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文檔簡介
生物化學與分子生物學第三篇遺傳信息的傳遞真核
與
組DNA的生物DNA的損傷和修復RNA的生物蛋白質(zhì)的生物表達調(diào)控細胞信號轉(zhuǎn)導本篇重點學習內(nèi)容中心法則
(The
Central
Dogma)轉(zhuǎn)錄翻譯逆轉(zhuǎn)錄復制生物體內(nèi)的遺傳信息傳遞遵循中心法則DNA以半保留
的方式將親代細胞的遺傳物質(zhì)高度忠實地傳遞給子代。以DNA為模板轉(zhuǎn)錄生成的mRNA作為信使,其核苷酸序列構(gòu)成的
子在
蛋白質(zhì)
時被翻譯為肽鏈中氨基酸的排列順序。細胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的信息全部來源于DNA序列。真核
與
組EukaryoteGeneandGenome第十三章本章內(nèi)容:真核真核的結(jié)構(gòu)與功能組的結(jié)構(gòu)與功能除了某些以RNA為通常是指
或組的RNA
外,組的一段DNA序列。
包括編碼序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)。(gene):編碼蛋白質(zhì)或RNA等具有特定功能產(chǎn)物的、負載遺傳信息的基本單位。組(genome):一個生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和。人類
組包含了細胞核
DNA(常和性 )及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)。真核
的結(jié)構(gòu)與功能第一節(jié)The
Structure
and
Function
ofEukaryote
Gene本節(jié)要點:一、真核 的基本結(jié)構(gòu)二、 編碼區(qū)編碼多肽鏈和特定的RNA分子三、調(diào)控序列參與真核 表達調(diào)控的功能利用堿基的不同排列荷載遺傳信息。通過
將遺傳信息穩(wěn)定、忠實地遺傳給子代細胞,在這一過程中為適應環(huán)境變化,可能會發(fā)生
突變。
作為
表達(gene
expression)的模板,使其所攜帶的遺傳信息通過各種RNA和蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)有序
而
來。與
功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)編碼區(qū)序列(coding
region
sequence
)在細胞內(nèi)表達為蛋白質(zhì)或功能RNA的DNA序列非編碼序列(non-coding
sequence)表達需要的調(diào)控區(qū)(regulatory
region)序列,包括啟動子(promoter)、增強子(enhancer)等。單個
的組成結(jié)構(gòu)及一個完整的生物體內(nèi)
的組織排列方式統(tǒng)稱為
組構(gòu)(gene
organization)。一、真核的基本結(jié)構(gòu)編碼蛋白質(zhì)或RNA的編碼序列。非編碼序列,包括編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列。真核 結(jié)構(gòu)不連續(xù),為斷裂(split
gene)。真核
結(jié)構(gòu)外顯子(exon);在
序列中,出現(xiàn)在成熟mRNA分子上的序列。內(nèi)含子(intron):外顯子之間、與mRNA剪接過程中被刪除部分相對應的間隔序列。真核生物絕大部分編碼蛋白質(zhì)的
都有內(nèi)含子。編碼rRNA和一些tRNA的也都有內(nèi)含子。內(nèi)含子的數(shù)量和大小決定了真核
的大小。不同種屬中,外顯子序列通常比較保守,而內(nèi)含子序列則變異較大。外顯子與內(nèi)含子接頭處有一段高度保守的序列,
這一共有序列是真核中RNA剪接的識別信號。的5端稱之為上游,3端稱為下游序列中開始RNA鏈的第一個核苷酸所對應的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負數(shù),下游的序列記為正數(shù)。二、
編碼區(qū)編碼多肽鏈和特定的RNA分子編碼區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,即DNA的一級結(jié)構(gòu)決定著其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA分子的一級結(jié)構(gòu)。的編碼序列決定其編碼產(chǎn)物的序列和功能。編碼序列中一個堿基的改變或突變,可能使
功能發(fā)生重要的變化。相同的DNA序列因起始位點的變化或不同的剪接方式而編碼不同的蛋白質(zhì)多肽鏈。三、調(diào)控序列參與真核表達調(diào)控的調(diào)控區(qū)(順式作用元件)位于
轉(zhuǎn)錄區(qū)前后,對
表達起調(diào)控作用的區(qū)域,因其是緊鄰的DNA序列,又稱旁側(cè)序列。轉(zhuǎn)錄起始點TATA盒CAAT盒GC盒增強子AATAAA剪接加尾轉(zhuǎn)錄終止點修飾點外顯子翻譯起始點內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體+1結(jié)構(gòu)啟動子上游啟動子元件啟動子上游調(diào)控元件增強子加尾信號細胞信號反應元件順式作用元件1.啟動子提供轉(zhuǎn)錄起始信號啟動子是DNA分子上能夠介導RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復合體的序列。多數(shù)啟動子位于真核細胞啟動子本身通常不被轉(zhuǎn)錄。少數(shù)啟動子(如編碼tRNA轉(zhuǎn)錄起點的上游,的啟動子)位于轉(zhuǎn)錄起始點的下游,這些DNA序列可以被轉(zhuǎn)錄。真核生物有3類啟動子,分別對應于細胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)。決定著每一個
在細胞內(nèi)的表達水平。能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種增強作用,大部分位于上游。增強子序列距離所調(diào)控
距離近者幾十個堿基對,遠的可達幾千個堿基對。通常數(shù)個增強子序列形成一簇。有時增強子序列也可位于內(nèi)含子之中。不同的增強子序列結(jié)合不同的調(diào)節(jié)蛋白。2.
