醫(yī)學(xué)生物學(xué)生命的遺傳和變異基因的結(jié)構(gòu)和功能_第1頁
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文檔簡介

醫(yī)學(xué)生物學(xué)生命的遺傳和變異基因的結(jié)構(gòu)和功能第1頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四第四章生命的遺傳和變異第2頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

第九節(jié)基因的結(jié)構(gòu)和功能

第3頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(一)基因組(Genome)基因組:是指在細(xì)胞或生物體中,一套完整單體的遺傳物質(zhì)的總和。一基因組與基因的一般概念第4頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四合成功能多肽或RNA順序必須的完全核酸順序(通常是DNA順序)。編碼蛋白質(zhì)肽鏈或RNA分子的核酸序列保證轉(zhuǎn)錄所必需的非編碼的調(diào)控序列結(jié)構(gòu)基因編碼區(qū)上游5’端的啟動(dòng)子非編碼序列內(nèi)含子(intron)位于編碼區(qū)下游3’端的終止子非編碼序列。非編碼區(qū)(包含調(diào)節(jié)基因)(二)基因(Gene)第5頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

第6頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(三)基因組的結(jié)構(gòu)基因組的結(jié)構(gòu):主要指不同DNA功能區(qū)域在DNA分子中的分布和排列情況。絕大多數(shù)生物體的遺傳物質(zhì)是DNA,個(gè)別生物(主要指RNA病毒)的基因組由RNA組成。第7頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(四)原核生物和真核生物的轉(zhuǎn)錄單位1.細(xì)菌操縱子產(chǎn)生多順反子mRNA操縱子(operon):在細(xì)菌中,一些功能上相關(guān)的酶的基因常一個(gè)緊接著一個(gè)地串聯(lián)排列,受同一操縱區(qū)控制,這種由多個(gè)結(jié)構(gòu)基因及其共同的轉(zhuǎn)錄操縱區(qū)組成的單一轉(zhuǎn)錄單位稱為操縱子。順反子(cistron):編碼一個(gè)多肽的mRNA稱順反子。多順反子(polycistronic):編碼若干多肽的mRNA被稱為多順反子。2.大多數(shù)真核基因產(chǎn)生單順反子第8頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四二病毒基因組的一般結(jié)構(gòu)特點(diǎn)(一)病毒概述:完整的病毒顆粒包括外殼蛋白和內(nèi)部的基因組DNA或RNA。根據(jù)病毒宿主分:植物病毒、動(dòng)物病毒和細(xì)菌病毒(又稱噬菌體)。根據(jù)基因組的核酸類型分:DNA病毒和RNA病毒。第9頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(二)病毒基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn):?1.不同病毒基因組大小相差較大。如乙肝病毒(HBV)基因組DNA為3.2kb,編碼4種蛋白,而痘病毒基因組DNA為300kb,編碼幾百種蛋白。?2.病毒基因組可由DNA組成,也可由RNA組成,但每種病毒顆粒只含有一種核酸。病毒基因組的DNA或RNA可能是單鏈的,也可能是雙鏈的,可能是閉合環(huán)狀的,也可能是線性的分子。如фX174基因組DNA為單鏈環(huán)狀DNA,腺病毒基因組為線性雙鏈DNA。第10頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四流感病毒?3.DNA病毒基因組均由連續(xù)的DNA分子組成。多數(shù)RNA病毒基因組也由連續(xù)的核糖核酸鏈組成,但有些則以不連續(xù)的核糖核酸組成。如流感病毒由8條不同的單鏈RNA分子構(gòu)成,均含有編碼蛋白質(zhì)的信息。第11頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四?4.常見基因重疊現(xiàn)象,即同一段DNA可編碼兩種甚至三種蛋白質(zhì)分子,這種現(xiàn)象在其他生物細(xì)胞中僅見于線粒體DNA和質(zhì)粒DNA中?;蛑丿B可分為以下幾種情況:

