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合成路線的選擇第一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日本章內(nèi)容2.1概述2.2合成子與逆向合成法2.3分子設(shè)計(jì)和分子工程2.4組合化學(xué)合成第二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日教學(xué)要求掌握合成子的概念;掌握逆向合成分析法;掌握合成路線設(shè)計(jì)方法。了解合成路線設(shè)計(jì)的意義、分子設(shè)計(jì)與分子工程的概念以及組合化學(xué)的概念。第三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日、合成路線設(shè)計(jì)的意義
合成路線設(shè)計(jì)主要是指從理論上討論分析如何設(shè)計(jì)合成路線以及合成的策略技巧。合成路線設(shè)計(jì)——根據(jù)目標(biāo)分子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),選擇適當(dāng)?shù)脑?,適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)組合成的較為合理的合成路線。合成路線是合成工作者為待合成的目標(biāo)化合物所擬定的合成方案。2.1概述第四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日20世紀(jì)70年代后期,合成化學(xué)家們開始總結(jié)合成的規(guī)律和合成設(shè)計(jì)等問題。較早提出合成路線設(shè)計(jì)問題的是美國哈佛大學(xué)的科里(Corey)教授(獲1990年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)),他在1964年提出“合成子法”(synthonapproach),得到化學(xué)界的廣泛重視。國內(nèi)外關(guān)于合成戰(zhàn)略的討論雖然只有40多年的歷史,但發(fā)展很快,并取得了很大成績,如今已發(fā)展到利用計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)合成路線。對(duì)于無機(jī)化合物和材料的合成來說,現(xiàn)代合成設(shè)計(jì)的重點(diǎn)是分子設(shè)計(jì)和分子工程的應(yīng)用。第五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日、合成路線設(shè)計(jì)的基本方法(1)原料決定在藥物、農(nóng)藥等的研究工作中,往往需要制備一系列的同系物或合成一系列類似物(只改變分子結(jié)構(gòu)中的某一部分),以便從中篩選出效果最佳的化合物并保留藥物的有效基本結(jié)構(gòu)。起始原料反應(yīng)目標(biāo)分子第六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日(2)反應(yīng)決定有些情況下,在實(shí)驗(yàn)室的基礎(chǔ)研究工作中會(huì)發(fā)現(xiàn)一些預(yù)料之外的化學(xué)反應(yīng),或反應(yīng)產(chǎn)物。這些產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)很特殊而又與某種天然有機(jī)物的結(jié)構(gòu)相似,因此往往以這個(gè)產(chǎn)生特定結(jié)構(gòu)的反應(yīng)出發(fā),找尋具有相似結(jié)構(gòu)特點(diǎn)的有意義的目標(biāo)分子,然后再確定適當(dāng)?shù)钠鹗荚?,從而確定整個(gè)合成路線。反應(yīng)目標(biāo)分子起始原料第七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日(3)目標(biāo)分子決定這是經(jīng)常采用并已發(fā)展成為有一定規(guī)律可循的邏輯推理的思維方法。Thelogicofchemicalsynthesis1972年,EJ.Corey,創(chuàng)建了一種獨(dú)特的有機(jī)合成理論—逆合成分析理論第八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日、合成路線的評(píng)價(jià)①合理的反應(yīng)機(jī)理即從單元反應(yīng)來分析應(yīng)該是可行的,其組合能夠達(dá)到合成所需化合物的目的。②合成效率高即力求減少副反應(yīng)以提高產(chǎn)品的收率。③合成路線簡捷反應(yīng)步驟的長短直接關(guān)系到合成路線的經(jīng)濟(jì)性。一個(gè)每步產(chǎn)率為90%的十步合成,全過程的總產(chǎn)率僅為35%;而五步合成,則總產(chǎn)率可提高為59%,若合成步驟僅三步時(shí),其總收率就升高為73%。因而就盡可能采用短的合成路線。④原料、試劑等來源豐富,毒性小,能耗低。⑤溫和的反應(yīng)條件,操作簡便安全。⑥盡可能符合綠色合成的原則。第九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2合成子與逆向合成法碳鏈的構(gòu)筑和碳環(huán)的形成是有機(jī)化合物合成過程中最基本的任務(wù)。第十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日構(gòu)筑骨架的方法:一是利用碳負(fù)離子或帶有較高負(fù)電荷密度的碳中心試劑(親核試劑,電子給予體,donor)與碳正離子或帶有正電荷密度的碳中心試劑(親電試劑,電子接受體,acceptor)的結(jié)合。+-第十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日二是利用碳中心自由基的偶合反應(yīng)。第十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日三是利用周環(huán)反應(yīng)來形成碳環(huán)。第十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2.1合成子的概念合成子是分子內(nèi)在的、與合成操作有關(guān)的結(jié)構(gòu)單元。合成子是目標(biāo)分子切斷后產(chǎn)生的假想的分子碎片,可以是正離子、負(fù)離子或自由基,也可以是相應(yīng)的反應(yīng)中的一個(gè)中間體。第十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日合成乙烷自由基合成子,簡稱r-合成子。給電子的合成單元,被稱作給電子合成子,簡稱d-合成子。CH3——CH3接受電子的合成單元,被稱作受電子合成子,簡稱a-合成子。具有合成子功能的試劑被稱為該合成子的合成等價(jià)體。第十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2.2常見的a-合成子和d-合成子
