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文檔簡介
生物氧化(Biologicaloxidation)生物化學1/92第二章生物氧化(biologicaloxidation)第二節(jié)線粒體氧化體系第三節(jié)ATP的生成(P340)第四節(jié)線粒體外NADH2的氧化(P326)第一節(jié)概論2/92第一節(jié)概論二、生物氧化所討論的問題三、生物氧化中CO2生成方式四、生物氧化中物質氧化的方式五、生物氧化的特點六、氧化-還原電勢(電位)七、參與生物氧化的酶類和電子載體一、概念3/92二、生物氧化所討論的問題1、細胞如何在酶的催化下將代謝物分子中的C轉變成CO2?2、細胞如何利用O2將代謝物分子中的H氧化成H2O?3、當有機物被氧化時,細胞如何貯存和利用氧化所產生的能量?5/92三、生物氧化中CO2生成方式基本方式:底物脫羧基作用α-脫羧
(羧基位置)β-脫羧分類:單純脫羧(不伴隨脫氫)氧化脫羧(伴隨脫氫)6/92(1)α—單純脫羧(2)β—單純脫羧α---酮酸脫羧酶Mg2+TPPO‖CH3CCOOHO‖CH3CH+CO2
β-酮酸脫羧酶COOHC=OCH2COOHαβCOOHC=O+CO2
CH31.單純脫羧基作用(不伴隨脫氫)
7/92四、生物氧化中物質氧化的方式生物體內氧化作用主要有三種方式:1.失電子如:Fe2+—→Fe3++e—
2.脫氫如:醇氧化為醛
3.加氧如:
醛氧化為酸(加水脫氫反應)
*生物體內氧化還原反應的同時,有能量的釋放和轉移9/92五、生物氧化的特點在活細胞內的水溶液中進行體溫條件(370C、pH7±)在一系列酶的催化下分步進行,能量逐步釋放(加水脫氫方式使生物體能獲取更多的能量)氧化過程中產生的能量主要貯藏在ATP中在學習生物氧化之前,有必要復習氧化還原電勢的概念10/92六、氧化-還原電勢(電位)(一)概念:一個氧化還原對失去電子或獲得電子的傾向稱為氧化還原電勢(電位)生物氧化中包括許多氧化-還原反應:
在生物氧化反應中,通常用氧化還原電位來相對地表示各種化合物對電子親合力的大小。H2←→2H++2e電子供體(還原型)電子受體(氧化型)Fe2+←→Fe3++e11/92六、氧化-還原電勢(電位)(二)標準電勢與自由能的關系:△E0′;氧化還原體系中兩個半反應的氧化還原電位差:E0′正極-E0′負極(失去電子傾向高)ΔG0′=-nΔE0’
F
(三)標準電勢與平衡常數(shù)的關系:
ΔG0′=-2.303RTlgK’eq=-nΔE0’
F
13/92七、參與生物氧化的酶類和電子載體2.氧化酶:如細胞色素氧化酶、抗壞血酸氧化酶等
3.加氧酶:如單加氧酶、加雙氧酶
4.傳遞體遞氫體(hydrogencarrier)主要有黃素蛋白傳遞體及輔酶Q(CoQ)遞電子體(electroncarrier),主要有多種細胞色素及鐵硫蛋白1.脫氫酶14/92脫氫酶(dehydrogenase)根據(jù)所含輔因子的不同,可將脫氫酶分為兩類:以黃素核苷酸為輔基的脫氫酶以煙酰胺核苷酸為輔酶的脫氫酶
這類酶均不能直接以氧為受氫體
SH2+E-NAD+S+E-NADH+H+SH2+E-NADP+S+E-NADPH+H+SH2+E-FMN→S+E-FMNH2SH2+E-FAD→S+E-FADH2遞氫體、氧如琥珀酸脫氫酶(FAD)、NADH脫氫酶(FMN)等;
