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1、植物組織DNA的提取、分離 基礎(chǔ)生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí):82009年11月2日11、學(xué)習(xí)并掌握用CTAB法提取植物總DNA的 原理和方法。一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?、學(xué)習(xí)并掌握核酸組分的分離技術(shù)瓊脂糖凝膠電泳方法2 核酸在植物體內(nèi)多與蛋白質(zhì)結(jié)合,以核蛋白的形式存在,因此提取分離核酸時(shí),必須使核酸與蛋白質(zhì)解離,并除去蛋白質(zhì)和多糖等雜質(zhì)。 本實(shí)驗(yàn)先將植物材料速凍、研磨,破碎細(xì)胞壁,然后加入十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)分離緩沖液,使細(xì)胞膜破裂,同時(shí)將核酸與蛋白質(zhì)及多糖等雜質(zhì)分開(kāi)。一定濃度的CTAB與核酸結(jié)合形成復(fù)合物,該復(fù)合物溶于高濃度的鹽溶液,(而在低鹽溶液中沉淀)再經(jīng)氯仿異戊醇抽提、離心,除去蛋白質(zhì)等雜質(zhì),
2、上清液中加入異丙醇,沉淀DNA,而CTAB溶于異丙醇。二、實(shí)驗(yàn)原理:3 瓊脂糖凝膠電泳是用瓊脂糖或優(yōu)質(zhì)瓊脂粉作支持介質(zhì)的一種電泳分離方法。它主要用于大于或等于1Kb 核酸的分離。有電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng)。其遷移率的大小,主要與DNA分子大小和空間構(gòu)象有關(guān)。其次,凝膠濃度、電泳電壓、PH值也會(huì)影響遷移率。核酸區(qū)帶觀察,是利用核酸與EB結(jié)合,在紫外光下可發(fā)出橙黃色熒光的性質(zhì),借助于紫外觀測(cè)儀來(lái)進(jìn)行。41、實(shí)驗(yàn)材料:三葉草葉片2、儀器: (1)電熱恒溫水浴鍋 (2)離心機(jī) (3)液氮罐 (4)研缽等 三、實(shí)驗(yàn)材料、儀器和試劑:5 3、試劑:(1)CTAB分離緩沖液: 2%CTAB,1.4M NaCl,
3、 20mM EDTA,100mM Tris-HCl (pH8.0),0.2%巰基乙醇共100ml (2)洗滌緩沖液:75%乙醇,100mM 乙酸銨共100ml (3)氯仿:異戊醇24:1(V/V)(4)異丙醇 (5)TE液 (6)液氮 (7)EB液(8)電泳緩沖液TBE(9)凝膠加樣緩沖液6(一)植物組織DNA的提?。?1、取10mlCTAB分離緩沖液加入離心試管中,于60水浴預(yù)熱。2、稱(chēng)取1.5g新鮮葉片于預(yù)冷的研缽中,加入液氮,迅速將葉片研磨成很細(xì)的粉末。3、將葉片粉末直接加入預(yù)熱的CTAB分離液中,輕輕轉(zhuǎn)動(dòng)混勻,60水浴保溫30分鐘。4、將液體轉(zhuǎn)入小燒杯中,加入等體積的氯仿異戊醇,輕輕搖
4、勻后,分裝到兩個(gè)離心管中,等重,4000r/min,離心8分鐘。5、用大開(kāi)口滴管取出上層水相于另一潔凈的離心管中,加入2/3體積預(yù)冷的異丙醇,輕輕混勻,使DNA沉淀,并與CTAB分離。(注意現(xiàn)象)四、實(shí)驗(yàn)步驟: 76、收集DNA:(1)如呈可見(jiàn)的絲狀DNA,可用玻璃棒(或小勺)輕輕攪起。 (2)如呈云霧狀,再2000r/min離心4min,小心倒去上清液。7、洗滌:(1)將絲狀DNA直接轉(zhuǎn)移到15ml的洗滌緩沖液中洗30分鐘(如不能攪起,可2000r/min離心10分鐘,轉(zhuǎn)速不宜太高,否則形成堅(jiān)實(shí)的沉淀); (2)在松散的沉淀物上加入15ml洗滌液,洗滌30分鐘,用玻璃棒輕輕攪起沉淀。8、保存
5、:將DNA從離心管中取出,于濾紙上干燥后溶于1mlTE中,低溫保存?zhèn)溆谩?(二)DNA組分的分離瓊脂糖凝膠電泳1、瓊脂糖凝膠的制備:以5 X TBE電泳緩沖溶液配制,濃度為0.7% 。將瓊脂糖粉和TBE液于沸水浴中加熱至完全溶解,待冷卻至60左右時(shí)加入EB,使EB終濃度為0 .5mg / ml 。2、凝膠板的制備: A、在膠床的兩頭貼上膠帶,形成8mm 高的擋 墻,壓緊膠帶,置于水平臺(tái)面上。 B、插入梳子,梳子下端距底板0 .5-1mm ,然后將凝膠不間斷地倒入膠床,高3-4mm ,避免產(chǎn)生氣泡,在室溫下凝固。9 C、完全凝固后撕去膠帶,于電泳槽中加入電泳緩沖溶液,高于膠面1mm,從一端斜拉出梳子,除去產(chǎn)生的氣泡。3、加樣:將樣品DNA溶液與加樣緩沖溶液 以5:1體積混合,加樣量每孔5-10 ul。4、電泳:陽(yáng)向極電泳。電位5V/cm ,當(dāng)染料 前沿移至底邊1-2 cm 處時(shí),停止電泳。5、觀察:將膠床置紫外檢測(cè)儀上觀察并記 錄。10五、思考題: 1、提取核酸時(shí)應(yīng)注意些什么問(wèn)題?2、EB在對(duì)核酸進(jìn)行染色時(shí)有什么優(yōu)點(diǎn)?其原理如何?3、用中文命名:CTAB、EB。 111、核酸提取過(guò)程中的注意事項(xiàng):(1)避免過(guò)酸過(guò)堿或高溫環(huán)境,合適的T:04, pH4-9;(2)防止機(jī)械力的切割作用
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