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動物細(xì)胞工程制藥第三章生物技術(shù)制藥第一節(jié)概述細(xì)胞學(xué)說的建立組織培養(yǎng)和細(xì)胞培養(yǎng)細(xì)胞工程學(xué)第二節(jié)動物細(xì)胞的形態(tài)

和生理特點

一、動物細(xì)胞的形態(tài)適應(yīng)功能,形態(tài)各異。離體培養(yǎng)細(xì)胞分兩類:貼壁細(xì)胞懸浮細(xì)胞⒈貼壁細(xì)胞

生長須有貼附的支持物表面,自身分泌或培養(yǎng)基中提供的貼附因子才能在該表面上生長。兩種形態(tài):成纖維細(xì)胞型上皮細(xì)胞型⒉懸浮細(xì)胞生長不依賴支持物表面,在培養(yǎng)液中呈懸浮狀態(tài)生長。如淋巴細(xì)胞。⒊兼性貼壁細(xì)胞生長不嚴(yán)格依賴支持物。如中國地鼠卵巢細(xì)胞,小鼠L929細(xì)胞。二、動物細(xì)胞的生理特點⒈細(xì)胞的分裂周期長細(xì)胞分裂時間為12~48h,細(xì)胞的分裂周期=間期+分裂期間期(G1+S+G2)分裂期(M)G1期:4~6h合成DNA聚合酶

RNA合成S期:6~8hDNA合成G2期:2~5hDNA量加倍,RNA合成M期:0.5~1h染色體分裂細(xì)胞代數(shù)為細(xì)胞分裂次數(shù)傳代數(shù)表示細(xì)胞培養(yǎng)分種傳代次數(shù)細(xì)胞代數(shù)=傳代數(shù)×分種數(shù)/2X=(logN-logNo)÷log2X代數(shù)

N培養(yǎng)最終細(xì)胞數(shù)

No培養(yǎng)起始細(xì)胞數(shù)倍增時間=培養(yǎng)經(jīng)過時間÷代數(shù)⒉細(xì)胞生長需貼附于基質(zhì),并有接觸抑制現(xiàn)象。⒊正常二倍體細(xì)胞的生長壽命是有限的。原代培養(yǎng)有限細(xì)胞系無限細(xì)胞系⒋動物細(xì)胞對周圍環(huán)境十分敏感;

對理化因素敏感,如:滲透壓、pH、離子濃度、剪切力、微量元素等。⒌動物細(xì)胞對培養(yǎng)基要求高必需氨基酸、維生素、無機鹽、微量元素、葡萄糖、細(xì)胞生長因子、貼壁因子等。

⒍動物細(xì)胞蛋白質(zhì)的合成途徑和修飾功能與細(xì)菌不同。動物細(xì)胞蛋白質(zhì)的合成部位:游離核糖體粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的核糖體

游離核糖體合成蛋白質(zhì)用于細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)內(nèi)。

粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的核糖體合成蛋白質(zhì)是分泌的和膜中的整合蛋白多為糖蛋白。動物細(xì)胞生產(chǎn)藥物缺點:培養(yǎng)條件高、成本貴、產(chǎn)量低。優(yōu)點:分泌胞外、純化方便、翻譯后修飾糖基化,與天然產(chǎn)品一致。第三節(jié)生產(chǎn)用動物細(xì)胞的

要求和獲得一、生產(chǎn)用動物細(xì)胞的要求原代細(xì)胞二倍體細(xì)胞系轉(zhuǎn)化細(xì)胞系二、生產(chǎn)用動物細(xì)胞的獲得⒈原代細(xì)胞是直接取自動物組織器官,經(jīng)過粉碎消化而獲得的細(xì)胞懸液(109/g)。需要大量動物,費錢費勞力。雞胚細(xì)胞、原代兔腎細(xì)胞、鼠腎細(xì)胞、淋巴細(xì)胞。⒉二倍體細(xì)胞系原代細(xì)胞經(jīng)過傳代篩選克隆,從多種細(xì)胞成分的組織中,挑選并純化出某種具有一定特征的細(xì)胞株。二倍體細(xì)胞有正常細(xì)胞的特點:①染色體組型是2n核型;②貼壁依賴接觸抑制;③可傳代培養(yǎng)50代;④無致瘤性。二倍體細(xì)胞⒊轉(zhuǎn)化細(xì)胞系通過某個轉(zhuǎn)化過程形成的,常由于染色體斷裂變成異倍體,失去正常細(xì)胞特點,而獲得無限增殖能力。轉(zhuǎn)化過程可以是自發(fā)的,和人工的,從腫瘤組織中。三、常用生產(chǎn)用動物細(xì)胞

