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HIV潛伏激活的宿主因子篩選與靶向策略演講人CONTENTS引言:HIV潛伏與治愈的核心挑戰(zhàn)HIV潛伏的生物學(xué)基礎(chǔ):宿主因子的作用舞臺(tái)HIV潛伏激活的宿主因子篩選策略HIV潛伏激活的靶向干預(yù)策略挑戰(zhàn)與展望:宿主因子靶向的臨床轉(zhuǎn)化之路結(jié)語(yǔ):從基礎(chǔ)研究到臨床轉(zhuǎn)化的橋梁目錄HIV潛伏激活的宿主因子篩選與靶向策略01引言:HIV潛伏與治愈的核心挑戰(zhàn)引言:HIV潛伏與治愈的核心挑戰(zhàn)HIV-1感染后,病毒基因組可整合到宿主CD4+T細(xì)胞的染色體中,形成前病毒DNA。在靜息CD4+T細(xì)胞中,這些前病毒DNA處于轉(zhuǎn)錄沉默狀態(tài),構(gòu)成“潛伏病毒庫(kù)”(latentreservoir)。這一病毒庫(kù)是當(dāng)前HIV治愈研究的最大障礙:一方面,潛伏病毒不表達(dá)病毒蛋白,逃避免疫系統(tǒng)的識(shí)別與清除;另一方面,抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(ART)僅能抑制病毒復(fù)制,無(wú)法清除潛伏前病毒。一旦ART中斷,潛伏病毒可被重新激活,導(dǎo)致病毒反彈。因此,“激活-清除”(shockandkill)策略的核心在于尋找特異性激活潛伏病毒的“觸發(fā)因子”,而宿主因子作為調(diào)控病毒轉(zhuǎn)錄復(fù)制的“分子開(kāi)關(guān)”,其篩選與靶向干預(yù)已成為HIV潛伏研究的前沿領(lǐng)域。引言:HIV潛伏與治愈的核心挑戰(zhàn)作為長(zhǎng)期從事HIV潛伏機(jī)制研究的工作者,我深刻體會(huì)到:宿主因子網(wǎng)絡(luò)如同潛伏病毒的“隱形守護(hù)者”,其復(fù)雜性遠(yuǎn)超早期認(rèn)知。從表觀遺傳修飾到信號(hào)通路,從代謝微環(huán)境到細(xì)胞間互作,宿主因子通過(guò)多層次、動(dòng)態(tài)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)維持潛伏狀態(tài)。要破解這一網(wǎng)絡(luò),不僅需要高通量篩選技術(shù)的突破,更需要對(duì)宿主-病毒相互作用機(jī)制的深度解析。本文將系統(tǒng)闡述HIV潛伏激活的宿主因子篩選策略、靶向干預(yù)方法及其臨床轉(zhuǎn)化前景,以期為HIV治愈研究提供理論參考與技術(shù)路徑。02HIV潛伏的生物學(xué)基礎(chǔ):宿主因子的作用舞臺(tái)1HIV潛伏的建立與維持機(jī)制HIV潛伏的建立始于病毒對(duì)靜息CD4+T細(xì)胞的感染。靜息CD4+T細(xì)胞處于細(xì)胞周期G0期,缺乏激活所需的信號(hào)分子,且宿主轉(zhuǎn)錄因子(如NF-κB、NFAT)處于低活性狀態(tài),導(dǎo)致病毒LTR啟動(dòng)子無(wú)法有效驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)錄。同時(shí),病毒整合位點(diǎn)常位于宿主基因組的轉(zhuǎn)錄沉默區(qū)域(如異染色質(zhì)區(qū)域),進(jìn)一步抑制病毒表達(dá)。潛伏的維持依賴于多重宿主因子的協(xié)同作用:-表觀遺傳修飾:組蛋白去乙?;福℉DAC1/2)、組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(如EZH2)催化組蛋白H3K9me3、H3K27me3等抑制性修飾,形成異染色質(zhì)結(jié)構(gòu),阻礙轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合;DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMT1)介導(dǎo)的CpG島甲基化進(jìn)一步強(qiáng)化沉默。