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文檔簡介
SciFinder?Web-文獻、物質(zhì)、反應檢索美國化學文摘社中國代表處導航PartISciFinder背景介紹PartII檢索技巧介紹文獻檢索
物質(zhì)檢索反應檢索PartIIISciFinderWeb新功能PartISciFinder背景介紹原始出版物CAS科學家CAS編輯發(fā)行信息檢索者或用戶SciFinder科學索引過程題目摘要改寫索引詞的編寫物質(zhì)索引的編寫(CAS.No.,CASRole)Preparationofprotractedglucagon-likepeptide-1andexendin-4analogscontainingatleastanaminoacid,especiallylysine,derivatizedwithfourfragmentssuchascarboxyalkanoyl-orimidazol-5-ylalkanoylaminosulfonylalkanoyl-piperidin-4-ylcarbonyl-aminoalkanoyl-linkerandrelatedmoietiesandtheirpharmaceuticalusefortreatingdiabetestype2andrelateddiseasesPeptidesderivatizedwitha-b-c-d-andtheirtherapeuticaluse
該專利SciFinder與專利原文的題目原文與SciFinder的摘要
TheinventionrelatestoprotractedpeptidederivativessuchasGlucagon-LikePeptide-1(GLP-1),exendin-4,andanaloguesthereof,aswellastherapeuticusesthereof.ThepeptidederivativeoftheinventioncomprisesapeptidewhereinatleastoneaminoacidresidueisderivatizedwithA-B-C-,orA-B-C-D-.Thesecompoundsareusefulinthetreatmentorpreventionofdiabetestype2andrelateddiseases.Thecompoundsarepotent,havealowratioofbindingaffinitytotheGLP-1receptorinthepresenceofhigh/lowalbuminconcentrations,havelonghalf-lives,andhaveahighaffinityofbindingtoalbumin,allofwhichisofpotentialrelevancefortheoverallaimofachievinglong-acting,stableandactiveGLP-1derivativeswithapotentialforonceweeklyadministration.Theinventionisrelatedtotheprepn.ofprotractedpeptidederivs.suchasGlucagon-LikePeptide-1(GLP-1),exendin-4,andtheiranalogscontg.atleastoneaminoacidresiduederivatizedwithfourfragmentssuchascarboxyalkanoyl-orimidazol-5-ylalkanoylaminosulfonylalkanoyl-piperidin-4-ylcarbonyl-aminoalkanoyl-linkerandrelatedmoieties,e.g.,(desaminoHis7,Glu22,Arg26,Arg34)GLP-1-(7-37)Lys[2-[2-[2-[2-[2-[2-[(S)-4-[1-[(9-Carboxynonadecanoyl)piperidine-4-carbonylamino]-4-carboxybutyryl]amino]ethoxy]ethoxy]acetyl]aminoethoxy]ethoxy]acetyl]amide(I),andtotheiruseinthetreatmentorpreventionofdiabetestype2andrelateddiseases.
Thepeptidederivs.oftheinventionarepotent,havealowratioofbindingaffinitytotheGLP-1receptorinthepresenceofhigh/lowalbuminconcns.,havelonghalf-lives,andhaveahighaffinityofbindingtoalbumin,allofwhichisofpotentialrelevancefortheoverallaimofachievinglong-acting,stableandactiveGLP-1derivs.withapotentialforonceweeklyadministration.
Thus,Iwasprepd.byderivatizationofthepeptidesequenceobtainedbysolidphasepeptidesynthesiswithFmoc-8-amino-3,6-dioxaoctanoicacid(Fmoc=9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)twice,Fmoc-Glu-Ot-Bu,Fmoc-isonipecoticacid,andeicosanedioicacidmonotert-Buester.
Ishowedalbuminbindingaffinity(EC50=300-800nM)andhadahalf-lifeintherangeof12-35hafters.c.administrationin0.05-17nmol/mLtodb/dbmice.