(1)一個(gè)基因完全包含在另一個(gè)基因之內(nèi);(2)部分重疊;(3)兩個(gè)基因只有一個(gè)堿基重疊。第12頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四第13頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四?5.病毒基因組的大部分是用來編碼蛋白質(zhì)的,只有很小的一部分不編碼蛋白質(zhì)。?6.病毒基因組DNA序列中功能上相關(guān)的蛋白質(zhì)基因往往叢集在基因組的一個(gè)或幾個(gè)特定的部位,形成一個(gè)功能單位或轉(zhuǎn)錄單元,它們可被一起轉(zhuǎn)錄成含有多個(gè)mRNA的分子(稱為多順反子mRNA),后加工成各種蛋白質(zhì)的mRNA模板。第14頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四?7.除逆轉(zhuǎn)錄病毒基因組有兩個(gè)拷貝外,至今發(fā)現(xiàn)的病毒基因組都是單倍體,每個(gè)基因在病毒顆粒中只出現(xiàn)一次。?8.噬菌體的基因都是連續(xù)的,而多數(shù)真核細(xì)胞病毒常含不連續(xù)基因。第15頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四三原核生物染色體基因組結(jié)構(gòu)的一般特點(diǎn)1.原核生物的遺傳物質(zhì)以一大團(tuán)或幾大團(tuán)的形式集中在一起,形成類核,占細(xì)胞體積的大約三分之一.(一)原核染色體的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)Ecoli的類核,細(xì)胞內(nèi)一團(tuán)緊密的組織就是類核2.其質(zhì)量大約80%為DNA,其他的為蛋白質(zhì)和RNA,蛋白質(zhì)對類核具有穩(wěn)定作用。第16頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四3.原核生物的DNA分子量較小,形成閉合環(huán)狀.4.E.coli的類核由支架和向四周伸出的100多個(gè)DNA環(huán)組成。5.支架是RNA和蛋白質(zhì)的復(fù)合結(jié)構(gòu),四周的每個(gè)環(huán)就是一個(gè)獨(dú)立的功能區(qū)。長40Kb,13um。第17頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四Ecoli的類核由支架和向四周伸出的DNA環(huán)組成Ecoli的細(xì)胞被裂解后,類核區(qū)的DNA就會(huì)釋放出去形成環(huán)狀第18頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四6.細(xì)菌的染色體約有75%的DNA編碼基因,余下的25%為基因間DNA(intergenicDNA)。

有一部分基因間DNA具有重要功能,如復(fù)制原點(diǎn),另一些基因間區(qū)域可能涉及到和DNA包裝蛋白的相互作用。第19頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四1.細(xì)菌染色體基因組通常僅由一條環(huán)狀雙鏈DNA分子組成。(二)原核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)2.基因組中只有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn)。3.具有操縱子結(jié)構(gòu)。第20頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四6.具有編碼同工酶的同基因(isogene)。5.和病毒基因組相似,不編碼的DNA部分所占比例比真核基因組少得多。7.編碼順序一般不會(huì)重疊。4.在大多數(shù)情況下,編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因在細(xì)菌染色體基因組中是單拷貝的,但編碼rRNA的基因往往是多拷貝的,這可能有利于核糖體的快速組裝。第21頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四8.在DNA分子中具有多種功能的識(shí)別區(qū)域,如復(fù)制起始區(qū)、終止區(qū)、轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)區(qū)和終止區(qū)等。這些區(qū)域往往具有特殊的序列,并且常含有反向重復(fù)序列。9.在基因或操縱子的終末具有特殊終止序列,可導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄終止和使RNA聚合酶從DNA鏈上脫落。第22頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(三)染色體外的遺傳物質(zhì)———質(zhì)粒概念

1.質(zhì)粒(plasmid)是獨(dú)立于許多細(xì)菌及某些真核細(xì)胞染色體外的雙鏈共價(jià)閉合環(huán)狀DNA分子(covalantclosedcircnlar,cccDNA),能獨(dú)立復(fù)制的最小遺傳單位。

2.質(zhì)粒大小在1—200kb之間,和病毒不同,它們沒有衣殼蛋白(裸DNA)。第23頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四第24頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

從生化學(xué)來說,除酵母的殺傷質(zhì)粒(killerplasmid)是RNA外,其余質(zhì)粒是染色體外的DNA分子。

從遺傳學(xué)來說,質(zhì)粒是在細(xì)胞分裂時(shí)能恒定傳遞給子代細(xì)胞的獨(dú)立遺傳因子或能在胞內(nèi)寄生和復(fù)制的復(fù)制子。第25頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四3.質(zhì)粒與宿主細(xì)胞的關(guān)系(1)質(zhì)粒對宿主的生存不是必需的,只是“友好”的“借居”宿主細(xì)胞中,既不殺傷細(xì)胞,對宿主的代謝活動(dòng)也無影響,宿主離開質(zhì)粒照樣的生存下去。(2)質(zhì)粒離開宿主就無法生存,只有依賴宿主細(xì)胞的(酶和蛋白質(zhì))幫助,才能完成自身的復(fù)制(擴(kuò)增)、轉(zhuǎn)錄。(3)質(zhì)粒經(jīng)常為宿主執(zhí)行一些適當(dāng)?shù)倪z傳功能,賦于宿主各種有利的表型(質(zhì)粒編碼蛋白質(zhì)或酶),使宿主獲得生存優(yōu)勢,作為對宿主細(xì)胞的補(bǔ)償(“交房租”)。與我們基因工程實(shí)驗(yàn)緊密相關(guān)的,如抗生素抗性基因:Ampr

