第七章

定性分析本章將學(xué)到:數(shù)據(jù)分析主菜單的特征熟練處理數(shù)據(jù)的性能積分參數(shù)利用反檢索(PBM)進(jìn)行定性分析自動譜庫檢索及報告參數(shù)恢復(fù)如何自建庫定性分析加載數(shù)據(jù)文件放大縮小獲得質(zhì)譜圖扣除本底譜圖檢查峰純度庫檢索常用的定性程序數(shù)據(jù)分析中鼠標(biāo)的功能按相對豐度顯示質(zhì)譜圖選用命令行tools/option/commandline輸入normal100按enter鍵從spectrum/tabulate可列出相對豐度表繼續(xù)鍵入draw按enter鍵.即可按相對豐度顯示質(zhì)譜圖測定信噪比的方法（僅對5973A）調(diào)用相應(yīng)的數(shù)據(jù)文件選用命令行鍵入macro,回車從loadmacro欄目中選擇sig_n.mac,雙擊在命令行鍵入sig_n.mac當(dāng)被問到是否使用當(dāng)前文件時回答yes鍵入目標(biāo)離子或輸入0表示用總離子流圖拖住左鍵指定信號范圍拖住左鍵指定噪音范圍工作站自動從打印機(jī)輸出報告用于設(shè)置RTE積分參數(shù)用于保存當(dāng)前RTE積分參數(shù)用于加載，修復(fù)，保存RTE積分參數(shù)RTE積分參數(shù)峰起點(diǎn)與終點(diǎn)豐度差與峰高相比基線位置。分離相鄰兩峰的最少掃描次數(shù)基線落下或切線峰位置（頂點(diǎn)或峰重心最小峰面積最多峰數(shù)目RTE積分文件擴(kuò)展名為.P關(guān)于RTE積分的說明Datapointsampling:。采樣點(diǎn)數(shù)默認(rèn)值為1。，即每個點(diǎn)都用，選擇2則每隔一點(diǎn)取一個點(diǎn)，選擇3每隔2點(diǎn)取一個點(diǎn)等等，其范圍從1-9，負(fù)值是不允許的。對毛細(xì)管色譜柱在掃描方式(Scan)采集的數(shù)據(jù)通常采樣點(diǎn)數(shù)設(shè)為1，在SIM采集的數(shù)據(jù)或噪音大的數(shù)據(jù)（任何時候積分器都顯示是分叉的峰）一般設(shè)為2或3。這個參數(shù)在早期版本的PTINT中稱作束(bench)。掃描方式采集選1；SIM方式可以選2或3smoothing:默認(rèn)值為不選，即不做平滑處理detectionfiltering:用來改善色譜噪音startthreshold:默認(rèn)值為0.2，很少改變stopthreshold;用于改善拖尾峰的積分情況，閾值越大，拖尾峰的面積越大baselinereset(#points):是分開兩個相鄰色譜峰的最小掃描數(shù)。如果相鄰兩個峰之間的掃描數(shù)小于該值，劃出的基線會低于峰起點(diǎn)或終點(diǎn)ifleadingortrailingedge<和baselinepreference一起用來確定以切線或陡線方式進(jìn)行面積積分。例如：前者選擇20%；后者選擇切線方式，其余陡線方式，則總離子流中峰起點(diǎn)與終點(diǎn)豐度差值小于峰高20%者用切線方式積分；其余的峰按陡線方式積分。Minimumpeakarea:面積閾值。對目標(biāo)化合物分析，一般最好選擇面積計數(shù)(Areacounts)而不選擇最大峰面積百分?jǐn)?shù)(%oflargestpeak)。當(dāng)目標(biāo)化合物不存在時，系統(tǒng)會去積分噪音峰，因而出現(xiàn)“假陽性”。Peaklocation:選擇定量報告中保留時間在峰尖或峰重心位置用于設(shè)置化學(xué)工作站積分參數(shù)用于保存當(dāng)前化學(xué)工作站

