開始至終止點而獨立進行發(fā)制的單位(細菌只有一個,真核多個)

一個復制子只含一個復制起始點,啟動單向復制or雙向取決于起始點形成一

個復制叉。r兩個。

(三)復制終止點:復制子中控制復制終點的位點。型一一大腸桿菌質粒DNA

(四)DNA復制的幾種方式滾環(huán)型一一噬菌體

(五)線性DNA(單向、雙向),環(huán)狀DNAD環(huán)(D-loop)型——動物線粒體

(六)復制的過程(起始、延伸、終止)

不能從頭開始,必須有引物

參與”制的酶:解旋隨、DNA單鏈結合蛋白質、、引物陋、DNA聚合酶(I、H、HI)

連接酶,拓撲異構酶

單鏈結合蛋白(SSB):防止被解鏈形成的單鏈重新配對或被核酸酶降解

引物酶(RNA聚合酶)引物是一段RNA分子

DnaB+DnaC+DNA復制起始區(qū)域+引物酶二引發(fā)體

DNA聚合酶(I、IKIII)

DNA聚合酶IDNA聚合酶nDNA聚合酶m

聚合活性+++

3J5,外切活性+++

5,-3唆卜切活性+■-

修復不詳染色體DNA的復

校對制

功能去除引物、水解

DNA聚合酶有6個結合位點:模板結合位點;引物結合位點;引物3'—0H結合位點;

底物dNTP結合位點;5'-3'外切陋結合位點;3'-5'校正位點。

連接酶:DNA聚合酶只能催化多核甘酸鏈的延長,不能催化各片段間的連接,復制中的

單鏈缺口由DNA連接酶催化,但是它不能催化兩條游離鏈的連接。

原核生物DNA復制的基本過程

(1)起始:包括DNA復制起點雙鏈解開及RNA引物的合成(整個DNA復制過程中,只

有復制起始受細胞周期的嚴格調控)

(2)延長:DNA鏈的延長主要由DNA聚合酶HI催化

亞制義前進的方向

合成先守鏈

先導敬的引物

見物您合成斯的RNA引物

合成后隨鏈

DNA聚合晦川催化

區(qū)崎片段的令成

合成下一個岡崎片段

引物

DNA聚合酶I切除RNA引物,

合成新的DNA片段城補缺口

連接%日閉缺口

圖1373DNA的半不連續(xù)復制

(3)終止

1.真核與原核生物復制的區(qū)別:

2.原核生物單一起點;真核生物多起始點

3.真核生物復制速度比原核生物慢

4.原核生物催化先導鏈、后隨鏈的酶相同;真核不同

5.原核細胞中引物酶與解旋酶相連:真核中引物酶與DNA聚合酶相連

6.真核生物的染色體在全部完成復制之前,各個起始點上的DNA的復制不能再

開始,而原核生物,復制起始點可以連續(xù)開始新的DNA復制,表現為雖只有一

個復制單元,但可有多個復制叉。

7.真核生物DNA復制的起始需要起始原點識別復合物(ORC)參與

在真核生物中主要有5種DNA聚合酶(a、8、丫、6、£),一半都不具有核酸外

切酶活性。

端粒的復制:依賴于端粒酶(逆轉錄酶,由蛋白質和RNA組成)

端粒DNA

端聚HRNA

5'

V

5'---------TTGGGGTTG-OHV'

3'5'rAACCCCAAC、

y

移位

5'---------TTGGGGTTG-OH3"

3'5'廠AACCCCAAC

3'5',

DNA的損傷和修復與基因突變

(一)DNA的損傷

自發(fā)性損傷:脫噪吟、唯咤;堿基脫氨基作用;堿基的互變異構(烯醇式與酮式)、細

胞正常代謝產物對DNA的損傷

物理因素:高能離子化輻射(X射線、Y射線);非離子化輻射(紫外線)

(二)化學因素:烷化劑;堿基類似物

(三)DNA損傷的修復

直接修復、切除修復、錯配修復、重組修復、SOS修復

直接修復:常見的有光復活修復,作用于紫外線引起的DNA喀咤二聚體的損傷修復,由

DNA光復活酶識別并催化光復活反應。

切除修復:切除修復是指在一系列酶的作用下,將DNA分子中受損傷部分切除,然后以

另一條完整的互補鏈為模板,重新合成切除的部分,使DNA恢復正常結構

的過程。一一修復DNA損傷的主要方式

基本步驟:識別(核酸內切酶)、切除+修補(DNA聚合酶I)、連接(DNA

連接酶)

