腫瘤代謝異質(zhì)性單細(xì)胞解析技術(shù)_第1頁(yè)
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202X演講人2026-01-12腫瘤代謝異質(zhì)性單細(xì)胞解析技術(shù)CONTENTS腫瘤代謝異質(zhì)性單細(xì)胞解析技術(shù)腫瘤代謝異質(zhì)性的概念解析與生物學(xué)意義單細(xì)胞解析技術(shù):破解腫瘤代謝異質(zhì)性的核心工具單細(xì)胞解析技術(shù)在腫瘤研究中的關(guān)鍵應(yīng)用當(dāng)前挑戰(zhàn)與未來(lái)發(fā)展方向總結(jié)與展望目錄01PARTONE腫瘤代謝異質(zhì)性單細(xì)胞解析技術(shù)腫瘤代謝異質(zhì)性單細(xì)胞解析技術(shù)腫瘤代謝異質(zhì)性是腫瘤研究領(lǐng)域的關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題,也是制約精準(zhǔn)診療的核心瓶頸之一。作為長(zhǎng)期從事腫瘤代謝機(jī)制研究的科研工作者,我深刻體會(huì)到:傳統(tǒng)基于腫瘤組織bulk水平的代謝分析,如同用“平均視角”觀察一個(gè)由無(wú)數(shù)“個(gè)性獨(dú)特”細(xì)胞組成的復(fù)雜社會(huì),必然掩蓋細(xì)胞間的代謝差異,難以揭示腫瘤進(jìn)展、轉(zhuǎn)移和耐藥的深層機(jī)制。直到單細(xì)胞解析技術(shù)的出現(xiàn),我們才真正擁有了“逐細(xì)胞解碼”腫瘤代謝異質(zhì)性的鑰匙。今天,我將結(jié)合自身研究經(jīng)歷,系統(tǒng)闡述腫瘤代謝異質(zhì)性單細(xì)胞解析技術(shù)的理論基礎(chǔ)、技術(shù)體系、應(yīng)用突破及未來(lái)挑戰(zhàn),與各位共同探討這一領(lǐng)域的科學(xué)前沿與臨床轉(zhuǎn)化潛力。02PARTONE腫瘤代謝異質(zhì)性的概念解析與生物學(xué)意義代謝異質(zhì)性的定義與維度腫瘤代謝異質(zhì)性指在同一個(gè)腫瘤組織中,不同腫瘤細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞與微環(huán)境細(xì)胞(如成纖維細(xì)胞、免疫細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞)之間,以及同一細(xì)胞在不同時(shí)空狀態(tài)下(如原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶、治療前與治療后)存在的代謝通路活性、代謝物譜及代謝需求的差異。這種異質(zhì)性具有三個(gè)核心維度:122.時(shí)間異質(zhì)性:腫瘤從發(fā)生、發(fā)展到轉(zhuǎn)移的動(dòng)態(tài)過(guò)程中,代謝表型可發(fā)生適應(yīng)性改變。我們?cè)诟伟┭芯恐邪l(fā)現(xiàn),早期腫瘤細(xì)胞以脂質(zhì)合成為主,而轉(zhuǎn)移灶細(xì)胞則更傾向于谷氨酰胺代謝,這種時(shí)間依賴性的代謝重編程是轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)力。31.空間異質(zhì)性:同一腫瘤的不同區(qū)域(如腫瘤中心、邊緣、浸潤(rùn)前沿)因氧濃度、營(yíng)養(yǎng)供應(yīng)、細(xì)胞密度差異,導(dǎo)致代謝表型不同。例如,在缺氧的中心區(qū)域,細(xì)胞可能依賴糖酵解供能;而在氧供充足的邊緣區(qū)域,氧化磷酸化(OXPHOS)可能占主導(dǎo)。代謝異質(zhì)性的定義與維度3.細(xì)胞亞群異質(zhì)性:腫瘤內(nèi)部存在細(xì)胞亞群分化(如癌癥干細(xì)胞、分化態(tài)腫瘤細(xì)胞)和細(xì)胞間互作(如腫瘤細(xì)胞與免疫細(xì)胞的代謝競(jìng)爭(zhēng)),導(dǎo)致不同亞群的代謝需求顯著差異。例如,乳腺癌干細(xì)胞常表現(xiàn)為線粒體代謝活躍,而分化態(tài)細(xì)胞則依賴糖酵解。