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3食品中致病菌快速檢測方法熒光PCR法綠假單胞菌的熒光PCR定性檢測方法,包括方法的原理、試劑cholerae)、銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa)的熒光PCR快速定性檢測。GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格3.1熒光PCR法(Fluorescence43.24縮略語DNA:脫氧核糖核酸(DeoxyriboNucleicAcid)PCR:聚合酶鏈反應(yīng)(PolymeraseChainReactdNTP:脫氧核苷三磷酸(Deoxy-ribonucledATP:脫氧腺苷三磷酸(DeoxyadenosineTriphdGTP:脫氧鳥苷三磷酸(DeoxyadenosinetriphodCTP:去氧胞苷二磷酸(DeoxycytidinediphosdTTP:脫氧胸苷三磷酸(DeoxythdUTP:脫氧尿苷三磷酸(DeoxyuridinetriphoTris:三(羥甲基)氨基甲烷(Tris(hydroxymetTaq酶:Taq聚合酶(TaqpolymeUNG酶:尿嘧啶-N-糖基化酶(Uracil-N-Glycosylase)方法。選取目標(biāo)菌屬的特異性基因序列設(shè)計引物和具關(guān)系,當(dāng)熒光信號強度達到或超過設(shè)定閾值時,確定CT值,表示該DNA模板有特異性基因序列,以此可判定樣品中目標(biāo)菌的檢出與否。除非另有規(guī)定,所用試劑均采用分析純。檢測用水符合GB/T66826.5小腸結(jié)腸耶爾森氏菌檢測試6.8單核細(xì)胞增生李斯特氏菌檢測試劑盒(凍干型PCR-熒光探針法)6.9腸出血性大腸埃希氏菌O157:H7檢測試劑盒(凍干型PCR-熒光探針法)6.27Tris-EDTA緩沖液:Tris-HCl(10-50mM(pH8.0))6.30引物和探針:針對目標(biāo)基因序列6.31Taq酶:耐高溫的TaqDNA聚合6.32dNTPs:脫氧核苷三磷酸混合6.33陽性對照:已知含有目標(biāo)基因序列的6.34陰性對照:不含目標(biāo)基因注:細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒組成參照附錄A;凍干型PCR-熒光探針法試劑盒組成7.1冰箱:2℃~8℃、-20℃7.3恒溫培養(yǎng)箱/恒溫水浴鍋:41.5℃±1℃7.5微需氧培養(yǎng)裝置:提供微需氧條件(5%氧氣、10%二氧化碳和85%氮氣)7.9無菌培養(yǎng)皿:直徑90mm679樣品前處理9.2DNA模板提取R9.3熒光PCR反應(yīng)體系制備添加量(μL)MgCl28UNG酶//111230s(熒光采集FAM通道10.2對照設(shè)置911.2結(jié)果判定樣品CT值≤35,且有典型的擴增曲線,則判定結(jié)果樣品35<CT值<40,應(yīng)重做樣品再次驗證,若CT值仍11.3陽性結(jié)果驗證及報告確定初步檢驗結(jié)果為陽性的,對樣品的增菌液或可疑菌落進一步按照國標(biāo)方法或行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)方法操1)混合增菌液:取100ul菌液至裂解液L管中,蓋蓋,搖勻(生物安全柜或超凈工作臺中操作心1min,棄去收集管中的濾液,裝回吸附柱;5)洗脫:加入50μL的洗脫液至吸附柱膜中央,靜置3min后12000rpm離心1min,棄去吸附柱,將反應(yīng)管放入儀器中,設(shè)置樣品、參數(shù)及熒光采集通道:FAM-沙門氏菌,反應(yīng)體系設(shè)置為15μL,注:以“康澤睿檢”PCR檢測試劑盒系列品牌為例;其他熒光PCR檢測試劑盒參照附錄B內(nèi)容。F:GCGGCGTTGGAGAGTGAR:AGCAATGGAAAAAGCAGGATGP:FAM-CATTTCTTAAACGGCGGTGTCTTTCCCT-BHQ1F:CGCAATACCTCCGGATTR:TCCGCAGAGGCACTGAGP:FAM-AACAGGTCGCTGCATGGCTGGAA-BHQ1(Vibrioparahaemolyticus)F:GCGACCTTTCTCTGAAATATTAATTGTR:CATTCGCGTGGCAAACAP:FAM-CGCACAAGGCTCGACGGCTGA-BHF:AAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAR:TTCTGCGAGTAACGTCAATCAP:FAM-ATTAACCTTTATGCCTTCCTCCTCGCTG-BHQ1(Campylobacterjejuni)F:TTGGTATGGCTATAGGAACTCTTATAGCTR:CACACCTGAAGTATGAAGTGGTCTAAGTP:FAM-ATGGCATATCCTAATTTA-MGBF:TTCTTCACGACTAAATAAACGCTCAR:GGTACTACTAAAGATTATCAAGACGGP:FAM-CAGAACACAATGTTTCCGATGCAACGT-BHQ1F:CTGAATCTCAAGCAAAACCTGR:CGCGACCGAAGCCAACP:FAM-ATACGATAACATCCACGGCTCTGGCTGG-BHF:TCCTCAGCTATAGGGTGCTTTTR:ATCGAAACAAGGCCAGTTTTTP:FAM-TATTTTTCCGAGTACATTGGCATCGTGTGG-BHQ1F:TGTTTATGGTGAGAACGGTGAR:TTCTTTATCTAGGCCCCAAAP:FAM-CCGTTAACCGAACCACCCGCAA-BHQ1F:GCTTTATTGTTCGATGCGTTA

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