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文檔簡介
DNA的復(fù)制、修復(fù)與重組DNA技術(shù)第十二章DNAreplication,repairandbination2
引言以中心法則為基本線索,現(xiàn)代分子生物學(xué)的基本內(nèi)容包括:復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯、基因表達(dá)調(diào)控和重組DNA技術(shù)3遺傳信息如何傳遞?DNA復(fù)制(replication)42.遺傳信息如何表達(dá)?轉(zhuǎn)錄(Transcription)
DNA的堿基按互補(bǔ)配對(duì)(G-C,T-A,A-U)的原則轉(zhuǎn)變?yōu)镽NA(B)翻譯(Translation)三個(gè)堿基序列對(duì)應(yīng)編碼一個(gè)氨基酸蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)5中心法則分子生物學(xué)的中心法則
(centraldogma)6阿瑟·科恩伯格。用實(shí)驗(yàn)證明DNA的復(fù)制并分離了復(fù)制所需的酶,因此于1959年獲得諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。羅杰·科恩伯格。對(duì)基因轉(zhuǎn)錄機(jī)制進(jìn)行了詳細(xì)描述,他因此于2006年獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。7DNA的復(fù)制DNA的損傷與修復(fù)重組DNA技術(shù)DNA的復(fù)制DNAreplication8主要內(nèi)容第一節(jié)DNA復(fù)制的幾個(gè)基本原則第二節(jié)參與DNA復(fù)制的一些酶類和蛋白質(zhì)第三節(jié)DNA復(fù)制過程
9第一節(jié)DNA復(fù)制的幾個(gè)基本原則(特點(diǎn))10DNA的結(jié)構(gòu)及染色體的構(gòu)成11一、半保留復(fù)制
(Semiconservativereplication)二、半不連續(xù)復(fù)制(Semidiscontinuousreplication)三、RNA引物
(RNAprime)
四、復(fù)制的真實(shí)性
(Fidelityof
replication)121953年4月,JD.Watson和FHC.Crick英國自然雜志發(fā)表論文,建立了DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。理論依據(jù)之一是堿基配對(duì)理論。DNA復(fù)制假說的提出。一、半保留復(fù)制(semi-conservativereplication)13子鏈繼承母鏈遺傳信息的幾種可能方式
全保留式半保留式混合式14密度梯度實(shí)驗(yàn)含15N-DNA的細(xì)菌培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液(含14N的NH4Cl)
第一代繼續(xù)培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液
第二代梯度離心結(jié)果實(shí)驗(yàn)依據(jù):普通DNA的沉降位置普通DNA重DNA重DNA15AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母鏈DNA
復(fù)制過程中形成的復(fù)制叉子代DNA
16
DNA進(jìn)行復(fù)制時(shí),DNA雙鏈每股鏈都可作為模板,按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則指導(dǎo)DNA新鏈的合成,這樣合成的兩個(gè)子代DNA分子,堿基序列與親代分子完全一樣。其中一條鏈來自親代的DNA鏈,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻逆湣6x:17模板:親代的DNA雙鏈(每股均可為模板)原則:按堿基配對(duì)原則(A-T、G-C)指導(dǎo)新鏈的合成特點(diǎn):合成的兩個(gè)子代DNA分子堿基序列與親代分子完全一樣,但一條鏈來自于親代的DNA鏈,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻逆溞〗Y(jié):18按半保留復(fù)制方式,子代DNA與親代DNA的堿基序列一致,即子代保留了親代的全部遺傳信息,體現(xiàn)了遺傳的保守性。半保留復(fù)制的意義:遺傳的保守性,是物種穩(wěn)定性的分子基礎(chǔ),但不是絕對(duì)的。19二、半不連續(xù)復(fù)制(semidiscontinuousreplication)
1、(親代)DNA兩股鏈反向平行兩股子鏈反向平行5’3
’3’5’5’3’3’5’3’5’5’3’親代子代子代202、存在兩種DNA聚合酶?