酶,水解β-內(nèi)酰胺環(huán),解除氨芐毒性,使細(xì)菌抗氨芐。Tetr

膜蛋白,可阻止四環(huán)素進(jìn)入細(xì)胞,使細(xì)菌抗四環(huán)素。第26頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四4.質(zhì)粒發(fā)現(xiàn)和研究意義

1)理論意義質(zhì)粒能夠復(fù)制、傳遞和表達(dá)遺傳信息,從分子遺傳學(xué)觀點(diǎn)來看是一種有機(jī)體,是比病毒更原始的生命形式,是生命起源研究的起一塊體重要基石。

2)實(shí)踐意義是基因工程的重要載體(vector),能把外源基因(目的基因)送到宿主細(xì)胞中去克隆擴(kuò)增或克隆表達(dá)。

①質(zhì)粒是可以改造的,可以剪切、剪接的,第27頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四②作為基因工程載體的3個(gè)特點(diǎn):

A.都能獨(dú)立自主的復(fù)制;

B.都能便利的加以檢測(抗生素抗性);

C.都能容易引進(jìn)宿主細(xì)胞中去,也易從宿主細(xì)胞中分離純化(提質(zhì)粒)。質(zhì)粒符合上述3個(gè)條件?;蚬こ讨兄饕褂萌斯?gòu)建的質(zhì)粒。第28頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四四真核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)(一)真核染色體的結(jié)構(gòu)第29頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四DNA是怎樣組裝在染色體中的?問題的提出:已知一個(gè)真核染色體中含有一個(gè)完整的DNA分子,并且此DNA分子是線形的和不具分支的。在人類細(xì)胞的46個(gè)染色體中,每個(gè)染色體含4800萬-24000萬bpDNA,其線型長度為1.6-8.2cm,而染色體的長度僅1.3-10um,其染色體的堆積比(packingratio)大于8000。染色質(zhì)中的DNA是怎樣達(dá)到如此高度凝聚的?第30頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(1)DNA盤繞在一個(gè)組蛋白八聚體上形成核小體的核心顆粒真核生物染色體DNA高度凝聚的形成----三個(gè)水平的折疊第一個(gè)水平:核小體,染色體結(jié)構(gòu)的第一層次。(2)組蛋白H1把核小體“封鎖”起來形成直徑為10nm的纖維狀結(jié)構(gòu),此時(shí),DNA的長度被壓縮了約7倍。第31頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四核小體電鏡圖第32頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四由10nm核小體纖絲卷繞成為圓筒型線圈而形成30nm纖絲;第二個(gè)水平:30nm纖絲,染色體結(jié)構(gòu)的第二層次2)此線圈的每一圈約為6個(gè)核小體,螺距為11nm。DNA的長度在一級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上又被壓縮了6倍。