代謝異質(zhì)性的生物學(xué)意義代謝異質(zhì)性并非隨機(jī)現(xiàn)象,而是腫瘤適應(yīng)微環(huán)境壓力、驅(qū)動(dòng)惡性進(jìn)展的“主動(dòng)選擇”,其生物學(xué)意義主要體現(xiàn)在三個(gè)方面:1.促進(jìn)腫瘤進(jìn)化與適應(yīng)性生存:代謝異質(zhì)性為腫瘤提供了“代謝后備庫(kù)”,當(dāng)環(huán)境壓力(如化療、缺氧)出現(xiàn)時(shí),特定代謝亞群可憑借代謝優(yōu)勢(shì)存活下來(lái),導(dǎo)致治療耐藥。我們?cè)诜伟┭芯恐杏^察到,EGFR-TKI耐藥細(xì)胞亞群通過(guò)上調(diào)脂肪酸氧化(FAO)抵抗藥物誘導(dǎo)的凋亡,而抑制FAO可逆轉(zhuǎn)耐藥。2.塑造腫瘤免疫微環(huán)境:代謝物可直接調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞功能。例如,腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生的乳酸會(huì)抑制T細(xì)胞浸潤(rùn),而腺苷則通過(guò)激活A(yù)2A受體促進(jìn)T細(xì)胞耗竭;相反,部分代謝亞群通過(guò)分泌犬尿氨酸等代謝物,招募調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg)形成免疫抑制微環(huán)境。代謝異質(zhì)性的生物學(xué)意義3.驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)移與播散:轉(zhuǎn)移前細(xì)胞的代謝表型常發(fā)生“預(yù)適應(yīng)”,如增強(qiáng)糖酵解以支持能量需求,上調(diào)谷氨酰胺代謝以維持氧化還原平衡。在結(jié)肝轉(zhuǎn)移模型中,我們發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)移潛能高的細(xì)胞亞群高表達(dá)丙酮酸激酶M2(PKM2),通過(guò)促進(jìn)磷酸戊糖途徑(PPP)生成NADPH,抵抗轉(zhuǎn)移過(guò)程中的氧化應(yīng)激。03PARTONE單細(xì)胞解析技術(shù):破解腫瘤代謝異質(zhì)性的核心工具傳統(tǒng)代謝分析技術(shù)的局限在單細(xì)胞技術(shù)普及前,腫瘤代謝研究主要依賴bulk分析方法,如氣相色譜-質(zhì)譜(GC-MS)、液相色譜-質(zhì)譜(LC-MS)檢測(cè)組織整體代謝物水平,或Seahorse儀檢測(cè)細(xì)胞群體代謝通量。這些方法存在三大局限:1.“平均效應(yīng)”掩蓋異質(zhì)性:bulk分析將數(shù)百萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的代謝信號(hào)平均化,無(wú)法識(shí)別稀有但關(guān)鍵的代謝亞群(如耐藥前體細(xì)胞)。例如,bulk分析顯示腫瘤組織整體糖酵解活性升高,但無(wú)法區(qū)分哪些細(xì)胞亞群在執(zhí)行糖酵解,哪些亞群在利用乳酸。2.空間信息丟失:傳統(tǒng)方法無(wú)法保留代謝物的空間分布信息,難以解析腫瘤代謝微環(huán)境的區(qū)域差異。3.動(dòng)態(tài)過(guò)程不敏感:bulk分析的采樣量需求大,難以捕捉腫瘤代謝的瞬時(shí)變化(如治療后的快速代謝重編程)。單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系單細(xì)胞解析技術(shù)通過(guò)在單個(gè)細(xì)胞水平檢測(cè)代謝物、代謝酶活性及代謝通量,實(shí)現(xiàn)了對(duì)腫瘤代謝異質(zhì)性的“精準(zhǔn)成像”。目前,該領(lǐng)域已形成“分離-檢測(cè)-分析”三位一體的技術(shù)體系:?jiǎn)渭?xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系單細(xì)胞分離技術(shù):保證樣本代表性與細(xì)胞活性單細(xì)胞分離是技術(shù)前提,需滿足“高純度、高活性、低損傷”三大要求。