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RNA測序和本進行RNA提取、測序和生物信息學(xué)分析。RNATrizolRNAIlluminaHiSeq2500測序分析RNA測序結(jié)果。TopHatCufflinksRNA序列比對GOKEGG數(shù)據(jù)庫進行轉(zhuǎn)錄本的功能注釋和信RNA測序和生物信息學(xué)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),與非縫合線組織相比,縫合Gs共有15715個基因表達量上調(diào),52個基因表達量下調(diào)。GO分析結(jié)果表明上調(diào)基因的富集功能主要涉及“花青素生物合成過程”、“花色苷聯(lián)合酶活性”等生物學(xué)過程。KEGG要涉及代謝途徑,丙酮酸代謝、碳酸鹽代謝、異源硫同化等通路在縫合線組織中發(fā)生了變化。控因子。例如,CYCD3、HAT22和EPF在縫合線局部早熟中可能均發(fā)揮了重要作用。CYCD3是調(diào)控細(xì)胞周期的基因,HAT22參與水稻頰瘤病的防御,EPF是芽發(fā)育過程中的一個調(diào)節(jié)因子。這些基因可能通過影響果實RNA
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