積分參數(shù)用于加載，修復(fù)，保存化學(xué)工作站積分

參數(shù)化學(xué)工作站積分參數(shù)確定積分器的初始靈敏度。閾值每增加1,靈敏度就降低一半。其范圍從-12.0到25.0。缺省值為18，但這個值通常太高。閾值是以2為底的對數(shù).化學(xué)工作站積分文件的擴(kuò)展名為.e提取離子色譜將所有離子色譜顯示在一起本底扣除首先在本底處雙擊鼠標(biāo)右鍵，得到一張質(zhì)譜圖。點(diǎn)擊File/SubtractBackground(BSB)不純純峰純距度用未知物譜圖與已知的譜圖文件相比較的過程.理想情況:

理想情況:

找到一個相同譜圖，確定了未知化合物.庫檢索的局限性:

檢索結(jié)果不能確切一致.

能否檢索到正確譜圖,

選擇正確的庫.

庫中是否存在該未知物?什么疲是庫摧檢索土?PB透M庫檢匯索運(yùn)堪用所非包含漠的壓劑縮譜若圖質(zhì)譜圖濃縮譜圖(15-26個最重要的峰)壓縮冷譜圖裳:當(dāng)U+慶A值小最大蘿時，兄質(zhì)躍譜圖糠包含離1櫻5-偶26新質(zhì)禽量裙(稼“最凝重要哲的峰乘")廳.定義由檢萬索目寺錄決漸定.0條-線10荷0%分組唯一染性和搞豐度瓦的函陣數(shù)唯一裁性:豐度:意義:PB溪M庫檢喪索的綱概念U+鑼A:予設(shè)央一個誦質(zhì)譜次峰重輛要性師的過器濾值原，對劇質(zhì)譜駱峰進(jìn)越行予劈燕篩選增大U+盾A闊(D鍵ef遺au墻lt炒=乎2堪,魔Ra約ng跨e勞=遼1-組9)增加鐘檢索囑時間不會足改變班匹配拖質(zhì)量很少喉發(fā)現(xiàn)窗增加載額外道的好恭的匹以配最小緞峰純肅度:未知忽譜圖畝中基能峰相毫當(dāng)于粘參考廣譜中陪基峰根的比湖例增加ME皮P詠(D衛(wèi)ef能au膏l(xiāng)t姿=蘭5舉0,爸R城an傅ge寫=瓦2需0-砍80封%)減少爺檢索法時間可以鞠排除院共流馬出峰詠的匹驚配Ti扎lt兆in久g:應(yīng)用視一個先二次喇函數(shù)釋調(diào)整乖參考敵譜中剃的相畫對豐脆度，排以改句善匹濕配度ON宋/O擔(dān)FF修(科De痛fa命ul決t=駱ON盲)用外廳部數(shù)蔽據(jù)庫類檢索襪時，激設(shè)為OF扮F會降小低匹賠配度Fl餡ag時T岔hr緣瑞es截ho沾ld狂:為參構(gòu)考譜序中重牲要的寸離子躲設(shè)定椅一個造相對艦豐度俊限制業(yè)，在林此限休度之贈上的倡離子宗，要劍求未央知物嫁譜圖傻中含茫有。增加Fl造ag姻T揚(yáng)hr坡es序ho鉤ld傳(既De柜fa枯ul據(jù)t=褲3,央R捧an前ge暢=0勉-9駐9%溉)可以激改善被匹配霸度可以撐增加騰匹配惰的數(shù)英目應(yīng)該兼與數(shù)娘據(jù)采綢集的創(chuàng)閾值瞎吻合靈活字運(yùn)用1.獲得適當(dāng)?shù)淖V圖.

-獲得適當(dāng)?shù)钠骄V圖.-減去適當(dāng)?shù)谋尘白V圖.2.

選擇譜庫和策略3.

譜檢索(在質(zhì)譜圖窗口雙擊鼠標(biāo)右鍵).4.

首先匹配的結(jié)果會自動產(chǎn)生.5.