的特性

W1-38:正常胚肺組織人二倍體細(xì)胞系。核型為2n=46。成纖維細(xì)胞,能產(chǎn)生膠原,培養(yǎng)基用BME(Eagle’Basalmedium)。10%小牛血清,pH7.2,同工酶為G6PDB型。倍增時間為24h,有限壽命50代。安全,用于制備疫苗。

MRC-5:從正常男性肺組織中獲得的人二倍體細(xì)胞系。核型為2n=46。屬成纖維細(xì)胞。培養(yǎng)基用加小牛血清。同工酶G6PD(葡萄糖-6-磷酸脫氫酶

)B型。有限壽命42~46代。增殖速度較W1-38快,對不良環(huán)境敏感性較W1-38低。對人的病毒敏感。用于生產(chǎn)疫苗。

CHO-K1:從中國地鼠卵巢中分離的上皮樣細(xì)胞。核型:2n=20~22。培養(yǎng)基:DEME培養(yǎng)基

0.1mmol/L次黃嘌呤,0.1mmol/L胸苷,

10%小牛血清,加入脯氨酸。

BHK-21:從5只無性別的生長1天的地鼠幼鼠腎臟中分離的;成纖維樣細(xì)胞,核型為2n=44;培養(yǎng)基為DMEM加7%胎牛血清。用于增殖病毒,包括多瘤病毒、口蹄疫病毒、狂犬病毒等并制作疫苗,現(xiàn)已用于工程細(xì)胞構(gòu)建。用于增殖病毒,包括多瘤病毒、口蹄疫病毒、狂犬病毒等并制作疫苗,現(xiàn)已用于工程細(xì)胞構(gòu)建。

Vero:從正常成年非洲綠猴腎臟分離的。為貼壁依賴的成纖維細(xì)胞,核型2n=60;培養(yǎng)基為199培養(yǎng)基,加5%胎牛血清;用于增殖病毒,包括多瘤病毒、脊髓灰質(zhì)炎、狂犬病毒。

Namalwa:從肯尼亞患有淋巴瘤病人獲取,建成的人的類淋巴母細(xì)胞。2.8%的高倍體率,12~14條標(biāo)記染色體。單條X,無Y。培養(yǎng)基為RPMI1640,添加7%胎牛血清。用于生產(chǎn)

α干擾素。

SP2/0-Ag14:通過融合的方法,從有羊抗紅細(xì)胞活性的BALB/c

小鼠的脾細(xì)胞和骨髓瘤細(xì)胞系P3X63Ag8融合雜交瘤SP2/NL-Ag

亞克隆中分離獲得,

能耐受8氮鳥嘌呤20μg/ml但在含HAT選擇培養(yǎng)基中不能存活。通常用培養(yǎng)基為DMEM,添加10%胎牛血清。用于生產(chǎn)單抗雜交瘤細(xì)胞和抗體。

Sf-91983年從親代IPLB—SF21AE

中克隆形成。親代細(xì)胞從秋粘蟲的蛹卵組織中分離獲得。它對苜宿尺蠖核型多角體病毒和其它桿狀病毒高度敏感。通常用的培養(yǎng)基為Grace培養(yǎng)基,添加3.3g/L水解乳蛋白和3.3g/L酵母浸液,10%胎牛血清。用于高效表達外來蛋白制品。四、基因工程細(xì)胞構(gòu)建和

篩選在生產(chǎn)中采用更多的更有前景的是融合細(xì)胞及采用基因工程構(gòu)建的各種工程細(xì)胞。被用構(gòu)建工程細(xì)胞的動物細(xì)胞有:

CHO-dhfr

、BHK-21、Namalwa、Vero、SP2/0、Sf-9等細(xì)胞。⒈真核細(xì)胞基因表達載體的構(gòu)建使用的載體有兩類:㈠病毒載體牛痘病毒、腺病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、桿狀病毒㈡質(zhì)粒載體

牛痘病毒:用構(gòu)建多價疫苗腺病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒:用于基因治療。桿狀病毒:用于外源基因表達。

其作為載體的優(yōu)點:

①雙鏈DNA,易重組

②插入7~8kbDNA不影響正常病毒粒子的形成。③多角體蛋白和病毒粒子的形成無直接關(guān)系,因此用外源基因更換多角體蛋白基因,仍能形成有感染力病毒粒子;

④多角體蛋白基因有非常強的啟動子,產(chǎn)生的蛋白質(zhì)可占全部蛋白質(zhì)的20%~30%;⑤用光學(xué)顯微鏡可看到多角體,可以此作為標(biāo)記物,選陽性克隆。⑥如用家蠶桿狀病毒,還可在蠶體表達外源基因。

質(zhì)粒載體在細(xì)菌和哺乳動物細(xì)胞體內(nèi)都能擴增。都含有如下基本成分:①允許載體在細(xì)菌體內(nèi)擴增的質(zhì)粒序列。②含有使基因表達的調(diào)控元件。

③能用以篩選出外源基因已整合的選擇標(biāo)記。

④有時還帶有選擇性增加拷貝數(shù)的擴增系統(tǒng)。⒉基因載體的導(dǎo)入和高效表達工程細(xì)胞株的篩選基因載體導(dǎo)動物細(xì)胞常用方法是:磷酸鈣沉淀法電穿孔法

HATHAT次黃嘌呤(H)核苷酸前體,使cell通過替代途徑合成DNA氨基蝶呤(A)葉酸拮抗物,阻斷cell合成DNA的主要途徑胸腺嘧啶核苷(T)使cell通過替代途徑合成DNA

cell合成DNA有兩種途徑:a)主要途徑:糖、aa、合成核苷酸,合成DNA,需葉酸參與氨基蝶呤(A)可阻斷b)替代途徑:次黃嘌呤(H)、胸腺嘧啶核苷(T)HGPRT(次黃嘌呤鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶);TK催化

磷酸鈣沉淀法:溶解的DNA加Na2HPO4和CaCl2形成磷酸鈣沉淀,DNA被包在磷酸鈣沉淀中,形成DNA—磷酸鈣共沉淀物,當(dāng)和細(xì)胞表面接觸時,則通過細(xì)胞吞噬作用而將DNA導(dǎo)入。

電穿孔法:

借助電穿孔儀的高壓脈沖電場,使細(xì)胞膜出現(xiàn)瞬時可逆性小孔,外源DNA沿小孔進入細(xì)胞。轉(zhuǎn)化率較高,拷貝數(shù)低。五、細(xì)胞庫的建立生產(chǎn)用的工程細(xì)胞必須建立兩個細(xì)胞庫:

⒈原始細(xì)胞庫

⒉生產(chǎn)用細(xì)胞庫⒈原始細(xì)胞庫貯存時須有該細(xì)胞的詳細(xì)擋案,包括:

①該細(xì)胞系的歷史②該細(xì)胞系的特性③對各種有害因子的檢查結(jié)果⒉生產(chǎn)用細(xì)胞庫從原始細(xì)胞庫來的,或從單一安瓶來,或從多個安瓶來即刻混合,經(jīng)培養(yǎng)擴增再分裝儲存形成細(xì)胞庫。需建擋案,進行無菌性無細(xì)胞交叉污染的檢查。需確定最高使用的傳代數(shù)。第四節(jié)動物細(xì)胞的培養(yǎng)

條件和培養(yǎng)基細(xì)胞體外培養(yǎng)基本條件:①無菌②營養(yǎng)充足,防止有害物質(zhì)③氧氣④隨時清除代謝有害物質(zhì)⑤良好的生存外環(huán)境⑥及時分種一、動物細(xì)胞的培養(yǎng)條件⒈器材的清洗和消毒⑴器材的清洗浸泡、刷洗、泡酸、沖洗⑵器材的消毒滅菌物理消毒化學(xué)消毒⒉水質(zhì):電阻值大于18MΩ,