根據(jù)合成子內(nèi)反應(yīng)中心碳原子與相應(yīng)官能團(tuán)(FG)間的位置不同,a-合成子又可以細(xì)分為a0—an
合成子,d-合成子分為d0—dn合成子。其中n值表示反應(yīng)中心碳原子與相應(yīng)官能團(tuán)間的相對(duì)位置。
a3:+C3-C2-C1-FGd3:-C3-C2-C1-FG
第十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2.2.1d-合成子
常見的d-合成子主要do、d1、d2和d3幾種類型。烷基負(fù)離子烯基負(fù)離子芳基負(fù)離子RH-但由于烷烴的酸性一般都非常弱由相應(yīng)的鹵代烴與金屬間反應(yīng)來制備的。第十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日末端炔烴的酸性較強(qiáng)(pKa≈22),其負(fù)離子可以由炔烴與強(qiáng)堿,如NaNH2、RLi和RMgX等直接反應(yīng)得到。
一些連有強(qiáng)拉電子取代基的甲基或亞甲基化合物,因-H具有較強(qiáng)的酸性,在強(qiáng)堿作用下易失去一個(gè)質(zhì)子形成穩(wěn)定的d1合成子。CH3SOCH3、CH3SO2CH3、HCN、R3SiCH2CI、Ph3P+-CH2RX-。-第十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日一些連有醛基、酮基、酯基和氰基的甲基或亞甲基化合物,因C—H具有相當(dāng)強(qiáng)的酸性,在強(qiáng)堿作用下易失去一個(gè)質(zhì)子形成穩(wěn)定的d2-合成子。RCH2CHO、RCH2COPh、RCH2CO2Et、CH2(CO2Et)、CH3COCH2CO2Et和CH2(CN)2-第十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日不對(duì)稱酮分子在堿作用下,可以形成兩種不同結(jié)構(gòu)的碳負(fù)離子:因此,反應(yīng)過程中會(huì)出現(xiàn)區(qū)域選擇性的問題。在低溫下與強(qiáng)堿作用后,易產(chǎn)生烷基取代少的碳負(fù)離子;在較高溫度下與堿性較弱的堿作用后,易產(chǎn)生烷基取代多、熱力學(xué)穩(wěn)定性高的碳負(fù)離子。第二十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2-庚酮在堿作用下的三甲基硅基化反應(yīng):甲基的酸性較強(qiáng)而立體位阻小,易被強(qiáng)堿LDA攫取,形成烷基取代少的碳負(fù)離子,此過程屬于動(dòng)力學(xué)控制。然而,烷基取代少的碳負(fù)離子的熱力學(xué)穩(wěn)定性較低,一旦它與烷基取代多、熱力學(xué)穩(wěn)定性高的碳負(fù)離子間形成動(dòng)態(tài)平衡,那么反應(yīng)將有利于生成烷基取代多的碳負(fù)離子相應(yīng)的產(chǎn)物,此過程屬于熱力學(xué)控制。
第二十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
具有活性-H的醛酮與伯胺反應(yīng)后形成的亞胺與LDA在醚類溶劑中發(fā)生去質(zhì)子反應(yīng)后,形成的亞胺負(fù)離子也屬于d2-合成子,第二十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日與肼作用后生成的腙經(jīng)去質(zhì)子后,也是一類很有利用價(jià)值的d2-合成子,它與親電試劑反應(yīng)常表現(xiàn)出很好的區(qū)域選擇性和立體選擇性。
具有活性-H的醛酮與仲胺反應(yīng)后形成的烯胺是一類有用的電中性的d2-合成子,它可以與鹵代烴、,β-不飽和羰基化合物及丙烯腈等親電試劑發(fā)生反應(yīng)。常用的仲胺主要有四氫吡咯、六氫吡啶和嗎啡啉。第二十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
具有活性-H的羧酸與氨基醇反應(yīng)后可以得到2-噁唑啉。后者與LDA在THF中反應(yīng)后得到的碳負(fù)離子是一種很有用的d2-合成子。利用該合成子可以合成-取代羧酸和-取代醛。第二十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日連有乙烯基和疏基的亞甲基化合物具有足夠強(qiáng)的酸性與丁基鋰等強(qiáng)堿發(fā)生質(zhì)子交換反應(yīng),形成具有一定利用價(jià)值的d3-合成子。第二十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
某些環(huán)丙烷衍生物也已經(jīng)發(fā)展成為d3-合成試劑,第二十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2.2.2a-合成子
受電子烷基合成子R+可以看做是由R—X發(fā)生C—X鍵異裂后產(chǎn)生的。最常用的合成等價(jià)體:
鹵代烷、硫酸甲酯、碳酸二甲酯、磺酸酯、磷酸三甲酯、Meerwein試劑(Me3OBF4)羰基正離子是具有代表性的a1-合成子。合成等價(jià)體:酰氯、羧酸酐、羧酸酰胺和黃原酸酯以及O-三烷基硅基硫代半縮醛。第二十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日常見的a2-合成子主要有:-羰基正離子-羥基正離子-鹵代羰基化合物環(huán)氧乙烷及其衍生物,β-不飽和硝基化合物也是a2-合成子的合成等價(jià)體。第二十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日常見的a3-合成子主要有β-羰基正離子相應(yīng)的合成等價(jià)體是,β-不飽和羰基化合物、,β-不飽和羧基化合物和,β-不飽和腈。第二十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日烯丙基型正離子和炔丙基正離子也可以視為a3-合成子它們相應(yīng)的合成等價(jià)體主要為3-鹵代丙烯、3-鹵代丙炔、3-丙烯醇的磺酸酯和3-丙炔醇的磺酸酯。