5’
3’
3’
5’
*
體內(nèi)僅有5’3’DNA聚合酶*
所有DNA聚合酶只能催化5’3’方向合成3’5’
如何合成?21崗崎片段的發(fā)現(xiàn)(Okazakifragment)DNA復(fù)制中--1-2千核苷酸片段合成終止--連成一長鏈(崗崎片段)1968年,大腸桿菌223
5
3
5
解鏈方向3′5′3′3′5′前導(dǎo)鏈(leadingstrand)隨從鏈(laggingstrand)半不連續(xù)復(fù)制崗崎片段5′模板方向合成方向23DNA復(fù)制時(shí):
一股以3’5’方向的母鏈作為模板,指導(dǎo)新合成的鏈以5’3’方向
連續(xù)合成的鏈稱為前導(dǎo)鏈。前導(dǎo)鏈(leadingstrand):(復(fù)制方向與解鏈方向一致)24隨從鏈(laggingstrand):
DNA復(fù)制時(shí):一股以5’3’方向的母鏈作為模板,指導(dǎo)新合成的鏈沿5’3’方向,合成1000-2000個(gè)核苷酸不連續(xù)的小片段,這就是崗崎片段。隨著鏈的延伸,有許多崗崎片段組成的這條鏈稱為隨從鏈。(復(fù)制方向與解鏈方向相反)25
半不連續(xù)復(fù)制的定義:在DNA復(fù)制過程中,親代DNA分子中以3’5’方向的母鏈作為模板指導(dǎo)新的鏈以5’3’方向連續(xù)合成,另一股以5’
3’方向的母鏈則指導(dǎo)新合成的鏈以5’
3’方向合成1000—2000個(gè)核苷酸長度的許多不連續(xù)的片段(崗崎片段),這種復(fù)制方式稱之為半不連續(xù)復(fù)制。26三、RNA引物DNA聚合酶a.不能催化兩個(gè)游離的dNTP聚合b.需要含3’-OH的引物(RNA)a.RNA聚合酶抑制物能抑制DNA合成*根據(jù):b.崗崎片段5’段有RNA引物27RNA聚合酶a.
能催化兩個(gè)游離的NTP聚合b.其產(chǎn)物提供3’-OH圖12-31、DNA復(fù)制時(shí)先在RNA聚合酶催化下,以DNA為模板,合成一小片段的RNA,作為DNA合成的引物。283、RNA引物的作用:
1)為DNA聚合酶提供合成核苷酸所需的3’-
OH
2)可盡量減小DNA復(fù)制起始處的突變2、
RNA引物最后要被DNA聚合酶Ⅰ除去,空隙由該酶補(bǔ)滿,缺口再由DNA連接酶連接。29四、復(fù)制的真實(shí)性DNA的半保留復(fù)制遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律RNA引物DNA聚合酶在復(fù)制延長中對(duì)堿基的選擇功能復(fù)制出錯(cuò)時(shí)有即時(shí)的校讀功能(3’5’外切酶功能)DNA損傷的修復(fù)機(jī)制30第二節(jié)參與DNA復(fù)制的一些酶類和蛋白質(zhì)31底物(substrate):
dATP,dGTP,dCTP,dTTP(dNTP)聚合酶(polymerase):
依賴DNA的DNA聚合酶,簡寫為DNA-pol模板(template):
解開成單鏈的DNA母鏈引物(primer):
提供3
-OH末端使dNTP可以依次聚合
其他的酶和蛋白質(zhì)因子DNA復(fù)制的條件32DNA聚合酶:ⅠⅡⅢ(原核生物);
、
、
、
、(真核生物)解鏈、解旋酶和蛋白質(zhì):DNA解鏈酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)、DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ/Ⅱ引發(fā)體DNA連接酶酶和蛋白質(zhì)因子33DNA聚合酶全稱:依賴DNA的DNA聚合酶(DNA-dependentDNApolymerase)簡稱:DNA-pol活性:5
3
的聚合酶活性核酸外切酶活性5
3
外切酶活性3
5
外切酶活性345′AGCTTCAGGATA
3′
|||||||||||3′TCGAAGTCCTAGCGAC5′
3
5
外切酶活性
5
3
外切酶活性?能從5
端切除DNA片段。能辨認(rèn)錯(cuò)配的堿基對(duì),并將其水解。
核酸外切酶活性:
35DNA聚合酶催化的聚合反應(yīng)3’,5’-磷酸二酯鍵3’5’圖12-436一、大腸桿菌的DNA聚合酶(ⅠⅡⅢ)也稱為Kornberg酶活性:
1.
5
3
的聚合活性
2.