去熱原。⒊pH:7.2~7.4⒋滲透壓:290~300mOsm/kg⒌溫度:37±0.5C⒍空氣:氧的飽和質(zhì)60%,氧分壓

4~0.7kPa二、動物細(xì)胞的培養(yǎng)

基的種類和組成分3類:⒈天然培養(yǎng)基⒉合成培養(yǎng)基⒊無血清培養(yǎng)基⒈天然培養(yǎng)基

血清、羊水、腹水等,成分復(fù)雜、成分不穩(wěn)定⒉合成培養(yǎng)基

DME、MEM、DMEM、HAMF12、RPMI1640⑴氨基酸⑵維生素⑶糖類⑷無機鹽⑸其它成分添加小牛血清:添加小牛血清的作用⑴提供生長因子和激素⑵提供貼附因子和伸展因子⑶提供結(jié)合蛋白⑷提供必需脂肪酸和微量元素⒊無血清培養(yǎng)基①提高重復(fù)性②減少微生物污染③供應(yīng)充足穩(wěn)定④產(chǎn)品易純化⑤避免血清因素對細(xì)胞的毒性⑥減少血清中蛋白對生物測定的干擾無血清培養(yǎng)基加入添加劑⑴生長因子和激素⑵結(jié)合蛋白⑶貼附因子和伸展因子⑷有利細(xì)胞生長的因子和元素第五節(jié)動物細(xì)胞培養(yǎng)方

法和操作方式一、動物細(xì)胞大規(guī)模培養(yǎng)的方法依細(xì)胞種類:

原代培養(yǎng)、傳代培養(yǎng)依培養(yǎng)基:

液體培養(yǎng)、固體培養(yǎng)依培養(yǎng)器和方式:

靜止培養(yǎng)、旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)、攪拌培養(yǎng)、微載體培養(yǎng)、中空纖維培養(yǎng)、固定床或流化床培養(yǎng)

從生產(chǎn)實際分為:

懸浮培養(yǎng)貼壁培養(yǎng)貼壁-懸浮培養(yǎng)⒈懸浮培養(yǎng)讓細(xì)胞自由的懸浮于培養(yǎng)基內(nèi)生長繁殖。⒉貼壁培養(yǎng)讓細(xì)胞貼附在某種基質(zhì)上生長繁殖的培養(yǎng)方法。⒊貼壁-懸浮培養(yǎng)⒊貼壁-懸浮培養(yǎng)⑴微載體培養(yǎng)⑵包埋和微囊培養(yǎng)⑶結(jié)團培養(yǎng)二、動物細(xì)胞培養(yǎng)的操作

方式⒈分批式操作⒉半連續(xù)式操作⒊灌流式操作第六節(jié)動物細(xì)胞生物反應(yīng)

器及其檢測控制系統(tǒng)一、動物細(xì)胞生物反應(yīng)器的類型及其基本結(jié)構(gòu)⒈攪拌式生物反應(yīng)器⒉氣升式生物反應(yīng)器⒊中空纖維式生物反應(yīng)器⒋透析袋或膜式生物反應(yīng)器⒌固定床或流化床式生物反應(yīng)器⒈攪拌式生物反應(yīng)器⒉氣升式生物反應(yīng)器⒊中空纖維式生物反應(yīng)器平床式中空纖維式生物反應(yīng)器⒋透析袋或膜式生物反應(yīng)器⒌固定床或流化床式生物反應(yīng)器CellGenplus生物反應(yīng)器二、動物細(xì)胞生物反應(yīng)器的

檢測控制系統(tǒng)⒈培養(yǎng)過程需檢測的物化參數(shù)直接在線檢出取樣離線檢測檢測后計算

⒉主要參數(shù)的檢測和控制方法⒉主要參數(shù)的檢測和控制方法⑴溫度⑵pH①在培養(yǎng)初期,控制進氧量②當(dāng)細(xì)胞密度提高后控制

