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#流程大放送#小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)處理和分析
知因無(wú)限介紹SmallRNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA??蓞⑴c基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化,以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過(guò)程oSmallRNA測(cè)序是研究生物樣品小RNA的最主要方法之一,首先采用膠分離技術(shù),收集樣品中18-30nt的RNA片段;再利用高通量測(cè)序技術(shù),一次性獲得單堿基分辨率的數(shù)百萬(wàn)條小RNA序列信息。該項(xiàng)技術(shù)可用于以下研究觀察疾病發(fā)生過(guò)程中病灶部位內(nèi)部miRNA的表達(dá)異常,確定與疾病相關(guān)miRNA基于小RNA樣本的新miRNA預(yù)測(cè)和新miRNA的調(diào)控靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)處理和分析流程圖多業(yè)理畫件樣古多業(yè)理畫件樣古預(yù)期示例圖展示■"I■pne-nlRNA■RNArH^■lAp&ai■n&LRN■"I■pne-nlRNA■RNArH^■lAp&ai■n&LRN已■Hc1&cqcunn■Ral&?qnlran■bfitSfirri^RArSBq———-anltenwRQi5cq〔£?罐電Q示例1A圖為測(cè)序序列分類,B圖為每個(gè)類別中序列長(zhǎng)度分布,C圖為miRNA表達(dá)水平聚示例2miRNA、靶基因與miRNA上游TF網(wǎng)絡(luò)圖?2生信「有實(shí)力’不怕比拼」軟著和專利匸自建數(shù)據(jù)庫(kù)J個(gè)性化分析模址團(tuán)甌說(shuō)員+-用戶數(shù)-黑計(jì)厘務(wù)客戶匸55項(xiàng).肺癌譏中-?ivuw.hin冥cant:匕database.Mm'』超100^近loo10萬(wàn)“5000名,部分登記號(hào):+胃逋bttp-cadbmicrosricom.'*1碩ts二分2CH5SR16C82Ch'冒肉瘤 osdtunixioscimm*析團(tuán)恥2015SR149C-S6-1礁歸揭http,psjicdb.micrcfEZLcoui-120i5SR13SflS3^肝?§::h?tp' :ncbinlmnah.^Dv-putmed.-20479183-^2O15SR1M5C8*J豬豹1性狀:說(shuō)工w%匸ei出i.iJnLniL£DL沮1曲4?0丁07盹弘擬南齊:litrp.'^vinrtJiJilza.jaih.so:.pubmed2103?5873-藥物不良反應(yīng):3ittp_-^^vw.Dcb
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