核酸外切酶活性1955年Kornberg發(fā)現(xiàn)了DNA聚合酶ⅠDNA聚合酶Ⅰ簡稱為polⅠ37323個(gè)氨基酸小片段5
核酸外切酶活性大片段/Klenow
片段
604個(gè)氨基酸DNA聚合酶活性
5
核酸外切酶活性N端C端木瓜蛋白酶DNA-polⅠ38從3
端水解DNA產(chǎn)生3
單核苷酸,這種外切酶活性對(duì)保證DNA復(fù)制的真實(shí)性具有重要的意義。39校讀功能:DNA聚合酶在接上新的核苷酸之前,能對(duì)3’末端的堿基進(jìn)行識(shí)別。若為錯(cuò)配的堿基,即可通過3’5’外切酶活性把錯(cuò)配的堿基切除,再把正確的堿基聚合上去,保證DNA復(fù)制的高度真實(shí)性,這種功能也稱為校讀功能(proofreading)。40具有5’3’外切酶活性小片段可除去崗崎片段5’端的RNA引物在DNA損傷修復(fù)中起重要作用41
3’5’5’3’
外切酶
聚合酶NC
5’3’外切酶小片段大片段(klenow片段)切除RNA引物損傷修復(fù)校讀功能聚合功能DNA聚合酶I是多功能酶DNA聚合酶I的多肽鏈上具有三種酶活性
Klenow片段是實(shí)驗(yàn)室合成DNA、進(jìn)行分子生物學(xué)研究中常用的工具酶。42DNA-polⅢ
(DNAPolymeraseⅢholoenzyme)多聚酶10種不同亞基組成θαε-核心聚合酶τ-二聚體形式連接兩個(gè)核心聚合酶γ2δδ’χψ-單個(gè)運(yùn)載夾鉗DNA聚合酶Ⅲ※β(4個(gè))-星環(huán)狀,容納DNA雙鏈DNA聚合酶Ⅲ全酶43核心酶由
、
和
亞基組成:
亞基(130000)主要功能是合成DNA
亞基具有3
5
外切酶活性(校正功能)
亞基可增強(qiáng)其活性
亞基可能起組裝作用44功能:是原核生物復(fù)制延長中真正起催化作用的酶。1.
由多個(gè)亞基的全酶.成不對(duì)稱的二聚體每個(gè)單體都具有催化活性,一個(gè)作用于前導(dǎo)鏈,另一個(gè)作用于隨從鏈,使DNA兩
股鏈在同一地方同一時(shí)間進(jìn)行合成。45462.
是一種非常高的續(xù)進(jìn)性(processive)酶3.
催化活性比DNA聚合酶I高100倍4.
DNA聚合酶III是DNA復(fù)制的主要酶47(a)DNA聚合酶Ⅲ全酶空間結(jié)構(gòu)圖(b)DNA聚合酶Ⅲ全酶電子云實(shí)體模型48原核生物的DNA聚合酶比較DNA聚合酶Ⅰ多功能酶5’3’外切酶3’5’外切酶
5’3’聚合酶單一肽鏈大小二個(gè)片段切除RNA引物,填補(bǔ)空缺損傷后修復(fù)DNA聚合酶Ⅲ多功能酶
5’3’聚合酶
3’5’外切酶
不對(duì)稱二聚體
單體1-前導(dǎo)鏈/單體2-隨從鏈DNA復(fù)制的主要酶
高續(xù)進(jìn)性
高聚合酶活性
高產(chǎn)物真實(shí)性49二、真核生物的DNA聚合酶DNA-pol
負(fù)責(zé)隨從鏈的合成在復(fù)制過程中起校讀、修復(fù)和填補(bǔ)缺口的作用。負(fù)責(zé)線粒體DNA的復(fù)制DNA-pol
DNA-pol
和PCNADNA-pol
、
負(fù)責(zé)前導(dǎo)鏈的合成50三、解旋、解鏈酶類和蛋白質(zhì)DNA分子的堿基埋在雙螺旋內(nèi)部,只有把DNA解成單鏈,它才能起模板作用;復(fù)制不斷延伸,螺旋不斷解開-解鏈、解旋酶類保持解開模板的單鏈狀態(tài)-單鏈DNA結(jié)合蛋白解旋后在復(fù)制前方產(chǎn)生很大的張力,DNA發(fā)生纏結(jié)后-DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶51
1、DNA解鏈酶(DNAhelicase)
功能:解開DNA雙鏈,具有ATP酶的活性,每解開1對(duì)堿基消耗2個(gè)ATP。522、單鏈DNA結(jié)合蛋白