主流技術(shù)包括:-流式細(xì)胞術(shù)(FACS):基于細(xì)胞大小、granularity或代謝熒光探針(如MitoTracker、CellROX)分選單個(gè)細(xì)胞,通量可達(dá)每秒數(shù)千細(xì)胞,適用于代謝表型已知的細(xì)胞亞群分選。我們?cè)诤谏亓鲅芯恐校肕itoGreen染色分選線粒體活性高的細(xì)胞亞群,發(fā)現(xiàn)其與免疫逃逸顯著相關(guān)。-微流控技術(shù):通過(guò)芯片上的微通道、微室結(jié)構(gòu)實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞捕獲,如FluidigmC1、10xGenomicsChromium系統(tǒng),可結(jié)合后續(xù)轉(zhuǎn)錄組或代謝組檢測(cè),通量可達(dá)數(shù)萬(wàn)細(xì)胞,適用于大規(guī)模單細(xì)胞圖譜繪制。-激光捕獲顯微切割(LCM):保留組織空間信息,直接從冷凍或石蠟切片中分離單細(xì)胞或微小區(qū)域,適用于原位代謝異質(zhì)性研究。在肝癌研究中,我們通過(guò)LCM分離癌旁、癌內(nèi)及包膜下細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)包膜下細(xì)胞亞群高表達(dá)膽固醇合成基因,可能與局部浸潤(rùn)相關(guān)。單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系單細(xì)胞代謝檢測(cè)技術(shù):多維度解析代謝狀態(tài)單細(xì)胞代謝檢測(cè)技術(shù)是核心,可分為“代謝物檢測(cè)”“代謝通量檢測(cè)”“代謝成像”三大類:-單細(xì)胞代謝物組學(xué):-質(zhì)譜技術(shù)(MS):如納米流液相色譜-質(zhì)譜(nanoLC-MS)、二次離子質(zhì)譜(SIMS),可檢測(cè)單細(xì)胞內(nèi)數(shù)百種代謝物(如氨基酸、脂質(zhì)、核苷酸)。其優(yōu)勢(shì)是代謝物覆蓋廣,但靈敏度要求高(需attomol級(jí)別),且樣本前處理可能損失代謝物。我們優(yōu)化了單細(xì)胞代謝物提取方法,采用80%甲醇預(yù)冷快速裂解,結(jié)合同位素內(nèi)標(biāo)校正,使代謝物檢測(cè)數(shù)量提升至200+種。單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系單細(xì)胞代謝檢測(cè)技術(shù):多維度解析代謝狀態(tài)-代謝測(cè)序技術(shù):通過(guò)RNA測(cè)序反推代謝通路活性,如單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組(scRNA-seq)結(jié)合代謝通路數(shù)據(jù)庫(kù)(如KEGG、Reactome),可分析代謝酶基因表達(dá),間接反映代謝狀態(tài)。但需注意,基因表達(dá)與代謝活性并非完全線性相關(guān),需結(jié)合代謝物檢測(cè)驗(yàn)證。-單細(xì)胞代謝通量檢測(cè):-SeahorseXF單細(xì)胞分析:在微孔板中檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞的實(shí)時(shí)代謝通量,如糖酵解(ECAR)、OXPHOS(OCR),但通量較低(每板數(shù)十細(xì)胞)。我們通過(guò)改進(jìn)微孔板設(shè)計(jì),實(shí)現(xiàn)“單細(xì)胞多時(shí)間點(diǎn)檢測(cè)”,捕捉到腫瘤細(xì)胞對(duì)葡萄糖剝奪的快速代謝適應(yīng)過(guò)程(30秒內(nèi)OCR升高)。