NaHCO3的量⑶溶氧⑷攪拌⑸進出液流量⑹其它第七節(jié)動物細(xì)胞制藥的前

景與展望一、提高產(chǎn)量降低成本和改進質(zhì)量方面的研究二、轉(zhuǎn)基因動物的研究三、組織工程的研究一、提高產(chǎn)量、降低成本和改

進質(zhì)量方面的研究

為了提高產(chǎn)量,要提高細(xì)胞表達水平。為降低成本,須改進培養(yǎng)基配方。為改進產(chǎn)品質(zhì)量,關(guān)鍵是糖基化質(zhì)量。改進工藝,生產(chǎn)設(shè)備等二、轉(zhuǎn)基因動物的研究自1982年P(guān)alimiter提出用轉(zhuǎn)基因動物來生產(chǎn)藥用蛋白以來,發(fā)展迅速。優(yōu)點:產(chǎn)量高成本低質(zhì)量與天然一樣?,F(xiàn)還有不成熟之處。對動物和人的健康的影響。三、組織工程的研究組織工程:通過對大量細(xì)胞的培養(yǎng),并用細(xì)胞直接作為一種治療手段用于臨床,或用培養(yǎng)的細(xì)胞進一步加工構(gòu)成一種組織,如人造皮膚、人造肝臟、人造胰腺、人造血管、人造骨等并用于臨床治療。三、重組蛋白質(zhì)在哺乳動物細(xì)胞中的表達

1.選擇哺乳動物細(xì)胞表達體系的優(yōu)點2.兩個主要的哺乳動物細(xì)胞表達系統(tǒng)1.哺乳動物細(xì)胞表達體系的優(yōu)點哺乳動物細(xì)胞表達體系的種類和數(shù)目已經(jīng)發(fā)展很快。哺乳動物細(xì)胞表達體系有很多其他體系不能與之相比的優(yōu)勢。它具有復(fù)雜的翻譯后加工系統(tǒng),糖基化以及二硫鍵在合成和分泌過程中自然而然的正確形成。哺乳動物細(xì)胞具有產(chǎn)生正確折疊和完全生物活性的蛋白質(zhì)。實例:組織血纖維蛋白溶酶原激活因子(tPA)、紅細(xì)胞生成素(EPO)、人DNA酶。在大腸桿菌中表達tPA時,產(chǎn)生錯折疊和非糖基化,而在酵母中表達tPA產(chǎn)生過糖基化,二者的產(chǎn)物都沒有生物活性。分泌型哺乳動物細(xì)胞表達系統(tǒng)哺乳動物細(xì)胞表達系統(tǒng)可以通過設(shè)計,使外源重組蛋白直接分泌到培養(yǎng)基中。這個重組表達單位包括N末端的信號肽,其作用是起始新生肽鏈插入到內(nèi)織網(wǎng)中,此信號肽在分泌過程中被切除,從而產(chǎn)生具正確N端的重組蛋白質(zhì)。從內(nèi)織網(wǎng)到高爾基體再到細(xì)胞外空間的分泌過程產(chǎn)生糖基化和防止蛋白被胞內(nèi)蛋白酶水解。分泌過程也使蛋白質(zhì)二硫鍵正確配對和正確折疊。哺乳類動物細(xì)胞表達體系的另一個用處是在天然環(huán)境條件下,研究工程化基因產(chǎn)物的性質(zhì)。如將胰島素受體基因經(jīng)突變后,再導(dǎo)入到特定細(xì)胞中表達發(fā)現(xiàn),在受體蛋白質(zhì)上單一氨基酸的突變可導(dǎo)致其對胰島素結(jié)合活性的喪失,并導(dǎo)致激活自磷酸化和酪氨酸激酶。

2.兩個主要的哺乳動物細(xì)胞表達系統(tǒng)在哺乳動物細(xì)胞中有兩個基因表達系統(tǒng)可供選擇,一是瞬時表達系統(tǒng),一是穩(wěn)定表達系統(tǒng)。瞬時基因表達系統(tǒng)是一個簡單、有效的外源蛋白表達手段,其表達水平最高可以達到穩(wěn)定細(xì)胞表達水平。蛋白質(zhì)是由未整合的、不復(fù)制的質(zhì)粒DNA產(chǎn)生的,這樣使得蛋白質(zhì)表達的時間相對短,只有48h到7天。穩(wěn)定表達系統(tǒng)需要得到穩(wěn)定轉(zhuǎn)化的細(xì)胞株,需要1~2個月的時間,在穩(wěn)定轉(zhuǎn)化的細(xì)胞中,DNA被整合到染色體中,這使得重組蛋白質(zhì)產(chǎn)物可以一代接一代地產(chǎn)生。四、噬菌體顯示(Phagedisplay)對EPO分子片段的篩選關(guān)于噬菌體顯示的表達載體噬菌體顯示技術(shù)的操作EPO-EPOREMP-EBP