又稱螺旋去穩(wěn)定蛋白(helixdestabilizingprotein,HDP)作用1)與單鏈DNA結(jié)合,維持模板處于單鏈狀態(tài),2)保護(hù)解開的單鏈模板不被核酸酶水解3)避免重新形成雙鏈;避免解開的單鏈自身發(fā)夾螺旋的形成4)使前端雙螺旋的穩(wěn)定性降低,易被解開
(singlestrandbindingprotein,SSB)533、DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNAtopoisomerase)
108
局部解鏈后54解鏈過程中正超螺旋的形成55拓?fù)洚悩?gòu)酶作用特點(diǎn)既能水解、又能連接磷酸二酯鍵(可逆的核酸酶)分類
拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ
拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ56作用機(jī)制
拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ切斷DNA雙鏈中一股鏈,使DNA解鏈旋轉(zhuǎn)不致打結(jié);適當(dāng)時(shí)候封閉切口,DNA變?yōu)樗沙跔顟B(tài)。反應(yīng)不需ATP。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ切斷DNA分子兩股鏈,斷端通過切口旋轉(zhuǎn)使超螺旋松弛。利用ATP供能,連接斷端,DNA分子進(jìn)入負(fù)超螺旋狀態(tài)。57四、引發(fā)體(primosome)DnaA
結(jié)合至復(fù)制起始部位
DnaB
具有解鏈酶的作用DnaC
協(xié)同DnaB引物酶是一種RNA聚合酶由多種蛋白質(zhì)及酶組成,是DNA復(fù)制開始所必需的。58
DnaA
DnaB、DnaCDNA拓?fù)洚悩?gòu)酶引物酶SSB3
5
3
5
引發(fā)體和引物含有解螺旋酶、DnaA/B/C蛋白、引物酶和DNA復(fù)制起始區(qū)域的復(fù)合結(jié)構(gòu)稱為引發(fā)體。
59五、DNA連接酶連接DNA鏈3
-OH末端和相鄰DNA鏈5
-P末端,使二者生成磷酸二酯鍵,從而把兩段相鄰的DNA鏈連接成一條完整的鏈。605’3’OH5’3’
OO-POO-有缺口的DNA鏈DNA連接酶ATPAMP+PPi
OO
POO-5’3’缺口封閉61缺口填補(bǔ):連接雙股DNA分子中一鏈的缺口連接雙鏈DNA分子中雙鏈的缺口不能連接二分子單鏈DNA
62應(yīng)用:限制性內(nèi)切酶切割后形成的粘性末端或平末端的連接1.崗崎片段之間的連接2.DNA損傷修復(fù)中的連接3.一種重要的工具酶:
63
DNA連接酶的特點(diǎn):1)DNA連接酶連接雙鏈DNA分子中的一股鏈上的缺口,或雙鏈DNA分子雙股鏈的缺口2)DNA連接酶要求一條DNA鏈3’端有游離的
OH,
另一條鏈的5’
末端帶有磷酸根,使二者生成磷酸二酯鍵3)連接酶的催化作用需消耗ATP
4)DNA連接酶是一種重要的工具酶64第三節(jié)DNA復(fù)制過程651)復(fù)制的起始2)復(fù)制的延長3)復(fù)制的終止DNA復(fù)制過程66一、復(fù)制的起始大腸桿菌復(fù)制時(shí)有特定的起始部位稱oriC,復(fù)制從oriC開始,同時(shí)向兩個(gè)方向進(jìn)行的,稱為雙向復(fù)制(bi-directionalreplication)。圖12-104個(gè)9-bp的反向重復(fù)序列高度保守出現(xiàn)11次67DNA雙鏈復(fù)制起始點(diǎn)DNA雙鏈解開成單鏈DNASSB引物酶RNA引物/3’-OHDNA聚合酶ⅢdNTP和3’-OH形成3’5’磷酸二酯鍵