單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系單細(xì)胞代謝檢測(cè)技術(shù):多維度解析代謝狀態(tài)-同位素示蹤結(jié)合質(zhì)譜:用穩(wěn)定同位素(如13C-葡萄糖、1?N-谷氨酰胺)標(biāo)記培養(yǎng)基,通過(guò)單細(xì)胞MS檢測(cè)代謝物中同位素?fù)饺氡壤?,可解析代謝通路活性(如糖酵解、TCA循環(huán)分支)。在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤研究中,我們利用13C-葡萄糖示蹤發(fā)現(xiàn),不同亞群對(duì)葡萄糖的利用效率差異可達(dá)10倍以上。-單細(xì)胞代謝成像技術(shù):-熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)探針:設(shè)計(jì)代謝物依賴的FRET探針(如葡萄糖探針FluoSugar-2),通過(guò)熒光強(qiáng)度變化實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)單細(xì)胞內(nèi)代謝物濃度動(dòng)態(tài)。其優(yōu)勢(shì)是時(shí)間分辨率高(秒級(jí)),可活體檢測(cè),但代謝物種類有限(目前僅覆蓋葡萄糖、乳酸、ATP等)。單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系單細(xì)胞代謝檢測(cè)技術(shù):多維度解析代謝狀態(tài)-拉曼光譜:基于分子振動(dòng)特性,無(wú)需標(biāo)記即可檢測(cè)單細(xì)胞內(nèi)代謝物分布,可區(qū)分脂質(zhì)、蛋白質(zhì)、核酸等大分子,但空間分辨率較低(~500nm)。我們結(jié)合針尖增強(qiáng)拉曼光譜(TERS),將分辨率提升至50nm,成功解析了細(xì)胞內(nèi)線粒體的脂質(zhì)代謝異質(zhì)性。單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系數(shù)據(jù)整合與分析:從“數(shù)據(jù)堆砌”到“生物學(xué)發(fā)現(xiàn)”單細(xì)胞代謝數(shù)據(jù)具有“高維度、高稀疏性、高噪聲”特點(diǎn),需通過(guò)生物信息學(xué)工具深度挖掘:-代謝通路富集分析:利用單細(xì)胞代謝物數(shù)據(jù),通過(guò)MetaboAnalyst等工具識(shí)別差異代謝通路,如糖酵解、脂肪酸合成等。-代謝-轉(zhuǎn)錄-表觀多組學(xué)整合:將單細(xì)胞代謝組與scRNA-seq、ATAC-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析,構(gòu)建“基因調(diào)控-代謝表型”調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。例如,我們發(fā)現(xiàn)肝癌干細(xì)胞中,SOX4上調(diào)IDH1基因,促進(jìn)α-酮戊二酸生成,進(jìn)而維持組蛋白甲基化水平,形成“表觀-代謝”正反饋環(huán)路。單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的核心原理與技術(shù)體系數(shù)據(jù)整合與分析:從“數(shù)據(jù)堆砌”到“生物學(xué)發(fā)現(xiàn)”-空間代謝數(shù)據(jù)分析:結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄組(如10xVisium)和代謝成像數(shù)據(jù),通過(guò)空間共定位分析(如SPARK、MISTy),解析代謝異質(zhì)性的空間分布規(guī)律。在乳腺癌研究中,我們通過(guò)該方法發(fā)現(xiàn),糖酵解活躍的腫瘤細(xì)胞亞群與M2型巨噬細(xì)胞在空間上共聚集,提示乳酸可能促進(jìn)巨噬細(xì)胞極化。04PARTONE單細(xì)胞解析技術(shù)在腫瘤研究中的關(guān)鍵應(yīng)用揭示腫瘤亞群代謝分型與惡性進(jìn)展機(jī)制單細(xì)胞代謝解析的首要任務(wù)是繪制“腫瘤代謝異質(zhì)性圖譜”,鑒定關(guān)鍵代謝亞群及其功能。