15/92一、呼吸鏈的概念respiratorychain:由一系列遞氫體和遞電子體以及相應的酶系統(tǒng)按一定順序排列在線粒體內膜上構成的一條長鏈(生物氧化還原鏈或稱為電子傳遞鏈),因與細胞攝取氧的呼吸過程有關,故又稱呼吸鏈。17/92二、線粒體內的兩條重要呼吸鏈(分類:NADH呼吸鏈和FADH2呼吸鏈)18/9221/92呼吸鏈的概念電子從NADH或FADH2到O2的傳遞所經過的途徑,稱為電子傳遞鏈,或稱呼吸鏈。它是由一系列遞氫體和遞電子體以及相應的酶系統(tǒng)按一定順序排列在線粒體內膜上的一條長鏈。主要由蛋白質復合體組成,大致分為四部分,即:NADH-Q還原酶、琥珀酸-Q還原酶、細胞色素還原酶和細胞色素氧化酶。23/921.以NAD+或NADP+為輔酶的脫氫酶(尼克酰胺核苷酸類)NAD+和NADP+的結構NAD+:R=HNADP+:R=PO32-功能:將底物上的氫激活并脫下。輔酶:NAD+或NADP+25/92尼克酰胺核苷酸的作用原理:+H+e+
H++H+2HHHeH+HNAD(P)+NAD(P)H+H++2H-2H26/92輔酶FMN傳遞電子的過程:29/92復合物Ⅰ的結構與電子傳遞過程30/92NADH-Q還原酶各輔基(輔酶)的氧化還原循環(huán):MSH2NAD+NADH2FMNFMNH22Fe3+2Fe2+2(Fe-S)CoQH2CoQ2Fe3+2Fe2+2(Fe-S)CoQH2CoQ2H+2H+NADH-Q還原酶泵到線粒體內膜外側31/92以NAD+或NADP+為輔酶的脫氫酶4H+鐵硫聚簇(Fe-S中心)主要以
(Fe-0S)(2Fe-2S)或
(4Fe-4S)形式存在,鐵硫聚簇與蛋白質結合稱為鐵硫蛋白。3.鐵硫蛋白32/92鐵硫聚簇通過Fe3+
Fe2+
變化,將電子從FMNH2上脫下傳給CoQ,每次傳遞一個電子.
CysSSSCysFe3+
Fe3+
CysSSSCys
CysSSSCysFe3+
Fe2+
CysSSSCys
+e-33/92
是脂溶性醌類化合物,而且分子較小,可在線粒體內膜的磷脂雙分子層的疏水區(qū)自由擴散。功能基團是苯醌,通過醌/酚的互變傳遞氫,Q(醌型結構)很容易接受2個電子和2個質子,還原成QH2(還原型);QH2也容易給出2個電子和2個質子,重新氧化成Q。因此,它在線粒體呼吸鏈中作為電子和質子的傳遞體。4.輔酶Q(泛醌、亦簡稱Q。是許多酶的輔酶)如:NADH-Q還原酶、琥珀酸-Q還原酶、脂酰-CoA脫氫酶等唯一的非蛋白組分兩條途徑的集合點5.細胞色素還原酶(細胞色素bc1復合體、復合體Ⅲ)含有兩種細胞色素(細胞色素b、細胞色素c1)和一鐵硫蛋白(2Fe-2S)。
細胞色素bc1復合體的作用是將電子從QH2轉移到細胞色素c:QH2cyt.bFe-Scyt.c1cyt.ccytbc135/922H+細胞色素(cytochrome,cyt)
是以鐵卟啉(血紅素)為輔基的蛋白質(有顏色),高等動物線粒體呼吸鏈中主要含有5種細胞色素a、a3、b、c、c1等,細胞色素b,c1,c的輔基都是鐵-原卟啉Ⅳ,細胞色素a、a3的輔基為血紅素A。
細胞色素主要是通過輔基中Fe3+
Fe2+
的互變起傳遞電子的作用。一個細胞色素每次傳遞一個電子。36/92QH2將電子傳給cytbc138/92細胞色素bc1復合物(復合物Ⅲ)細胞色素c在復合體III和Ⅳ之間傳遞電子。(細胞色素c交互地與細胞色素還原酶的C1和細胞色素氧化酶接觸)是唯一能溶于水的細胞色素40/926.細胞色素氧化酶(復合體Ⅳ、細胞色素c氧化酶)由cyta和a3
組成。復合物中除了含有鐵卟啉外,還含有2個銅原子(CuA,CuB)。Cyta與CuA相配合,cyta3與CuB相配合,當電子傳遞時,細胞色素的Fe3+Fe2+間循環(huán),同時Cu2+Cu+間循環(huán),將電子從cytc直接傳遞給O2。也叫末端氧化酶。41/9244/92