dnaAdnaB/dnaC解鏈、解旋酶拓?fù)洚悩?gòu)酶68復(fù)制開始后由于DNA雙鏈解開,在兩股單鏈上進(jìn)行復(fù)制,在電子顯微鏡下均看到DNA復(fù)制前進(jìn)部伸展成叉狀的復(fù)制現(xiàn)象,稱為復(fù)制叉(replicationfork)。12-11Y字形Y字形69真核細(xì)胞DNA分子巨大,有許多個(gè)復(fù)制起始點(diǎn),同時(shí)進(jìn)行復(fù)制,形成多個(gè)復(fù)制單位。電鏡下觀察如眼泡狀。12-1212-1270二、復(fù)制的延長指在DNA-pol催化下,新合成的DNA鏈不斷延長。其化學(xué)本質(zhì)是磷酸二酯鍵的不斷生成。
大腸桿菌崗崎片段的長度為1000-2000個(gè)前導(dǎo)鏈合成1000-2000個(gè)核苷酸后,隨從鏈開始合成。
DNA聚合酶III為不對(duì)稱二聚體,每一個(gè)單體均可催化DNA合成,一個(gè)作用于前導(dǎo)鏈,另一個(gè)作用于隨從鏈。71前導(dǎo)鏈的合成72隨從鏈的合成735’3’3’5’圖12-13
74圖12-1475三、復(fù)制的終止RNA引物被DNA聚合酶I切除DNA聚合酶I填補(bǔ)空缺缺口由連接酶連接形成磷酸二酯鍵7677參與復(fù)制的酶類與蛋白質(zhì)78端粒(telomere):真核生物線性染色體的兩個(gè)末端每復(fù)制一次,新合成鏈的5’RNA引物被切除后,留下空缺。末端問題(真核生物阻止端??s短的機(jī)制)四、真核生物端粒DNA的復(fù)制79802009年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)
發(fā)現(xiàn)端粒和端粒酶是如何保護(hù)染色體的
伊麗莎白-布萊克本
卡蘿爾-格雷德杰克-紹斯塔克
811、端粒DNA的結(jié)構(gòu)和端粒酶端粒DNA的3’末端是由數(shù)百個(gè)串聯(lián)重復(fù)GT豐富的短的寡核苷酸組成,如四膜蟲為-GGGGTT-,人為-AGGGTT-。端粒DNA的生物學(xué)作用:維持染色體的穩(wěn)定性起著重要作用,保護(hù)DNA雙鏈末端,使其免遭端-端融合、降解、重排、染色體丟失等變化。82防止端粒縮短的酶端粒酶
RNA
作為合成端粒DNA的模板端粒酶
蛋白質(zhì)一種特殊逆轉(zhuǎn)錄酶,以其中RNA為模板催化合成端粒DNA
,具有種屬特異性
832、端粒酶的作用機(jī)制圖12-163.再發(fā)動(dòng)新一輪的合成延長,合成較長的重復(fù)序列DNA末端1.RNA和DNA單鏈互補(bǔ)序列識(shí)別結(jié)合2.以RNA為模板的逆轉(zhuǎn)錄過程84DNA聚合酶復(fù)制子鏈4.以延長的DNA單鏈為模板,3’-OH為引物合成富含CA的互補(bǔ)鏈進(jìn)一步加工DNA連接酶核酸酶G-T發(fā)夾85哺乳動(dòng)物中端粒末端形成大的環(huán)狀結(jié)構(gòu),環(huán)狀DNA+蛋白質(zhì)保護(hù)染色體3’端的穩(wěn)定圖12-17端粒的環(huán)狀結(jié)構(gòu)86端粒酶和衰老、腫瘤有關(guān)87第四節(jié)DNA的損傷和修復(fù)1.DNA雙鏈?zhǔn)荄NA修復(fù)的基礎(chǔ)2.DNA損傷是絕對(duì)的,而修復(fù)是相對(duì)的3.在DNA復(fù)制過程中修復(fù)DNA損傷可保持遺傳密碼的穩(wěn)定性88DNA修復(fù)的基礎(chǔ)一條鏈有損傷修復(fù)酶切除以未損傷的鏈為模板,合成與原來相同的序列89
1、自發(fā)的因素周圍環(huán)境溶劑分子的隨機(jī)熱碰撞
嘌呤堿脫落
胞嘧啶(C)自發(fā)脫氨成尿嘧啶(U)
一、造成DNA損傷的因素902、物理因素:
1)紫外線(UV)損傷產(chǎn)生嘧啶二聚體
2)電離輻射的損傷
產(chǎn)生堿基破壞、分子交聯(lián)和單鏈端裂等
91物理因素:紫外線(ultraviolet,UV)、各種輻射
UV92(三)化學(xué)因素