第三十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日結(jié)構(gòu)特殊的環(huán)丙基甲基化合物可以充當(dāng)a4-合成子的合成等價(jià)體:第三十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2.3極性轉(zhuǎn)換導(dǎo)致合成子類型改變的過程,稱作極性轉(zhuǎn)換。a-合成子的合成等價(jià)體d-合成子的合成等價(jià)體反應(yīng)中心碳原子的遷移第三十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
2.2.3.1雜原子的交換通過交換合成試劑分子內(nèi)的雜原子,可以使一些常見的a-合成子轉(zhuǎn)換成d-合成子。
M=Li,MgCl,Cu+-a-合成子d-合成子第三十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日酰氯是提供?;x子的有效合成試劑(a1),它與四羰基鐵酸鈉作用后可以轉(zhuǎn)變成?;?fù)離子的合成試劑(d1)。RCOClRCO-FeCO4PPh3葉立德試劑+-第三十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2.3.2雜原子的引入普通的烯烴由于分子內(nèi)存在π-電子,通常屬于給電子試劑。若將烯烴氧化成環(huán)氧乙烷化合物,即引入一個(gè)氧原子后,那么原來雙鍵上的碳原子的反應(yīng)性就被逆轉(zhuǎn)。+-a-合成子d-合成子第三十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日烯醇負(fù)離子與鹵素(通常為氯或溴)反應(yīng),即在分子內(nèi)引入一個(gè)鹵素原子后,其-碳原子的反應(yīng)性由親核性變成了親電性。-+第三十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
2.2.2.3碳片段的引入盡管在合成試劑分子內(nèi)引入某些碳片段后可以使反應(yīng)中心發(fā)生極性逆轉(zhuǎn)或遷移,但這方面的應(yīng)用實(shí)例較少。芳香醛(a1)與氰氫酸加成,使醛基碳原子的極性發(fā)生逆轉(zhuǎn)。+-第三十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日醛(a1)與乙炔負(fù)離子加成得到的2-炔醇經(jīng)氧化成2-炔酮后,末端炔氫原子易被強(qiáng)堿攫取形成炔碳負(fù)離子(d3),從而使反應(yīng)中心的位置發(fā)生了遷移。+第三十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
2.2.4簡單化合物的逆向合成分析
2.2.4.l逆向合成分析的基本知識(shí)從目標(biāo)化合物的結(jié)構(gòu)著手,把分子按一定的方式切成幾個(gè)片斷?;驹瓌t是這些片斷可以通過已知的或可以想到的化學(xué)反應(yīng)進(jìn)行重新連接。每一個(gè)片斷必須有相對(duì)應(yīng)的試劑,且該試劑應(yīng)該比目標(biāo)分子更易得到。在進(jìn)行逆向分析時(shí),結(jié)構(gòu)上的每一步變化被稱為轉(zhuǎn)換,一般用雙線箭頭表示;而通常合成步驟的每一步被稱為反應(yīng),一般用單線箭頭表示。第三十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
逆向合成分析:目標(biāo)分子CB起始原料
合成路線:起始原料BC目標(biāo)分子為了更加合理地對(duì)分子進(jìn)行切斷,人們還常常采用下述手段;①官能團(tuán)的連接和重排(Con/Rearr);②官能團(tuán)的互換(FGI);③官能團(tuán)的添加(FGA);④官能團(tuán)的移去(FGR)。第四十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日通過這些手法的處理后,一般應(yīng)該可以將目標(biāo)分子轉(zhuǎn)換成更容易得到的化合物。第四十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.2.4.2簡單化合物的逆向合成分析1、分析目標(biāo)分子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn);2、找出目標(biāo)分子的某一處可以通過適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)形成一個(gè)或幾個(gè)化學(xué)鍵;3、切斷,產(chǎn)生較為簡單的分子片段;4、對(duì)分子片段重復(fù)前面步驟,直到得到最簡單的合成子。目標(biāo)分子前體亞目標(biāo)分子合成子第四十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)開鏈單官團(tuán)分子,通??梢钥紤]在官能團(tuán)的
-碳或β-碳的連接處進(jìn)行切斷。例如,叔醇化合物可以在其
-碳上進(jìn)行切斷:第四十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日水解第四十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日目標(biāo)分子CABHGFEDI第四十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日46切斷的原則:
1.應(yīng)有合理的切斷依據(jù):
正確的切斷應(yīng)以合理的反應(yīng)機(jī)理為依據(jù),切斷后要有較好的反應(yīng)將其連接。
【例1】
第四十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日【例2】
很顯然,b路線不可行,因?yàn)橄趸胶茈y發(fā)生付-克?;磻?yīng)。a路線是合理的路線。第四十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日48【例3】a路線切斷一個(gè)碳原子后,留下的是一個(gè)不易得到的中間體,還需要進(jìn)一步的切斷。b路線將目標(biāo)分子切斷成易得的原料丙酮和環(huán)己基溴,所以b的合成路線較a短,符合最大簡化原則,是較好的切斷。
