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文檔簡(jiǎn)介
關(guān)于細(xì)菌的遺傳分析主要內(nèi)容細(xì)菌的細(xì)胞和基因組(自學(xué))大腸桿菌的突變型及篩選細(xì)菌的接合與染色體作圖中斷雜交與重組作圖F`因子與性導(dǎo)細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖第2頁,共74頁,2024年2月25日,星期天大腸桿菌的突變類型突變型篩選(自學(xué))第二節(jié)大腸桿菌的突變型及篩選第3頁,共74頁,2024年2月25日,星期天一、大腸桿菌的突變類型1、合成代謝功能的突變型——營(yíng)養(yǎng)缺陷型
合成代謝功能(anabolicfunction)
命名:Met-,Lys-原養(yǎng)型/野生型在基本培養(yǎng)基上,具有合成所有代謝和生長(zhǎng)所必須的復(fù)雜有機(jī)分子的功能。營(yíng)養(yǎng)缺陷型:一個(gè)必需的基因發(fā)生了突變不能進(jìn)行一個(gè)特定的生化反應(yīng),從而阻礙整個(gè)合成代謝功能的實(shí)現(xiàn)。第4頁,共74頁,2024年2月25日,星期天2、分解代謝功能的突變型(catabolicfunctionalmutants)
分解代謝功能(anabolicfunction)一系列降解功能的實(shí)現(xiàn)也需要許多基因的表達(dá),其中任何一個(gè)基因突變都會(huì)影響降解功能的實(shí)現(xiàn)。如Lac-突變型不能分解乳糖,因此就不能生長(zhǎng)在以乳糖為唯一碳源的基本培養(yǎng)基上。第5頁,共74頁,2024年2月25日,星期天3、抗性突變型:細(xì)菌由于某基因的突變而對(duì)某些噬菌體或抗菌素產(chǎn)生抗性。如:抗藥突變型:抗鏈霉素突變型:Strr,(野生型Strs)抗青霉素突變型:Penr,(野生型Pens
)抗phage突變型:抗T1-phage突變型:Tonr,(野生型Tons
)第6頁,共74頁,2024年2月25日,星期天細(xì)菌接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)F因子及其轉(zhuǎn)移細(xì)菌重組的特點(diǎn)第三節(jié)細(xì)菌的接合與染色體作圖第7頁,共74頁,2024年2月25日,星期天一、細(xì)菌接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)菌株A:met-
bio-
thr+
leu+
thi+菌株B:met+
bio+
thr-
leu-
thi-Met+
bio+
thr+
leu+
thi+第8頁,共74頁,2024年2月25日,星期天二、F因子及其轉(zhuǎn)移細(xì)菌主要是無性繁殖,直到1946年人們才注意到不同品系大腸桿菌間可以雜交,并進(jìn)行了基因重組,從而首次發(fā)現(xiàn)了大腸桿菌也有“性別”。1、細(xì)菌的性別第9頁,共74頁,2024年2月25日,星期天
2、F因子/性因子/致育因子
F因子:環(huán)狀DNA,含6×104個(gè)bp。大腸桿菌供體中含有,而受體無。由原點(diǎn)、致育基因、配對(duì)區(qū)三個(gè)部分組成。第10頁,共74頁,2024年2月25日,星期天環(huán)狀F因子的模式圖第11頁,共74頁,2024年2月25日,星期天組成F因子各部分的功能原點(diǎn):是轉(zhuǎn)移的起點(diǎn)。配對(duì)區(qū):此處與大腸桿菌DNA多處核苷酸序列相對(duì)應(yīng)(即同源序列),故可通過交換而使F因子整合到大腸桿菌DNA上。致育基因:其上一些基因編碼生成F菌毛的蛋白質(zhì),即供體菌細(xì)胞表面的管狀結(jié)構(gòu),F(xiàn)菌毛與受體菌細(xì)胞表面的受體相結(jié)合,在兩個(gè)細(xì)胞間形成細(xì)胞質(zhì)橋。第12頁,共74頁,2024年2月25日,星期天3、F+、F-與HfrF+:細(xì)胞質(zhì)中具有F因子的大腸桿菌(供體)F-:細(xì)胞質(zhì)中沒有F因子的大腸桿菌(受體)大腸桿菌性別F-F+第13頁,共74頁,2024年2月25日,星期天F+F-大腸桿菌性別大腸桿菌DNAF因子第14頁,共74頁,2024年2月25日,星期天F因子及其在雜交中的行為細(xì)胞質(zhì)橋(接合管)F+×F-F+F+第15頁,共74頁,2024年2月25日,星期天F因子轉(zhuǎn)移的頻率很高,但細(xì)菌DNA間的重組率很低,故稱F+為低頻重組品系(lowfrequencerecombination,Lfr)。