關(guān)于某某人造蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)服務(wù)合同一、合同雙方基本信息甲方（委托方）：名稱：某某生物科技有限公司地址：中國(guó)XX省XX市XX區(qū)XX路XX號(hào)法定代表人：XXX聯(lián)系人：XXX聯(lián)系方式：電話XXX-XXXXXXXX，電子郵箱XXX@乙方（服務(wù)提供方）：名稱：某某蛋白質(zhì)工程研究中心地址：中國(guó)XX省XX市XX區(qū)XX路XX號(hào)法定代表人：XXX聯(lián)系人：XXX聯(lián)系方式：電話XXX-XXXXXXXX，電子郵箱XXX@二、服務(wù)內(nèi)容與技術(shù)要求（一）服務(wù)范圍蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)乙方需基于甲方提供的目標(biāo)蛋白質(zhì)氨基酸序列，利用AlphaFold、Rosetta等主流生物信息學(xué)工具，完成以下任務(wù)：生成3套以上候選三維結(jié)構(gòu)模型；提供模型質(zhì)量評(píng)估報(bào)告（包括置信度分?jǐn)?shù)、Ramachandran圖分析等）；針對(duì)甲方指定的功能位點(diǎn)（如活性中心、結(jié)合界面）進(jìn)行結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)優(yōu)化。輔助分析服務(wù)蛋白質(zhì)-配體對(duì)接模擬：針對(duì)甲方提供的小分子化合物，預(yù)測(cè)其與目標(biāo)蛋白的結(jié)合模式及親和力；結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性分析：通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬評(píng)估預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)在生理?xiàng)l件下的穩(wěn)定性；突變效應(yīng)預(yù)測(cè)：對(duì)甲方指定的突變位點(diǎn)（不超過(guò)10個(gè)）進(jìn)行結(jié)構(gòu)影響分析，提供功能改變的可能性評(píng)估。（二）技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)預(yù)測(cè)模型的全局模型質(zhì)量評(píng)估分?jǐn)?shù)（如pLDDT）需達(dá)到90分以上（滿分100分），核心功能區(qū)域局部分?jǐn)?shù)不低于95分；分子動(dòng)力學(xué)模擬時(shí)長(zhǎng)不少于100ns，結(jié)果需包含RMSD、RMSF等關(guān)鍵參數(shù)的統(tǒng)計(jì)分析；所有分析報(bào)告需提供原始數(shù)據(jù)、可視化圖表及標(biāo)準(zhǔn)化解讀說(shuō)明，格式為PDF及可編輯的Excel文件。（三）數(shù)據(jù)交付交付內(nèi)容：三維結(jié)構(gòu)模型文件（PDB格式）；質(zhì)量評(píng)估報(bào)告及原始數(shù)據(jù)分析結(jié)果；技術(shù)服務(wù)過(guò)程中產(chǎn)生的中間數(shù)據(jù)（如序列比對(duì)結(jié)果、模擬參數(shù)設(shè)置文件）；乙方使用的軟件版本及參數(shù)配置說(shuō)明。交付方式：通過(guò)加密云盤(pán)傳輸及紙質(zhì)報(bào)告郵寄（一式兩份）；交付時(shí)間：自甲方提供完整數(shù)據(jù)及預(yù)付款到賬后60個(gè)工作日內(nèi)完成首次交付，如需修訂，乙方應(yīng)在甲方反饋意見(jiàn)后15個(gè)工作日內(nèi)完成二次交付。三、服務(wù)期限與驗(yàn)收（一）服務(wù)期限本合同服務(wù)期自雙方簽字蓋章且甲方預(yù)付款到賬之日起計(jì)算，總周期為90個(gè)自然日。其中：數(shù)據(jù)準(zhǔn)備與模型構(gòu)建階段：1-30日；質(zhì)量評(píng)估與優(yōu)化階段：31-50日；輔助分析與報(bào)告撰寫(xiě)階段：51-60日；驗(yàn)收與修訂階段：61-90日。（二）驗(yàn)收標(biāo)準(zhǔn)甲方在收到乙方交付成果后15個(gè)工作日內(nèi)完成驗(yàn)收，逾期未提出書(shū)面異議視為默認(rèn)驗(yàn)收通過(guò)；驗(yàn)收指標(biāo)包括：交付文件完整性（需涵蓋合同約定的全部?jī)?nèi)容）；技術(shù)參數(shù)達(dá)標(biāo)率（如模型質(zhì)量分?jǐn)?shù)、模擬時(shí)長(zhǎng)等）；報(bào)告邏輯性與可讀性（需滿足甲方科研團(tuán)隊(duì)獨(dú)立解讀需求）。若驗(yàn)收未通過(guò)，甲方需向乙方出具書(shū)面修改意見(jiàn)，明確具體問(wèn)題及修訂要求，乙方應(yīng)在15個(gè)工作日內(nèi)完成優(yōu)化并重新提交驗(yàn)收。