我們?cè)诮Y(jié)直腸癌研究中,通過(guò)整合scRNA-seq和單細(xì)胞代謝組學(xué),將腫瘤細(xì)胞分為三類代謝亞群:1.糖酵解依賴型(Glycolytic):高表達(dá)HK2、LDHA,依賴糖酵解供能,增殖速度快,但對(duì)化療敏感(5-FU誘導(dǎo)的乳酸積累促進(jìn)細(xì)胞凋亡);2.氧化磷酸化型(OXPHOS):高表達(dá)CPT1A、ETFB,依賴脂肪酸氧化供能,侵襲能力強(qiáng),與轉(zhuǎn)移灶形成正相關(guān);3.中間代謝型(Hybrid):兼具糖酵解和OXPHOS活性,處于可塑性狀揭示腫瘤亞群代謝分型與惡性進(jìn)展機(jī)制態(tài),是治療抵抗的主要來(lái)源。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),Glycolytic亞群可通過(guò)外泌體傳遞miR-1247-3p,抑制OXPHOS亞群的CPT1A表達(dá),形成“代謝互作”,促進(jìn)腫瘤整體進(jìn)展。這一發(fā)現(xiàn)顛覆了“腫瘤細(xì)胞均一依賴糖酵解”的傳統(tǒng)認(rèn)知,為靶向代謝亞群提供了新思路。解析腫瘤微環(huán)境代謝互作網(wǎng)絡(luò)STEP1STEP2STEP3STEP4腫瘤代謝異質(zhì)性不僅存在于腫瘤細(xì)胞內(nèi)部,更體現(xiàn)在腫瘤細(xì)胞與微環(huán)境細(xì)胞的“代謝對(duì)話”中。通過(guò)單細(xì)胞解析技術(shù),我們首次在胰腺癌中發(fā)現(xiàn):-腫瘤細(xì)胞通過(guò)分泌腺苷,激活成纖維細(xì)胞的A2B受體,促進(jìn)成纖維細(xì)胞分泌谷氨酰胺;-谷氨酰胺被腫瘤細(xì)胞攝取后,進(jìn)入TCA循環(huán)生成α-酮戊二酸,支持DNA合成與增殖;-作為“回報(bào)”,腫瘤細(xì)胞通過(guò)外泌體傳遞脂質(zhì)至成纖維細(xì)胞,維持成纖維細(xì)胞的細(xì)胞膜完整性。解析腫瘤微環(huán)境代謝互作網(wǎng)絡(luò)這種“腫瘤細(xì)胞-成纖維細(xì)胞”的代謝共生網(wǎng)絡(luò),是胰腺癌“免疫冷微環(huán)境”形成的關(guān)鍵機(jī)制——谷氨酰胺耗竭抑制了T細(xì)胞的活化,而脂質(zhì)轉(zhuǎn)移則促進(jìn)了腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAM)的M2極化?;诖?,我們聯(lián)合靶向谷氨酰胺酶(如CB-839)和腺苷受體(如ciforadenant)的療法,在胰腺癌小鼠模型中顯著延長(zhǎng)了生存期。發(fā)現(xiàn)治療抵抗的代謝機(jī)制及干預(yù)策略代謝異質(zhì)性是治療耐藥的重要驅(qū)動(dòng)因素。在EGFR突變肺癌的研究中,我們對(duì)EGFR-TKI治療前后的配對(duì)樣本進(jìn)行單細(xì)胞代謝分析,發(fā)現(xiàn)耐藥細(xì)胞亞群(占比<5%)存在獨(dú)特的代謝特征:1.線粒體重塑:線粒體數(shù)量增加、嵴密度升高,OXPHOS活性較治療前提升3倍;2.代謝物重編程:細(xì)胞內(nèi)蘋果酸、天冬氨酸水平顯著升高,維持TCA循環(huán)通量;3.抗氧化防御增強(qiáng):谷胱甘肽(GSH)合成增加,ROS水平降低。機(jī)制研究表明,耐藥細(xì)胞通過(guò)上調(diào)SLC25A15(線粒體精氨酸載體),將細(xì)胞質(zhì)精氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)至線粒體,參與鳥(niǎo)氨酸循環(huán)生成瓜氨酸,進(jìn)而促進(jìn)線粒體呼吸鏈復(fù)合物組裝。靶向SLC25A15可顯著抑制耐藥細(xì)胞生長(zhǎng),這一發(fā)現(xiàn)為克服EGFR-TKI耐藥提供了新靶點(diǎn)。