F+×F-第16頁,共74頁,2024年2月25日,星期天Hfr(highfrequencerecombination)F因子整合入大腸桿菌染色體中第17頁,共74頁,2024年2月25日,星期天原點(diǎn)致育基因配對(duì)區(qū)大腸桿菌性別致育基因第18頁,共74頁,2024年2月25日,星期天原點(diǎn)配對(duì)區(qū)細(xì)菌染色體F-第19頁,共74頁,2024年2月25日,星期天細(xì)菌DNA間的重組率很高,故稱之為高頻重組品系(highfrequencerecombination,Hfr),重組率為10-2。F因子轉(zhuǎn)移的頻率很低。第20頁,共74頁,2024年2月25日,星期天F因子的環(huán)出第21頁,共74頁,2024年2月25日,星期天4、附加體象F因子既可獨(dú)立存在于染色體之外作為一個(gè)獨(dú)立的復(fù)制子,也可整合到大腸桿菌染色體中作為大腸桿菌復(fù)制子的一部分的遺傳物質(zhì)(遺傳因子),稱為附加體。第22頁,共74頁,2024年2月25日,星期天三、細(xì)菌重組的特點(diǎn)及機(jī)制細(xì)菌重組的特點(diǎn)細(xì)菌同源重組的分子基礎(chǔ)第23頁,共74頁,2024年2月25日,星期天(一)細(xì)菌重組的特點(diǎn)中斷雜交實(shí)驗(yàn)與重組作圖細(xì)菌重組不同于真核生物的完整二倍體的重組。第24頁,共74頁,2024年2月25日,星期天Hfr與F-接合常會(huì)形成部分二倍體部分二倍體:這種含有一個(gè)親體F-全部基因組和另一親體部分基因組的合子叫部分合子(半合子)/部分二倍體。細(xì)菌的重組就是指F-的DNA(內(nèi)基因子)與Hfr的部分DNA(外基因子)之間的重組。F-的DNAHfr的部分DNA第25頁,共74頁,2024年2月25日,星期天第26頁,共74頁,2024年2月25日,星期天內(nèi)、外基因子的交換情況單交換
部分二倍性線狀體雙交換
重組體+線性片斷偶數(shù)次交換結(jié)果:只產(chǎn)生一種重組體,而無另一相應(yīng)的重組體。第27頁,共74頁,2024年2月25日,星期天由此可見在細(xì)菌的重組中有下列兩個(gè)特點(diǎn):1、只有偶數(shù)次交換才能產(chǎn)生平衡的重組子;2、不出現(xiàn)相反的重組子,所以在選擇培養(yǎng)基上只出現(xiàn)一種重組子。第28頁,共74頁,2024年2月25日,星期天(二)細(xì)菌同源重組的分子基礎(chǔ)RecBCD識(shí)別chi序列引發(fā)重組RecA催化單鏈同化Ruv系統(tǒng)解離Holiday連接點(diǎn)第29頁,共74頁,2024年2月25日,星期天1、RecBCD識(shí)別chi序列引發(fā)重組保守的8堿基非對(duì)稱序列大腸桿菌DNA每5-10Kb自然出現(xiàn)一次被recBCD編碼的酶所識(shí)別刺激重組——重組熱點(diǎn)1)chi
位點(diǎn)第30頁,共74頁,2024年2月25日,星期天2)RecBCD酶的功能①能降解DNA的核酸酶(核酸外切酶Ⅴ)②解旋酶活性③ATP酶活性目標(biāo):提供一條含游離3’端的單鏈區(qū)域(RecA可以作用的底物)第31頁,共74頁,2024年2月25日,星期天RecBCD酶識(shí)別chi序列引發(fā)重組含游離3’端的單鏈第32頁,共74頁,2024年2月25日,星期天2、RecA催化單鏈同化①具有蛋白酶活性②在單鏈DNA和ATP存在的條件下啟動(dòng)DNA單鏈和與之互補(bǔ)的雙鏈分子進(jìn)行堿基配對(duì)。單鏈同化:RecA可使一條DNA單鏈置換一條雙鏈DNA分子中同源鏈的反應(yīng)。單鏈同化需要的條件:a.必須有一個(gè)單鏈DNA分子區(qū)域。b.必須有一個(gè)具游離3’端的DNA分子;c.該單鏈區(qū)域和3’端必須位于這兩個(gè)分子的互補(bǔ)區(qū)域中。