2.應(yīng)遵循最大程度簡化的原則ab第四十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日3.應(yīng)遵循原料易得的原則
如果切斷有幾種可能時(shí),應(yīng)選擇合成步驟少、產(chǎn)率高、原料易得的方案?!纠?】自選原料合成正丁醇法一:法二:法三:討論你認(rèn)為合適的方法第四十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日逆向切斷的技巧
應(yīng)用逆向合成法設(shè)計(jì)合成路線,首先就要切斷目標(biāo)分子。對(duì)于目標(biāo)分子,其結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)主要包含三個(gè)方面,即:①
碳架的建立;②
官能團(tuán)的轉(zhuǎn)化;③
立體化學(xué)的選擇性和控制。第五十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日1.優(yōu)先考慮碳架的形成
通常要盡可能選擇靠近官能團(tuán)的位置形成新的碳-碳鍵,以利于合成反應(yīng)的進(jìn)行。碎片中就必須有鹵素官能團(tuán)存在。
則碎片中就必須有羰基和活潑α-H,否則就不能聯(lián)接碳架。
第五十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日【例5】用丙烯合成丙酸
CH3CH2COOH
CH3CH2CH2OH
CH3CH=CH2
CH3CH2CH2OH
CH3CH2CH2Br
CH3CH=CH2
目標(biāo)分子在逐步切斷和官能團(tuán)的轉(zhuǎn)換中并不是隨意進(jìn)行的,一是要向目標(biāo)分子靠近,二是要使分子的切斷具有合理的反應(yīng)機(jī)理。
第五十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日53【例6】用乙醇制備
逆向切斷推導(dǎo):第五十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日第五十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日則其合成路線為:
第五十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日第五十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.碳-雜鍵的部位優(yōu)先切斷
碳-雜鍵因有極性往往不如碳-碳鍵穩(wěn)定,并且在合成時(shí)此鍵也易于生成。因此在合成一個(gè)復(fù)雜分子時(shí),常將碳-雜鍵的形成放在最后幾步完成。但在逆向合成分析時(shí),合成方向后期形成的碳-雜鍵,應(yīng)先行考慮切斷。
第五十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日58
【例7】設(shè)計(jì)目標(biāo)分子的合成路線
逆向切斷推導(dǎo):
第五十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日59則合成路線為
在醋酸乙酯中的-COOEt基團(tuán)可提高α-H的活性,而合成等效劑選用乙醇時(shí)則不行。
第五十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日3.目標(biāo)分子活性部位應(yīng)先切斷
目標(biāo)分子中官能團(tuán)部位和某些支鏈部位可先切斷,因?yàn)檫@些部位常是最易成鍵的地方。
【例8】設(shè)計(jì)目標(biāo)分子的合成路線第六十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日則合成路線第六十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日4.添加輔助基團(tuán)后切斷
有些化合物結(jié)構(gòu)上沒有明顯的官能團(tuán),或沒有明顯可切斷的鍵。這種情況下,可以在分子的適當(dāng)位置添加某個(gè)官能團(tuán),以便于找到逆向變換的位置及相應(yīng)的合成子。但同時(shí)應(yīng)考慮到這個(gè)添加的官能團(tuán)在正向合成時(shí)易被除去,否則不能添加。
第六十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日【例10】設(shè)計(jì)合成路線
分析:分子中無明顯的官能團(tuán)可利用,但在環(huán)已基上添加一個(gè)雙鍵可幫助切斷。
合成路線第六十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日5.回推到適當(dāng)階段再切斷
有些分子可以直接切斷,但有些分子卻不能直接切斷,或經(jīng)切斷后得到的合成子在正向合成時(shí)沒有合適的方法連接起來。此時(shí)應(yīng)將目標(biāo)分子回推到某一替代的目標(biāo)分子再行切斷。經(jīng)過逆向官能團(tuán)轉(zhuǎn)換或連接或重排,將目標(biāo)分子回推到某一替代的目標(biāo)分子是常用的方法。第六十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日例如,在合成時(shí)所得到的兩個(gè)合成子中,-CH2CH2OH合成子找不到其等價(jià)試劑。如果將目標(biāo)分子變換為后,再切斷,就可以由兩分子乙醛經(jīng)醇醛縮合方便地連接起來了。
第六十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日分析:目標(biāo)分子中苯環(huán)上有一烯丙基,故可以由苯基烯丙基醚經(jīng)Claisen重排得到。
【例11】設(shè)計(jì)合成路線