第33頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

30nm纖絲連接到腳手架上形成輻射環(huán)。DNA的長度在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上被壓縮了40倍。第三個(gè)水平:輻射的環(huán),染色體結(jié)構(gòu)的第三層次第34頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四DNA包裝為染色體具有幾個(gè)重要功能:DNA為什么要包裝為染色體?1.染色體是DNA的緊密結(jié)構(gòu),更適合存在于細(xì)胞中;2.這種包裝可以保護(hù)DNA免受損傷;3.只有包裝成染色體的DNA才能在每次細(xì)胞分裂時(shí)有效地將DNA傳遞給兩個(gè)子代細(xì)胞。4.有助于基因的表達(dá)和親本染色體之間的重組。第35頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四真核染色體的三個(gè)重要元件在真核染色體上有幾個(gè)重要的元件:復(fù)制起始位點(diǎn)(originsofreplication):每隔30-40kb均勻分布在每條真核染色體上,一般位于非編碼區(qū)。著絲粒(centromere):是DNA復(fù)制后染色體正確分離所必須的。每條染色體上只有一個(gè)著絲粒。大多數(shù)真核生物的著絲粒大于40kb,且主要由重復(fù)DNA序列組成。端粒(telomere):位于線性染色體的末端。維持染色體穩(wěn)定及染色體的末端復(fù)制。它們對于細(xì)胞分裂過程中染色體的正確復(fù)制和分離是至關(guān)重要的。第36頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四著絲粒、復(fù)制起始位點(diǎn)和端粒是真核染色體必需的第37頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四多于或少于一個(gè)著絲粒導(dǎo)致染色體的缺失或斷裂第38頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四與端粒有關(guān)的疾病早老征;癌癥;第39頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(二)真核生物基因組結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)(1)基因組DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體;(2)除了核基因組,還有細(xì)胞器基因組;(3)基因簇存在大量非編碼序列;(4)存在大量重復(fù)序列;(5)含有內(nèi)含子;(6)基因組遠(yuǎn)大于原核生物的基因組;(7)存在許多結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的基因家族。第40頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(三)

DNA序列的類別根據(jù)DNA復(fù)性速率的高低,DNA可以被分為4類:1.單一序列(uniquesequence)/低度重復(fù)序列,即每個(gè)單拷貝基因組中含一個(gè)/幾個(gè)拷貝。主要是結(jié)構(gòu)基因和基因內(nèi)/間的間隔序列,編碼蛋白質(zhì)及其基因的調(diào)控序列。第41頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四2.中度重復(fù)序列(moderatelyrepetitivesequence),每個(gè)單倍體基因組中含10-105拷貝。編碼組蛋白、免疫球蛋白、rRNA、tRNA、核糖體蛋白。第42頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四3.高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence),每個(gè)單倍體基因組含>105拷貝。分類:衛(wèi)星DNA反向重復(fù)DNAα衛(wèi)星DNA第43頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四功能:參與復(fù)制和基因表達(dá)的調(diào)控;與進(jìn)化有關(guān):有種屬特異性;DNA指紋;與減數(shù)分裂有關(guān)。第44頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四1)衛(wèi)星DNA:

將真核細(xì)胞的DNA打碎后進(jìn)行CsCl密度梯度離心,其沉降圖譜中除了主帶外還有幾條密度不等的額外的小帶,稱之為衛(wèi)星帶,它們的DNA稱為衛(wèi)星DNA(satelliteDNA),也叫簡單序列DNA(simplesequenceDNA)。第45頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

人的主帶DNA的平均浮力密度為1.701gcm-3,其GC含量平均為40.3%,主要由單拷貝DNA片段組成。衛(wèi)星DNA的浮力密度分別為1.678、1.693和1.697gcm-3,其GC含量取決于它們的重復(fù)序列組成。第46頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四106-108

copies/genome多為串聯(lián)重復(fù)排列分布于著絲點(diǎn),端粒區(qū),結(jié)構(gòu)基因兩側(cè)不編碼蛋白質(zhì)或RNA第47頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四第48頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四小衛(wèi)星DNA(minisatelliteDNA):幾百個(gè)核苷酸對的單元重復(fù)。微衛(wèi)星DNA(microsatelliteDNA):以1-6個(gè)核苷酸為基本單位,長度在100bp以內(nèi)。第49頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四2)反向重復(fù)序列(invertedrepeats):

也叫回文序列(palindrome),在DNA雙螺旋分子中,一條鏈的堿基序列(5’→3’)和另一條鏈沿同一方向(5’→3’)的序列相同。第50頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四第51頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四3)α衛(wèi)星DNA靈長類特有,用HindIII酶切DNA得到的172bp重復(fù)單位的高度重復(fù)序列。由嘌呤和嘧啶交替組成。第52頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(四)基因家族多基因家族(multigenefamily):來源相同(同一個(gè)祖先基因ancestralgene)、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的一組基因。超基因家族(supergenefamily):基因家族由中等重復(fù)序列構(gòu)成大的基因群,包含幾百個(gè)功能相關(guān)的基因,緊密成簇排列。第53頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四假基因(pseudogene):在多基因家族中某些與正常功能基因在核苷酸序列上相似,但不能轉(zhuǎn)錄或轉(zhuǎn)錄后生成無功能基因產(chǎn)物的DNA序列,被稱為假基因。假基因常用符號(hào)ψ表示,如ψα1