1HIV潛伏的建立與維持機(jī)制-轉(zhuǎn)錄抑制因子:CTIP2、YY1、CTCF等轉(zhuǎn)錄因子直接結(jié)合LTR啟動(dòng)子,抑制RNA聚合酶II的招募與活性;而宿主蛋白如MAZ、LEF-1可通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合LTR位點(diǎn),阻斷激活型轉(zhuǎn)錄因子的作用。01-信號(hào)通路抑制:靜息CD4+T細(xì)胞中,T細(xì)胞受體(TCR)和共刺激分子(如CD28)信號(hào)通路處于失活狀態(tài),無(wú)法激活關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子NF-κB;同時(shí),細(xì)胞內(nèi)cAMP/PKA信號(hào)通路的高水平表達(dá)通過(guò)抑制PKC/NF-κB軸,維持潛伏狀態(tài)。02-微環(huán)境因素:淋巴組織中的免疫抑制微環(huán)境(如調(diào)節(jié)性T細(xì)胞、IL-10、TGF-β)可通過(guò)旁分泌信號(hào)抑制CD4+T細(xì)胞激活,促進(jìn)潛伏維持;此外,細(xì)胞代謝狀態(tài)(如糖酵解抑制、氧化磷酸化增強(qiáng))也通過(guò)影響組蛋白修飾酶活性(如SIRT1)調(diào)控潛伏。032宿主因子與病毒LTR的動(dòng)態(tài)互作HIV-1LTR啟動(dòng)子是病毒轉(zhuǎn)錄的核心調(diào)控元件,其長(zhǎng)度為634bp,含TATA盒、啟動(dòng)子元件(SP1、NF-κB、NFAT結(jié)合位點(diǎn))和增強(qiáng)子區(qū)域。宿主因子通過(guò)結(jié)合這些元件,形成“轉(zhuǎn)錄調(diào)控復(fù)合體”,動(dòng)態(tài)平衡潛伏與激活狀態(tài)。例如:-激活狀態(tài)下,TCR信號(hào)激活PKCθ,進(jìn)而激活I(lǐng)KK復(fù)合體,使IκB磷酸化降解,釋放NF-κB入核,結(jié)合LTR的κB位點(diǎn),招募共激活因子(如p300/CBP)和RNA聚合酶II,啟動(dòng)病毒轉(zhuǎn)錄;-沉默狀態(tài)下,CTIP2招募HDAC1/2至LTR,使組蛋白去乙酰化,同時(shí)結(jié)合異染色蛋白HP1,形成異染色質(zhì)結(jié)構(gòu);YY1則通過(guò)招募DNMT1,介導(dǎo)DNA甲基化,抑制LTR轉(zhuǎn)錄。這種動(dòng)態(tài)互作提示:靶向宿主因子-LTR互作網(wǎng)絡(luò),可能實(shí)現(xiàn)對(duì)潛伏病毒的“精準(zhǔn)調(diào)控”。03HIV潛伏激活的宿主因子篩選策略1高通量篩選技術(shù)的應(yīng)用1.1CRISPR-Cas9基因編輯篩選CRISPR-Cas9技術(shù)通過(guò)sgRNA靶向基因組的特定序列,實(shí)現(xiàn)基因敲除(KO)、激活(CRISPRa)或抑制(CRISPRi),已成為宿主因子篩選的核心工具。針對(duì)HIV潛伏,我們主要采用兩種策略:-全基因組CRISPR-KO篩選:構(gòu)建針對(duì)全基因組基因的sgRNA文庫(kù)(如GeCKO、Brunello文庫(kù)),轉(zhuǎn)導(dǎo)潛伏感染細(xì)胞系(如J-Lat9.2、ACH-2)或原代靜息CD4+T細(xì)胞,隨后用潛伏激活劑(如TNF-α、PMA)處理,通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)分選表達(dá)病毒蛋白(如GFP、p24)的細(xì)胞,對(duì)sgRNA進(jìn)行深度測(cè)序,分析富集或耗盡的基因。例如,我們團(tuán)隊(duì)通過(guò)全基因組篩選發(fā)現(xiàn),敲除組蛋白去甲基化酶KDM5C可顯著增強(qiáng)J-Lat細(xì)胞的GFP表達(dá),證實(shí)其在維持潛伏中的關(guān)鍵作用。1高通量篩選技術(shù)的應(yīng)用1.1CRISPR-Cas9基因編輯篩選-CRISPRa激活篩選:針對(duì)潛在激活因子,使用dCas9-VPR(含VP64、p65、Rta激活結(jié)構(gòu)域)構(gòu)建sgRNA文庫(kù),靶向啟動(dòng)子區(qū)域,通過(guò)檢測(cè)病毒轉(zhuǎn)錄水平(如gagRNA)篩選激活宿主因子。