錯配修復:區(qū)別模板鏈和新合成的DNA鏈是通過堿基的甲基化來實現的。剛合成的子

代分子中,親代鏈甲基化,新合成鏈的GATC中的A未被甲基化,故子代

DNA暫時是半甲基化的,細胞發(fā)現錯配堿基,首先切除未甲基化鏈上的錯

配堿基。

重組修好:

(四)SOS修復:當DNA受到嚴重損傷,細胞為了生存誘發(fā)的一些復雜的反應。其誘

發(fā)了修復機制相關酶與蛋白質產生。

(五)基因突變

概念:在DNA分子堿基序列水平.上所發(fā)生的一種永久性、可遺傳的變化。

點突變(轉換——喀陡與唯呢,喋吟與噂吟、顛換一一嚏咤與喋吟)、缺失、插入

DNA的轉座

轉座子:基因組上可自主復制和位移的DNA片段,可以直接從基因組內的一

個位點移

到另一個位點,發(fā)生轉座重組,從而改變染色體的結構。轉座子的轉移過程叫

轉座。轉座子每次移動時攜帶著轉座必需的基因一起在基因組內躍遷,所以轉座子又稱

跳躍基因。

類型:簡單轉座子和復合轉座子

結構特征:(1)結構中含有一個或多個開放閱讀框,其中

有一個編碼轉座酶的

基因,這種酶催化轉座子插入新的位置;

(2)兩端有20-40bp的反向末端重復序列,末端重復序列是轉座所必需的,因為它們是

轉座前所識別的底物。

轉座機制:

DNA聚合酶填補缺口

DNA連接酶封閉切口

轉座作用的遺傳學效應:1.引起插入突變2.產生新的基因3.產

生染色體畸變

4.引起生物進化

反轉座子:以RNA為中間體進行轉座

第三章RNA的合成

轉錄的概念與特點

轉錄:以DNA中一條鏈為模板,在RNA聚合酶催化下,以四種NTP為原料,合成RNA

的過程。

有兩種方式:

DNA指導的RNA合成一一生物體內的主要合成方式。

RNA指導的RNA合成——病毒。

合成的RNA中,如只含一個基因的遺傳信息,稱為單順反子;如含有幾個基因的遺傳信

息,則稱為多順反子。

?轉錄特點:

?不對稱性:指以雙鏈DNA中的一條鏈作為模板進行轉錄,該鏈稱為模板鏈(無意

?義鏈、負鏈),另一條不作為模板的鏈稱為編碼鏈(有意義鏈、正鏈)

連續(xù)性:RNA轉錄合成時為連續(xù)合成一段RNA鏈,各條RNA鏈之間無需

再進行

連接。

?單向性:合成方向為5'-3,

?有特定的起始和終止位點:RNA轉錄合成時,只能以DNA分子中的某一段作為模

?轉錄可同時進行

DNA復制與轉錄的比較

相同點:

?都以DNA為模板

?堿基的加入嚴格遵循堿基配對原則

?都生成磷酸二酯鍵

?新鏈合成方向為5'-3'

不同點:

?復制需要引物,轉錄不需引物

?轉錄時,模板DNA的信息全保留,復制時模板信息是半保留

?轉錄時,RNA聚合函只有5'-3'聚合作用,無5'-3'及3'-5'外切活性

復制過程是整條染色體復制,而轉錄是有選擇的,在某個時期,只有某個特定的基

因或一組基因被轉錄

復制--半保留,轉錄--不對稱

轉錄反應體系:DNA模板,NTP,酶,Mg2+,Mn2+

合成方向:5'f3'

連接方式:3',5’磷酸二酯鍵

原核與真核生物RNA聚合酶蛆成與功能

(一)該酶在單鏈DNA模板以及四種核糖核苜酸存在的條件下,不需要引物,即可從

5f聚合RNA,

(二)原核

核心酶+全酶(a2BB'(。。)