TheelectronpathincomplexIV45/927.琥珀酸-Q還原酶(復合體Ⅱ)琥珀酸脫氫酶也是此復合體的一部分,其輔基包括FAD和Fe-S聚簇。琥珀酸脫氫酶催化琥珀酸氧化為延胡索酸,同時其輔基FAD還原為FADH2,然后FADH2又將電子傳遞給Fe-S聚簇。最后電子由Fe-S聚簇傳遞給琥珀酸-Q還原酶的輔酶CoQ。46/92四、呼吸鏈中各組分的排列順序P120確定呼吸鏈中各遞氫體或遞電子體的排列順序的實驗方法有多種1.測定各種電子傳遞體的標準氧化還原電位(E0′),依還原電位大小排列:2.用分離出的電子傳遞體進行呼吸鏈復合物體外重組實驗4.利用光譜變化觀察線粒體各傳遞體氧化順序3.利用呼吸鏈的特殊阻斷抑制劑,阻斷鏈中某些特定的電子傳遞環(huán)節(jié)。48/921.測定各種電子傳遞體的標準氧化還原電位(E0′),依還原電位大小排列★E0’越小,越易失去電子,處于呼吸鏈的前面,反之,E0’越大,越易得到電子,處于呼吸鏈的后面。
★當電子從E0’值小的物質傳到E0’值大的物質時,伴隨著自由能的降低,即有熱量放出:
△G0’=-nF△E0’
=-nF
(E0’受體-E0’供體)
其中:n是轉移的電子數(shù),F(xiàn)是法拉第常數(shù)。49/92-0.32-0.12+0.10+0.04+0.23+0.25+0.29+0.8NADH—FMN.Fe.S—CoQ—Cytb—Cytc1—Cytc—Cytaa3—O2
琥珀酸
FAD-Fe.S50/922.用分離出的電子傳遞體進行呼吸鏈復合物體外重組實驗51/922.用分離出的電子傳遞體進行呼吸鏈復合物體外重組實驗51/9252/92
NADH
FMN(Fe-S)CoQCytb、c1
CytcCytaa3
O2
(Fe-S)
(Cu2+)
FAD(Fe-S)
琥珀酸3.利用呼吸鏈的特殊阻斷抑制劑,阻斷鏈中某些特定的電子傳遞環(huán)節(jié)。凡能夠切斷呼吸鏈中某一部位電子流的物質,稱為呼吸鏈電子傳遞抑制劑。53/92魚藤酮、安密妥、粉蝶霉素A
CN-、-N3、CO抗霉素AFAD(Fe-S)NADHFMN(Fe-S)CoQCytbCytc1CytcCytaa3O2
呼吸鏈抑制劑作用位點魚藤酮、安密妥:抑制NADH到輔酶Q的電子傳遞;抗霉素A:抑制細胞色素b到c1之間的電子傳遞;氰化物、疊氮化物、一氧化碳:抑制細胞色素aa3到氧的電子傳遞。54/924.用分光光度法測得各個傳遞體發(fā)生吸收光譜的變化完整的線粒體當電子傳遞體處于氧化態(tài)時,懸浮液渾濁,光吸收不能直接測出;但當之處于還原態(tài)時,即可以氧化態(tài)為對照測出。游離的線粒體在有氧下進行電子傳遞時,NADH一端還原性最強,而靠近氧一端電子傳遞體幾乎處于氧化態(tài),由此判斷電子的流向。當向完全處于還原狀態(tài)的電子傳遞體中加入氧時,最先被氧化的是細胞色素aa3,其次cytC,cytC1,cytb,最后是NADH。55/92第三節(jié)、ATP的生成(P340)
一、氧化磷酸化的概念二、ATP的生成方式三、氧化磷酸化的作用機制六、呼吸鏈的加強、抑制和解偶聯(lián)四、磷氧比值五、ATP生成的結構基礎57/92生物體內物質氧化產生能量與ADP劫獲能量進行磷酸化產生ATP的過程相偶聯(lián)的作用稱為氧化磷酸化作用。一、氧化磷酸化的概念58/92二、ATP的生成方式1.氧化磷酸化(電子傳遞體磷酸化)2.底物水平磷酸化59/921.氧化磷酸化定義:呼吸鏈電子傳遞過程中釋放的能量,在ATP合酶的催化下,使ADP磷酸化成ATP的過程,由于代謝物的氧化反應與ADP的磷酸化反應偶聯(lián)進行,故稱為氧化磷酸化。呼吸鏈SH2H(2H++2e)S能ADP+PiATPO212氧化磷酸化偶聯(lián)H2O60/92SH2S2HRCOOHCO2+RHE代謝物氧化產物2Hα-磷酸甘油穿梭蘋果酸穿梭
+
O212H2O能量ADP+H3PO4ATP+
H2O氧化磷酸化呼吸鏈線粒體胞液61/92確定氧化磷酸化偶聯(lián)部位
(ATP生成部位)的實驗方法1)P/O比值測定:一對電子通過呼吸鏈傳遞至O2所產生的ATP分子數(shù)。經過幾種不同底物在離體線粒體實驗中測得:琥珀酸P/O=1.7蘋果酸P/O=3.0由此確定NADH呼吸鏈中有三個偶聯(lián)部位:NADH-----CoQCytb-----CytcCytaa3---O2而琥珀酸呼吸鏈中只有二個偶聯(lián)部位:Cytb-----CytcCytaa3---O262/922)電位變化測定琥珀酸(