在結(jié)果欄目中所選擇的匹配上擊鼠標(biāo)左鍵，可檢查其它匹配庫檢遲索步搶驟選擇燒所要呢檢索辨的譜孤庫選擇"Sp伍ec智tr曬um誕/S繪el桶ec薄t揭Li訪br男ar卡y.吹..瘋”輸入?選擇漠所需姐譜庫單擊"OK填"庫檢當(dāng)索和秀報告設(shè)置腸檢索列策略選擇"Sp盼ec噸tr喊um濕/E鐮di昏t遷St您ra紫te擴(kuò)gy租..醫(yī)."設(shè)置蝕所需都參數(shù)單擊"OK澆"庫檢灣索和脊報告Re煉ve測rs詳e犁Se沙ar裹c(diǎn)h茄P腰ar午am看et主er辭sU+殘A:予設(shè)旋一個屋質(zhì)譜咐峰重伏要性材的過動濾值蘿，對交質(zhì)譜兄峰進(jìn)壺行予糊篩選增大U+巨A蠅(D仇ef豎au保lt捏=先2戶,塵Ra凱ng廁e松=往1-峽9)增加較檢索玩時間不會歉改變摩匹配水質(zhì)量很少捆發(fā)現(xiàn)毀增加舒額外眨的好蠟的匹砌配最小粗峰純勞度:未知涌譜圖事中基圣峰相復(fù)當(dāng)于奴參考姑譜中濃基峰桂的比婚例增加ME片P呢(D燃ef兼au向lt講=啄5經(jīng)0,晌R猛an饅ge蠶=證2巡壽0-舅80魯%)減少獅檢索深時間可以漏排除割共流達(dá)出峰燭的匹攀配Ti嚼lt副in亡g:應(yīng)用裁一個么二次盲函數(shù)船調(diào)整皇參考媽譜中脂的相煎對豐往度，因以改翻善匹厚配度ON綁/O揪FF狂(刮De蛙fa漿ul停t=訴ON嚴(yán))用外把部數(shù)戚據(jù)庫末檢索鋒時，鞋設(shè)為OF歡F會降建低匹戶配度Fl靜ag瘋T壓hr峽es權(quán)ho叔ld落:為參刑考譜瓶中重歷要的降離子溝設(shè)定塊一個確相對榜豐度引限制滿，在竄此限簡度之掉上的疏離子能，要腳求未續(xù)知物效譜圖康中含首有。增加Fl墻ag梳T線hr戶es修ho萄ld溫(滋De拿fa溉ul吊t=蛛3,屈R錦an豈ge講=0膊-9蓋9%遍)可以判改善取匹配旅度可以抱增加謙匹配撿的數(shù)佛目應(yīng)該伍與數(shù)種據(jù)采末集的墓閾值懇吻合靈活凍運(yùn)用檢索舟策略由Mc管La伴ff涉er石ty等建撕立的疼以“un攻iq飛ue個ne輔ss乳”與孤“ab里un欣da齒nc桃e”之和提來確額定質(zhì)鹽譜峰駱的重擾要性掀，具仍有統(tǒng)切計學(xué)糾意義叢.概率=題0.標(biāo)5員(U+匙A)U+枕A值越謠高則洋該離合子在緊所有型譜圖亮中出朝現(xiàn)的假幾率鍛越小熄,因此劍更有涉意義Ab膽un姐da奴nc踩e:陡0轟-1燥00晨%分為肅7組Un昆iq攝ue苗ne替ss液:取決飲于質(zhì)河譜峰咐在所若有譜配圖中殺出現(xiàn)樣的次四數(shù)，生分為尖13侄組基峰:包括堪在內(nèi)分子抽離子:包括偉在內(nèi)合邏料輯的織丟失醋:包括駁在內(nèi)共同粒的離點(diǎn)子:Un眉iq樂ue木ne宣ss=詞0不和黨合邏勒輯的賤丟失結(jié):唯一砍性減坡小逆檢杠索綜虎述27230319818215012294824240801201602002402801.0E50.0E52.0E53.0E58218230394421221501982723.0E52.0E51.0E50.0E54080120160200240280未知陣譜減少較至15武-2販6個最務(wù)有意岡義的快離子與譜塌庫中澇的譜屠圖相索對照未知莫譜的墳峰是曠否在繪譜庫扯中?豐度呆相同歷否?評價禍比較顯示紛結(jié)果檢索蹤蝶結(jié)果2040608010012014016018020022024026028002000400060008000m/z-->AbundanceAverageof9.739to9.796min.:EVALDEMO.D(*)29435574871011151291431571711851992132272392702040608010012014016018020022024026028002000400060008000m/z-->Abundance#153629:Hexadecanoicacid,methylester(CAS)$$Methylpal(*)435574879711512914315717118519921322723927027230319818215012294824240801201602002402801.0E50.0E52.0E53.0E58218盟230傭39419廚827斑23.碧0E52.民0E51.翠0E50.票0E5408012岸016星020艦024司028槳0檢索泥步驟未知遮物譜簡化凱為1塞0個最勾有意暢義的汁峰與譜灰?guī)毂却逸^譜庫義中是劉否有摟這些拒峰?豐度惠比是科否正柏確?評價中對比汗結(jié)果顯示夫檢索狗結(jié)果Si末gn歷if血ic朽an睛ce竹=極M心as蝴s暈x鄉(xiāng)豐Ab貼un廟da編nc眾e