第六十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日則合成路線第六十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)雙官能團(tuán)分子,通常可以考慮在兩個(gè)官能團(tuán)之間的某個(gè)位置進(jìn)行切斷。r1-合成子a1-合成子d1-合成子第六十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日不過,也有不少1,2-雙官能團(tuán)分子可以通過FGI和FGR法進(jìn)行反合成分析,例如:第六十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)1,3-雙官能團(tuán)分子,通??梢岳胊1-合成子和d2-合成子的組合方式進(jìn)行切斷。例如:第七十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日在特定情況下,也可以用a2-合成子和d1-合成子的組合方式進(jìn)行切斷。例如:第七十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)1,4-雙官能團(tuán)分子,通常可以利用a2-合成子和d2-合成子的組合方式進(jìn)行切斷。例如:第七十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日在特定情況下,也可以用a3-合成子和d1-合成子的組合方式進(jìn)行切斷。第七十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)1,5-雙官能團(tuán)分子,通??梢岳胊3-合成子和d2-合成子的組合方式進(jìn)行切斷。第七十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)1,6-雙官能團(tuán)分子,通??梢岳肅on和Rearr兩種方法將其轉(zhuǎn)換成環(huán)已酮或者環(huán)已烯及其衍生物,后者在適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)條件下已被氧化開環(huán)。第七十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)環(huán)戍烷化合物,通??梢愿鶕?jù)環(huán)上官能團(tuán)的數(shù)目和性質(zhì)來切開:第七十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日對(duì)環(huán)己烯衍生物,通??梢岳肹4+2]環(huán)加成的逆反應(yīng)方式將環(huán)切開:第七十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日例:1-溴-3-甲基-2-丁烯的逆合成分析第七十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日第七十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日FGIFGI第八十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.3分子設(shè)計(jì)和分子工程
2.3.1分子設(shè)計(jì)與分子工程的基本概念
2.3.1.1分子設(shè)計(jì)
分子設(shè)計(jì):在已有有關(guān)結(jié)構(gòu)與性能關(guān)系的理論指導(dǎo)下,以合成特定結(jié)構(gòu)或性能的化合物或分子聚集體為目標(biāo),在原子和分子水平上對(duì)目標(biāo)物合成路線及其合成方法進(jìn)行設(shè)計(jì)的理論和方法。第八十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.3.1.2分子工程分子工程是將分子設(shè)計(jì)的思想與工程學(xué)原理相結(jié)合,按照某種特定需要,在分子水平上實(shí)現(xiàn)結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)和施工。結(jié)構(gòu)主要代表原子在空間相互結(jié)合成分子或其他化學(xué)實(shí)體的方式。還要考慮電子結(jié)構(gòu)和晶體缺陷等其他層次和類型以及有關(guān)結(jié)構(gòu)的原理。因此,分子工程是一個(gè)涉及物理、化學(xué)、材料、生物學(xué)以及微電子工程學(xué)的交叉學(xué)科。第八十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日揭示功能與結(jié)構(gòu)的關(guān)系是分子工程學(xué)研究的中心。功能是體系對(duì)外界作用的響應(yīng),或者說是體系對(duì)受到的輸入變換為輸出的方式,開展各種層次功能體系微觀鍵合和空間結(jié)構(gòu)的研究,對(duì)分子工程的研究有著重大意義。作為研究物質(zhì)的組成、結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和變化以及相關(guān)現(xiàn)象和規(guī)律的化學(xué)學(xué)科,在分子工程學(xué)中處于核心地位。第八十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.3.1.3分子組裝所謂分子組裝,是指按照分子工程原理,從原子和分子出發(fā),由小到大向上應(yīng)用化學(xué)合成和組裝等方式進(jìn)行操作,在較溫和的控制條件下分階段地將分子基塊(分子組元)有序地組裝出所需的分子聚集體。第八十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日當(dāng)代的科學(xué)技術(shù)發(fā)展表明,比起零維的原子或離子來,分子聚集體的排列次序及組合方式,即物理上的所謂有序性對(duì)其性質(zhì)和功能有著重大影響。例如,對(duì)于硝基苯胺(NO2C6H4NH2)這類正電荷中心和負(fù)電荷中心相互分離而又重疊的偶極分子,在氣態(tài)或稀溶液中分子間沒有相互作用,因而是無序的。第八十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日必須對(duì)分子進(jìn)行設(shè)計(jì)和組裝。非對(duì)稱中心的結(jié)構(gòu)對(duì)稱中心的結(jié)構(gòu)具有非線性光學(xué)倍頻性質(zhì)第八十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.3.2分子設(shè)計(jì)與分子工程的發(fā)展
