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文檔簡介
一、引物設(shè)計:1,選擇合適的載體。酶切位點及其順序(酶切位點的順序一定不能顛倒)。2,在NCBI上再次確認(rèn)目的片段的堿基序列,進(jìn)行primerblast,確定其特異性。使用primer5排除目的片段里含有的酶切位點,或利用其本身含有的酶切位點,最后確定所使用的酶。首位20個堿基上游酶切位點保護(hù)堿基1個設(shè)計引物:primer-up起始密碼子閱讀框無移碼:首位20個堿基上游酶切位點保護(hù)堿基1個起始密碼子閱讀框無移碼末尾20個堿基的反向互補堿基下游酶切位點保護(hù)堿基1個Primer-down終止密碼子,整個無移碼:-----------末尾20個堿基的反向互補堿基下游酶切位點保護(hù)堿基1個終止密碼子,整個無移碼核對----送公司合成。對公司合成的引物離心,10000rpm、5-10分鐘、at4℃,在超凈臺按照管子上標(biāo)注的體積加入1*TE,為100uM,再用ddH2O稀釋成10uM,-30℃保存。二、PCR():(一)、引物Tm值titrate:pcr(15ul小體系)Sence:0.3ul一般titrate5個溫度值,并設(shè)一Antisence:0.3ul個NC(不加template)DNTP:0.3ulcDNA一般為Hela或293TTaq:0.1ul10*buffer:1.5ulTemplate(cDNA):1ulH2O:11.5ul(二)、pcr(50ul大體系)Sence:1ulTm溫度用titrate時得到的條帶Antisence:1ul最亮的溫度DNTP:1ulTaq:0.5ul10*buffer:5ulTemplate(cDNA):2ulH2O:39.5ul三、跑膠,膠回收:1.2%的瓊脂糖膠:大膠孔1、1.2%的瓊脂糖膠:大膠孔煮沸3次稱1.2g的瓊脂糖煮沸至少三次至無肉眼可見沉淀凝膠塊煮沸3次煮沸至少三次至無肉眼可見沉淀凝膠塊加入100ml的1XTAE(視plasmid大小不同膠的濃度不同,plasmid越小膠濃度越大)膠凝固后,即可點樣跑膠。2、跑膠:120V、40min。3、泡EB溶液20min后,紫外燈下觀察,切膠(要帶防護(hù)手套和口罩)4、做膠回收:(1)加入400ul溶膠液,55℃溶膠;(2)待膠全溶后,過膠回收柱,12000rpm,1min;(3)DNAWashBuffer500ul,12000rpm,1min,twice;(4)開蓋離心,15min;(5)換新的1.5mlEP管,加ElutionBuffer30ul,12000rpm,1min,重復(fù)吸取,12000rpm,1min;(ElutionBuffer使用前65℃溫?zé)幔?)測濃度四、連接:2xBuffer5ul10ul的體系TVector0.5ul16℃水浴過夜Insert4ulInsert的量應(yīng)用ug數(shù)統(tǒng)計Insert的量應(yīng)用ug數(shù)統(tǒng)計Lignase0.5ul若insert濃度較大,應(yīng)加的量小于4ul,則其余部分用水補齊。五、連接轉(zhuǎn)化:感受態(tài)DH5α感受態(tài)DH5α100ul連接產(chǎn)物10ul(1)、冰上20min→熱激:42℃、1min30s→冰上20min;(2)、加500ulSOC(或者500ulLB),37℃、220rpm、1h;(3)、平板提前取出提前放37℃恒溫箱預(yù)熱,取100ulIPTG+50ulX-Gal,混勻,涂板,正置于37℃恒溫箱吸收;(4)、將上述轉(zhuǎn)化后的菌液涂板(根據(jù)載體抗性不同涂不同的抗性板);(5)、37℃恒溫培養(yǎng)箱,倒置過夜。六、挑菌:4mlLB+一定比例抗生素(與平板抗生素一致,取決于載體對應(yīng)的抗生素,Amp比例為1:1000,Kana比例為1:200),用黃槍頭挑取單菌落,于試管中吹懸,灼燒瓶口及試管塞,37℃,220rpm,震蕩過夜(至菌液渾濁不透明)。一般挑5-6管七、菌液PCR(15ul體系)Sence:0.3ul加一PC,用以前連T成功的Antisence:0.3ulplasmidDNTP:0.3ul使用T載體的通用引物T7、Sp6Taq:0.1ul10*buffer:1.5ulTemplate(菌液):1ulH2O:11.5ul跑DNA膠驗證,取條帶位置正確的提取質(zhì)粒。