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文檔簡介
2026年生物信息學(xué)與基因數(shù)據(jù)分析初階測試題一、單選題(共10題,每題2分,合計20分)說明:下列每題只有一個最符合題意的選項。1.中國在《“健康中國2030”規(guī)劃綱要》中提出,到2030年要實現(xiàn)基因測序成本降至每GB______元以下。A.1000B.500C.100D.502.下列哪個工具主要用于對二代測序(NGS)數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制?A.BLASTB.FastQCC.BowtieD.GATK3.在基因表達(dá)譜分析中,差異表達(dá)基因篩選時,通常使用哪些方法校正P值?A.Benjamini-HochbergB.BonferroniC.BothAandBD.Noneoftheabove4.中國學(xué)者在《NatureBiotechnology》發(fā)表的研究中,利用AlphaFold2模型預(yù)測了超過______萬個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。A.100萬B.500萬C.1000萬D.1億5.以下哪個數(shù)據(jù)庫主要存儲中國的家系遺傳病數(shù)據(jù)?A.dbSNPB.1000GenomesProjectC.中國遺傳病基因數(shù)據(jù)庫(CGD)D.Ensembl6.在RNA-seq數(shù)據(jù)分析中,"rRNA去除"通常使用哪個工具?A.HISAT2B.TrimmomaticC.STARD.Samtools7.中國國家基因庫(NGDC)目前存儲的基因組數(shù)據(jù)量已達(dá)到______TB級別。A.1B.10C.100D.10008.以下哪個算法用于序列比對中的局部對齊?A.Smith-WatermanB.Needleman-WunschC.LanczosD.HMMER9.在中國,"精準(zhǔn)醫(yī)療"戰(zhàn)略中,基因檢測主要應(yīng)用于哪些領(lǐng)域?(多選)A.腫瘤靶向治療B.遺傳病診斷C.藥物代謝D.Alloftheabove10.以下哪個軟件包用于整合多組學(xué)數(shù)據(jù)?A.R語言(Bioconductor)B.Python(Scikit-learn)C.MATLABD.Cytoscape二、多選題(共5題,每題3分,合計15分)說明:下列每題有多個符合題意的選項,請全部選出。1.中國科學(xué)家在《CellResearch》發(fā)表的研究中,利用單細(xì)胞RNA測序技術(shù)解析了哪些生物過程?A.腫瘤微環(huán)境B.胚胎發(fā)育C.免疫應(yīng)答D.神經(jīng)退行性疾病2.在基因注釋中,以下哪些數(shù)據(jù)庫提供了人類基因組注釋信息?A.GenBankB.EnsemblC.RefSeqD.UniProt3.中國華大基因推出的"天蓬計劃"旨在推動______。A.基因測序技術(shù)普及B.基因數(shù)據(jù)共享C.遺傳病防控D.生物信息學(xué)人才培養(yǎng)4.在WGS數(shù)據(jù)分析中,以下哪些步驟屬于變異檢測流程?A.質(zhì)量控制(QC)B.變異識別C.變異注釋D.統(tǒng)計過濾5.中國的"十四五"規(guī)劃中,生物信息學(xué)發(fā)展重點包括______。A.人工智能與基因數(shù)據(jù)的結(jié)合B.云計算平臺建設(shè)C.倫理法規(guī)完善D.國際合作項目三、判斷題(共10題,每題1分,合計10分)說明:請判斷下列說法的正誤。1.中國的"人類基因組計劃"(HGP)于2001年正式啟動。2.RNA-seq數(shù)據(jù)需要進(jìn)行"rRNA去除"以避免假陽性。3.BLAST主要用于基因序列的同源性搜索。4.中國的基因數(shù)據(jù)庫(CNGB)與國際數(shù)據(jù)庫(NCBI)完全獨立。5.腫瘤基因組測序通常使用全外顯子組測序(WES)。6.變異注釋工具如VEP可以識別基因的功能影響。7.中國的基因測序成本已接近國際領(lǐng)先水平。8.單細(xì)胞測序技術(shù)可以解析細(xì)胞異質(zhì)性。9.基因表達(dá)譜分析中,F(xiàn)oldChange是衡量差異的重要指標(biāo)。10.基因數(shù)據(jù)分析的倫理問題主要涉及隱私保護(hù)。四、簡答題(共5題,每題5分,合計25分)說明:請簡述下列問題,字?jǐn)?shù)不超過200字。1.簡述中國生物信息學(xué)發(fā)展的重要里程碑。2.解釋什么是"基因注釋",并列舉三個常用數(shù)據(jù)庫。