增強子增強鄰近
的轉(zhuǎn)錄增強子是增強真核式作用元件,是真核啟動子工作效率的順中最重要的調(diào)控序列,沉默子(silencer)是抑制
轉(zhuǎn)錄的特定DNA序列,當其結(jié)合一些反式作用因子時對基因的轉(zhuǎn)錄起阻遏作用,使
沉默。3.
沉默子是負調(diào)節(jié)元件真核
組的結(jié)構(gòu)與功能第二節(jié)The
Structure
and
Function
ofEukaryoteGenome本節(jié)要點:組具有獨特的結(jié)構(gòu)組中存在大量重復序列組中存在大量的多與假基一、真核二、真核三、真核因四、線粒體DNA結(jié)構(gòu)有別于
DNA五、人
組中有兩萬多個六、人的
在 上的分布特征組:細胞或生物體的一套完整單倍體遺傳物質(zhì)的總和。一、真核組具有獨特的結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)特點:的編碼序列所占比例遠小于非編碼序列。高等真核生物
組
的重復序列,真核
組中存在多
和假
。大多 具有可變剪接,80%的可變剪接會使蛋白質(zhì)的序列發(fā)生改變。
組DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合形成
,于細胞核內(nèi),除配子細胞外,體細胞的組為二倍體。二、真核組中存在大量重復序列高度重復序列(highly
repetitive
sequence)中度重復序列(modera y
repetitive
sequence)單拷貝序列(single
copy
sequence)或低度重復序列(一)高度重復序列長度約占人DNA(sa主要存在于的著絲粒區(qū)域,重復單位一般由2~10
bp組成,成串排列,在人
組中約占5%~6%。重復頻率可達106以上,不編碼蛋白質(zhì)或RNA。分類:反向重復序列(inverted
repeat
sequence)兩個相同順序的互補拷貝在同一DNA鏈上反向排列而成,重復單位長度約300
bp,多數(shù)散在于
組中,總組的5%。lite
DNA)參與
配對如
DNA成簇樣分布在
著絲粒附近,可能與減數(shù)
時
配對有關(guān)。功能:參與
水平的調(diào)節(jié)存在于DNA
起點區(qū)的附近,是一些蛋白質(zhì)(包括酶)的結(jié)合位點。參與
表達的調(diào)控可以轉(zhuǎn)錄到核內(nèi)不均一RNA分子中,有些反向重復序列可以形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),有助于穩(wěn)定RNA分子。(二)中度重復序列重復數(shù)十至數(shù)千次,大多數(shù)與單拷貝間隔排列。短分散重復片段平均長度約300
bp~500bp,與長度約為1000
bp的單拷貝序列間隔排列。拷貝數(shù)可達數(shù)十萬。如Alu
、KpnI
、Hinf
。長分散重復片段平均長度為3500
bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。Alu重復達30~50萬次,每個成員的長度約300
bp。每個單位長度中一個限制性內(nèi)切酶Alu的切點(AG↓CT),將其切成長130bp和170bp的兩段。KpnI僅次于Alu
的第二大
,重復序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ的位點呈散在分布,拷貝數(shù)約為3000~4800個Hinf以319bp長度的串聯(lián)重復存在于人
組中重復序列中含有限制性內(nèi)切酶Hinf
I的位點。rRNA
重復序列屬于中度重復序列各重復單位中的rRNA
都是相同的。rRNA
集中成簇存在,這樣的區(qū)域稱為rDNA區(qū)。人類的rRNA
位于13、14、15、21和22號染色體的核仁組織區(qū),每個核仁組織區(qū)平均含有50個rRNA5SrRNA的重復單位。似乎全部位于1號,每個單倍體組約有1000個5SrRNA
。在單倍體
組中只出現(xiàn)一次或數(shù)次,大多數(shù)為蛋白質(zhì)編碼的
。(三)單拷貝序列(低度重復序列)三、真核族與假組中存在大量的多家多是指由某一祖先
經(jīng)過重復和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的
。成簇地分布在某一條用,
某些蛋白質(zhì)。如組蛋白上,同時發(fā)揮作。的不同成員成簇地分布于不同碼一組功能上緊密相關(guān)的蛋白質(zhì)。如球蛋白上,編。DNA序列相似,但功能不一定相關(guān)的若干個單拷貝
或若干組
總稱。假
(psuedogene)組中存在的一段與正常
非常相似但不能表達的DNA序列。以來表示。超(superfamily
gene)四、線粒體DNA結(jié)構(gòu)有別于
DNA線粒體DNA(mitochondrial
DNA,mtDNA)是核外遺傳物質(zhì),能獨立編碼線粒體中的一些蛋白質(zhì)。mtDNA
的結(jié)構(gòu)為環(huán)狀分子,與原核生物的DNA類似,結(jié)構(gòu)特點也與原核生物相似。人的線粒體組線粒體
組編碼37個
,包括13個編碼呼吸鏈多酶體系的一些多肽的
、22個編碼mt-tRNA的
、2個編碼mt-rRNA(16S和12S)的
。支原體M.genitalium0.58470無流感
桿菌
H.
influrnzae1.831743無枯草芽孢桿菌B.
subtilis4.204100無大腸桿菌E.
coli4.604288無釀酒酵母S.
cerevisiae13.50603416裂殖酵母S.
pombe12.50492916燕麥O.
sativa4663000021果蠅D.
melanogaster165136014秀麗隱桿線蟲C.
elegans97184246小鼠mouse27003000020人H.
sapiens30002500023數(shù)數(shù)*五、人
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