20世紀(jì)50年代,美國麻省理工學(xué)院出版了《分子科學(xué)與分子工程》專集,提出了從原子、分子和固體的結(jié)構(gòu)來討論材料和器件的分子設(shè)計(jì)課題。從此以后,分子設(shè)計(jì)的提法就屢見不鮮。在化學(xué)合成中出現(xiàn)的“有機(jī)合成子”、“前體物”和“分子基塊”等名詞就是源自分子設(shè)計(jì)的概念。第八十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日現(xiàn)代有機(jī)合成的發(fā)展趨勢(shì)之一就是以分子識(shí)別作為設(shè)計(jì)、合成、組裝有機(jī)分子的基礎(chǔ)。所謂分子識(shí)別,是指分子互補(bǔ)性。分子互補(bǔ)性使有機(jī)分子在弱作用力的推動(dòng)下能夠組裝為超分子聚集體。分子識(shí)別(或互補(bǔ)性)指導(dǎo)下的有機(jī)分子設(shè)計(jì),無論我們是想模擬某個(gè)生物模型,還是要組裝某種納米材料,都要求我們對(duì)于模擬對(duì)象的作用過程及其分子結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)有所了解,對(duì)互補(bǔ)的雙方(主體和客體、受體和供體)的結(jié)構(gòu)關(guān)系要有預(yù)先的設(shè)定,在設(shè)計(jì)分子的結(jié)構(gòu)時(shí),要同時(shí)想著它的功能。第八十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日分子設(shè)計(jì)主要應(yīng)用于藥物合成與功能材料的制備。通過分子設(shè)計(jì),可以提高尋找具有特定性質(zhì)或功能的分子或分子聚集體的命中率。藥物分子設(shè)計(jì)對(duì)創(chuàng)新藥物的研制十分重要。它可以使大量的篩選工作減少一些盲目性。它根據(jù)治療某種疾病的需要,采用數(shù)據(jù)庫搜索的算法去尋找新型的藥物分子,并采用新發(fā)展的從頭設(shè)計(jì)法,經(jīng)過設(shè)計(jì)——合成——測(cè)活的多次循環(huán),有可能得到能用于治療某種疾病的藥物。第八十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日在化學(xué)上,可以從元素出發(fā),由原子的軌道和能級(jí)構(gòu)造出分子中的成鍵及晶體的能帶。晶體化學(xué)研究原子的密堆積以及極性晶體的結(jié)構(gòu)規(guī)律,但在對(duì)一些特殊形態(tài)的聚集體進(jìn)行討論時(shí),需要從實(shí)驗(yàn)上提供更多的結(jié)構(gòu)參數(shù)和電荷分布規(guī)律。原子、離子和范德瓦爾斯半徑、電離能、親核勢(shì)、電負(fù)性、偶極矩、極化率等概念的建立,對(duì)結(jié)構(gòu)和性質(zhì)關(guān)系的研究提供了豐富的依據(jù)。半個(gè)世紀(jì)以來,分子設(shè)計(jì)和分子工程不乏成功的事例,取得了一系列重大的成就。從40年代起,半導(dǎo)體器件和尼龍、聚酯等高分子材料以及后來的基因和蛋白質(zhì)工程,都是這方面的突出代表。在化學(xué)領(lǐng)域中,運(yùn)用已知原理設(shè)計(jì)溶劑、螫合劑、分子篩以及某些功能高分子都有很好的成果。第九十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.3.3分子工程基本方法如何依據(jù)功能選擇結(jié)構(gòu),與結(jié)構(gòu)的關(guān)系;如何選擇分子組元,構(gòu)筑所設(shè)計(jì)的結(jié)構(gòu);如何將組元組裝,實(shí)現(xiàn)預(yù)定的功能。結(jié)構(gòu)將由要實(shí)現(xiàn)的特定功能所決定,依據(jù)確定的結(jié)構(gòu)來選擇組元。組裝方法將由組元間的連接方式、組元性質(zhì)及其所處的條件來決定。這三個(gè)問題彼此有機(jī)聯(lián)系,形成了實(shí)施了分子工程的三個(gè)基本環(huán)節(jié)。第九十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日分子工程面臨的問題之一就是如何從龐大的分子庫中,選擇所要的結(jié)構(gòu)基元。這就是分子設(shè)計(jì)的主要任務(wù)。雖然自然界及長期的化學(xué)實(shí)踐已為我們積累了很多結(jié)構(gòu)基塊,但在人類改造世界的過程中,更需要能動(dòng)地去設(shè)計(jì)和創(chuàng)造更為豐富和有效的分子基塊,以滿足實(shí)際的多元化需求。在分子組元選定以后,分子工程接下來的任務(wù)就是將選定的分子組元組裝具有特殊性質(zhì)或功能的分子聚集體。如對(duì)二階非線性光學(xué)材料,應(yīng)控制分子的非對(duì)稱中心結(jié)構(gòu)的生長,如采取引進(jìn)大取代基、手性原子、氫鍵及減小分子基態(tài)偶極矩等方法。第九十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.4組合化學(xué)合成組合化學(xué)也稱組合合成,它利用組合論的思想,將各種化學(xué)構(gòu)建單元通過化學(xué)合成衍生出一系列結(jié)構(gòu)各異的分子群體,并從中做出優(yōu)化篩選。組合化學(xué)是近幾年來逐漸發(fā)展并成熟起來的一個(gè)學(xué)科,其概念和技術(shù)已被廣泛地接受并用于科學(xué)研究的各個(gè)方面。“Science”1998年把它列為科學(xué)研究領(lǐng)域的九大突破之一,化學(xué)家們稱之為“21世紀(jì)的化學(xué)合成”。組合化學(xué)的出現(xiàn)大大加速了化合物的合成與篩選速度,有人做過這樣的統(tǒng)計(jì):一個(gè)化學(xué)家用組合化學(xué)方法2~6周的工作量,就需要10個(gè)化學(xué)家用傳統(tǒng)化學(xué)方法花費(fèi)一年的時(shí)間來完成。第九十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.4.1組合化學(xué)的基本原理傳統(tǒng)的化學(xué)合成每次進(jìn)行一個(gè)反應(yīng),生成一個(gè)化合物,經(jīng)過分離、純化,再進(jìn)行下一個(gè)反應(yīng),如此反復(fù),最終得到目標(biāo)產(chǎn)物,特點(diǎn)是反應(yīng)的步驟數(shù)遠(yuǎn)大于所需的化合物數(shù)。第九十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日組合合成選擇一系列結(jié)構(gòu)、反應(yīng)性能接近的構(gòu)建模塊(A1—An)與另一構(gòu)建模塊(B1—Bn