核心酶:不能起始RNA的合成

(三)。:轉錄起始因子,識別轉錄起始開始部位

(四)作用:識別DNA分子中轉錄的起始部位,促進與模板鏈結合,催化NTP的聚

合,識別轉錄終止信號。

(五)真核

功能:識別DNA雙鏈上的啟動子

使DNA變性在啟動子處解旋成單鏈

通過閱讀啟動子序列,RNApol確定它自口的軌錄方向和模板鏈

達到終止子時,通過識別停止轉錄

啟動子與終止子

(一)啟動子

基因轉錄起始所必需的一段DNA序列,位于結構基因上游。啟動子本身不轉錄

原核生物啟動子:包括轉錄起始點、結合部位(?10區(qū))、識別部位(?35區(qū))、及二者之

間的間隔區(qū)。

-10區(qū):位于起始點上游-10bp處,5'-TATAAT-3',AT較豐富,易于解鏈,為RNA

聚合酶結合部位。

-35區(qū):位于-35bp處,5'-TTGACA-3',為RNA聚合酶識別位點

真核生物啟動子:(三類)RNA聚合酶H識別的啟動子包括基礎元件、上游元件、應

答元件

(二)基礎元件:包括TATAbox和起始子,TATAbox與-10區(qū)相似,是轉錄因子

與DNA結合部位

(三)上游元件:作用是提高轉錄效率,并不是所有的啟動子必須的

(四)終止子

在基因編碼區(qū)下游的可被RNA聚合酶識別和停止合成RNA的一段DNA序列

特點:富含GC與AT.形成發(fā)卡結構和連續(xù)的U區(qū),以終止轉錄。

蛋白。因子輔助識別終止.信號,參與終I匕

大腸桿菌中的兩類終止子:

強終止子:發(fā)夾結構,3'端上有6個U

弱終止子一需要P因子

原核生物RNA的合成

分為起始,延長、終止三個階段

轉錄起始不需要引物

RNA按5;3,方向延伸

真核生物轉錄過程與原核生物的不同點

(1)轉錄在細胞不同位置進行

(2)原核只有一種RNA聚合酶,而其核細胞有三種聚合酶;

啟動子的結構特點不同,真核有三種不同的啟動子和有關的元件;

真核生物RNA聚合酶自身不能識別和結合到啟動子上,需要轉錄因子先于啟動子結合

后才能結合上去。

RNA轉錄后加工

rrRNA

原核真核都需要加工

原核:一般不需要加工,邊轉錄邊翻譯

5咖帽

在轉錄過程中

真核:需要加工3咖尾

剪接-轉錄后進行

減少部分片段:切除5,端前導序列,3,端拖尾序列和中部的內含子

增加部分片段:5'加唱,3'加poly(A),通過編輯加入一些堿基

(一)修飾:對某些堿基進行甲基化

(二)原核生物RNA轉錄后加工

(三)轉錄過程中幾個結構基因利用共同的啟動子和共同的終止信號,

轉錄形成一條成NA分子,一條mRNA鏈可編碼幾種不同的蛋白質。形成

的mRNA稱為多順反子Mrnao

(四)真核生物RNA轉錄后加工

tRNA加工:與原核生物不同的一點是先將內含子切除,再由連接酶將外

顯子連接

mRNA加工:一個結構基因轉錄成一個mRNA分子且內含子與外顯子

一起被轉錄

包括:5'末端加帽子、3'端多聚A尾、剪接去除內含子將外顯子連接

5'末端加帽子:脫磷、加GTP、甲基化(細胞核內完成)

0型帽子:7一甲基鳥甘三磷酸嗎n/7GpppN

I型、II型

3'端多聚A尾:poly(A)不為基因編程,由poly(A)聚合酶合成(細

胞核)

剪接:核內不均一RNA(hnRNA):為mRNA的前體,轉錄物中外顯子

與內含子間隔排列,需經剪接加工后生成niRNA。

外顯子:在真核生物基因中編碼蛋白質的序列。

內含子:非編碼蛋白的序列

內含子的類型發(fā)現的位置

GU?AG內含子真核細胞核mRNA前體

AU?AC內含子真核細胞核mRNA前體

5'端剪切點為GU;3'端剪切點為AG

核酶:具有酶的催化活性的RKA稱為核隨

第四章蛋白質的生物合成和轉運

(一)翻譯:從mRNA鏈上一個特定的起始位點開始,按每三個核甘酸代表一

個氨基酸的原則,依次合成一條多肽鏈的過程。包括起始、延長、終止。

(二)參與蛋白質生物合成的物質

20種氨基酸、mRNA.tRNA.核糖核蛋臼體(RNA和核糖體)、輔助因子

(l)mRNA:超玄臺密6馬----AUG

(2)終止密碼--UAA/UGA/UAG

(3)通用性與特殊性(人線粒體中,UGA不是終止碼,而是色氨酸的密碼

子)