*亞硝酸鹽(使胞嘧啶脫氨而成尿嘧啶)*5-溴尿嘧啶(5-BU)
*氮芥類93二、DNA損傷的類型點(diǎn)突變類型結(jié)果轉(zhuǎn)換----同型堿基顛換----異型堿基啟動(dòng)子/剪接信號(hào)影響整個(gè)基因功能編碼序列蛋白質(zhì)功能改變中性變化AA變化,功能不變靜止突變堿基變,AA不變94鐮形紅細(xì)胞貧血病人Hb(HbS)β亞基N-val
·
his
·
leu
·
thr
·
pro·
val
·
glu
·
·
·
·
·
·
C肽鏈CACGTG基因正常成人Hb(HbA)β亞基N-val
·
his
·
leu
·
thr
·
pro·
glu
·
glu
·
·
·
·
·
·
C肽鏈CTCGAG基因95缺失插入倒位一個(gè)堿基/一段核苷酸/整個(gè)基因一段原來沒有的堿基/核苷酸序列DNA鏈內(nèi)部重組,一段方向顛倒96谷
酪
蛋
絲5’……GCA
GUA
CAU
GUC……丙
纈組纈正常5’……GAG
UAC
AUG
UC……缺失C缺失引起框移突變97三、修復(fù)機(jī)制(一)光修復(fù)機(jī)制280nm239nm1、不需要光復(fù)活酶嘧啶單體嘧啶二聚體2、需要光復(fù)活酶嘧啶單體嘧啶二聚體光復(fù)活酶(+)98(二)切除修復(fù)(暗修復(fù))1、DNA引起大的損傷,一般由切除修復(fù)系統(tǒng)修復(fù)。2、對(duì)所有生物的生存是關(guān)鍵的。99OHPDNA聚合酶ⅠOHPDNA連接酶ATPE.coli的切除修復(fù)機(jī)制4個(gè)核苷酸8個(gè)核苷酸UvrAUvrBUvrC擴(kuò)創(chuàng)UV特異切割酶1001、切除修復(fù)是人體細(xì)胞最重要和有效的修復(fù)機(jī)制,主要由DNA-polⅠ和連接酶完成。2、遺傳性疾病如著色性干皮病由于缺乏
UV特異核酸內(nèi)切酶。101(三)堿基切除修復(fù)
DNA糖苷酶識(shí)別切除改變的堿基核酸內(nèi)切酶切除磷酸二酯鍵
DNA聚合酶Ⅰ填補(bǔ)
DNA連接酶連接1022.識(shí)別的酶:(1)一類DNA糖苷酶(20種)各具特異性
e.g.尿嘧啶DNA糖苷酶—識(shí)別DNA中的U
(由C突變而來)(2)作用:識(shí)別-----DNA中改變的堿基水解-----改變的堿基與脫氧核糖間的糖苷鍵改變的堿基脫落10312341043.DNA堿基的組成為何是“T”
?(1)DNA中的C脫氨容易突變成U,
造成子代DNA的突變G:CA:T(2)尿嘧啶DNA糖苷酶—識(shí)別DNA中的U
(由C突變而來)(3)若DNA中存在U,無法區(qū)別突變U和正常U(4)DNA中U甲基化/耗能生成T(5)DNA堿基中T的存在,
增加遺傳信息的穩(wěn)定性(6)RNA中的U:數(shù)量多/半衰期短/經(jīng)濟(jì)105基因重組技術(shù)作為分子醫(yī)學(xué)中最重要、最基本的技術(shù)之一,是許多分子醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)實(shí)施的基礎(chǔ),在基因診斷、治療和預(yù)防中具有舉足輕重的意義。
第五節(jié)重組DNA技術(shù)與基因工程106DNA重組(binationofDNA)自然界常見現(xiàn)象兩個(gè)DNA分子間/一DNA分子的兩個(gè)不同部位之間鏈斷裂/片段交換重接改變基因的組合和序列交換可發(fā)生在同一細(xì)胞內(nèi)(間)/不同生物107重組DNA技術(shù)(20世紀(jì)70年代)實(shí)驗(yàn)室,人工的方法不同來源/不同種屬的DNA片段
拼接成重組DNA分子引入活細(xì)胞內(nèi)
大量復(fù)制/表達(dá)108