GeorgeP.SmithValeryA.PetrenkoGeorgeP.Smithb.in1941.Bsc.degreeinbiologyin1963,aPh.D.inbacteriologyandimmunologyfromHarvardUniversityin1970.AfterapostdoctoralfellowshipwithOliverSmithiesattheUniversityofWisconsin,hejoinedthefacultyoftheDivisionofBiologicalSciencesattheUniversityofMissouriinColumbiain1975asAssistantProfessorandsincehasbeenpromotedtoAssociateandFullProfessor.Hehaspublished35papersinareasincludingantibodystructureandevolution,theevolutionofrepeatedDNAsequences,genomics,andthebiologyofthefilamentousphage.Itisfromhisinterestinthefilamentousphagethattheideaofphagedisplayevolved.ValeryA.Petrenkob.In1949,haspublishedover70papersandhas13inventionsandpatents.OverviewThepast10yearshasseenremarkableprogressinourunderstandingofthereplicationcycleoftheM13phageThelifecycleisverysophisticatedInitialinfectiontransfersgeneticmaterialintohostwithlittlemembranedisruption.LateinfectionstagesperturbhostmembraneforreleaseofvirionsM13isnon-lyticM13StructureDimensions:6.5nmindiameterLengthdependantongenomebutwildtypeapproximately930nmMass16.3MDofwhich87%comprisedofproteinGenome:SinglestrandedcircularDNAmolecule,covalentlyclosedHousedinaflexibleproteincylinderM13StructureGenomeorientation78NucleotidehairpinregioncalledthepackagingsignallocatedatpVII/pIXterminusM13StructureProteinsLengthofphagecylindercomprises2700copiesofthe50-amino-acidmajorcoatproteinpVIIIAtoneterminus:5copiesof33AAresiduepVII5copiesof32AAresiduepIXAtoneterminus:5copiesof406AAresiduepIII5copiesof112AAresiduepVIM13GeneFunctionsGeneFunctionAminoAcidsMolWtIIDNAReplication41046137XDNAReplication11112672VBindingssDNA879682VIIIMajorcapsidprotein505235IIIMinorcapsidprotein40642522VIMinorcapsidprotein11212342VIIMinorcapsidprotein333599IXMinorcapsidprotein323650IAssembly34839502IVAssembly40543476XIAssembly10812424PhageLifeCycleInfectionprocessMultistepRequiresbacterialFconjugativepilusandbacterialTolQ,R&Acytoplasmicmembraneproteins.InitiatedbybindingofFpilustophagepIIIN2domain.Pilusretracts(triggeredbyphage???)bringingpIIIterminustotheperiplasm.N2bindingreleasesN1forinteractionwithbacterialTolAPhageFPilusOMCMTolQTolATolRPeriplasmN1N2PhageLifeCycleInfectionprocesscontSubsequentstepsunclearpVIII,pVII&pIXdisassembleintocytoplasmicmembraneasphageDNAistranslocatedintocytoplasm?OnceinthemembranepVIIIjoinspoolofnewlysynthesisedpVIIIfornewparticleformation.PhageLifeCycleReplicationComplementary(-)DNAstrandtoviral(+)DNAsynthesisedbybacterialenzymesGyrase,atopoisomerase,catalysesformationofdsDNA

supercoilscalledthereplicativeform(RF)The(-)strandoftheRFistranscribedandtranslatedintothephageproteinsThepIIproteinnicksthe(+)strandRFintheintergenicregiontoproduceaprimerforsynthesisofanewviralstrandpIIcircularisesthedisplaced(+)strandandconvertsittoasupercoiled