表示與α1

相似的假基因.一個(gè)基因家族的成員彼此在結(jié)構(gòu)和功能上是相似的,但也包括假基因。第54頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

一個(gè)基因家族的基因常常是成簇地存在于一個(gè)染色體上,但也有分散的,甚至位于不同染色體上?;虼兀╣enecluster):同一家族的成員有時(shí)緊密的排列在一起,叫基因簇。第55頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四基因家族可分為三種類型:1.簡單多基因家族:其中的基因結(jié)構(gòu)是相同的,基因與基因之間由中度重復(fù)序列隔開,如rDNAgenefamily等。rDNAgenefamilySeaurchia450copiesTobacco750copiesDrosophila100copiesT18sT5.8sT28s

NT

18sT5.8sT45s41s20s32s28s5.8s18s第56頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四2.復(fù)雜多基因家族:各個(gè)成員并不都是相同的。如海膽和果蠅的5個(gè)組蛋白基因構(gòu)成一個(gè)復(fù)雜的多基因家族。HistonegenefamilyH1H4H2BH3H2A海膽組蛋白基因重復(fù)1000次/基因組;第57頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四胚胎的胎兒的成年人的3.由發(fā)育階段控制的多基因家族:如人類珠蛋白基因家族。第58頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(五)自私DNA(selfishDNA)哺乳動(dòng)物基因組中存在的大量未知功能的DNA序列,也稱寄生DNA(parasiteDNA)。第59頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(六)真核基因組的結(jié)構(gòu)(一些特征性的結(jié)構(gòu))1斷裂基因(splitgene)在真核生物中,大多數(shù)編碼蛋白質(zhì)的基因是不連續(xù)的,即在其編碼氨基酸的序列之間插入了不編碼的序列,故稱之為斷裂基因。斷裂基因中,編碼氨基酸的序列稱為外顯子(exon);非翻譯的間插序列稱為內(nèi)含子(intron)。第60頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四卵清蛋白mRNA與DNA雜交結(jié)果第61頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四在已分析的DNA序列中,原核生物基因中幾乎沒有內(nèi)含子,低等真核生物如酵母內(nèi)含子也不普遍,但在高等真核生物中則大量存在內(nèi)含子,且多數(shù)情況下,內(nèi)含子要比外顯子長得多。并非所有的高等生物的基因都含有內(nèi)含子。在已經(jīng)分析過的基因中,已知編碼組蛋白和干擾素的基因是不含內(nèi)含子的。第62頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四2結(jié)構(gòu)基因的側(cè)翼序列與調(diào)控序列

側(cè)翼序列(flankingsequence):每個(gè)斷裂基因第一個(gè)和最后一個(gè)外顯子的外側(cè)的不轉(zhuǎn)錄非編碼區(qū)。啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、終止子第63頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(1)啟動(dòng)子(promoter)

①概念:啟動(dòng)子是促進(jìn)DNA轉(zhuǎn)錄的DNA序列,是DNA分子上可與RNApol特異性識(shí)別結(jié)合并使之轉(zhuǎn)錄的部位,但啟動(dòng)子本身不被轉(zhuǎn)錄。

②功能特點(diǎn):啟動(dòng)子位于結(jié)構(gòu)基因上游啟動(dòng)子有方向性決定轉(zhuǎn)錄方向及那一條DNA鏈作模板轉(zhuǎn)錄(以信息鏈的互補(bǔ)鏈作模板轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄的mRNA與信息鏈一致)。

③真核生物的啟動(dòng)子元件:TATA框、CAAT框、GC框第64頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(2)增強(qiáng)子(enhancer)和沉默子(silencer)增強(qiáng)子是一段DNA序列,其中含有多個(gè)能被反式作用因子識(shí)別與結(jié)合的順式作用元件。反式作用因子與這些元件結(jié)合后,通常為增強(qiáng)鄰近基因的轉(zhuǎn)錄。增強(qiáng)子一般位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-100~-300bp處,但在基因之外或某些內(nèi)含子中也有增強(qiáng)子序列(P42)。增強(qiáng)子作用特點(diǎn):①可在5’端或3’端發(fā)揮作用;②不受序列方向制約;③通過增強(qiáng)啟動(dòng)子發(fā)揮作用。沉默子負(fù)調(diào)控序列、負(fù)增強(qiáng)子;第65頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(3)終止子(terminator)在結(jié)構(gòu)基因的最后一個(gè)外顯子中有一個(gè)保守的AATAAA序列,此位點(diǎn)下游有一段GT豐富區(qū)或T豐富區(qū),這兩部分序列共同構(gòu)成poly(A)加尾信號(hào)。