)進(jìn)行反應(yīng):可生成n×n個(gè)化合物。若將AiBj與構(gòu)建模塊(C1—Cn)和(D1-Dn)反應(yīng),可生成更多的化合物。第九十五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日組合合成的特點(diǎn)是用少數(shù)的幾步就可以得到數(shù)以萬計(jì)的化合物。組合化學(xué)經(jīng)常被人們稱為數(shù)字游戲,也就是如何排列眾多的合成砌塊的問題。從理論上講,組合合成的總反應(yīng)產(chǎn)物數(shù)N是由兩個(gè)因素決定的,每一步的合成砌塊數(shù)目b和合成的步驟數(shù)x。第九十六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日庫中分子數(shù)與構(gòu)建模塊數(shù)及反應(yīng)步驟數(shù)的關(guān)系:構(gòu)建模塊數(shù)反應(yīng)步驟數(shù)庫中分子數(shù)10234102103104構(gòu)建模塊數(shù)反應(yīng)步驟數(shù)庫中分子數(shù)20234202203204構(gòu)建模塊數(shù)反應(yīng)步驟數(shù)庫中分子數(shù)100234100210031004從表可看出,庫中分子數(shù)與模塊數(shù)成線性關(guān)系,與反應(yīng)步驟數(shù)成指數(shù)關(guān)系。第九十七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日組合化學(xué)研究的目標(biāo)就是怎樣有效地得到這一反應(yīng)的所有產(chǎn)物N。實(shí)際上,這還是一個(gè)數(shù)字問題。反應(yīng)物的數(shù)目越多,反應(yīng)組分越多,產(chǎn)物的數(shù)目越大,產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)也就越多樣化。因此,組合化學(xué)合成的根本問題就是怎樣快速地得到更多的包羅萬象的化合物。第九十八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日假設(shè)有m個(gè)反應(yīng)單元分別與n個(gè)反應(yīng)單元進(jìn)行一次同步反應(yīng),就可以生成所有可能組合(即m×n個(gè))的化合物。例如,將10種芳環(huán)上含有不同取代基的溴代異氰酰胺(A)化合物混合在一起,然后分成10等份,即每份中含有10種不同的(A)類化合物。將這10組組分相同的混合物分別與10種取代基不同的苯胺進(jìn)行反應(yīng)(1),即可生成10組(每組中有10種)產(chǎn)物各異的(C)類化合物,亦即一次同步反應(yīng)共生成100種(C)類化合物.若將這10組化合物(C)混合并分成10等份[每一份中含有100種(C)類化合物],再將其與10種不同的溴代烷(RBr)進(jìn)行反應(yīng)(2),就可生成10組(每組含有100種)(D)類化合物,共計(jì)1000種不同的化合物。在兩步反應(yīng)中,先后使用了30種不同的反應(yīng)物[即10種(A)、10種(B)和10種RBr],共生成10×10×10種化合物.不難看出,通過組合化學(xué)技術(shù)可在很短的時(shí)間內(nèi)合成出成千上萬種不同的化合物。第九十九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日第一百頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
①構(gòu)建模塊中的反應(yīng)物間能順序成鍵。②構(gòu)建模塊必須是多樣性且是可得到的,這樣才可能獲得一系列供研究的化合物庫。③模塊中反應(yīng)物進(jìn)行的反應(yīng)速率要接近,且反應(yīng)的轉(zhuǎn)化率和選擇性要高。④產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)有高的多樣性,以供研究,從中找出最佳結(jié)構(gòu)。⑤反應(yīng)條件能調(diào)整,操作過程能實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。第一百零一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
組合化學(xué)定義:是一種在短時(shí)間內(nèi),以有限的反應(yīng)步驟,同步合成大量具有相同結(jié)構(gòu)母核化合物的技術(shù)。
所有的組合合成都包括化合物庫的制備、庫成分的檢測(cè)及目標(biāo)化合物的篩選三個(gè)步驟。由某一類先導(dǎo)化合物經(jīng)組合合成技術(shù)制備出來的數(shù)目龐大的“化合物群”稱為化合物庫。組合化學(xué)研究的核心問題,就是解決如何構(gòu)建分子多樣性的化合物庫。第一百零二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日組合合成固相液相純化簡單,反應(yīng)物可過量,反應(yīng)完全可實(shí)現(xiàn)多樣設(shè)計(jì)易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化反應(yīng)條件成熟,不需調(diào)整無多余步驟適用范圍寬發(fā)展不完善連接和切鏈?zhǔn)嵌嘤嗖襟E載體與鏈接的適應(yīng)范圍有限反應(yīng)物不能過量反應(yīng)可能不完全純化困難不易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化優(yōu)點(diǎn)缺點(diǎn)第一百零三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.4.2固相組合化學(xué)合成
固相合成是Merrifield利用樹脂作為載體合成多肽的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的。反應(yīng)物A先接到帶有鏈接體的樹脂球載體上,然后再與另一反應(yīng)物B反應(yīng),生成連接在載體上的產(chǎn)物,最后經(jīng)過濾、洗滌,使產(chǎn)物與反應(yīng)液分離,再通過斷裂反應(yīng),得到所需化合物AB。第一百零四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日(1)混合-裂分法利用線性有機(jī)反應(yīng)的特點(diǎn),將一些系列固相反應(yīng)物分組平行反應(yīng),所得產(chǎn)物混合到分組后再進(jìn)行下一步的平行反應(yīng)。這種方法既適用于混合物的合成,也可用于系列單分子的平行合成,是混合物合成中最常用的一種方法。