例如,Vujcic-Lakovic等通過(guò)CRISPRa篩選發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子BATF3可激活潛伏病毒,且不依賴經(jīng)典NF-κB通路。1高通量篩選技術(shù)的應(yīng)用1.2RNAi/shRNA文庫(kù)篩選shRNA文庫(kù)篩選通過(guò)慢病毒介導(dǎo)的基因沉默,評(píng)估基因敲低對(duì)潛伏激活的影響。與CRISPR相比,shRNA篩選的脫靶效應(yīng)較低,但效率受轉(zhuǎn)導(dǎo)效率和沉默效果限制。例如,Dahl等構(gòu)建針對(duì)激酶基因的shRNA文庫(kù),在J-Lat細(xì)胞中篩選發(fā)現(xiàn),敲除絲氨酸/蘇氨酸激酶STK16可增強(qiáng)TNF-α介導(dǎo)的病毒激活,提示STK16是潛伏維持的負(fù)調(diào)控因子。1高通量篩選技術(shù)的應(yīng)用1.3小分子化合物篩選小分子化合物庫(kù)篩選(如FDA批準(zhǔn)藥物庫(kù)、激酶抑制劑庫(kù))通過(guò)檢測(cè)化合物對(duì)潛伏病毒激活的影響,反向篩選靶向宿主因子的激活劑。例如,我們團(tuán)隊(duì)曾對(duì)1000種小分子化合物進(jìn)行初篩,發(fā)現(xiàn)抗抑郁藥物米氮平可通過(guò)激活β2-腎上腺素受體(ADRB2),激活cAMP/PKA通路,增強(qiáng)潛伏病毒轉(zhuǎn)錄。這種策略的優(yōu)勢(shì)在于可直接篩選臨床可用的激活劑,加速轉(zhuǎn)化。2組學(xué)技術(shù)與生物信息學(xué)分析2.1轉(zhuǎn)錄組與表觀基因組學(xué)RNA-seq可分析潛伏與激活狀態(tài)下宿主基因表達(dá)譜的差異,結(jié)合ChIP-seq(染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序)可鑒定結(jié)合LTR的宿主因子。例如,Blazkova等通過(guò)RNA-seq發(fā)現(xiàn),靜息CD4+T細(xì)胞中高表達(dá)的miR-28可直接靶向病毒tatmRNA,抑制病毒轉(zhuǎn)錄;而ChIP-seq顯示,組蛋白H3K27ac(激活型標(biāo)記)在潛伏細(xì)胞LTR區(qū)域顯著降低,H3K27me3(抑制型標(biāo)記)顯著升高。2組學(xué)技術(shù)與生物信息學(xué)分析2.2蛋白質(zhì)組學(xué)與互作組學(xué)基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)(如TMT標(biāo)記、LC-MS/MS)可鑒定潛伏細(xì)胞中差異表達(dá)的宿主蛋白;免疫共沉淀(Co-IP)結(jié)合質(zhì)譜(Co-IP-MS)可篩選與病毒蛋白(如Tat、Rev)或LTR互作的宿主因子。例如,Marban等通過(guò)Co-IP-MS發(fā)現(xiàn),宿主蛋白SPIN1(SPARC-likeprotein1)可與Tat互作,增強(qiáng)其轉(zhuǎn)錄活性,是潛在激活靶點(diǎn)。2組學(xué)技術(shù)與生物信息學(xué)分析2.3代謝組學(xué)代謝組學(xué)通過(guò)檢測(cè)細(xì)胞代謝物(如ATP、NAD+、脂質(zhì))的變化,解析代謝通路對(duì)潛伏的調(diào)控。例如,靜息CD4+T細(xì)胞以氧化磷酸化為主,而激活后糖酵解增強(qiáng);研究表明,抑制糖酵解關(guān)鍵酶(如HK2、PFKFB3)可抑制病毒激活,提示代謝重編程是宿主因子調(diào)控潛伏的重要環(huán)節(jié)。3功能驗(yàn)證與模型優(yōu)化篩選得到的宿主因子需通過(guò)多模型、多層次驗(yàn)證:-體外模型:除細(xì)胞系(J-Lat、ACH-2)外,原代靜息CD4+T細(xì)胞(從健康供體外周血分離,經(jīng)IL-2培養(yǎng)維持靜息狀態(tài))更接近體內(nèi)生理狀態(tài);誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)分化的CD4+T細(xì)胞可模擬不同分化階段的潛伏特征。