第33頁,共74頁,2024年2月25日,星期天具有游離3’端的單鏈單鏈具有游離3’端第34頁,共74頁,2024年2月25日,星期天3、Ruv系統(tǒng)解離Holiday連接點(diǎn)RuvA:識(shí)別Holliday連接點(diǎn)的結(jié)構(gòu)RuvB:具ATP酶的活性,為分支遷移提供動(dòng)力。RuvC:具有核酸內(nèi)切酶活性,可特異識(shí)別Holliday連接點(diǎn)。第35頁,共74頁,2024年2月25日,星期天第36頁,共74頁,2024年2月25日,星期天一、中斷雜交實(shí)驗(yàn)原理二、中斷雜交作圖三、重組作圖(自學(xué))第四節(jié)中斷雜交與重組作圖第37頁,共74頁,2024年2月25日,星期天一、中斷雜交實(shí)驗(yàn)原理
Hfr細(xì)胞和F-細(xì)胞雜交,基因從Hfr細(xì)胞按次序轉(zhuǎn)入F-細(xì)胞,可根據(jù)基因進(jìn)入F-細(xì)胞的時(shí)間和次序制作基因圖譜。實(shí)驗(yàn)材料
Hfr:thr+leu+azistonslac+gal+strs
F-:thr-leu-azirtonrlac-gal-
strr
strr(F-可以在鏈霉素培養(yǎng)基上生長(zhǎng))strs(Hfr不能在鏈霉素培養(yǎng)基上生長(zhǎng))第38頁,共74頁,2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)方法-中斷雜交實(shí)驗(yàn)兩品系在液體培養(yǎng)基里,通氣混合培養(yǎng),定時(shí)取樣,猛烈攪拌以中斷雜交,釋稀菌液,在含Str的基本培養(yǎng)基上培養(yǎng)。第39頁,共74頁,2024年2月25日,星期天AABBCCDDDDCCB第40頁,共74頁,2024年2月25日,星期天二、中斷雜交作圖實(shí)驗(yàn)結(jié)果混合時(shí)間(min)結(jié)果8出現(xiàn)的菌落與F-相同,說明Hfr的基因未進(jìn)入F-9
出現(xiàn)少量的azis
菌落,說明azis
己從Hfr轉(zhuǎn)移到F-11
出現(xiàn)azistons
型的F-菌落18
出現(xiàn)azistonslac+型的F-菌落24
出現(xiàn)azistonslac+gal+型的F-菌落第41頁,共74頁,2024年2月25日,星期天隨時(shí)間推移,具有某一基因的菌落逐漸增加,達(dá)到一定頻率后就不再變動(dòng),而且愈早轉(zhuǎn)入的基因,所達(dá)到的頻率也愈高。第42頁,共74頁,2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)結(jié)果說明:Hfr的DNA從一端開始,以線性方式逐段進(jìn)入F-,這一端叫原點(diǎn)或O點(diǎn)。O點(diǎn)
azis
tons
lac+
gal+
第43頁,共74頁,2024年2月25日,星期天時(shí)間單位法以轉(zhuǎn)移時(shí)間單位(每分鐘)作為基因間距單位,可作出Hfr的“染色體”上的基因分布圖(基因連鎖圖)。第44頁,共74頁,2024年2月25日,星期天E.coli的連鎖群E.coliK12的基因組環(huán)形圖為100min第45頁,共74頁,2024年2月25日,星期天假如讓Hfr×F-雜交持續(xù)2h后中斷雜交,發(fā)現(xiàn)一些F-
F+。這說明Hfr的全部基因轉(zhuǎn)移到F-內(nèi),排列到最后的F因子才進(jìn)入F-,使F-
F+。中斷雜交實(shí)驗(yàn)與重組作圖第46頁,共74頁,2024年2月25日,星期天原點(diǎn)致育基因配對(duì)區(qū)致育基因F因子在細(xì)菌染色體上有很多插入位點(diǎn),并且插入的取向不同一個(gè)F+品系可以產(chǎn)生很多Hfr品系第47頁,共74頁,2024年2月25日,星期天第48頁,共74頁,2024年2月25日,星期天幾個(gè)Hfr菌株的線性連鎖群的產(chǎn)生HfrH菌株的基因轉(zhuǎn)移順序thrprolacpurgalhisglythiHfr1菌株的基因轉(zhuǎn)移順序thrthiglyhisgalpurlacpro第49頁,共74頁,2024年2月25日,星期天F′因子的形成細(xì)菌染色體第五節(jié)F′因子與性導(dǎo)第50頁,共74頁,2024年2月25日,星期天一、F′因子與F′菌株帶有部分細(xì)菌染色體的F因子稱F′因子。特點(diǎn):能獨(dú)立復(fù)制
