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文檔簡介

1、熒光原位雜交技術(shù)原理儀器耗材試劑及配制標(biāo)本制備探針的制備雜交與檢測注意事項一、原理將熒光素直接標(biāo)記的核酸探針(或生物素、地高辛等標(biāo)記的核酸探針)與標(biāo)本中的靶核酸序列按照堿基互補配對原則進(jìn)行雜交,經(jīng)洗滌后直接(或通過免疫熒光信號擴(kuò)增)在熒光顯微鏡下觀察,從而對靶目標(biāo)中的待測核酸進(jìn)行定性、定位或定量的研究。二、儀器耗材儀器: 熒光顯微鏡及分析軟件, PCR擴(kuò)增儀(變性),370C隔水培養(yǎng)箱(雜交),濕盒,恒溫水浴箱,冰箱,普通離心機(jī),小型高速低溫離心機(jī),移液槍(1000ul,200ul, 20ul,10ul),玻片盒,通風(fēng)櫥,震蕩混勻器,染色缸、計時器,溫度計,溫濕度顯示器,量筒,酒精燈,燒杯,天

2、平,試劑瓶等。二、儀器耗材耗材: 離心管(50ml,15ml,1.5ml),PCR管,各種規(guī)格的tip頭,載玻片(帶磨砂的),大蓋玻片( 方形,用于鏡檢),小蓋玻片(一般用圓形,用于雜交時候封片),封片膠等。三、試劑液體LB,氯霉素,STE,BAC試劑盒,異丙醇,NICK試劑盒,無水乙醇,甲酰胺, 20SSC,2SSC ,70%酒精,90%酒精,100%酒精,BSA,HumanCotI DNA,50%硫酸葡聚糖,0.3%NP40/0.4SSC, PBS緩沖液,0.1%NP40/2SSC,DAPI 染色液等。四、標(biāo)本制備 按第四章人淋巴細(xì)胞培養(yǎng)及收獲及染色體制備收獲外周血中期染色體,調(diào)整懸液濃度

3、(20倍物鏡視野下20-30個細(xì)胞,分裂指數(shù)在4%以上為宜),懸液-200C保存。五、探針的準(zhǔn)備BAC-DNA的抽提標(biāo)記純化1、BAC-DNA的抽提無菌操作臺上,接種BAC菌種7ul于含氯霉素(氯霉素終濃度為30ug/ml)的15ml液體LB培養(yǎng)液中,空氣搖床上37,280rpm,震蕩培養(yǎng)18-20h。4000 rpm,4,離心10min去上清,加入5mlSTE(冰預(yù)冷)重懸4000 rpm,4,離心10min去上清,加入250ul P1 (冰預(yù)冷)重懸轉(zhuǎn)入1.5mlEP管中(冰預(yù)冷5min)加入250ul P2(預(yù)溫)輕輕轉(zhuǎn)6次,室溫靜置5min加入250ul P3(冰預(yù)冷)輕輕轉(zhuǎn)6次,冰上

4、5min13200 rpm,4,離心10min1、BAC-DNA的抽提移上清至新的EP管(冰預(yù)冷),加入700ul異丙醇,混勻13200 rpm,4,離心10min去上清,加入1ml 70%無水乙醇混勻13200 rpm,4,離心10min去上清,加入15ul Nuclease-free water溶解DNA室溫放置2、標(biāo)記探針采用缺口平移標(biāo)記法(NICK試劑盒)在0.5mlEppendorf管中加入: Nuclease-free water 13.5ul dNTP mix (0.1mM) 10ul dTTP(0.1mM) 5ul 10buffer 5ul 模板DNA(1-1.5ug) 6ul

5、 SpectrumGreen 或 SpectrumOrange 或 SpectrumRed dUTP(0.2mM) 2.5ul Nick translation enzyme 8ul 總體積 50ul2、標(biāo)記探針上PCR儀:15 8小時75 10分鐘滅活4保存取標(biāo)記后的探針5ul跑1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,標(biāo)記后探針長度范圍在100-400bp較好(穩(wěn)定,達(dá)到5000bp)3、純化探針在1.5mlEppendorf管中加入: Ecoli tRNA(1ug/ul) 1ul 鮭魚精DNA(10mg/ml) 5ul 8M醋酸胺 6ul 糖元 (10mg/ml) 1ul 4保存。3、純化探針將標(biāo)記好的探

6、針加入上述Eppendorf管,再加入-20無水乙醇200ul,-70放置30分鐘4,15000rpm,離心10分鐘去上清,加入200ul70%乙醇4,15000rpm,離心5分鐘吸去乙醇,立即加入甲酰胺25ul室溫,避光,溶解10分鐘,-20保存六、雜交與檢測外周血玻片準(zhǔn)備雜交體系準(zhǔn)備雜交洗脫結(jié)果觀察1、外周血玻片準(zhǔn)備75烤箱烘烤2小時置于2SSC 中30min依次放入70%,90%,100%酒精中各2min室溫干燥2、雜交體系準(zhǔn)備 在1.5mlEppendorf管中加入 20SSC 1.5ul BSA(1ug/ul) 1ul HumanCotI DNA (1mg/ml) 2ul 探針 3.

7、75ul 甲酰胺 3.75ul 50%硫酸葡聚糖 3ul 總體積 15ul3、雜交PCR擴(kuò)增儀開啟,使溫度達(dá)到80滴加配好的雜交液15ul于雜交區(qū)蓋上蓋玻片,封膠,PCR擴(kuò)增儀80變性2min將玻片置于濕盒,放入37雜交16小時以上4、洗脫雜交次日 70 0.4SSC/0.3%NP40 漂洗2min室溫 2SSC/0.1%NP40 漂洗 1min室溫2SSC 2min室溫70%,90%,100%酒精中脫水各2min室溫干燥加20ul DAPI加到雜交區(qū),蓋上蓋玻片,復(fù)染10min熒光顯微鏡下觀察結(jié)果5、結(jié)果觀察觀察鏡下熒光雜交信號, 計數(shù)30個細(xì)胞和采集4張圖像。七、注意事項玻片準(zhǔn)備時要注意玻片的干凈和透明度;雜交過程中要保持濕潤;雜交必須對玻片變性溫度進(jìn)行摸索;染色體制備分

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