mRNA轉(zhuǎn)錄到此部位后,產(chǎn)生AAUAAA和隨后的GU(或U)豐富區(qū)。與RNApol結(jié)合的延長因子可以識(shí)別這種結(jié)構(gòu)并與之結(jié)合,然后在AAuAAA下游10-30個(gè)堿基的部位切斷RNA,并加上poly(A)尾.第66頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四第67頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四五轉(zhuǎn)座因子(transposableelement)可移動(dòng)的基因成分(可移動(dòng)基因,movablegenemob),是指能夠在一個(gè)DNA分子內(nèi)部或兩上DNA分子之間移動(dòng)的DNA片段。在細(xì)菌中指在質(zhì)粒和染色體之間或在質(zhì)粒和質(zhì)粒之間移動(dòng)的DNA片段(文獻(xiàn)上有時(shí)形象地稱其為是跳躍基因,jumpinggene)。轉(zhuǎn)位也是DNA重組的一種形式。

第68頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

移動(dòng)基因最早由美國冷泉港實(shí)驗(yàn)室(coldspringHarborLaboratory)的女科學(xué)家BarbaraMClintock于上個(gè)世紀(jì)40年代晚期在玉米中首次發(fā)現(xiàn)的。60年代,為J.A.Shapirc研究大腸桿菌高效突變實(shí)驗(yàn)證實(shí)。1983年榮獲諾貝爾生物學(xué)醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。第69頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(一)

轉(zhuǎn)座因子的種類及特征細(xì)菌的轉(zhuǎn)座因子包插入序列,轉(zhuǎn)座子及可轉(zhuǎn)座的噬菌體。(1)插入序列(insertionsequence,IS)

TSTransposasegene+othergenesTSIRIRTStargetsite靶位點(diǎn)Transposasegene轉(zhuǎn)位酶基因IRinvertedrepeated反向(倒轉(zhuǎn)重復(fù)順序)IS的形體圖第70頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(1)IS是一類較小的轉(zhuǎn)座因子,長度約700-2000bp,按發(fā)現(xiàn)順序IS1、IS2…命名,只攜帶轉(zhuǎn)移的必需基因,不含有其它偏碼蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)基因,本身沒有表型效應(yīng)。(2)IS兩側(cè)為反向(倒轉(zhuǎn))重復(fù)順序(16-41bp),中間為轉(zhuǎn)位酶基因,在插入新的位點(diǎn)側(cè)有3~116p順向重復(fù)順序(directrepeatedsequence),DR是靶位點(diǎn)序列復(fù)制的產(chǎn)物。(3)IS到處活動(dòng),可以插入到E.coli染色體的各個(gè)位置上,也可以插入到質(zhì)粒和某些噬菌體基因組上,甚至同一基因不同位點(diǎn)上。這種插入作用可以雙向進(jìn)行,可以是正向,也可以是反向插入IS這種移動(dòng)方式稱為轉(zhuǎn)位作用(transposition)。(4)在一個(gè)世代的107細(xì)菌中有1次插入。*TR(反向倒轉(zhuǎn)重復(fù)序列):GGAAGGT、、、ACCTTCCCTTCCA、、、TGGAAGG*DR(正同向重復(fù)序列):TACGTTACGT第71頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四2.轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn)(1)Tn是一類較大的可移動(dòng)成分,除mobgene外,尚含有其它基因,如抗藥基因等。Tn是在研究抗藥基因中發(fā)現(xiàn)的,由此知道抗藥基因可在質(zhì)粒之間,質(zhì)粒與染色體之間或質(zhì)粒與可轉(zhuǎn)座的噬菌體之間來回移動(dòng),Tn的轉(zhuǎn)位原理和Is基本相同,轉(zhuǎn)位頻率為10-3~10-6/拷貝。(2)根據(jù)結(jié)構(gòu)特征的不同,Tn可以分為2個(gè)亞類:① 復(fù)合型Tn:轉(zhuǎn)座酶由IS編碼,IS可以是反向(或正向)重復(fù)構(gòu)型。② TnA:數(shù)個(gè)結(jié)構(gòu)基因(mob、mdr等)十IR組成。

