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微生物分類(lèi)與鑒定第1頁(yè)/共13頁(yè)概念:
微生物分類(lèi)學(xué):按微生物親緣關(guān)系將其排成多種分類(lèi)單
位或分類(lèi)群的科學(xué)。
分類(lèi):將有關(guān)個(gè)體的大量資料經(jīng)科學(xué)的歸納整理或反映
生物進(jìn)化規(guī)律的自然分類(lèi)系統(tǒng)。鑒定:檢測(cè)未知純種微生物的多種性狀特征,查找分類(lèi)
系統(tǒng)進(jìn)行歸類(lèi)命名。
命名:為新發(fā)現(xiàn)的微生物按國(guó)際命名法給出一個(gè)學(xué)名。第2頁(yè)/共13頁(yè)一、微生物的命名法
(一)分類(lèi)單位:
界、門(mén)、綱、目、科、屬、種種是最基本的分類(lèi)單位,每一分類(lèi)單位之后可有亞門(mén)、亞綱、亞目、亞科.....1.種:
種是一個(gè)基本分類(lèi)單位,是一大群表型特征高度相似、親緣關(guān)系極其接近,與同屬內(nèi)其他種有明顯差別的菌株的總稱(chēng)。這里的種僅僅是指種的模式種或典型種第3頁(yè)/共13頁(yè)2.新種:
發(fā)表文章時(shí),確定為新種,在學(xué)名后加sp.nov(speciesnova)或nov.sp。微生物的命名法指某一明顯而穩(wěn)定的特征與模式種不同的種,有時(shí)稱(chēng)小種。如:E.colik12模式種(野生型)是不需要特殊aa的,而實(shí)驗(yàn)室變異后,可從k12獲
得某aa的缺陷型,此即稱(chēng)為E.colik12的亞種或小種。
3.亞種:(subspecies,subsp,ssp):第4頁(yè)/共13頁(yè)4.型(form):
同種微生物的各種類(lèi)型。
如:血清型、抗原型5.菌株(strain):
又稱(chēng)品系:一種微生物的不同來(lái)源的純培養(yǎng)物。微生物的命名法第5頁(yè)/共13頁(yè)(二)命名
1.雙名法:林奈創(chuàng)立。此為國(guó)際命名法規(guī),即:每一微生物的學(xué)名都依屬與種而命名
屬名+種名+(首次定名人)+現(xiàn)定名人+定名年份屬名:拉丁文的名詞或用作名詞的形容詞,字首大寫(xiě),表示
微生物的主要特點(diǎn),由微生物構(gòu)造,形狀或由科學(xué)家命名種名:為拉丁文形容詞,為微生物次要特征,字首小寫(xiě),
為微生物色素、形狀、來(lái)源或科學(xué)家姓名等。如:Escherichiacoli
當(dāng)文章中前面已出現(xiàn)學(xué)名時(shí),后面可將屬名縮寫(xiě)成一至三個(gè)字母。如:E.coli微生物的命名法第6頁(yè)/共13頁(yè)2.
三名法:
種名后面加亞種,亞種可用正體
如:Staphylococcusaureussubsp3.屬名+sp(ssp),表示種名未定。微生物的命名法第7頁(yè)/共13頁(yè)二、分類(lèi)依據(jù)
(一)形態(tài)特征:大小,排列,分化,結(jié)構(gòu),染色等(二)培養(yǎng)特征:營(yíng)養(yǎng)要求,生長(zhǎng)的物理環(huán)境(酸堿
度,溫濕度),菌落,菌苔,液體
培養(yǎng)特征。(三)代謝特征:微生物生命活動(dòng)的方式。(四)化學(xué)組成特征:細(xì)胞主要特征性化學(xué)成分的鑒定如:細(xì)胞壁成分、細(xì)胞內(nèi)含物(五)抗原特征:抗原成為化學(xué)組成的一個(gè)特殊方面,微
生物具有許多不同類(lèi)型的抗原。(六)生態(tài)特征:與其他生物的關(guān)系、自然界的分布、致
病性等第8頁(yè)/共13頁(yè)現(xiàn)代分類(lèi)依據(jù)還需補(bǔ)充:(七)細(xì)胞壁成分:(八)GC含量某一特定種的DNA堿基組成是恒定的。GC含量以堿基全部克分子中G和C的摩爾百分?jǐn)?shù)表示:
G+CG+C+A+T×100%=(G+C)mol%
種內(nèi)各株可差2.5~4.0%;若相差<2%為同種。不同種相差5%以上;若相差>10%為不同屬。分類(lèi)依據(jù)所得數(shù)值范圍從23~75第9頁(yè)/共13頁(yè)(九)DNA雜交法:原理:根據(jù)DNA解鏈的可逆性和堿基配對(duì)的專(zhuān)一性。若同源性70%以上為種的水平,20%以上可能是屬的水平。分類(lèi)依據(jù)第10頁(yè)/共13頁(yè)(十)16SrRN
A在30多億年生物進(jìn)化的漫長(zhǎng)歷史中始終執(zhí)行著相同的生理功能,所以堿基順序變化很少,所以稱(chēng)其為保守結(jié)構(gòu)。分類(lèi)依據(jù)第11頁(yè)/共13頁(yè)三、常用分類(lèi)方法:經(jīng)典分類(lèi)法:將形態(tài)、結(jié)構(gòu)特征作為初步特征,再比較生理、生化特征,采用雙歧法整理結(jié)果,進(jìn)行分類(lèi)
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