FAD-Fe.S)
NADH—FMN.Fe.S—CoQ—Cytb—Cytc1—Cytc—Cytaa3—O2
(-0.32-0.12+0.10+0.04+0.23+0.25+0.29+0.8)①②③
ΔE0’=0.33V
ΔE0’=0.19V
ΔE0’
=0.51VΔG0′=-63.7=-36.7=-98.4(KJ/mol)(ATP-30.54KJ/mol)63/92+0.01??氧化磷酸化偶聯(lián)部位64/922.底物水平磷酸化
定義:由底物分子因脫氫或脫水而使分子內部能量分配產生的高能磷酸鍵(或高能硫酯鍵),在激酶作用下將高能鍵上的鍵能直接轉移給ADP(或GDP)而生成ATP(或GTP)的反應,稱為底物水平磷酸化。例如:糖酵解過程每次底物磷酸化產生一個ATP65/92糖酵解過程的底物磷酸化:磷酸甘油酸激酶
3-磷酸甘油酸這是糖酵解中第一次底物水平磷酸化反應ADPATP1,3-二磷酸甘油酸(1,3-DPG)OPO3
2-66/92糖酵解過程的底物磷酸化:ADPATP丙酮酸激酶(Mg2+,K+)磷酸烯醇式丙酮酸
烯醇式丙酮酸糖酵解中第二次底物水平磷酸化反應67/92三、氧化磷酸化的作用機制化學偶聯(lián)假說(高能共價中間物?)構象偶聯(lián)假說(構象變化?)化學滲透假說(1961年,英國Mitchell)68/92
因提出氧化磷酸化偶聯(lián)機制:化學滲透學說而在1978年獲諾貝爾化學獎的PeterDMitchell化學滲透假說的偶聯(lián)機制H+H+eOADP+PiATP內外膜間隙內膜線粒體基質電子傳遞給氧釋出的能量推動質子泵H+被泵至線粒體內外膜間隙,在內膜兩側形成化學梯度(勢能)當H+順梯度回到基質面時,釋出的能量使ADP磷酸化為ATP70/92化學滲透學說71/92質子驅動力72/9273/92ATP轉移酶:轉移ATP至胞漿75/92化學滲透假說基本要點:電子經呼吸鏈傳遞的同時,可將質子(H+)從內膜的基質面排到內膜外,而造成膜內外的電化學梯度。當H+離子順梯度回流時釋放出自由能,可使ADP+PiATP。
77/92化學滲透假說基本要點:呼吸鏈中遞氫體和遞電子體是交替排列的,在內膜中都有特定的位置,催化的反應是定向的;當遞氫體從內膜內側接受底物傳來的H+后,可將其中的電子傳給其后的遞電子體,而將H+泵到內膜外側,故具有氫泵作用。線粒體內膜不能讓H+自由通過,H+泵出使內膜外側[H+],造成“跨膜化學電位差”。電化學梯度的形成可看成能量的儲存,是由電子傳遞時釋放的能量所引起。因而當H+離子順梯度回流(通過F0回流到基質)時釋放出自由能,可使ADP+PiATP。78/92四、磷氧比值
P/O值:是指某物質氧化時每消耗1mol氧所消耗無機磷的mol數(shù)。實質:每消耗1mol原子氧所產生的ATP的mol數(shù)。兩類呼吸鏈的磷氧比(真核細胞):NADH呼吸鏈:3(2.5)FADH2呼吸鏈:2(1.5)79/92離體線粒體實驗中測得一些底物的P/O值β-羥丁酸
NAD+→FMN→CoQ→Cyt→O2
2.4~2.82.5琥珀酸
FAD→CoQ→Cyt→O2
1.71.5抗壞血酸
Cytc→Cytaa3→O2
0.881Cytc(Fe2+)Cytaa3→O2
0.61~0.681底物呼吸鏈的組成生成ATP數(shù)P/O值80/92五、ATP生成的結構基礎
ATP合酶(三聯(lián)體、三分子體、F0F1復合體)頭部柄部基底部F1:具ATP合酶活性,α3β3γδεF0:質子通道,鑲嵌于線粒體內膜ab2cn81/9282/92TheATPsynthasecomprisesaprotonchannel(Fo)andaATPase(F1)FO的亞基F1的γ-亞基83/92Theγsubunitpassesthroughthecenteroftheα3β3
