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分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第1頁(yè)Wheredoesthemutationcomefrom?DNAreplicationChemicaldamagetothegenematerialInsertionscausedbyDNAelementsLifeandbiodiversitydependonahappybalancebetweenmutationanditsrepair.分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第2頁(yè)
突變體(mutant):攜帶突變生物個(gè)體或群體或株系
突變基因(mutantgene):存在突變位點(diǎn)基因野生型基因(wildtypegene):表示方法表現(xiàn)型Arg+Arg-
基因型arg+arg-
野生型正性狀分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第3頁(yè)
●Chromosomemutation
chromosomenumber
chromosomestructure
●核苷酸突變(pointmutation)
突變(mutation):能夠經(jīng)過(guò)復(fù)制而遺傳DNA結(jié)構(gòu)任何永久性改變分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第4頁(yè)P(yáng)ointmutation---堿基替換、堿基插入、堿基缺失轉(zhuǎn)換(transition)PyPy
Pu
Pu
顛換(transvertion)
Py
Pu
PointmutationsT-CandA-GT-G/AandA–C/T分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第5頁(yè)Replicationerrorsandtheirrepair分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第6頁(yè)DNAmismatch+-----A------------C---DNApol(ξ=10-8)經(jīng)第二次校正ξ=10-11錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)(MRSMismatchRepairSystem)1).source:校正活性所漏校堿基
thefidelityofthereplicationcanimprove102~103times1.Mismatchrepairremoveserrorsthatescapeproofreading分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第7頁(yè)DNApolymeraseHelicaseSSB外切核酸酶(Ⅰ和Ⅶ)ligaseMCE(mismatchcorrectenzyme)3subunitsmutH,L,SdamgeneDNA腺嘌呤甲基化酶(m6A甲基化酶)掃描新生鏈中錯(cuò)配堿基識(shí)別新生鏈中非m6AGATC序列酶切含錯(cuò)配堿基新生DNA區(qū)段
2).Components分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第8頁(yè)Mismatchrepairpathwayfortherepairofreplicationerrors分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第9頁(yè)★thetransienthemimethylationintheDNAreplicationDammethylasemethylatesAresiduesonbothstrandsofthesequenceGATC(palindromicseq.)平均每2kb左右有一GATCseq.分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第10頁(yè)a、DNA/MutS
complexrecruitsMutLDNAhelicaseII,SSB,exonucleaseI去除包含錯(cuò)配堿基片段DNApolymeraseIII和
DNAligasefillthegap昂貴代價(jià)用于確保DNA準(zhǔn)確性3).
TheprocessofrepairMutLactivatesMutH,whichcausesanickonthestrandnearthesiteofthemismatch
分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第11頁(yè)外切核酸酶Ⅰ切割切點(diǎn)5’端(錯(cuò)配堿基在切點(diǎn)5’端)
----------------Ⅶ----------------3’端(--------------------------3’端)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第12頁(yè)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第13頁(yè)HowtorepairDNAdamage?Wheredoesthedamagecomefrom?mutagen分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第14頁(yè)1.Alkylation(烷化劑)亞硝酸(nitrousacidHNO2)羥氨(hydroxylamineHA)甲磺酸乙酯(ethylmethanesulfonateEMS)
N-甲基-N’-硝基-N-亞硝基胍(N-methyl-N’-nitro-N-nitrosoguanidionNNG)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第15頁(yè)NH2OH(Hydroxylamine
HA羥胺)C(i)A(a)HNHHOC(a)HAHNHHHOHNHHOHNHHOHNHHONH能使胞嘧啶(C)先變成羥氨基胞嘧啶,再經(jīng)互變異構(gòu)反應(yīng)變成能與腺嘌呤配正確羥氨基胞嘧啶分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第16頁(yè)2.RadiationUltravioletlight,γradiation,x-ray
---嘧啶二聚體(TTdimer)∧U.V.…CTTA…分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第17頁(yè)
脫氨氧化
U.V.CUA(a)U.V.U.V.H2OH++OH-C(a)
C(i)A(a)
脫嘌呤造成突變:堿基替換、缺失、重復(fù)、移框分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第18頁(yè)3、BaseanalogAbaseanalogisachemicalthatcansubstituteforanormalnucleobaseinnucleicacids.分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第19頁(yè)5-溴尿嘧啶5-BromineUracil分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第20頁(yè)5-BrU:G:A
烯醇式enolBrOHHOBr
酮式KetoHOAGCTTCCTATCGAAGGATAGCTBCCTATCGAAGGAT酮式5-BrU滲透AGCTBCCTATCGAAGGATAGCTCCCTATCGAGGGAT第二輪復(fù)制A·T
G·C
轉(zhuǎn)變AGCTBCCTATCGAGGGATAGCTTCCTATCGAAGGAT第一輪復(fù)制酮式到稀醇式轉(zhuǎn)變烯醇式滲透為G·C
A·T