八、質(zhì)粒小提1、菌液于2mlEP管內(nèi)離心,12000rpm,2min;2、棄上清,加溶液Ⅰ250ul吹懸沉淀;3、加溶液Ⅱ250ul,輕輕搖晃10次,靜置5min;4、加溶液Ⅲ350ul,震蕩5次,冰上靜置1min;5、離心,12000rpm,15min;6、將上清過柱,12000rpm,1min;7、漂洗液700ul過柱,12000rpm,1min;8、漂洗液500ul過柱,12000rpm,1min;9、開蓋離心,12000rpm,15min;10、換新的1.5mlEP管,加60ul洗脫液,12000rpm,1min,重復(fù)洗脫一次。11、測濃度。九、質(zhì)粒PCR(15ul體系)Sence:0.3ulAntisence:0.3ulDNTP:0.3ul使用特異性引物Taq:0.1ul10*buffer:1.5ulTemplate(plasmid):0.5ulH2O:12ul跑DNA膠驗證,取條帶位置正確的做酶切。十、酶切(10ul小體系酶切)ControlXholBamHⅠX-BBuffer1111Palsmid200ngXhol-0.2-0.2BamHⅠ--0.20.2H2O補足至10ul37℃2h跑DNA膠驗證,若切全了且位置正確,則送測序。十一、測序結(jié)果blast通過NCBI對測序結(jié)果進(jìn)行blast,若沒有突變或者沒有有義突變,沒有缺失,則沒有閱讀框的移碼,酶切位點方向與類別均正確,起始子終止子正確,進(jìn)行質(zhì)粒擴(kuò)增,大體系酶切。沒有閱讀框的移碼,酶切位點方向與類別均正確,起始子終止子正確,十二、質(zhì)粒擴(kuò)增感受態(tài)DH5α感受態(tài)DH5α10ulPlasmid1ul(50ng)(1)、冰上15min→熱激:42℃、1min30s→冰上2min;(2)、加100ulSOC(或者100ulLB),37℃、220rpm、30h;(4)、1ul培養(yǎng)液+100ulSOC(或LB)涂板(根據(jù)載體抗性不同涂不同的抗性板);(5)、37℃恒溫培養(yǎng)箱,倒置過夜。十三、酶切(一)、10ul小體系酶切驗證(與第十步體系相同)(二)、60ul大體系酶切(insert、vector)ControlX-BBuffer6ul6ulPalsmid100ng5ugXhol-1ulBamHⅠ-1ulH2O補足至60ul37℃3h在酶切到2h30min時,取10ul酶切溶液跑DNA電泳已確認(rèn)是否切全,insert:若未切全,可補1/4的酶繼續(xù)切半個小時;若已切全,則可將剩余酶切液跑電泳,切膠,膠回收。Vector:若未切全,可補1/4的酶繼續(xù)切半個小時;若已切全,則加1ulCIAP酶繼續(xù)切處理CIAP酶的作用是除去磷酸基團(tuán),降低載體自連30min,然后將酶切液跑電泳,切膠,膠回收。處理CIAP酶的作用是除去磷酸基團(tuán),降低載體自連十四、切膠,膠回收與第三步相同十五、連接10xBuffer1ul10ul的體系Vector0.5ul16℃水浴過夜Insert4ulT4DNALignase1ulVector與insert的質(zhì)量比為5:3物質(zhì)量比,即摩爾比,載體:insert=1:#物質(zhì)量比,即摩爾比,載體:insert=1:#若insert濃度較大,則其余部分用水補齊。十六、連接轉(zhuǎn)化感受態(tài)DH5α100ul感受態(tài)DH5α100ul連接產(chǎn)物10ul(1)、冰上20min→熱激:42℃、1min30s→冰上20min;(2)、加500ulSOC(或者500ulLB),37℃、220rpm、1h;(3)、將上述轉(zhuǎn)化后的菌液涂板(根據(jù)載體抗性不同涂不同的抗性板);(4)、37℃恒溫培養(yǎng)箱,倒置過夜。十七、挑菌:4mlLB+一定比例抗生素(與平板抗生素一致,取決于載體對應(yīng)的抗生素,Amp比例為1:1000,Kana比例為1:200),用黃槍頭挑取單菌落,于試管中吹懸,灼燒瓶口及試管塞,37℃,220rpm,震蕩過夜(至菌液渾濁不透明)。一般挑5-6管十八、菌液PCR(15ul體系)Sence:0.3ul加一PC,用以前連該載體成功Antisence:0.3ul的plasmidDNTP:0.3ul使用載體的通用引物Taq:0.1ulpc3.1的通用引物為cmv和bgh10*buffer:1.5ul19b的通用引物為t7和terminaterTemplate(菌液):1ulH2O:11.5ul跑DNA膠驗證,取條帶位置正確的提取質(zhì)粒。