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實驗二原核生物基因組DNA的制備

一、實驗?zāi)康恼莆諒募?xì)菌中提取基因組DNA的基本原理熟悉利用試劑盒提取細(xì)菌DNA的技術(shù)流程提取卡介苗BCG基因組DNA二、實驗原理①裂解細(xì)胞②除去蛋白質(zhì)③析出DNACTAB(cetyltriethylammoniumbromide,十六烷基三乙基溴化銨)是一種去污劑,它能與核酸形成復(fù)合物,這些復(fù)合物在高鹽溶液(0.7mol/lNaCl)中可溶并且穩(wěn)定存在。此時的高鹽溶液中除含有CTAB-核酸復(fù)合物外,還含有大量的多糖和蛋白。核酸提純(1)用氯仿先對此高鹽溶液進(jìn)行抽提,大量蛋白和多糖等被從溶液中抽提沉淀出來,而核酸仍留在溶液中;接著可用乙醇或異丙醇將核酸從溶液中沉淀出來,然后用水或TE緩沖液等將核酸溶解。(2)降低溶液中鹽的濃度(0.3mol/lNaCl),CTAB與核酸的復(fù)合物就會因溶解度降低而沉淀出來,而大部分的蛋白及多糖仍溶于溶液中;通過離心將CTAB-核酸沉淀下來,然后溶解于高鹽溶液中。三、實驗材料卡介苗BCG細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(離心柱型)DP302水浴鍋、離心機(jī)、移液器試劑盒采用可以特異性結(jié)合DNA的離心吸附柱和獨(dú)特的緩沖液系統(tǒng)提取細(xì)菌基因組DNA。離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料為特有新型材料,可高效、專一吸附DNA,最大限度去除雜質(zhì)蛋白及細(xì)胞中其他有機(jī)化合物。回收的DNA可適用于各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR、文庫構(gòu)建等實驗。四、注意事項實驗中所有的廢棄物均要高壓滅菌。五、實驗步驟(1)取細(xì)菌培養(yǎng)液1-5ml,10,000rpm,1min,盡量吸凈上清。(2)沉淀中加入180μl溶菌酶溶液(20mg/ml),37℃,60min。(3)加入20μl蛋白酶K溶液,混勻。(4)加入220μl緩沖液GB,振蕩15s,70℃,10min,溶液變澄清。瞬時離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。(5)加入220μl無水乙醇,充分振蕩15s,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀,瞬時離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。(6)將上一步所得溶液和絮狀沉淀都加入一個吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm,30s,棄廢液,將吸附柱CB3放入收集管中。(7)向吸附柱CB3中加入500μl緩沖液GD,12,000rpm,30s,棄廢液,將吸附柱CB3放入收集管中。(8)向吸附柱CB3中加入600μl漂洗液PW,12,000rpm,30s,棄廢液,將吸附柱CB3放入收集管中。(9)重復(fù)步驟⑧。(10)將吸附柱CB3放回收集管中,12,000rpm,2min,棄廢液。將吸附柱CB3室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。(11)吸附柱CB3轉(zhuǎn)入一個干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-200μl洗脫緩沖液TE,室溫放置2-5min,12,000rpm,2min,將溶液收集到離心管中。(為增加基因組DNA的得率,可將離心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室溫放置2min,12,000rpm,2min)五、結(jié)果檢測紫外吸收法檢測所提取基因組DNA的濃度與純度;取少量DNA溶液在

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