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實(shí)驗(yàn)二原核生物基因組的制備第1頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康恼莆諒募?xì)菌中提取基因組DNA的基本原理熟悉利用試劑盒提取細(xì)菌DNA的技術(shù)流程提取卡介苗BCG基因組DNA第2頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六二、實(shí)驗(yàn)原理①裂解細(xì)胞②除去蛋白質(zhì)③析出DNA第3頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六CTAB(cetyltriethylammoniumbromide,十六烷基三乙基溴化銨)是一種去污劑,它能與核酸形成復(fù)合物,這些復(fù)合物在高鹽溶液(0.7mol/lNaCl)中可溶并且穩(wěn)定存在。此時(shí)的高鹽溶液中除含有CTAB-核酸復(fù)合物外,還含有大量的多糖和蛋白。第4頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六核酸提純(1)用氯仿先對(duì)此高鹽溶液進(jìn)行抽提,大量蛋白和多糖等被從溶液中抽提沉淀出來(lái),而核酸仍留在溶液中;接著可用乙醇或異丙醇將核酸從溶液中沉淀出來(lái),然后用水或TE緩沖液等將核酸溶解。第5頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六(2)降低溶液中鹽的濃度(0.3mol/lNaCl),CTAB與核酸的復(fù)合物就會(huì)因溶解度降低而沉淀出來(lái),而大部分的蛋白及多糖仍溶于溶液中;通過(guò)離心將CTAB-核酸沉淀下來(lái),然后溶解于高鹽溶液中。第6頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六三、實(shí)驗(yàn)材料卡介苗BCG細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(離心柱型)DP302水浴鍋、離心機(jī)、移液器第7頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六試劑盒采用可以特異性結(jié)合DNA的離心吸附柱和獨(dú)特的緩沖液系統(tǒng)提取細(xì)菌基因組DNA。離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料為特有新型材料,可高效、專一吸附DNA,最大限度去除雜質(zhì)蛋白及細(xì)胞中其他有機(jī)化合物?;厥盏腄NA可適用于各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR、文庫(kù)構(gòu)建等實(shí)驗(yàn)。第8頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六四、注意事項(xiàng)實(shí)驗(yàn)中所有的廢棄物均要高壓滅菌。第9頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六五、實(shí)驗(yàn)步驟(1)取細(xì)菌培養(yǎng)液1-5ml,10,000rpm,1min,盡量吸凈上清。(2)沉淀中加入180μl溶菌酶溶液(20mg/ml),37℃,60min。(3)加入20μl蛋白酶K溶液,混勻。(4)加入220μl緩沖液GB,振蕩15s,70℃,10min,溶液變澄清。瞬時(shí)離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。第10頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六(5)加入220μl無(wú)水乙醇,充分振蕩15s,此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀,瞬時(shí)離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。(6)將上一步所得溶液和絮狀沉淀都加入一個(gè)吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm,30s,棄廢液,將吸附柱CB3放入收集管中。第11頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六(7)向吸附柱CB3中加入500μl緩沖液GD,12,000rpm,30s,棄廢液,將吸附柱CB3放入收集管中。(8)向吸附柱CB3中加入600μl漂洗液PW,12,000rpm,30s,棄廢液,將吸附柱CB3放入收集管中。第12頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六(9)重復(fù)步驟⑧。(10)將吸附柱CB3放回收集管中,12,000rpm,2min,棄廢液。將吸附柱CB3室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。第13頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六(11)吸附柱CB3轉(zhuǎn)入一個(gè)干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-200μl洗脫緩沖液TE,室溫放置2-5min,12,000rpm,2min,將溶液收集到離心管中。(為增加基因組DNA的得率,可將離心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室溫放置2min,12,000rpm,2min)第14頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六五、結(jié)果檢測(cè)紫外吸收法檢測(cè)所提取基因組DNA的濃度與純度;取少量DNA溶液在0.8%的瓊脂糖凝膠上電泳分離并在核酸紫外檢測(cè)儀上觀察。第15頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六少量DNA溶液在0.8%的瓊脂糖凝膠上電泳分離圖片第16頁(yè),共17頁(yè),2023年,2月20日,星期六六.思考題(1)操作第(4)步驟的時(shí)候溶液是否變得清亮?如果
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