Amxam=110[(Am)2x(am)2]1/2

=11010=1相似扮指數(shù)=Pe蘇rf乳ec悶t捏ma旅tc譜h耗=聯(lián)1,融P損er狡fe訓(xùn)ct左m聾is惑ma育tc瞞h蜜=敏0Re易po詞rt嘉s消SI阿x驢1敬0,棕00柱0驗證慎手段分子螞式計會算氮規(guī)陜則同位粱素簇散摸樣合理燭丟失丟失則中性美碎片PB夢M檢索召結(jié)果檢索綢結(jié)果注意素:沒有桿一個牽檢索伯程式嶼，或駱一種市經(jīng)驗譯保證符10旨0%影的正逗確檢鐘索結(jié)境果.床很兔多因寄素會煙影響甩檢索群的質(zhì)文量檢索嶼統(tǒng)計校表檢索毯統(tǒng)計狼表說垃明檢索福統(tǒng)計呈表說嬸明(扎續(xù))檢索甘報告槍作為議方法宿的一秒部分選擇"Me姨th呀od黃/E腐di獵t皂Me委th銹od里..怪."選擇"Li豆bS端ea念rc鐵hRe徑po證rt孩"設(shè)置延所需泡報告煎格式和目孤的文鈔件自動上庫檢膠索譜庫懸檢索磨報告在譜庫中是否包含該化合物?檢索策略的選擇.庫檢索.未知譜的狀況.

適當(dāng)?shù)膾呙璺秶?掃描閾值

在GC峰中的位置

混合物譜圖

平均/背景扣除影響山檢索互的因理素參數(shù)瞎檢索參數(shù)敗檢索舊結(jié)果選用手分子革結(jié)構(gòu)葬數(shù)據(jù)妻庫步趙驟點(diǎn)擊Ad青d腐ne彎w伸fi峽le在mo云ls守tr頭uc處雙膽擊左絕鍵在mo駐ls汁tr橋uc.sd乘b處雙釋擊左池鍵點(diǎn)擊OK從vi蒙ew源/s績ta針nd揭ar塘d墓me槐nu轉(zhuǎn)回交原窗遣口較好的匹配快速檢索了解參考譜圖的質(zhì)量可以編輯和修改用戶萍自建淺庫建立配自建記庫添加儲和編虛輯信撓息（將象用戶踏當(dāng)前拼數(shù)據(jù)乘文件肯中的泊一張覆質(zhì)譜也圖放幣入自鴨建庫革）把商灑品譜奮庫中府的一奸張放襪入自覺建庫澤（連兩同結(jié)系構(gòu)式匹）自動沃化工擺具