hexamerandmakesthenucleotide-bindingsitesintheβsubunitsdistinctfromoneanother.Unlikethetightandlooseforms,theopenformoftheβsubunitcanchangeconformationsufficientlytoreleaseboundnucleotides.ATPReleaseFromtheβsubunitintheopenform.Therotationoftheγsubunitinterconvertsthethreeβsubunits.ThesubunitintheT(tight)form,whichcontainsnewlysynthesizedATPthatcannotbereleased,isconvertedintotheO(open)form.Inthisform,itcanreleaseATPandthenbindADPandPtobeginanewcycle.Binding-ChangeMechanismforATPSynthase.Theα3β3hexamerofATPsynthaseisfixedtoasurface,withtheγsubunitprojectingupwardandlinkedtoafluorescentlylabeledactinfilament.TheadditionandsubsequenthydrolysisofATPresultinthecounterclockwiserotationoftheγsubunit,whichcanbedirectlyseenunderafluorescencemicroscope.DirectObservationofATP-DrivenRotationinATPSynthase.
Thecsubunitconsistsoftwoαhelicesthatspanthemembrane.Anasparticacidresidueinthesecondhelixliesonthecenterofthemembrane.Thestructureoftheasubunithasnotyetbeendirectlyobserved,butitappearstoincludetwohalf-channelsthatallowprotonstoenterandpasspartway(到中途)butnotcompletelythroughthemembrane.Aprotonentersfromtheintermembranespaceintothecytosolichalf-channeltoneutralizethechargeonanaspartateresidueinacsubunit.Withthischargeneutralized,thecringcanrotateclockwisebyonecsubunit,movinganasparticacidresidueoutofthemembraneintothematrixhalf-channel.Thisprotoncanmoveintothematrix,resettingthesystemtoitsinitialstate.ProtonMotionAcrosstheMembraneDrivesRotationoftheCRingEachprotonentersthecytosolichalf-channel,followsacompleterotationofthe
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