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瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA【一】背景知識凝膠電泳是分離和純化DNA片段最常用的技術(shù);分離、鑒定和提純核酸首選的標(biāo)準(zhǔn)方法。根據(jù)制備凝膠的材料:
瓊脂糖電泳凝膠電泳聚丙烯酰胺電泳【二】實驗?zāi)康膶W(xué)習(xí)瓊脂糖凝膠電泳分離DNA的原理和方法檢測堿裂解法提取質(zhì)粒的結(jié)果檢測雙酶切法鑒定重組質(zhì)粒的結(jié)果檢測PCR法鑒定重組質(zhì)粒的結(jié)果瓊脂糖濃度(%)線型DNA分子的分離范圍(Kb)0.35~600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2配制多大濃度的瓊脂糖凝膠,要根據(jù)被檢的DNA分子大小來確定。(3)溴化乙錠為扁平狀分子,在紫外光照射下發(fā)射熒光。EB可與DNA分子形成EB-DNA復(fù)合物,其熒光強度與DNA的含量成正比。據(jù)此可判斷DNA分子量大小和粗略估計樣品DNA濃度。瓊脂糖是一種線性多糖聚合物。濃度越高,孔隙越小,其分辨能力就越強。瓊脂糖濃度(%)線型DNA分子的分離范圍(Kb)0.35~600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2【四】儀器、材料與試劑質(zhì)粒樣品、酶切樣品和PCR樣品。凝膠電泳系統(tǒng)和電泳圖像分析系統(tǒng)(凝膠成像系統(tǒng))等。瓊脂糖、
1XTBE電泳緩沖液、溴化乙錠、
6X載樣緩沖液(
6Xloadingbuffer)和DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(
LambdaDNA/EcoRI+HindIIIMarker)等。
凝膠成像分析系統(tǒng)LambdaDNA/EcoRI+HindIIIMarker(Ferments)一個已知分子質(zhì)量的DNA樣品做最對照,用來確定待測樣品的相對分子質(zhì)量。電泳指示劑溴酚蘭在堿性液體中呈紫蘭色,一般與蔗糖、甘油或聚蔗糖400組成上樣緩沖液。作用:①增加樣品比重,以確保DNA均勻沉入加樣孔內(nèi)。②形成肉眼可見的指示帶,預(yù)測核酸電泳的速度和位置。③使樣品呈色,使加樣操作更方便。上樣緩沖液溴化乙錠溴化乙錠(3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶溴鹽EthidiumBromide,EB),EB染色(EB可很好地?fù)饺氲诫p鏈DNA中),在紫外光下會發(fā)出橙紅色的熒光,用于對DNA進行染色和觀察。用于觀察的紫外光有3種波長,一般使用中波紫外光(302nm)。短波紫外光(254nm)觀察效果較好,但對DNA的破環(huán)很大。長波紫外光(366nm):回收。EB染料優(yōu)點:染色操作簡便,快速,室溫下15-20min;不會使核酸斷裂;靈敏度高,10ng或更少的DNA即可檢出;可以加到樣品中或膠中。EB是誘變劑,使用時一定要戴手套。EB廢液要經(jīng)過處理才能丟棄。SYBR:新型低毒,高靈敏度染料,加入樣品中,價格較昂貴?!疚濉繉嶒灢襟E制備瓊脂糖凝膠(1%)制備凝膠板加樣電泳
染色結(jié)果觀察
(1)制備凝膠和膠板:
45ml(1×TBE)+0.4g瓊脂糖(三角瓶
),
煮膠,溶解,冷卻至60℃(不燙手),倒板(4-6mm),室溫下充分凝固,豎直拔下梳子。膠板設(shè)計(44人):每1
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