十九、質(zhì)粒小提1、菌液于2mlEP管內(nèi)離心,12000rpm,2min;2、棄上清,加溶液Ⅰ250ul吹懸沉淀;3、加溶液Ⅱ250ul,輕輕搖晃10次,靜置5min;4、加溶液Ⅲ350ul,震蕩5次,冰上靜置1min;5、離心,12000rpm,15min;6、將上清過柱,12000rpm,1min;7、漂洗液700ul過柱,12000rpm,1min;8、漂洗液500ul過柱,12000rpm,1min;9、開蓋離心,12000rpm,15min;10、換新的1.5mlEP管,加60ul洗脫液,12000rpm,1min,重復(fù)洗脫一次。11、測濃度。二十、質(zhì)粒PCR(15ul體系)Sence:0.3ulAntisence:0.3ulDNTP:0.3ul使用特異性引物Taq:0.1ul10*buffer:1.5ulTemplate(plasmid):0.5ulH2O:12ul跑DNA膠驗證,取條帶位置正確的做酶切。二十一、酶切ControlXholBamHⅠX-BBuffer1111Palsmid200ngXhol-0.2-0.2BamHⅠ--0.20.2H2O補足至10ul37℃2h跑DNA膠驗證,若切全了且位置正確,則送測序。二十二、測序比對通過NCBI對測序結(jié)果進(jìn)行blast,若沒有突變或者沒有有義突變,沒有缺失,則擴(kuò)增一批質(zhì)粒后,構(gòu)建到表達(dá)載體中PC3.1也是表達(dá)載體,是哺乳動物細(xì)胞的表達(dá)載體。PC3.1也是表達(dá)載體,是哺乳動物細(xì)胞的表達(dá)載體二十三、構(gòu)建到表達(dá)載體(一)、將plasmid轉(zhuǎn)化進(jìn)表達(dá)載體BL21BL21是大腸桿菌宿主細(xì)胞,不是表達(dá)載體BL21是大腸桿菌宿主細(xì)胞,不是表達(dá)載體感受態(tài)BL2110ul感受態(tài)BL2110ulPlasmid1ul(1)、冰上15min→熱激:42℃、1min30s→冰上2min;(2)、加100ulSOC(或者100ulLB),37℃、220rpm、30min;(3)、5ul菌液+100ulSOC(或100ulLB)涂板(根據(jù)載體抗性不同涂不同的抗性板);(4)、37℃恒溫培養(yǎng)箱,倒置過夜。(二)、挑菌(早上挑)2.5ml2xYT(或者LB)+一定比例抗生素(Amp1:1000、Kana1:200這里最好用終濃度表示,黑本夾子上有配方,根據(jù)配方ug/ml計算出最終加的量),37℃,220rpm這里最好用終濃度表示,黑本夾子上有配方,根據(jù)配方ug/ml計算出最終加的量(三)、小樣誘導(dǎo)1、待菌液微渾濁時取出,取300ul菌液加200ul50%甘油,封口膜封口于-80℃凍存。再需要用時取出,溶化后直接劃線即可。2、取300ul菌液,離心12000rpm,1min,棄上清,沉淀用90ul水吹勻,加30ul4xSDS,95℃煮10min,誘導(dǎo)前樣品即備好。3、剩余1.4ml菌液,用IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)(有兩種誘導(dǎo)條件)1:200同樣,終濃度220rpm37℃常溫誘導(dǎo)4h同樣,終濃度1:1000180rpm25℃低溫誘導(dǎo)16h4、誘導(dǎo)完成后,取300ul菌液,離心12000rpm,1min,棄上清,沉淀用90ul120ul水吹勻,加30ul40ul4xSDS,95℃煮10min,誘導(dǎo)后樣品即備好。120ul40ul5、剩余菌液離心12000rpm,2min,棄上清,沉淀用100ul水吹勻,20%功率1s1s超聲2min左右,至菌體均勻澄清,離心12000rpm,5min,取上清90ul,加30ul4xSDS,95℃煮10min,上清樣品即備好;剩余上清棄掉,沉淀用120ul水吹勻,加40ul4xSDS,95℃煮10min,沉淀樣品即做好。6、先跑考染驗證蛋白是否誘導(dǎo)出,然后跑westernblot驗證抗體驗證誘導(dǎo)出的條帶是否為特異性蛋白是否好用。驗證誘導(dǎo)出的條帶是否為特異性蛋白7、上樣順序及上樣量:前后清沉105105(ul)(四)、大樣誘導(dǎo)1、將之前的保種菌液取出劃線,37℃,倒置過夜;2、2.5ml2xYT(或者LB)+一定比例抗生素,搖菌,待微微渾濁后,倒進(jìn)含抗生素的200ml2xYT(或者LB)里,37℃,220rpm,振蕩培養(yǎng),期間注意觀察測量使其OD值在0.4-0.6之間為止;3、取500ul菌液作
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