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文檔簡介
第十三章
園藝植物生物技術(shù)與生物信息學(xué)第1頁第1頁產(chǎn)生背景人類基因組計劃帶來了海量核酸和蛋白質(zhì)序列,為了搜集、存儲這些序列,從這些序列中獲取有用生物學(xué)信息,摸索其蘊藏生命意義,生物信息學(xué)(bioinformatics)應(yīng)運而生科技界一顆耀眼新星將給生命科學(xué)帶來變革性改變第2頁第2頁第一節(jié)生物信息學(xué)基本知識生物信息學(xué)是由生命科學(xué)、計算機科學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)和化學(xué)等學(xué)科互相滲入而形成一門新型交叉學(xué)科,也是一門碩士物學(xué)系統(tǒng)和生物學(xué)過程中信息流綜合系統(tǒng)科學(xué),通過其獨特橋梁作用和整合作用,人們能夠從各生物學(xué)科眾多分散觀測資料中取得對生物學(xué)系統(tǒng)和生物學(xué)過程運作機制理解,最后達到應(yīng)用于實踐目的。第3頁第3頁一、生物信息學(xué)研究任務(wù)與內(nèi)容科學(xué)基礎(chǔ):①發(fā)達、復(fù)雜、可互相交流數(shù)據(jù)庫系統(tǒng);②強有力創(chuàng)新算法和軟件;③自動化大規(guī)模高通量生物學(xué)研究辦法和平臺技術(shù)本質(zhì):利用計算機科學(xué)和網(wǎng)絡(luò)技術(shù)來處理生物學(xué)問題第4頁第4頁研究內(nèi)容:①生物信息搜集、存儲和管理②基因組序列信息提取和分析開發(fā)快速功效強大信息檢索工具及搜索后信息自動化處理技術(shù)③功效基因組相關(guān)信息分析,強調(diào)用發(fā)展和整合試驗辦法分析基因組序列信息來闡明基因功效④生物大分子結(jié)構(gòu)模擬⑤生物信息分析技術(shù)和辦法研究,發(fā)展有效能支持大尺度作圖與測序需要軟件,數(shù)據(jù)庫以及數(shù)據(jù)庫分析工具,創(chuàng)建適合用于基因組信息分析新技術(shù)、新辦法等第5頁第5頁二、生物信息學(xué)慣用數(shù)據(jù)庫基本數(shù)據(jù)庫:包括原始數(shù)據(jù),如,DNA序列、蛋白質(zhì)序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)等二級數(shù)據(jù)庫:對基本數(shù)據(jù)庫進行分析、提煉加工后形成,以便于用戶直接使用第6頁第6頁(一)DNA數(shù)據(jù)庫
最主要、最初級數(shù)據(jù)庫主要有3大數(shù)據(jù)庫:三大數(shù)
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