現(xiàn)代基因工程的創(chuàng)始人P·Berg(美國,1926-)在1960年以敏銳的科學(xué)預(yù)見力提出一個(gè)大膽的設(shè)想:是否可以創(chuàng)造出一種人工方法,把外界的遺傳基因引入動(dòng)物體內(nèi),以達(dá)到改變遺傳性狀和治療某些疾病的需要呢?1972年,伯格把兩種病毒的DNA用同一種限制性內(nèi)切酶切割后,再用DNA連接酶把這兩種DNA分子連接起來,于是產(chǎn)生了一種新的重組DNA分子,首次實(shí)現(xiàn)兩種不同生物的DNA體外連接,獲得了第一批重組DNA分子,這標(biāo)志著基因工程技術(shù)的誕生。伯格因此獲得了1980年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。
109
1973年,美國斯坦福大學(xué)教授S·Cohen和加州大學(xué)舊金山分校教授H·W·Boyer將兩個(gè)不同的質(zhì)粒(一個(gè)是抗四環(huán)素質(zhì)粒,另一個(gè)是抗鏈霉素質(zhì)粒)拼接在一起,組成嵌合質(zhì)粒,并將其導(dǎo)入大腸桿菌,當(dāng)該重組質(zhì)粒進(jìn)入大腸桿菌體內(nèi)后,這些大腸桿菌能抵抗兩種藥物,而且這種大腸桿菌的后代都具有雙重抗藥性。這表明“雜合質(zhì)?!痹诖竽c桿菌的細(xì)胞分裂時(shí)也能自我復(fù)制。110
Cohen隨后以DNA重組技術(shù)發(fā)明人的身份向美國專利局申報(bào)了世界上第一個(gè)基因工程的技術(shù)專利。這標(biāo)志著自然界不同物種間在億萬年中形成的天然屏障被打破了,人類可以根據(jù)自己的意愿定向地改造生物的遺傳特性,甚至創(chuàng)造新的生命類型。
1977年,吉爾伯特(W·Gilbert)分別將編碼胰島素和干擾素的DNA經(jīng)過體外重新拼接后,導(dǎo)入大腸桿菌中,分別使大腸桿菌合成了胰島素和干擾素。
111
基因工程問世后的短短30年間,不僅催生了一個(gè)又一個(gè)基因工程的新成果,也催生了一個(gè)源于DNA研究的新興產(chǎn)業(yè),導(dǎo)致眾多的生命科學(xué)高技術(shù)企業(yè)應(yīng)運(yùn)而生。到2001年年初,美國生物技術(shù)公司已有1400家,而這一數(shù)字還不包括為數(shù)更多的相關(guān)技術(shù)公司和傳統(tǒng)制藥公司,2000年底美國生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)的收入達(dá)到250億美元??梢院敛豢鋸埖卣f,基因工程對(duì)生物、醫(yī)藥和農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域都產(chǎn)生了革命性的影響,它對(duì)人們生活影響的深度和廣度早已超出了人們的想象。112
淡綠、橘黃、淺紅、金黃……用這些天然彩色蠶繭絲無需染色而織成色彩斑斕的綢緞,兼具華美外觀和環(huán)保內(nèi)質(zhì)。通過基因重組法選育高產(chǎn)彩色繭蠶品種獲成功。113
玫瑰的栽培歷史可以追溯到5000年前,但通過色素呈現(xiàn)出藍(lán)色的玫瑰卻從來沒有過。從藍(lán)色三葉草中提取制造藍(lán)色色素的基因,然后注入到玫瑰中,并成功地讓翠雀花素單獨(dú)顯色。114基因工程(geneticengineering)/遺傳工程
由于它可以把一個(gè)生物體中攜帶的某一特
定的遺傳信息,通過一定的方法轉(zhuǎn)移到另
一生物體中,使之獲得前者的遺傳特征,創(chuàng)
造新的遺傳組合,所以又稱基因工程。
克?。╟lone)
指通過無性繁殖過程所產(chǎn)生的與親代
完全相同的子代群體。115基因工程--當(dāng)代新興的學(xué)科領(lǐng)域1.基因與疾病的關(guān)系:2.生物制藥:100種以上人胰島素、促紅細(xì)胞生成素(1996年)3.疫苗研究:BCG疫苗4.環(huán)境監(jiān)測(cè)與凈化1161996年7月5日,世界上第一只克隆羊“多利”在英國蘇格蘭盧斯林研究所的試驗(yàn)基地誕生。117重組DNA技術(shù)的基本步驟