第一百零五頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日混合-裂分法原理示意圖第一百零六頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日(2)編碼同步合成法在一粒樹脂珠上合成一種不能作微量測(cè)序的化合物時(shí),同時(shí)在這個(gè)樹脂珠上連接一段作為編碼用的多肽。多肽分子中的每一個(gè)氨基酸代表目標(biāo)分子中的一個(gè)組成部分。在混合裂分合成中,每連接一個(gè)組成部分就在同一樹脂珠上的編碼鏈上接上一個(gè)代表該組分的氨基酸。當(dāng)合成完成后,若要測(cè)定某一化合物結(jié)構(gòu),只要測(cè)得與該化合物相連的樹脂珠上的編碼多肽的排列次序就可推知。
第一百零七頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.4.3液相組合化學(xué)合成
所謂的液相組合合成技術(shù),是指所有的反應(yīng)在液相中進(jìn)行,根據(jù)體系的不同性質(zhì)選擇不同的檢測(cè)與篩選手段,以達(dá)到尋找目標(biāo)產(chǎn)物的目的。液相合成僅局限于一步多組分或一鍋多步反應(yīng),副產(chǎn)物多,分離復(fù)雜,因此很難用于混合物的合成。液相合成的關(guān)鍵是反應(yīng)產(chǎn)物的分離提純。第一百零八頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日(1)多組分液相合成法
組合合成中應(yīng)用很多的是多組分縮合反應(yīng)。多組分縮合反應(yīng)通常指三個(gè)或多個(gè)反應(yīng)物在同一反應(yīng)器里縮合而形成具有這些組分的組成部分的產(chǎn)物。多組分反應(yīng)效率高、合成速度快,而且產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)更加多樣化,因?yàn)檫@類反應(yīng)的產(chǎn)物同時(shí)代表著多個(gè)反應(yīng)物的特性。第一百零九頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日(2)官能團(tuán)轉(zhuǎn)換法在第一代合成庫的基礎(chǔ)上,引進(jìn)新的官能團(tuán)衍生出第二代化學(xué)庫,也被稱為“后合成修飾”。這種方法不僅快速增加化學(xué)庫的體積,也是提高產(chǎn)物結(jié)構(gòu)性質(zhì)多元化的一個(gè)有效辦法。第一百一十頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.4.4庫成分的檢測(cè)與篩選
合成化合物庫的最終目的是尋找具有目標(biāo)性能的產(chǎn)物(通常是活性最大的產(chǎn)物),因此必須對(duì)庫成分進(jìn)行檢測(cè)與篩選。事實(shí)上,庫的構(gòu)建與篩選是相互聯(lián)系的,對(duì)于不同類型的庫,應(yīng)選用不同的篩選方法。如上面的平行溶液合成法合成的庫,要采用位置掃描法,即對(duì)每個(gè)孔中產(chǎn)物的活性進(jìn)行掃描檢測(cè)。而對(duì)于由混合裂分法構(gòu)建的庫,一般采用解纏繞法。除了以上兩種檢測(cè)與篩選方法外,編碼法也是常用的方法。此方法是在構(gòu)建化合物庫時(shí),給每一個(gè)構(gòu)建單元加一個(gè)標(biāo)記物,庫合成完畢后,只須鑒別標(biāo)記物即可知產(chǎn)物的歷史,從而得知產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)。第一百一十一頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.4.5材料庫的構(gòu)建、檢測(cè)與篩選2.4.5.1材料庫的構(gòu)建方法
無機(jī)化合物不像有機(jī)分子那樣順序成鍵,因此前面介紹過的混合-裂分法等不能用做無機(jī)材料庫的構(gòu)建。但與有機(jī)化合物庫的構(gòu)建一樣,材料庫的構(gòu)建同樣需要巧妙的構(gòu)思。目前,氣相沉積和溶液法是構(gòu)建固態(tài)材料庫的兩種主要方法。第一百一十二頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
Schultz等利用射頻濺射技術(shù)將一系列金屬氧化物和碳酸鹽以氣相形式順序通過一系列物理遮板,并以薄膜形式沉積在底板上,每沉積一個(gè)化合物,換一次遮板,相當(dāng)于生成兩種不同成分的化合物,這樣經(jīng)過7塊板沉積7次,并經(jīng)熱處理,最終將生成128(27)個(gè)化合物的庫。M1M2M3M4M5M6M7物理遮板第一百一十三頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日
所謂的溶液法,指的是初始反應(yīng)物以溶液形式存在,它的最大優(yōu)點(diǎn)是易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,與前面的平行溶液合成法類似。近年來,仿照噴墨打印機(jī)自動(dòng)噴墨技術(shù)的自動(dòng)掃描點(diǎn)樣技術(shù)是溶液反應(yīng)物構(gòu)建材料庫的通用方法。它是通過電腦程序精確控制取樣的量(可精確至5nL),并由機(jī)械手在底板上迅速掃描點(diǎn)樣,得到液滴點(diǎn)陣,再經(jīng)合適的條件(溶膠-凝膠、水熱條件、共沉淀等)處理,點(diǎn)陣中每一點(diǎn)就是一種產(chǎn)物,用于檢測(cè)、篩選。第一百一十四頁,共一百二十一頁,2022年,8月28日2.4.5.2材料庫的檢測(cè)與篩選
庫成分的檢測(cè)與篩選被組合化學(xué)奠基人之一的Houghten比喻為“大海撈針”。事實(shí)上,目前存在的困難并不是如何構(gòu)建材料庫,而是缺乏快速有效的平行檢測(cè)手段,這也是目前材料領(lǐng)域組合化學(xué)進(jìn)一步發(fā)展的主要障礙??茖W(xué)家在檢測(cè)手段方面作了不少努力,也發(fā)明了不少有效的檢測(cè)方法。但這些方祛的一個(gè)共同缺點(diǎn)是應(yīng)用的局限性太大,通常一種方法只適合一類材料的檢測(cè)
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