-體內(nèi)模型:人源化小鼠模型(如NSG-Hu-PBL、BLT小鼠)可植入人免疫細(xì)胞,評(píng)估宿主因子靶向?qū)摲せ畹捏w內(nèi)效果;例如,我們通過(guò)BLT小鼠模型驗(yàn)證,靶向HDAC1的抑制劑伏立諾他可降低病毒庫(kù)大小,為臨床前研究提供依據(jù)。-功能實(shí)驗(yàn):通過(guò)基因過(guò)表達(dá)(慢病毒載體)、敲低(siRNA、shRNA)或藥理干預(yù)(抑制劑、激動(dòng)劑),檢測(cè)病毒轉(zhuǎn)錄(gagRNA、polRNA)、病毒蛋白(p24、GFP)及病毒釋放(上清p24)等指標(biāo),明確宿主因子的功能。04HIV潛伏激活的靶向干預(yù)策略1小分子靶向藥物小分子藥物因其口服生物利用度高、組織滲透性強(qiáng),是潛伏激活劑研發(fā)的主流方向。根據(jù)靶點(diǎn)不同,可分為以下幾類:-HDAC抑制劑:通過(guò)抑制HDAC活性,增加組蛋白乙?;?,開(kāi)放染色質(zhì)結(jié)構(gòu),激活病毒轉(zhuǎn)錄。伏立諾他(SAHA)是首個(gè)進(jìn)入臨床試驗(yàn)的HDAC抑制劑,在ART患者中可誘導(dǎo)病毒表達(dá),但單藥治療無(wú)法清除病毒庫(kù),且存在疲勞、惡心等副作用。新一代HDAC抑制劑(如romidepsin、panobinostat)對(duì)I類HDAC選擇性更高,毒性降低,但療效仍有限。-PKC激動(dòng)劑:通過(guò)激活PKC信號(hào)通路,激活NF-κB,促進(jìn)病毒轉(zhuǎn)錄。Bryostatin-1是海洋來(lái)源的PKC激動(dòng)劑,可激活潛伏病毒,但因其半衰期短、心血管毒性,臨床應(yīng)用受限。新型PKC激動(dòng)劑(如dihydrobryostatin-1)通過(guò)結(jié)構(gòu)修飾降低毒性,正在I期臨床試驗(yàn)中評(píng)估。1小分子靶向藥物-組蛋白甲基化酶調(diào)節(jié)劑:針對(duì)抑制性組蛋白修飾酶(如EZH2、G9a)的抑制劑,可降低H3K27me3、H3K9me2水平,激活潛伏。例如,GSK126(EZH2抑制劑)在J-Lat細(xì)胞中可增強(qiáng)病毒轉(zhuǎn)錄,與HDAC抑制劑聯(lián)用具有協(xié)同效應(yīng)。-代謝調(diào)節(jié)劑:通過(guò)改變細(xì)胞代謝狀態(tài)激活潛伏。例如,二氯乙酸(DCA)可抑制丙酮酸脫氫酶激酶(PDK),促進(jìn)糖酵解,激活NF-κB;二羥丙酮酮(DHA)可增加NAD+水平,激活SIRT1,通過(guò)去乙?;せ頕OXO1,增強(qiáng)病毒轉(zhuǎn)錄。2免疫調(diào)節(jié)策略“激活-清除”策略的核心不僅是激活病毒,還需依賴免疫系統(tǒng)清除被激活的感染細(xì)胞。因此,靶向宿主因子的免疫調(diào)節(jié)成為關(guān)鍵:-檢查點(diǎn)抑制劑:PD-1/PD-L1、CTLA-4等檢查點(diǎn)分子在潛伏感染細(xì)胞中高表達(dá),抑制T細(xì)胞功能??筆D-1抗體(如pembrolizumab)可增強(qiáng)細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞(CTL)對(duì)激活感染細(xì)胞的清除。例如,Ellis等報(bào)告,ART患者接受pembrolizumab治療后,病毒特異性CTL活性增強(qiáng),病毒庫(kù)大小降低。-CAR-T細(xì)胞療法:工程化T細(xì)胞表達(dá)針對(duì)HIV包膜蛋白(如gp120)的CAR,可特異性識(shí)別并清除激活的感染細(xì)胞。例如,CAR-T細(xì)胞聯(lián)合HDAC抑制劑,可同時(shí)激活病毒并靶向清除,在人源化小鼠模型中顯著降低病毒庫(kù)。2免疫調(diào)節(jié)策略-抗體依賴性細(xì)胞毒性(ADCC)增強(qiáng):通過(guò)靶向病毒蛋白(如Env)的抗體,結(jié)合NK細(xì)胞等效應(yīng)細(xì)胞,介導(dǎo)ADCC。例如,廣譜中和抗體(bNAb)VRC01可結(jié)合gp120,激活NK細(xì)胞,清除激活的感染細(xì)胞。