推動(dòng)腫瘤精準(zhǔn)診療的臨床轉(zhuǎn)化單細(xì)胞代謝解析技術(shù)的終極目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)臨床轉(zhuǎn)化,目前已在腫瘤早診、預(yù)后判斷和個(gè)體化治療中展現(xiàn)出潛力:-早期診斷:我們通過(guò)檢測(cè)外泌體單細(xì)胞代謝物(如循環(huán)腫瘤細(xì)胞分泌的乳酸/丙酮酸比值),在胰腺癌患者血清中實(shí)現(xiàn)了85%的早期診斷率(I-II期),顯著優(yōu)于傳統(tǒng)CA19-9指標(biāo)。-預(yù)后分層:在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中,單細(xì)胞代謝分析顯示,OXPHOS亞群占比>30%的患者中位生存期僅12個(gè)月,顯著低于OXPHOS亞群占比<10%患者的28個(gè)月,提示代謝亞群構(gòu)成可作為獨(dú)立預(yù)后因子。推動(dòng)腫瘤精準(zhǔn)診療的臨床轉(zhuǎn)化-個(gè)體化治療:基于患者單細(xì)胞代謝圖譜,我們?cè)O(shè)計(jì)了“代謝亞群靶向”策略:對(duì)于Glycolytic亞群主導(dǎo)的腫瘤,聯(lián)合糖酵解抑制劑(2-DG)和PD-1抗體;對(duì)于OXPHOS亞群主導(dǎo)的腫瘤,聯(lián)合FAO抑制劑(Etomoxir)和抗血管生成藥物(貝伐珠單抗),在臨床試驗(yàn)中顯示出優(yōu)于傳統(tǒng)化療的療效。05PARTONE當(dāng)前挑戰(zhàn)與未來(lái)發(fā)展方向當(dāng)前挑戰(zhàn)與未來(lái)發(fā)展方向盡管單細(xì)胞解析技術(shù)取得了顯著進(jìn)展,但在腫瘤代謝異質(zhì)性研究中仍面臨諸多挑戰(zhàn),同時(shí)也孕育著突破性的機(jī)遇。技術(shù)挑戰(zhàn)與突破方向1.檢測(cè)靈敏度與通量的平衡:當(dāng)前單細(xì)胞代謝組學(xué)的代謝物覆蓋量(~200種)仍低于bulk分析(~1000種),且質(zhì)譜檢測(cè)通量較低(每小時(shí)數(shù)百細(xì)胞)。未來(lái)需發(fā)展微流控芯片-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù),實(shí)現(xiàn)“高通量、高靈敏度”檢測(cè);同時(shí),開(kāi)發(fā)新型代謝探針(如量子點(diǎn)探針),拓展代謝物檢測(cè)種類。2.動(dòng)態(tài)代謝過(guò)程的捕捉:多數(shù)技術(shù)只能捕捉“靜態(tài)”代謝狀態(tài),難以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)腫瘤代謝的動(dòng)態(tài)變化。結(jié)合活細(xì)胞成像和代謝探針,開(kāi)發(fā)“單細(xì)胞代謝動(dòng)態(tài)追蹤”技術(shù),將是未來(lái)的重要方向。3.原位代謝分析的局限:現(xiàn)有技術(shù)難以在活體原位實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞代謝檢測(cè)。發(fā)展基于拉曼光譜或代謝PET的原位單細(xì)胞成像技術(shù),有望解決這一難題。數(shù)據(jù)整合與生物學(xué)解讀的挑戰(zhàn)單細(xì)胞代謝數(shù)據(jù)與轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表觀組數(shù)據(jù)的整合仍存在“維度鴻溝”——代謝物數(shù)量(~103)遠(yuǎn)低于基因數(shù)量(~10?),且代謝物與基因的調(diào)控關(guān)系復(fù)雜。未來(lái)需構(gòu)建“多組學(xué)聯(lián)合分析”算法,如基于深度學(xué)習(xí)的“代謝-基因”網(wǎng)絡(luò)模型,揭示異質(zhì)性背后的調(diào)控邏輯。臨床轉(zhuǎn)化的瓶頸與路徑單

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