3.RNA-seq數(shù)據(jù)分析的基本流程包括哪些步驟?4.中國在基因隱私保護(hù)方面有哪些法規(guī)?5.比較WGS和WES在腫瘤基因組分析中的優(yōu)缺點。五、計算題(共3題,每題10分,合計30分)說明:請根據(jù)題目要求進(jìn)行計算或分析。1.某研究組對1000個樣本進(jìn)行RNA-seq,發(fā)現(xiàn)A基因在腫瘤組中表達(dá)量比正常組高5倍(FoldChange=5),經(jīng)統(tǒng)計校正后P值=0.01。問該基因是否顯著差異表達(dá)?(假設(shè)閾值P<0.05)2.某WGS數(shù)據(jù)集包含3GB原始數(shù)據(jù),經(jīng)過質(zhì)控和比對后,剩余2.5GB有效數(shù)據(jù)。若檢測到1000個SNP,計算其平均頻率是多少?3.中國某醫(yī)院進(jìn)行遺傳病篩查,采用基因芯片技術(shù)檢測10個基因的突變。若芯片靈敏度為90%,特異性為95%,樣本中實際存在2個基因突變,計算假陽性和假陰性率。六、論述題(1題,15分)說明:請結(jié)合中國生物信息學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀,論述基因數(shù)據(jù)分析在臨床應(yīng)用中的挑戰(zhàn)與機遇。答案與解析一、單選題答案1.C(中國提出的目標(biāo)是每GB100元以下)2.B(FastQC用于測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估)3.C(Benjamini-Hochberg用于多重檢驗校正)4.C(AlphaFold2預(yù)測了1000萬個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu))5.C(中國遺傳病基因數(shù)據(jù)庫主要收錄國內(nèi)數(shù)據(jù))6.B(Trimmomatic用于rRNA去除)7.B(NGDC存儲量已達(dá)10TB級別)8.A(Smith-Waterman用于局部對齊)9.D(涵蓋所有領(lǐng)域)10.A(Bioconductor用于多組學(xué)整合)二、多選題答案1.ABCD(研究涵蓋腫瘤、發(fā)育、免疫、神經(jīng)等)2.ABC(GenBank、Ensembl、RefSeq提供注釋)3.ABCD(涵蓋技術(shù)普及、數(shù)據(jù)共享、防控、人才培養(yǎng))4.ABCD(包含QC、變異識別、注釋、過濾)5.ABCD(涵蓋AI結(jié)合、云平臺、倫理法規(guī)、國際合作)三、判斷題答案1.×(中國HGP于2007年啟動)2.√(rRNA去除可減少噪聲)3.√(BLAST用于序列同源性搜索)4.×(CNGB與NCBI有合作)5.√(WES覆蓋外顯子區(qū),適合腫瘤分析)6.√(VEP可預(yù)測變異功能影響)7.×(中國測序成本仍高于國際)8.√(單細(xì)胞測序解析細(xì)胞異質(zhì)性)9.√(FoldChange是差異表達(dá)指標(biāo))10.√(隱私保護(hù)是核心倫理問題)四、簡答題答案1.中國生物信息學(xué)發(fā)展里程碑:-2001年《人類基因組計劃》啟動;-2018年國家基因庫(NGDC)成立;-2020年AlphaFold2模型發(fā)布;-2025年"精準(zhǔn)醫(yī)療"全面推廣。2.基因注釋:指將基因組序列映射到已知基因或功能元件的過程。常用數(shù)據(jù)庫:-Ensembl(人類基因組注釋);-RefSeq(NCBI基因注釋);-UniProt(蛋白質(zhì)功能信息)。3.RNA-seq分析流程:-質(zhì)量控制(FastQC);-序列比對(STAR);-去除rRNA(Trimmomatic);-差異表達(dá)分析(DESeq2);-功能注釋(GO分析)。4.中國基因隱私法規(guī):-《個人信息保護(hù)法》禁止基因數(shù)據(jù)濫用;-《人類遺傳資源管理條例》限制出境;-醫(yī)院需簽署知情同意書。5.WGSvsWES:-WGS覆蓋全基因組,成本高,適合復(fù)雜疾病;-WES覆蓋外顯子,成本低,適合孟德爾病。五、計算題答案1.腫瘤組A基因顯著表達(dá):-P值=0.01<0.05,故顯著差異表達(dá)。2.SNP平均頻率:-總SNP數(shù)/有效數(shù)據(jù)量=1000/2.5GB≈0.4%(假設(shè)1GB=10^9堿基)。3.假陽性/假陰性率:-假陽性:10×(1-0.95)×(1-0.9)=0.05;-假陰性:2×0.1×0
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