SciFinder的六大數(shù)據(jù)庫文摘數(shù)據(jù)庫
CAplus
(1萬種期刊,61個國家地區(qū)的專利,日更新)
Medline
(4800種生物醫(yī)學期刊)物質(zhì)數(shù)據(jù)庫
Registry(>1億零600萬個物質(zhì)/序列,日更新)
Chemcats
(>3400萬條商業(yè)物質(zhì)數(shù)據(jù)庫)
ChemList
(>24.7萬種管制品物質(zhì)數(shù)據(jù)庫)反應數(shù)據(jù)庫
CASReact(>2200萬單步及多步反應,周更新)文獻檢索物質(zhì)檢索反應檢索PartII檢索技巧介紹文獻檢索多種途徑關鍵詞檢索ResearchTopic作者姓名檢索AuthorName機構名稱檢索CompanyName文獻識別DocumentIdentifier期刊Journal專利Patent關鍵詞檢索納米材料在醫(yī)藥中應用的專利
關鍵詞檢索納米材料在醫(yī)藥中應用的文獻輸入nanomaterialwithpharmaceutical用英文的介詞of、with、by、beyond連接關鍵詞,不建議使用布爾邏輯符and兩種輸入方法對比文獻檢索結果對文獻結果集的后處理操作——Analyze/RefineAnalyze:作者姓名 物質(zhì)學科名稱 機構名稱所屬數(shù)據(jù)庫 文獻類型索引詞 CA概念標題期刊名稱 出版語言出版年代 附加詞Refine途徑:主題詞作者姓名機構名稱出版年代語言所屬數(shù)據(jù)庫使用Refine功能限定文獻類型為專利點擊文章標題獲得文章摘要②①③④⑤①獲取文章中涉及的物質(zhì);②獲取文章中涉及的反應;③獲取此論文的引用文獻;④獲取引用此論文的文獻;⑤有條件地獲取全文文獻來源信息結果的保存和輸出注:存儲名稱均為英文最近保存:檢索歷史:姓必須輸入,大小寫都可以,名只需輸入首字母。作者姓名檢索姓名的首字母在列表中將所有符合條件的簡稱和全稱都選上去除同名同音現(xiàn)象文獻檢索物質(zhì)檢索反應檢索PartII檢索技巧介紹物質(zhì)檢索途徑結構式檢索ChemicalStructureMarkush檢索Markush分子式檢索MolecularFormula物質(zhì)標識SubstanceIdentifier結構式檢索物質(zhì)結構式檢索提供了三種方式:Exactsearch用途:查詢結構式確定的有機化合物,可以檢索物質(zhì)的鹽、同位素、混合物、聚合物Substructuresearch用途:查詢母體化合物的衍生物;結果數(shù)量多。Similaritysearch用途:查詢文獻數(shù)量少、或者沒有文獻物質(zhì)的相似化合物。結構式檢索界面單擊注:初次使用需安裝JAVA插件結構式繪制界面工具欄常用結構元素鉛筆元素周期表可變基團重復基團碳鏈選擇工具環(huán)鎖定正電橡皮常用基團基團定義可變位置連接模版選擇工具原子鎖定環(huán)旋轉負電工具介紹常用元素常用環(huán)系結構鍵的立體構型已選模板恢復至碳碳單鍵原子旋轉亞結構式檢索舉例三唑啉酮類衍生物具有廣泛的生物活性,特別是在除草劑方面,以其高效、低毒、環(huán)境友好的特點成為當代除草劑研究領域中最熱門的課題之一。亞結構式檢索亞結構檢索結果物質(zhì)檢索中的分析/精選功能Analysis功能:是否有商業(yè)品來源物質(zhì)所有的元素是否有反應信息物質(zhì)的職能符(CASRole)Refine功能:物質(zhì)結構式是否包含同位素是否包含金屬元素是否有商業(yè)品來源信息是否有性質(zhì)物性參數(shù)是否有相關文獻原子取代基點擊對結果集進行亞結構限定用Refine功能原子取代基限定用Refine功能原子取代基限定得到我們需要的物質(zhì)結果相似結構檢索如果一個物質(zhì)公開報道的文獻較少或者沒有,我們是否可以借鑒與該物質(zhì)結構類似的物質(zhì)涉及的相關文獻?分數(shù)越高,結構越相似