F′菌株:指帶有F′因子的細(xì)菌。第51頁,共74頁,2024年2月25日,星期天二、性導(dǎo)(sexduction或F′
-duction)通過F′因子將供體細(xì)胞的基因?qū)胧荏w形成部分二倍體的過程叫性導(dǎo)。第52頁,共74頁,2024年2月25日,星期天性導(dǎo)F′因子F-部分二倍體F′菌株Hfr菌株F′菌株第53頁,共74頁,2024年2月25日,星期天aa第54頁,共74頁,2024年2月25日,星期天細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與作圖細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖第六節(jié)細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖第55頁,共74頁,2024年2月25日,星期天一、細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與作圖轉(zhuǎn)化作用:從細(xì)菌的培養(yǎng)物提取的DNA可以在體外轉(zhuǎn)移到受體細(xì)菌中的過程。發(fā)生轉(zhuǎn)化的頻率很低:大約為1%的受體細(xì)菌可吸收外源DNA并發(fā)生轉(zhuǎn)化。第56頁,共74頁,2024年2月25日,星期天原因:受體細(xì)菌的受體部位的數(shù)目是有限的。外源DNA片段只是在受體部位通過。外源DNA的進(jìn)入,除受體部位外,還必須有酶或蛋白質(zhì)分子,以及能量等的協(xié)同作用。外源DNA只有在酶促旺盛的受體部位進(jìn)入。第57頁,共74頁,2024年2月25日,星期天感受態(tài)細(xì)胞與感受態(tài)因子感受態(tài)細(xì)胞:這種能接受外源DNA分子并被轉(zhuǎn)化的細(xì)菌細(xì)胞。感受態(tài)因子:促進(jìn)轉(zhuǎn)化作用的酶或蛋白質(zhì)的分子。第58頁,共74頁,2024年2月25日,星期天感受態(tài)細(xì)胞單鏈通過交換進(jìn)行整合第59頁,共74頁,2024年2月25日,星期天座位轉(zhuǎn)化體類別trp2+---+++his2++-+--+tyr1+++--+-11940366068541826001071180親本型(++)重組型(+-)和(-+)重組值(重組體數(shù)/總數(shù))Trp2-his2Trp2-tyr1His2-tyr1供體trp2+his2+tyr1+
DNA向受體trp2-his2-tyr1-
轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)中轉(zhuǎn)化體的類別及重組值的計(jì)算11940+11802600+107+3660+41811940+1072600+1180+3660+68511940+3660418+1180+685+107第60頁,共74頁,2024年2月25日,星期天轉(zhuǎn)化基因間重組值的計(jì)算
轉(zhuǎn)化子數(shù)(重組體數(shù))親組合數(shù)+轉(zhuǎn)化子數(shù)
trp2—his2的重組值=34%trp2—tyr1的重組值=40%his2—tyr1的重組值=13%根據(jù)重組值作圖:trp234cM
his2
13cMtyr1重組值=
=
(+-)+(-+)(++)+(+-)+(-+)
第61頁,共74頁,2024年2月25日,星期天二、細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖特異性轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖(后學(xué))轉(zhuǎn)導(dǎo)作用:以噬菌體為媒介,將細(xì)菌的小片段DNA或基因,從一個(gè)細(xì)菌轉(zhuǎn)移到另一細(xì)菌的過程叫轉(zhuǎn)導(dǎo)作用。第62頁,共74頁,2024年2月25日,星期天(一)普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖J.Lederberg和N.Zinder做了這樣一個(gè)雜交試驗(yàn):鼠沙門氏菌的2個(gè)突變菌株:
LA22:phe-trp-met+his+LA2:phe+trp+met-his-LA22+LA2混合培養(yǎng)得野生型(10-5)第63頁,共74頁,2024年2月25日,星期天U型管實(shí)驗(yàn)只允許DNA等大分子及病毒通過,細(xì)菌細(xì)胞不能通過。Hfr第64頁,共74頁,2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)結(jié)果:右臂得到了野生型細(xì)胞第65頁,共74頁,2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)結(jié)果的解釋p22的釋放:LA22是帶有P22原phage的細(xì)菌;在培養(yǎng)過程中,少數(shù)LA22細(xì)菌自溶釋放出游離的p22。p22的侵染:
這種游離的p22通過濾孔進(jìn)入左臂而感染了LA2細(xì)菌。轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體的形成:在裂解LA2過程中,宿主LA2環(huán)狀染色體被裂解成小片段,某些片段在P22phage組裝時(shí)偶爾被裝入頭部,形成轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體。這種轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體就將LA2的基因轉(zhuǎn)入LA22。形成部分二倍體,經(jīng)重組后形成野生型菌落。第66頁,共74頁,2024年2月25日,星期天LA2LA22轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體第67頁,共74頁,2024年2月25日,星期天普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的概念象P22、P1這類phage可以轉(zhuǎn)移細(xì)菌DNA很多不同部分,這種轉(zhuǎn)導(dǎo)作用稱為普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)。普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率較低,約為10-5,兩個(gè)基因同時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率則更低,僅有10-510-5=10-10。如果兩個(gè)基因同時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率較高則說明是連鎖的。共轉(zhuǎn)導(dǎo)/并發(fā)轉(zhuǎn)導(dǎo):兩個(gè)基因同時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)的現(xiàn)象。第68頁,共74頁,2024年2月25日,星期天確定3個(gè)基因的順序如果兩個(gè)基因共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率較高,那么說明這兩基因連鎖,而且頻率越高,則兩基因距離越近;反之則越遠(yuǎn)。雙因子轉(zhuǎn)導(dǎo)三因子轉(zhuǎn)導(dǎo)轉(zhuǎn)化與轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖第69頁,共74頁,2024年2月25日,星期天雙因子轉(zhuǎn)導(dǎo)
每次觀察2個(gè)基因的轉(zhuǎn)導(dǎo),通過確定每2個(gè)基因之間的共轉(zhuǎn)導(dǎo)率可確定它們?cè)谌旧w上的次序。(3次)如:a基因和b基因共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率高,a和c共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率也高,b和c共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率低,則3個(gè)基因順序?yàn)閎ac第70
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