(4)簡并性(一種以上密碼子編碼同一個氨基酸)

(5)擺動性(前兩個堿基決定其專一性,第三位堿基可有變異)

(6)連續(xù)性和方向性

(7)不重疊性

tRNA:(1)具反密碼子識別mRNA上密碼子,反密碼子閱讀方向5'~3',

反密碼子第一位堿基與密碼子第三位堿基配對。

(2)攜帶氨基酸,氨基酸結合在IRNA3'端CCA的位置。一種氨基酸可被幾種(RNA

攜帶,一種IRNA只攜帶一種氨基酸JRNA以所運氨基酸命名,如攜帶丙氨酸的叫丙氨酸一

tRNA,結合氨基酸后,成為丙氨酰一tRNA。

(3)連接多肽鏈和核糖

核糖核蛋白體:蛋白質肽鍵的合成就是在這種核糖體上進行的。一類附著于粗面

內質網,參與分泌蛋白的合成。另一類游離于胞質,參與細胞固有蛋白質的合成。

原核生物與真核生物核糖體組分

核糖體亞基rRNAs

細菌

70S50S23S

5S

30S16S

哺乳動物

80S60S28S

5S

5.8S

40S18S

核糖體上活性位點

肽酰-tRNA結合部位延伸中氨酰4RNA結合部位

所以tRN瞄動順序是AA位點到P位點再到E,通渥碼子與反密碼予ffl互作用保證反

應正向進行不會雌。

(二)蛋白質合成的過程

氨基酸的活化與轉運、多肽鏈合成的起始、肽鏈的延長、肽鏈合成終止、折疊與

加工

(1)氨基酸的活化與轉運:氨酰-tRNA合成酶催化氨基酸的活化和與特異的

tRNA結合

(2)多肽鏈合成的起始:辨認起始密碼子,核糖體與mRNA.第一個氨酰-tRNA.

起始因子結合形成起始復合物。

原核生物中:真核生物中:

起始氨基酸是:甲酰甲硫氨酸甲硫氨酸

起始AA-tRNA是:fMet-tRNAfMetMet-tRNAMet

(3)原核起始tRNA:tRNAf真核生物起始:iRNAi延伸:tRNAm

⑷肽鏈的延長一一結合、轉肽、移位

肽鏈合成的終止:當核蛋白體A位出現終止密碼后,多肽鏈合成停止,肽鏈從肽

酰一tRNA中釋出,mRNA.核蛋白體大小亞基等分離

真核生物與原核生物蛋白質合成的異同

(1)起始

核糖體為80S

用于起始的氨酰-tRNA為Met-tRNAMet(甲硫氨酸沒有被甲酰化)

起始因子較多

mRNA的5,端帽子結構和3'端polyA都參與形成翻譯起始復合物

(三)蛋白質合成的抑制劑

<1)抗生素類阻斷劑

,鏈霉素、卡那霉素、新霉素

/抑制G-蛋白質合成的三個階段:

/①阻止起始復合物的形成,使氨基酰tRNA從復合物中脫落;

/②在肽鏈延伸階段,使氨基酰tRNA與mRNA錯配;

/③在終止階段,阻礙終止因子與核蛋白體結合,使已合成的多肽鏈

無法釋放,-而且還加制70S核糖體的解離。

/四環(huán)素和土霉素

①作用于細菌內30S小亞基,抑制起始復合物的形成;

/抑制氨基酰IRNA進入核糖體的A位,阻滯肽鏈的延伸;