StructuralgenesIRIRStructuralgeneIS1IS1第72頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四部分細(xì)菌的轉(zhuǎn)座子長度(bp)末端結(jié)構(gòu)抗藥性基因Tn9(復(fù)合型)2650IS1氯霉素Tn3(TnA族)5000(38bp)IR氯卡青霉素第73頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四3.可轉(zhuǎn)座的噬菌體(transposablephage)(1)包括Mu和D108兩種噬菌體,是一類溫和噬菌體*。(2)感染細(xì)菌后,可以整合到細(xì)菌染色體中,插入位點(diǎn)是隨機(jī)的(而入phage插入位點(diǎn)是專一的),可以插到結(jié)構(gòu)基因內(nèi)部,引起突變,Mu即Mutator(突變子)因此得名。(3)插入部位的2側(cè)有短的DR,插入時(shí),一個(gè)拷貝留在原位,新合成的拷貝插入新的部位。(4)和IS,Tn相比,Mu末端不含IR,這是可轉(zhuǎn)座成分的一個(gè)例外。第74頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四*噬菌體(phage)—是侵襲細(xì)菌的病毒,主要由蛋白質(zhì)和核酸組成。噬菌的生活周期分為①溶菌周期和②溶原周期。溶原性噬菌體(溫和噬菌體)→宿主菌→將自身DNA整合到細(xì)菌染色體中→和細(xì)菌染色體一起復(fù)制→隨細(xì)菌增殖傳到細(xì)菌子代中去,不產(chǎn)生子代Phage.第75頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(二)轉(zhuǎn)座作用的機(jī)理1.復(fù)制性轉(zhuǎn)位機(jī)理共聯(lián)體生成和解離,靶序列的切割與復(fù)制。2.非復(fù)制型轉(zhuǎn)位作用轉(zhuǎn)位將供體DNA轉(zhuǎn)座因子兩側(cè)各切斷一條單鏈并與靶序列的兩個(gè)游離末端連接,隨后并沒有復(fù)制過程,而是由轉(zhuǎn)座酶將供體DNA轉(zhuǎn)座因子的另一端也切斷,因此在供體DNA留下一個(gè)致死性缺口。轉(zhuǎn)座子的兩條游離單鏈在靶位點(diǎn)退火接合,DNA聚合酶項(xiàng)平缺口。第76頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四第77頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(三)轉(zhuǎn)位的遺傳效應(yīng)1.基因重排可能產(chǎn)生1個(gè)新的蛋白分子等,基因重排是進(jìn)化的動(dòng)力。2.基因突變插入到基因內(nèi)部,可引起插入失活。3.插入位點(diǎn)引入新的基因如引進(jìn)抗藥基因。4.基因倍增第78頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四六線粒體基因組(mitochondriongenome)第79頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四特點(diǎn):基因排列緊湊,無內(nèi)含子缺少終止密碼子,以U/UA結(jié)尾突變率高母系遺傳密碼子與核DNA不完全相同第80頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四原核基因組、真核基因組、病毒基因組比較

原核基因組真核基因組病毒基因組1.生物學(xué)特征類核、無核膜轉(zhuǎn)錄、翻譯有核膜,錄在核,譯在漿DNA或RNA不共存1個(gè)V顆粒(一同時(shí)進(jìn)行 般利用宿主機(jī)制轉(zhuǎn)錄、翻譯)2.染色體數(shù)目單倍體配子為單倍體、體細(xì)胞單倍體、逆轉(zhuǎn)錄病毒除外

雙倍體3.核酸分子結(jié)構(gòu)雙鏈環(huán)狀DNA分子雙鏈線型以ssDNA,dsRNA突出4.基因組大小5000多個(gè)基因(E.coli)5~10萬(2.8萬)3~幾百個(gè)5.核酸類型DNA DNA DNA或RNA6.核酸數(shù)目中多少7.結(jié)構(gòu)基因連續(xù)性無內(nèi)含子,連續(xù)基因有內(nèi)含子、斷裂基因真核病毒不連續(xù)、原核連續(xù)8.重疊基因無 無 有9.操縱子結(jié)構(gòu)有,多順反子無操縱子結(jié)構(gòu)、單順反子無操縱子結(jié)構(gòu)10.重復(fù)順序大量重復(fù)順序有、少有、少11.編碼區(qū)/

非編碼區(qū)50%,50%5%、95%95%、5%12.基因家簇 √ 13.假基因 √ 14.可移動(dòng)基因√√ 15.端粒 √

16.復(fù)制方式半保留 半保留 多樣第81頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四七基因表達(dá)的調(diào)控