轉(zhuǎn)變分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第21頁(yè)吖啶橙(AcridineOrangeAO)扁平染料分子溴化乙錠(EthidiumBromideEB)-ATTTTTCG--TAAAAAGC--ATTTCG--TAAAGC-TAOT-ATEBTTTTCG--TA分子插入AOEB-ATTTCG--TAAAGC--ATX’TTTTCG--TAXAAAAGC-XAAAAGC-結(jié)果產(chǎn)生---移框突變分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第22頁(yè)ThesystemsrepairingdamagetoDNAExcisionrepairsystemsRecombinantionalrepair分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第23頁(yè)1.DirectrepairofDNA是經(jīng)過(guò)一個(gè)可連續(xù)掃描DNA,識(shí)別出損傷部位蛋白質(zhì),將損傷部位直接修復(fù)方法。該修復(fù)方法不用切斷DNA或切除堿基。比如:在全部原核和真核生物中都存在一個(gè)光激活酶。在可見(jiàn)光下,這種酶能夠結(jié)合在胸腺嘧啶二聚體引發(fā)扭曲雙螺旋部位,催化兩個(gè)胸腺嘧啶堿基再生,正常A-T堿基對(duì)重新形成。分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第24頁(yè)photoreactivation分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第25頁(yè)2.MethylgroupremovalThemethyltransferaseisnotcatalytic;havingonceacceptedamethylgroup,itcannotbeusedagain.分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第26頁(yè)甲基轉(zhuǎn)移酶Cys-SHCys-S-CH3分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第27頁(yè)3.核苷酸切除修復(fù)UvrABC核酸切割酶原核生物
12-13個(gè)核苷酸真核生物
27-29個(gè)核苷酸
UvrD(DNAhelicase)DNApolΙLigase(NucleotideExcisionRepairNER)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第28頁(yè)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第29頁(yè)★Rec-A.gene
以某種方式參加DNA損傷修復(fù)?Rec修復(fù)系統(tǒng)比切除修復(fù)系統(tǒng)更有效
當(dāng)前知道
?Uvr系統(tǒng)負(fù)責(zé)切除二聚體?Rec系統(tǒng)負(fù)責(zé)消除沒(méi)有被切除二聚體可能造成后果4.Recombinative—Repair復(fù)制后修復(fù)、E.coli挽回系統(tǒng)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第30頁(yè)TTTTAAAATTTTTTTTAAAATTTT變性
E.coli(Rec-A,uvr-a-)D.S.DNAS.S.DNAU.V.復(fù)制提取變性復(fù)制過(guò)程越過(guò)二聚體而在對(duì)應(yīng)新鏈上留下缺口★二聚體后起始★修復(fù)時(shí)期證實(shí)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第31頁(yè)●與Rec-A蛋白引發(fā)重組(strandtransfer)相關(guān)●TTdimer未被修復(fù),僅表現(xiàn)在后代群體中TTdimer
濃度稀釋●鏈非準(zhǔn)確轉(zhuǎn)移,造成突變機(jī)率增加修復(fù)相關(guān)機(jī)制:分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第32頁(yè)
重組修復(fù)
(鏈轉(zhuǎn)移修復(fù))
復(fù)制后修復(fù)輕易犯錯(cuò)RecA,DNApolymeraeligase二聚體后起始RecA
聚合酶、連接酶重組修復(fù)后損傷位點(diǎn)可由其它機(jī)制深入修復(fù)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第33頁(yè)RecA蛋白首先與單鏈DNA結(jié)合(需消耗ATP)。于是RecA蛋白即被活化而可將雙螺旋解旋和分離,同時(shí)企圖將它結(jié)合單鏈與被解旋區(qū)域退火,如此繼續(xù)下去,直到找到互補(bǔ)次序。只要一旦有一小部份被真正“退火”,ATP供給能量就會(huì)繼續(xù)驅(qū)使配對(duì)反應(yīng)趨于完成。當(dāng)新雜交雙鏈形成時(shí),RecA蛋白即從原來(lái)單鏈掉下來(lái)。分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第34頁(yè)Repairdouble-strandbreakNonhomologousendjoining:isabackupsysteminyeast,butinhighercellsitistheprinciplepathwaybywhichbreaksarerepaired分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第35頁(yè)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第36頁(yè)分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第37頁(yè)5.SOS
respones(SOS修復(fù))TheSOSresponseisaglobalresponsetoDNAdamageinwhichthecellcycleisarrestedandDNArepairandmutagenesisareinduced.TheSOSusestheRecAprotein(Rad51ineukaryotes).TheRecAprotein,stimulatedbysingle-strandedDNA,isinvolvedintheinactivationoftheLexArepressortherebyinducingtheresponse.Itisanerror-pronerepairsystem.分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第38頁(yè)FunctionofRecAproteina、DNA重組活性b、與S.S.DNA結(jié)合活性c、少數(shù)蛋白proteinase活性分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第39頁(yè)mechanismofSOSresponseSOS修復(fù)--無(wú)模板指導(dǎo)DNA復(fù)制
大劑量紫外線(xiàn)照射,大量二聚體產(chǎn)生SOS系統(tǒng)誘導(dǎo),錯(cuò)誤潛伏復(fù)制超越二聚體而進(jìn)行錯(cuò)誤堿基分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第40頁(yè)SOS修復(fù)只是SOS反應(yīng)一個(gè)別RecA在SOS反應(yīng)反應(yīng)中起關(guān)鍵作用RecA與LexA組成調(diào)控環(huán)路DNA損傷
SOSRecA受LexA個(gè)別抑制分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第41頁(yè)當(dāng)DNA復(fù)制受阻/DNAdamaged細(xì)胞內(nèi)原少許表示RecA-p與S.S,DNA結(jié)合激活RecA-pproteinase活性修復(fù)損傷LexA-p降解RecA-p高效表示SOSopen當(dāng)DNA正常復(fù)制時(shí)(無(wú)復(fù)制受阻,無(wú)DNA損傷,無(wú)TTdimer)RecA-p不表現(xiàn)proteinase活性分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第42頁(yè)當(dāng)DNA復(fù)制度過(guò)難關(guān)后SOSrepair是一個(gè)錯(cuò)誤傾向性極強(qiáng)修復(fù)機(jī)制是進(jìn)化中形成“竭盡全力,治病救人”辦法(正常狀態(tài)下,SOS是關(guān)閉)RecA-p很快消失LexAgeneonSOSoff分子生物學(xué)dna的變性和修復(fù)第43
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