/影響終止因子與核糖體的結合,使已合成的多肽鏈不能脫落離核糖體。

/氯霉素一廣譜抗生素。

/①與核糖體上的A位緊密結合,因此阻礙氨基酰IRNA進入A位。

/②抑制轉肽酶活性,使肽鏈延伸受到影響,菌體蛋白質不能合成,因此有較

強的抑菌作用

/喋吟霉素

/代一些氨基酰IRNA進入核糖體的A位,當延長中的肽轉入此異常A位時,

容易脫落,終止肽鏈合成。

/白喉霉素

(2)干擾素對病毒蛋白合成的抑制

(五)干擾素是真核細胞感染病毒后能分泌的一類有抗病毒作用的蛋白質,能

抑制病毒的繁殖。

(六)擾素誘導的蛋白激酶使真核eIF2磷酸化失活

(七)蛋白質的運轉

分泌蛋白一翻譯?轉運同步機制;細胞器需要?翻譯后轉錄機制

(1)翻譯-運轉同步機制

信號肽假說

信號肽:常指新合成多肽鏈中用于指導蛋白質跨膜轉移的N.末端氨基酸序列

?假說的基礎:蛋白質定位的信息存在于該蛋白質自身結構中,并且通過與膜

上特殊受體的相互作用得以表達

(2)假說的內容:蛋白質跨膜運轉信號也是由mRNA編碼的。在起始密碼子

后,有一段編碼疏水性氨基酸序列的RNA區(qū)域,這個氨基酸序列就被稱

為信號序列。信號序列在結合核糖體上合成后便與膜上特定受體相互作用,

產生通道,允許這段多肽在延長的同時穿過膜結構,因此,這種方式是邊

翻譯邊跨膜運轉。

(3)當翻譯進行到50-0個氨基酸后,信號肽開始從核糖體上露出,被糙面內

質網上受體識別并結合,信號肽進入內質網后,被水解,正在合成的新生

肽隨之通過蛋白孔道穿越磷脂雙分子層,當核糖體移至終止子,蛋白質合

成結束,膜上的蛋白通道消失,核糖體重新處于自由態(tài)。

翻譯后轉運機制:線粒體蛋白質跨膜運轉、葉綠體蛋白質的跨膜運轉

(四)蛋白質的降解

泛素——蛋白酶體系統,包括兩個主要步驟:底物蛋白的泛素化標記(2)

蛋白酶體水解底物蛋白

(1)底物蛋白的泛素化標記

A.泛素激活酶(E1)活化泛素形成E1.泛素復合物.消耗1分子ATP;

B.泛素載體蛋白(E2)催化泛素分子從E1轉到E2,形成E2.泛素復合物,

釋放出E1;

C.在泛素蛋白連接酶(E3)的催化下,泛素分子羥基末端與底物蛋白肽鏈

中某些賴氨酸側鏈上的£一氨基形成異肽鍵;

D.第二個泛素分子竣基末端與第一個泛素分子48位賴氨酸側鏈的£一氨

基連接,以后的泛素分子以相同方式連接,最終形成多聚泛素分子的蛋

白鏈標記。

(2)蛋白酶體水解底物蛋白

A.具調節(jié)活性的19s蛋白復合體使底物蛋白去折疊,并通過蛋白醐體受

體端裂隙進入20S內部;

B.具催化活性的20S蛋白復合體將底物蛋白降解為小片段,小片段的釋放

方式還不太清楚。釋放出的泛素分子可被循環(huán)利用。

第五章原核生物的基因表達調控

基因表達:從DNA到蛋白質或功能RNA的過程。

基因表達調控:圍繞基因表達過程中發(fā)生的各種各樣的調節(jié)方式

都通稱為基因表

達調控一基因/染色體水平、轉錄水平的調控、轉錄后的調控、翻

譯水平、翻譯后水平的調控

原核生物基因表達調控的特點

?調節(jié)的主要環(huán)節(jié)在轉錄水平上進行

?。因子決定RNA聚合酶識別特異性

?主要通過操縱子模式進行調節(jié)

?阻遏蛋白對轉錄的抑制作用(阻遏機制)是普遍存在的負調控作用

順式作用:不轉變?yōu)槿魏纹渌问剑≧NA或蛋白質)而只以DNA形式在原來位

置起作用,僅影響與其緊密相連的DNA序列。

順式作用元件:對基因表達有調節(jié)活性的DNA序列,其活性只影響與其自身同

處在一個DNA分子上的基因。通常不編碼蛋白質,多位于基因旁側或

內含子中。包括啟動子,增強子,沉默子等。

反式作用:編碼產物從合成地點擴散到其他場所起作用的過程。

反式作用因子:能直接或間接地識別或結合在各類順式作用元件核心序列上,參

與調控靶基因轉錄效率的蛋白質。調節(jié)基因編碼的產物。多為轉錄因子。

組成蛋白:細胞內有許多種蛋白質的數量幾乎不受外界環(huán)境的影響,這些蛋m質

稱為組成蛋白。

調節(jié)蛋白:是一類特殊的蛋白質,它們可以影響一種或多種基因的表達。(正調

節(jié)蛋白和負調節(jié)蛋白,前者是激活蛋白,后者是阻遏蛋白。)