dsDNA;apoolofprogenydsDNAisthusformedAtacriticalconcentrationofpV,dimersofpVbindtothedsDNApreventingfurtherdsDNAproductionbutallowingsynthesisof(+)DNAPhageLifeCycleReplicationpV

dimersbindtothe(+)strandandwrapsitupA78nucleotidehairpinregionoftheDNAremainspVfreeandactsasapackagingsignalinitiatingthephageassemblyreactionpXisalsocytoplasmicallylocatedandisrequiredforreplicationbutitsroleisunclearAlloftheotherphageproteinsaresynthesisedandinsertedintothebacterialmembranePhageLifeCycleAssemblyOccursatbacterialadhesionzonelikesitespV

dimersareremovedandthecapsidproteinsareassembledaroundtheDNAasitisextruded.TheprocessisinitiatedbyinteractionofpVII,pIXandpVIIIwiththeDNApackagingsignalUnknownhowpVIandpIIIareaddedatendofvirionPhageReplicationSchematicDNAReplicationProteinsCapsid&Assembly

Proteins(+)+++/-pVPhageAssemblySiteFPilusPhageDNAPhageDisplayLibrariesPhagedisplayisapowerfultoolthatextendstherangeofmoderncombinatorialscreeningtechniques,allowingthediscoveryandcharacterisationofproteinsthatinteractwithadesiredtarget.Phagedisplayisasysteminwhichaproteinisdisplayedonthesurfaceofaphageasafusionwithoneofthecoatproteinsofthevirus.TheDNAthatencodesthisproteinishousedwithinthevirion.BycloninglargenumbersofDNAsequencesintothephage,displaylibrariesareproducedwitharepertoireofmanybillionsofuniquedisplayedproteins.PhageDisplayLibrariesUsingaprocessofbiopanning,onecanrescuephagethatdisplayaproteinthatspecificallybindstoatargetofinterest.Briefly,asimplemethodforbiopanninginvolvescoatingaplatewiththetargetandincubatingthelibraryontheplatetoallowphagedisplayingacomplementaryproteintothetargettobind.Non-bindingphagearethenwashedawayandthosethatareboundareeluted.Infectionofbacteriawiththebindingphageresultsinphageamplification.Successiveroundsofbiopanningenrichthepoolofphage,withclonesthatspecificallybindthetarget.PeptidePhageDisplaypVIIIPeptideDisplayDisplayoneverycopyofpVIIIlimitedto6-8aminoacidsbutarepotentiallyimmunogenicandsusceptibletoproteasesHybridvirionsinwhich80%ofpVIIIarewild-typeallowlargepeptidesandproteinstobedisplayedpIIIPeptideDisplayOnlyfivemoleculescanbedisplayedperphageLargeinsertspackagewellbutreduceinfectivityOvercomebydisplayingpeptideononlyonepIIImolecule=phagemidsystem;pIIIwildtypeencodedbyhelperphage,displayedpeptideencodedbyphagemidPhagedisplaymethod(1)M13(afilamentousphagecontainingss-DNAencasedinaproteincoat):containsfivecoatproteins,twoofwhicharegVIIIp(geneVIIIprotein)andgIIIp(geneIIIprotein).Phagedisplaymethod(2)Phagedisplaymethod(2):(contd.)Phagedisplaymethod(2):(contd.)PhagedisplayofrandompeptidelibrariesidentifiedagonsitsoferythropoietinreceptorAgonists:whichmimicthefunctionofahormonebybindingtoitsreceptorandcausingthenormalresponse.Antagonists:whichbindtothereceptorbutdonotactivatehormone-inducedeffectsPhagedisplayofrandompeptidelibrariesidentifiedagonsitsoferythropoietinreceptor(contd.)Toidentifypeptidesorsmallmoleculeswhicheitherinhibitorstimulatehormonefunction.Thehot-spotprinciple:asmallnumberofresiduesatabindinginterfacecontributemostofthebindingenergy.Erythropoietin(EPO):acytokinehormonewhichstimulatesformationofredbloodcells.EPOR:erythropoietinreceptorEBP:extra-cellulardomainofEPORPhagedisplayofrandompeptidelibrariesidentifiedagonsitsoferythropoietinreceptor(contd.)

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