1.目的基因的獲得
2.目的基因與載體的連接
3.重組DNA分子導(dǎo)入受體細(xì)胞
4.篩選出含重組DNA基因分子的受體細(xì)胞克隆
5.克隆基因的表達(dá)及表達(dá)產(chǎn)物的檢測(cè)和分離純化118一、基因工程的基本步驟三個(gè)過程1.切與接2.轉(zhuǎn)3.篩圖12-211191、重組DNA分子的構(gòu)建目的基因+DNA載體重組分子(外源性DNA片段)(質(zhì)粒/病毒)120
(二)引入宿主細(xì)胞
重組分子
宿主細(xì)胞
轉(zhuǎn)化/感染/轉(zhuǎn)染(三)篩選挑選含重組分子的細(xì)胞克隆(擴(kuò)增/表達(dá))121
二、重組DNA分子的構(gòu)建
1、目的基因或DNA片段基因組(genomiclibrary)文庫從mRNA合成cDNA(complementarylibrary)和cDNA文庫人工合成PCR擴(kuò)增DNA片段或cDNA1222、載體(vector)質(zhì)粒,噬菌體(線狀雙鏈DNA病毒),逆轉(zhuǎn)錄病毒存在細(xì)菌染色體外、散在分布小的雙鏈閉環(huán)DNA自我復(fù)制含有抗藥基因:抗氨芐青霉素基因、抗四環(huán)素基因
質(zhì)粒(plasmid):123抗氨芐青霉素基因抗四環(huán)素基因圖12-22124
理想質(zhì)粒的條件:⑴多個(gè)單切口的限制性內(nèi)切酶的位點(diǎn)⑵含抗藥性標(biāo)志接入外源性DNA后,抗藥性消失⑶含有高效的自主復(fù)制序列
1253、常用工具酶
限制性內(nèi)切酶(restrictionendonuclease)
DNA連接酶逆轉(zhuǎn)錄酶
S1核酸酶(切單鏈DNA/RNA)
堿性磷酸酶末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT)
126限制性內(nèi)切酶(restrictionenzyme
或restrictionendonuclease)限制性內(nèi)切酶是微生物的一種自我保護(hù)酶,它能識(shí)別雙鏈DNA分子中某一段特異堿基序列并切開。識(shí)別的DNA序列多數(shù)為4-6個(gè)堿基,也有8個(gè)堿基的。識(shí)別序列都具有回文結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)。
“分子手術(shù)刀”127“分子剪刀”的發(fā)現(xiàn)者128命名原則:EcoRⅠ
細(xì)菌屬名
種名
株系
編號(hào)
識(shí)別DNA序列的堿基數(shù):4—6個(gè)切除機(jī)率多
8個(gè)切除機(jī)率少分析大片段DNA識(shí)別序列:回文/雙重對(duì)稱結(jié)構(gòu)切口:粘性末端
平端末端129限制性內(nèi)切酶切口有兩種:
1.粘性末端(cohesiveend或stickyend)
2.平端末端(bluntend)
★平末端(bluntend)
在識(shí)別順序的對(duì)稱軸上,對(duì)雙鏈DNA同時(shí)切割。
HpaI
HpaI
5’GTTAAC3’5’GTT+AAC3’
3’CAATTG5’3’CAA
TTG5’
130★5’端粘性末端(cohesiveend)
在識(shí)別順序的雙側(cè)末端切割DNA雙鏈,于對(duì)稱軸的5’末端切割。
EcoRI
EcoRI
5’GAATTC3’5’G+pAATTC3’
3’CTTAAG5’3’CTTAAp
+G5’
131
★3’端粘性末端
在識(shí)別順序的雙側(cè)末端切割DNA雙鏈,于對(duì)稱軸的3’末端切割。
PstI
PstI
5’CTGCAG3’5’CTGCA+pG3’
3’GACGTC5’
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