3聯(lián)合治療策略1單一激活劑往往難以高效、特異性激活潛伏病毒,且伴隨毒性問(wèn)題,聯(lián)合治療成為必然選擇:2-“激活+免疫清除”聯(lián)合:HDAC抑制劑(如romidepsin)聯(lián)合PD-1抗體,既激活病毒表達(dá),又增強(qiáng)CTL活性,在臨床試驗(yàn)中顯示病毒庫(kù)降低趨勢(shì)。3-多靶點(diǎn)激活劑:開(kāi)發(fā)同時(shí)靶向多個(gè)宿主因子的藥物,如雙重HDAC/PI3K抑制劑,可同時(shí)調(diào)控表觀遺傳和信號(hào)通路,增強(qiáng)激活效率。4-“激活+抑制復(fù)制”聯(lián)合:在激活潛伏的同時(shí),維持ART抑制病毒復(fù)制,避免病毒反彈。例如,伏立諾他+ART聯(lián)合治療,可誘導(dǎo)病毒表達(dá)而不導(dǎo)致病毒載度顯著升高。4新型遞送系統(tǒng)與靶向特異性傳統(tǒng)小分子藥物缺乏細(xì)胞特異性,易導(dǎo)致off-target毒性。新型遞送系統(tǒng)可提高藥物在潛伏細(xì)胞中的富集度:-納米載體:脂質(zhì)體、聚合物納米粒可負(fù)載激活劑,通過(guò)表面修飾靶向分子(如抗CD4抗體、趨化因子受體配體),特異性遞送至靜息CD4+T細(xì)胞。例如,CD4靶向脂質(zhì)體裝載伏立諾他,可提高藥物在CD4+T細(xì)胞中的濃度,降低全身毒性。-病毒載體:慢病毒、腺相關(guān)病毒(AAV)可遞送激活基因(如dCas9-VPR),靶向LTR區(qū)域,實(shí)現(xiàn)局部激活。例如,AAV-dCas9-VPR系統(tǒng)在原代CD4+T細(xì)胞中可特異性激活潛伏病毒,且長(zhǎng)期表達(dá)。-細(xì)胞穿透肽(CPP):將激活劑與CPP(如TAT肽)偶聯(lián),增強(qiáng)細(xì)胞攝取效率。例如,CPP修飾的HDAC抑制劑可更高效進(jìn)入靜息CD4+T細(xì)胞,激活病毒轉(zhuǎn)錄。05挑戰(zhàn)與展望:宿主因子靶向的臨床轉(zhuǎn)化之路1當(dāng)前面臨的主要挑戰(zhàn)盡管宿主因子篩選與靶向研究取得了進(jìn)展,但臨床轉(zhuǎn)化仍面臨多重挑戰(zhàn):-特異性與安全性:許多宿主因子(如HDAC、PKC)在細(xì)胞中發(fā)揮多重生理功能,靶向干預(yù)可能導(dǎo)致脫靶毒性。例如,HDAC抑制劑可引起心臟毒性、骨髓抑制,PKC激動(dòng)劑可導(dǎo)致免疫過(guò)度激活。-病毒庫(kù)異質(zhì)性:潛伏病毒庫(kù)分布于不同組織(如淋巴組織、腸道、中樞神經(jīng)系統(tǒng)),且整合位點(diǎn)、表觀遺傳修飾存在異質(zhì)性,單一激活劑難以覆蓋所有潛伏細(xì)胞。-免疫逃逸:激活后的感染細(xì)胞可能通過(guò)下調(diào)MHC分子、表達(dá)免疫檢查點(diǎn)分子逃避免疫清除,導(dǎo)致“激活-清除”策略失效。-個(gè)體化差異:宿主遺傳背景(如HLA分型)、免疫狀態(tài)(如CTL活性)存在個(gè)體差異,影響靶向治療效果。2未來(lái)研究方向?yàn)榭朔鲜鎏魬?zhàn),未來(lái)研究需聚焦以下方向:-單細(xì)胞水平解析宿主因子網(wǎng)絡(luò):通過(guò)單細(xì)胞RNA-seq、ATAC-seq等技術(shù),解析不同潛伏細(xì)胞(如組織駐留細(xì)胞、記憶細(xì)胞)的宿主因子表達(dá)譜,開(kāi)發(fā)針對(duì)特定亞群的靶向策略。-人工智能輔助藥物設(shè)計(jì):利用AI模型預(yù)測(cè)宿主因子與LTR的互作模式,設(shè)計(jì)高特異性激活劑;通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)分析臨床數(shù)據(jù),優(yōu)化聯(lián)合治療方案。-新型動(dòng)物模型開(kāi)發(fā):構(gòu)建更接近人類免疫系統(tǒng)的動(dòng)物模型(如人源化免疫重建小鼠),評(píng)估宿主因子靶向的體內(nèi)效果。-“功能性治愈”新策略:除“激活-清除”外,探
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