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1蝦肝腸胞蟲核酸檢測技術(shù)規(guī)范4縮略語BstDNA聚合酶:嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶(BacCt值:反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)(DNA:脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacidNTP:脫氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribLAMP:環(huán)介導等溫擴增(Loop-mediatedisothPCR:聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainreactiSYBRGreenIqPCRMix:含雙鏈嵌合熒光染色劑的熒光定量2):5.10This平衡酚(飽和酚)、1):):5.18瓊脂糖:電泳級。5.27BstDNA聚合酶,8U/μL。36.5水平電泳槽:50mL~500mL,帶有凝膠7.1.1.2對蝦受精卵、幼體、仔蝦及體長3cm以下稚蝦蟲、豐年蟲等餌料生物樣品取完整個體,冷藏運輸進行核酸抽提?;蛑糜跍缇蓸尤萜鲀?nèi),加入待檢將采集樣品用研磨棒研磨均勻,取10mg~100mg組織勻漿液,置于滅菌1.5mL的離心管中,用于48.3冷卻至室溫,加入等體積平衡酚,顛倒混合10min,于10000r/min離心3min,取上層水相至新),9.1通用要求樣品的PCR擴增應(yīng)在PCR反應(yīng)區(qū)獨立完成,避免造成區(qū)域間污按商品化預混液說明書配制反應(yīng)體系)。同時設(shè)陽性對照、陰性對照及空白對照。短59.2.3瓊脂糖凝膠電泳加樣孔朝負極,加入1×TAE電泳緩沖液至沒過膠面勻后加入加樣孔,同時設(shè)立DNA分子量標準對照。5V/cm電泳30min,當溴酚藍2/3處時停止電泳,凝膠成像儀觀察并判斷結(jié)果。若條帶未區(qū)分開,可適當增加電泳9.2.4結(jié)果判定9.2.4.3待測樣品第一輪PCR在514bp處9.2.4.4結(jié)果判定可疑時,應(yīng)用其他檢測方法進行確認。9.3.1反應(yīng)體系在熒光PCR管中加入2×SYBRGre陰性對照及空白對照。短暫離心后將PCR管置于9.3.2反應(yīng)條件9.3.3結(jié)果判定9.4.1反應(yīng)體系在熒光PCR管中加入10×ThermoPol緩沖液2.5μL、外最后加滅菌雙蒸水至25μL體積(或者按商品化預混液說明書配制反應(yīng)體系)。同時設(shè)陽性對照、陰性對照及空白對照。短暫離心后將PCR管置于恒溫熒光PCR儀中或熒光定量PCR儀中選擇SYBR通9.4.2反應(yīng)條件9.4.3結(jié)果判定69.4.3.4結(jié)果判定可疑時,應(yīng)用其他檢測方法進行確認。7A.1EHP套式PCR引物序列及其在靶基因中的位置GCTGTTTGTCTCCAACTGTA.1.2套式PCR引物在靶基因中A.2EHP熒光定量PCR引物序列及其在靶基因中的位置8ACAAAGTTACCAGAAGGTTATGA.2.2熒光定量PCR引物在靶基因中的位置A.3EHPLAMP引物序列及其在靶基因中的位置A.3.1LAMP引物序列TAGAAGATGCAAAGAGATATTACTTAAACCCTTAACAACACTCTAAGTTACCAGAAGGTTATGATTGGCGGCACAATTCTCAATGTCTGTGTAAATATCGTCTTGGCGGCACAATTCTCAATGTCTGTGTAAATATCGTCAACATTTAGTTCGTCACGCATTCAAACACTGTAAACCTTA.3.2LAMP引物在靶基因中的
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