四、費(fèi)用及支付方式（一）服務(wù)費(fèi)用本合同總費(fèi)用為人民幣XX萬(wàn)元（大寫(xiě)：XX元整），具體構(gòu)成如下：|服務(wù)項(xiàng)目|金額（萬(wàn)元）|備注||------------------------|--------------|----------------------------||三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與優(yōu)化|XX|含3套模型及質(zhì)量評(píng)估||分子動(dòng)力學(xué)模擬|XX|100ns模擬及數(shù)據(jù)分析||突變效應(yīng)預(yù)測(cè)|XX|限10個(gè)突變位點(diǎn)||技術(shù)報(bào)告撰寫(xiě)與可視化|XX|含原始數(shù)據(jù)與圖表||合計(jì)|XX|不含稅費(fèi)，稅費(fèi)按實(shí)際發(fā)生計(jì)算|（二）支付方式預(yù)付款：合同簽訂后7個(gè)工作日內(nèi)，甲方向乙方支付總費(fèi)用的40%（即人民幣XX萬(wàn)元）；中期款：乙方完成三維結(jié)構(gòu)模型初稿并經(jīng)甲方確認(rèn)后7個(gè)工作日內(nèi)，支付總費(fèi)用的30%（即人民幣XX萬(wàn)元）；尾款：項(xiàng)目驗(yàn)收通過(guò)后15個(gè)工作日內(nèi)，支付剩余30%（即人民幣XX萬(wàn)元）。乙方收款賬戶信息：開(kāi)戶名：某某蛋白質(zhì)工程研究中心開(kāi)戶行：中國(guó)XX銀行XX支行賬號(hào)：XXXXXXXXXXXXXXXXXXX五、知識(shí)產(chǎn)權(quán)與數(shù)據(jù)歸屬（一）知識(shí)產(chǎn)權(quán)歸屬甲方權(quán)利：甲方提供的原始氨基酸序列、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)等基礎(chǔ)材料的知識(shí)產(chǎn)權(quán)歸甲方所有；基于甲方數(shù)據(jù)產(chǎn)生的預(yù)測(cè)結(jié)果、分析報(bào)告等衍生成果，甲方享有獨(dú)占使用權(quán)，可用于科研論文發(fā)表、專利申請(qǐng)等，但需注明乙方技術(shù)支持（格式為“本研究中蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)服務(wù)由某某蛋白質(zhì)工程研究中心提供”）。乙方權(quán)利：乙方保留服務(wù)過(guò)程中使用的算法、軟件工具及標(biāo)準(zhǔn)化流程的知識(shí)產(chǎn)權(quán)；未經(jīng)甲方書(shū)面許可，乙方不得將甲方數(shù)據(jù)或項(xiàng)目成果用于其他商業(yè)或科研目的，但可在匿名化處理后用于技術(shù)方法學(xué)改進(jìn)。（二）數(shù)據(jù)使用限制乙方僅可在本合同約定范圍內(nèi)使用甲方提供的數(shù)據(jù)，不得向第三方泄露或轉(zhuǎn)讓；甲方如需將預(yù)測(cè)結(jié)果用于商業(yè)開(kāi)發(fā)（如藥物研發(fā)、試劑盒生產(chǎn)等），需另行與乙方簽訂知識(shí)產(chǎn)權(quán)許可協(xié)議，具體費(fèi)用及權(quán)限另行協(xié)商。六、保密條款保密范圍：包括但不限于甲方的氨基酸序列、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、未公開(kāi)的研究成果，乙方的技術(shù)流程、算法參數(shù)、收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)等；保密義務(wù)：雙方均需對(duì)合作過(guò)程中獲取的對(duì)方商業(yè)秘密和技術(shù)秘密?chē)?yán)格保密，未經(jīng)對(duì)方書(shū)面同意不得向任何第三方披露；保密期限：本條款自合同簽訂之日起生效，有效期為合同終止后5年；例外情形：因法律法規(guī)要求、司法機(jī)關(guān)或行政主管部門(mén)強(qiáng)制要求披露的信息，披露方應(yīng)提前通知對(duì)方，并配合采取必要的保密措施。七、違約責(zé)任（一）甲方違約若甲方未按時(shí)支付款項(xiàng)，每逾期1日，需向乙方支付逾期金額0.05%的違約金，累計(jì)違約金不超過(guò)合同總金額的5%；若甲方提供的數(shù)據(jù)存在虛假或不完整，導(dǎo)致乙方服務(wù)無(wú)法正常進(jìn)行，乙方有權(quán)暫停服務(wù)，且已支付費(fèi)用不予退還，甲方需承擔(dān)由此造成的額外成本。（二）乙方違約若乙方未按時(shí)交付成果，每逾期1日，需向甲方支付合同總金額0.05%的違約金，逾期超過(guò)30日的，甲方有權(quán)解除合同并要求乙方退還已支付費(fèi)用；若乙方交付的成果未達(dá)到合同約定的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)，經(jīng)2次修訂后仍無(wú)法通過(guò)驗(yàn)收，甲方有權(quán)要求乙方退還50%已支付費(fèi)用，并保留追究其他損失的權(quán)利；若乙方違反保密義務(wù)，需向甲方支付合同總金額20%的賠償金，并承擔(dān)由此造成的直接經(jīng)濟(jì)損失。八、爭(zhēng)議解決與其他（一）爭(zhēng)議解決雙方在合同履行過(guò)程中發(fā)生的爭(zhēng)議，應(yīng)首先通過(guò)友好協(xié)商解決；協(xié)商不成的，任何一方均有權(quán)向合同簽訂地（XX市XX區(qū)）有管轄權(quán)的人民法院提起訴訟；爭(zhēng)議解決期間，除爭(zhēng)議事項(xiàng)外，雙方應(yīng)繼續(xù)履行合同其他條款。（二）其他條款不可抗力：因地震、戰(zhàn)爭(zhēng)、政策調(diào)整等不可預(yù)見(jiàn)、不能避免的客觀事件導(dǎo)致合同無(wú)法履行的，雙方互不承擔(dān)責(zé)任，應(yīng)及時(shí)通知對(duì)方并協(xié)商后續(xù)處理方案；合同變更：任何對(duì)合同條款的修改需經(jīng)雙方書(shū)面確認(rèn)并簽署補(bǔ)充協(xié)議，補(bǔ)充協(xié)議與本合同具有同等法律效力；合同份數(shù)：本合同一式肆份，甲乙雙方各執(zhí)貳份，具有同等法律效力，自雙