1概念基因表達(dá)(geneexpression)是指生物體基因組種結(jié)構(gòu)基因所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄及翻譯等一系列過程,合成特定的蛋白質(zhì),進(jìn)而發(fā)揮其特定生物學(xué)功能的全過程?;虮磉_(dá)產(chǎn)物各種RNA(tRNA、mRNA和rRNA)以及蛋白質(zhì)、多肽。第82頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四2基因表達(dá)的特異性

(1)時(shí)間特異性按功能需要,某一特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生,稱之為基因表達(dá)的時(shí)間特異性(temporalspecificity)。多細(xì)胞生物基因表達(dá)的時(shí)間特異性又稱階段特異性(stagespecificity)。第83頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四84(2)空間特異性在個(gè)體生長全過程,某種基因產(chǎn)物在個(gè)體按不同組織空間順序出現(xiàn),稱之為基因表達(dá)的空間特異性(spatialspecificity)。基因表達(dá)伴隨時(shí)間順序所表現(xiàn)出的這種分布差異,實(shí)際上是由細(xì)胞在器官的分布決定的,所以空間特異性又稱細(xì)胞或組織特異性(cellortissuespecificity)。第84頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

3基因表達(dá)的方式

(1)組成性表達(dá)

管家基因在生命全過程都是必需的、且在一個(gè)生物個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)的基因。

組成性基因表達(dá)(constitutiveexpression)

無論表達(dá)水平高低,管家基因較少受環(huán)境因素影響,而是在個(gè)體各個(gè)生長階段的大多數(shù)或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。區(qū)別于其他基因,這類基因表達(dá)被視為組成性基因表達(dá)。按對刺激的反應(yīng)性,基因表達(dá)的方式分為:第85頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(2)適應(yīng)性表達(dá)(adaptiveexpression)受環(huán)境影響誘導(dǎo)表達(dá)

在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,相應(yīng)的基因被激活,基因表達(dá)產(chǎn)物增加,這種基因稱為可誘導(dǎo)基因??烧T導(dǎo)基因在特定環(huán)境中表達(dá)增強(qiáng)的過程,稱為誘導(dǎo)(induction)。阻遏表達(dá)

如果基因?qū)Νh(huán)境信號(hào)應(yīng)答是被抑制,這種基因是可阻遏基因??勺瓒艋虮磉_(dá)產(chǎn)物水平降低的過程稱為阻遏(repression)。第86頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四(3)協(xié)調(diào)表達(dá)(coordinateexpression)

協(xié)調(diào)表達(dá)

在一定機(jī)制控制下,功能上相關(guān)的一組基因,無論其為何種表達(dá)方式,均需協(xié)調(diào)一致、共同表達(dá),即為協(xié)調(diào)表達(dá)(coordinateexpression),這種調(diào)節(jié)稱為協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)(coordinateregulation)。第87頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四4基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(1)適應(yīng)環(huán)境變化、維持細(xì)胞增殖、分化(2)維持個(gè)體生長、發(fā)育

第88頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四控制區(qū)信息區(qū)結(jié)構(gòu)基因(S)操縱序列(O)啟動(dòng)序列(P)調(diào)節(jié)基因(I)CPA5原核基因表達(dá)調(diào)控的乳糖操縱子學(xué)說第89頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四乳糖操縱子調(diào)節(jié)機(jī)制多順反子(polycistronicmRNA)(1)乳糖操縱子(lacoperon)的結(jié)構(gòu)

調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動(dòng)序列操縱序列

結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙?;D(zhuǎn)移酶ZYAOPDNA第90頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時(shí)(2)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)阻遏基因第91頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時(shí)IDNAZYAOPpol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄mRNA乳糖半乳糖β-半乳糖苷酶第92頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四++++轉(zhuǎn)錄無葡萄糖,cAMP濃度高時(shí)有葡萄糖,cAMP濃度低時(shí)(3)CAP(catabolicgeneactivatorprotein)的正調(diào)節(jié)ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP第93頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度降低而葡萄糖濃度升高時(shí)

細(xì)胞中cAMP濃度降低

缺乏乳糖與阻遏蛋白結(jié)合

CAP失活

阻抑蛋白與操縱基因結(jié)合

CAP及RNA聚合酶不能與啟動(dòng)基因結(jié)合

基因轉(zhuǎn)錄被阻遏

阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)第94頁,共105頁,2023年,2月20日,星期四

當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖

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