相似性結構檢索結果相似性結構檢索,取代基可能不同,取代基位置可能不同,母核結構略有不同。物質(zhì)檢索途徑結構式檢索ChemicalStructureMarkush檢索Markush分子式檢索MolecularFormula物質(zhì)標識SubstanceIdentifier物質(zhì)名稱檢索達菲,通用名為磷酸奧司他韋(Oseltamivirphosphate)。奧司他韋(Oseltamivir)于1999年在瑞士上市,2001年10月在我國上市。達菲是一種非常有效的流感治療用藥,并且可以大大減少并發(fā)癥(主要是氣管與支氣管炎、肺炎、咽炎等)的發(fā)生和抗生素的使用,因而是目前治療流感的最常用藥物之一,也是公認的抗禽流感、甲型H1N1病毒最有效的藥物之一。用SciFinder查詢Oseltamivir的相關信息。輸入物質(zhì)的化學名稱、俗名、CASNo.檢索結果點擊獲取物性參數(shù)點擊獲取物性參數(shù)物性參數(shù)舉例:查詢Oseltamivir制備中反應類型為MichaelReaction的文獻
由物質(zhì)獲取制備反應首先獲取關于Oseltamivir制備類的文獻應用Categorize功能進行分類獲取Oseltamivir反應類用MichaelReaction合成的文獻Combine功能舉例:查找Roche以外的公司或機構發(fā)表的關于Oseltamivir的文章
思路:①查詢所有關于Oseltamivir的文章②將公司名稱限定為Roche③運用Combine功能從之前保存的結果中調(diào)出關于物質(zhì)檢索Oseltamivir的檢索結果
運用refine功能將公司名稱限定為Roche
物質(zhì)檢索途徑結構式檢索ChemicalStructureMarkush檢索Markush分子式檢索MolecularFormula物質(zhì)標識SubstanceIdentifier分子式檢索分子式輸入規(guī)則:同一組分中的元素,必須有明確的分割符號。對于不含C的物質(zhì),按照字母順序書寫;對于含C物質(zhì),CH寫在前面,其他按照字母順序;對于多組分物質(zhì),用“.”將不同組分分開,組分排列順序按照C數(shù)的降序排列,C數(shù)相同時,按照H數(shù)降序排列,H數(shù)再一樣,則按照第三個元素的字母降序排列。物質(zhì)檢索總結物質(zhì)的檢索途徑包括:名稱、CASNo.、分子式、結構式檢索物質(zhì),得到的信息相當有限,只有物質(zhì)的基本信息、性質(zhì)、譜圖等。物質(zhì)檢索卻是非常好的獲取文獻和反應的途徑。
GetReferences——Categorize——SyntheticChemistry——Reactions文獻檢索物質(zhì)檢索反應檢索PartII檢索技巧介紹反應檢索界面點擊切換至反應檢索界面單擊點開反應式面板繪制反應面板反應箭頭原子定位反應官能團反應角色定義反應位置檢索具體的反應反應式檢索界面查詢得到兩個相關反應
獲取反應細節(jié)
點擊獲得文獻的信息或者有條件獲取全文獲取相似反應相似性反應檢索結果反應檢索的分析與限定功能反應分析類型:作者姓名 出版語言溶劑出版年代機構名稱反應步數(shù)文獻類型 產(chǎn)率期刊名稱 催化劑反應的限定功能:反應式產(chǎn)率反應步數(shù)反應類型排除的反應類型不參與反應的基團
用Refine限定反應收率由反應得到文獻在反應面板上畫出所有的反應信息最開始不畫反應物,只畫產(chǎn)物。在refine中輸入反應物的結構式限定如果沒有相關反應結果,可獲取產(chǎn)物相關的制備文獻獲取相似反應反應檢索小結PartIIISciFinderWeb新功能SciFinderWeb新增功能Markush檢索增加了文獻檢索工具的互動性增加了相似反應增加了反應檢索的限定功能種類自定義文獻打印的內(nèi)容操作界面更加簡潔請合理使用SciFinder!!!
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