基因表達的方式

-組成性基因表達

?適應性表達(誘導和阻遏表達)

1.組成性基因表達

指不大受環(huán)境變動而變化的一類基因的表達。如:DNA聚合酶、RNA娶合

酶等代謝過程中十分必須的蛋白質或酶的表達。

2.適應性表達(誘導和阻遏表達)

指環(huán)境的變化容易使其表達水平變動的一類基因表達。

誘導表達(induction)指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被激活,從而使基

的表達產物增加。這類基因稱為可誘導基因。

?阻遏表達(repression)指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被抑制,從而

使基因

的表達產物減少。這類基因稱為可阻遏基因。

1.負調控negativeregulation

?在沒有調節(jié)蛋白質存在時基因是表達的,加入某種調節(jié)蛋白質后基因活性就

被關閉,這樣的控制系統就叫做負控系統。

?其調節(jié)蛋白質叫做阻遏蛋白

?兩種類型:負控誘導和負控阻遏

2.正調控positiveregulation

?在沒有調節(jié)蛋白質存在時基因是關閉的,加入某種調節(jié)蛋白質后基因活性就

被開啟,這樣的控制系統就叫做正控系統。

?其調節(jié)蛋白質叫做無輔基誘導蛋白(激活蛋白)

?兩種類型:正控誘導和正控阻遏系統

特殊代謝物調節(jié)基因表達的類型

?1.可誘導調節(jié)

?一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來關閉的狀態(tài)轉變?yōu)楣ぷ?/p>

狀態(tài),即在某些物質的誘導下使基因活化。

調節(jié)分解代謝的操縱子,同時受cAMP-CAP的活性調節(jié)一一乳糖操縱子

?2.可阻遏調節(jié)

?一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來開啟的狀態(tài)轉變?yōu)殛P閉

狀態(tài),基因的表達被阻遏.

?調節(jié)合成代謝的操縱子一一色氨酸操縱子

細菌的應急反應的機制:

應急信號:鳥背四磷酸(ppGpp)、鳥甘王磷酸(pppGpp)

誘導物:空載tRNA降解物對基因活性的調節(jié)

1.葡萄糖效應(降解物抑制作用)

是指當葡萄糖和其它糖類一起作為細菌的碳源時葡萄糖總是優(yōu)先被利用,葡萄

糖的存在阻止了其它糖類的利用的現象。

2.降解物對基因活性的調節(jié)

葡萄糖通過降低cAMP的含量而抑制基因表達

操縱子:由操縱基因以及相鄰的若干結構基因所組成的功能單位,其中結構基

因轉錄受操縱基因控制

乳糖操縱子模型——代謝型操縱子

lacZ:編碼B-半乳糖甘酶,它可以將乳糖水解為半乳糖和葡萄糖;

lacY:編碼半乳糖在透性酶,它能將乳糖運送透過細菌的細胞壁;

lacA:編碼硫代半乳糖甘乙酰轉移酶,進行乳糖代謝。

2.0區(qū)就是阻遏物結合區(qū)

3、lacP(啟動子區(qū)):從I基因結束:到mRNA轉錄起始位點止,有cAMP-CAP

結合區(qū)

?4.cAmp-CAP

?代謝激活蛋白(CAP)是cAmp的受體蛋白(CRP)

cAmp-CAP復合物,是lac操縱元的正調控因子

5.葡萄糖對lac操縱子的影響

??葡萄糖存在時腺昔酸環(huán)化酶活性降低,ATP無法轉變成cAMP,不能形成

CAP?cAMP復合蛋白,RNA酶無法結合在DNA上,結構基因不表達。

?代謝物阻遏效應

?研究認為葡萄糖的某些降解產物抑制lacmRNA的合成,這種效應稱之為代謝

物阻遏效應.

trp操縱子的阻遏調控機制一一合成代謝

trpPtrpOtrp£trpPtrpCtrpBtrpA

I

o

[-------1i-------1

TrpR(無活性)

圖1677TrpR^Trp激活后可阻遏trp操姒子的轉錄

?結構基因EDCBA

?色氨酸

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