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文檔簡介

1、向GenBank批量上傳序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文檔：待上傳序列刪減至合適長度后，將待上傳序列全部打開隨后點(diǎn)擊File - export as one，保存文件格式為：*.fas ，將待上傳序列全部歸至一個(gè)FASTA文檔。注意序列命名：2.在GenBank的Submission Tools里，下載序列信息編輯軟件Sequin。網(wǎng)址：/Sequin/（下圖中點(diǎn)擊Instructions下載軟件）注意打開安裝文件后，程序會自動安裝在安裝包所在的文件夾。3.打開Sequin，點(diǎn)擊Start New

2、 Submission。4.隨后選擇序列發(fā)布日期，輸入論文題目。若之前保存有模板，可以點(diǎn)擊下面的“Click here to import a template”導(dǎo)入。模板導(dǎo)出在下文的第五點(diǎn)提到。5. 聯(lián)系人、作者信息、機(jī)構(gòu)或者學(xué)校信息建議導(dǎo)出模板，之后修改信息時(shí)可以直接導(dǎo)入模板而不需重新輸入。6. 選擇上傳的序列類型。7. 導(dǎo)入之前準(zhǔn)備好的FASTA文件：導(dǎo)入之后，輸入序列ID（序號ID相當(dāng)于編號，可以自由命名，只要各個(gè)序列的ID不一致即可。在這里以病人編號作為序列ID）：導(dǎo)入序列成功后，顯示各個(gè)序列信息如下：點(diǎn)擊Sequencing Method，將測序方法輸入：選擇上傳序列的用途：病毒類

3、型：8. 編輯每條序列的信息：點(diǎn)擊Import Source Table可以導(dǎo)入模板，點(diǎn)擊Export This Table可以輸出模板備用。9. 選擇核酸類型，序列內(nèi)容后，點(diǎn)擊Open Record Viewer。10. 添加每條序列的信息，包括編碼區(qū)重復(fù)區(qū)RNA結(jié)構(gòu)等等。雙擊相關(guān)信息可進(jìn)行修改，點(diǎn)擊Annotate添加相關(guān)信息。11. 檢查信息是否有誤（也可以點(diǎn)擊Search里的Validate檢測是否有明顯錯(cuò)誤）：有些錯(cuò)誤是可以忽略的，如上傳的序列為CDS序列，那么軟件報(bào)錯(cuò)”序列無終止子”時(shí)可忽略。隨后，點(diǎn)擊Done保存待上傳序列：注意此時(shí)保存的文件包含所有序列信息，因此只需保存一次即可。12.將保存好的文件作為郵件附件，發(fā)送至：gb-s

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