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酶的催化作用機(jī)制第1頁(yè),共19頁(yè)。1.酶促反應(yīng)(Enzymecatalysis)又稱酶催化或酵素催化作用,指的是由酶作為催化劑進(jìn)行催化的化學(xué)反應(yīng)。酶促反應(yīng)與非酶促反應(yīng)比較非酶促反應(yīng):S?S≠→P酶促反應(yīng):E+S?ES?ES≠→EP→E+P第2頁(yè),共19頁(yè)。反應(yīng)方向,即化學(xué)平衡方向,主要取決于反應(yīng)自由能變化ΔG。而反應(yīng)速率快慢,則取決于反應(yīng)活化能Ea第3頁(yè),共19頁(yè)。反應(yīng)酶Ea/(KJ·mol-1)H2O2分解反應(yīng)無75.3H2O2分解反應(yīng)肝過氧化氫酶23.01脲的水解無99.6脲的水解脲酶49.8酶催化作用的本質(zhì)是酶的活性中心與底物分子通過短程非共價(jià)力(如氫鍵,離子鍵和疏水鍵等)的作用,形成ES反應(yīng)中間物,其結(jié)果使底物的價(jià)鍵狀態(tài)發(fā)生形變或極化,起到激活底物分子和降低過渡態(tài)活化能作用第4頁(yè),共19頁(yè)。2.酶催化反應(yīng)機(jī)制類型(1)酸堿催化(2)共價(jià)催化(3)金屬離子催化作用第5頁(yè),共19頁(yè)。(1)酸堿催化酸堿催化可分為狹義的酸堿催化和廣義的酸堿催化。酶參與的酸堿催化反應(yīng)一般都是廣義的酸堿催化方式。廣義酸堿催化(general-basecatalysis)是指通過Bronsted酸(質(zhì)子酸)提供部分質(zhì)子,或通過Bronsted堿(質(zhì)子堿)接受部分質(zhì)子的作用,達(dá)到降低反應(yīng)活化能的過程。這種機(jī)制參與絕大多數(shù)酶的催化。蛋白質(zhì)分子上的某些側(cè)鏈基團(tuán)(如Asp、Glu和His)可以提供質(zhì)子并將質(zhì)子轉(zhuǎn)移到反應(yīng)的過渡態(tài)中間物而達(dá)到穩(wěn)定過渡態(tài)的效果。第6頁(yè),共19頁(yè)。影響酸堿催化的反應(yīng)速率的因素有兩個(gè):1、酸或堿的強(qiáng)度;2、質(zhì)子傳遞速率。第7頁(yè),共19頁(yè)。pH和緩沖溶液濃度對(duì)特定酸堿催化和廣義酸堿催化的影響第8頁(yè),共19頁(yè)。廣義的酸催化廣義的堿催化第9頁(yè),共19頁(yè)。酮式--烯醇式互變異構(gòu)反應(yīng),在無催化劑的條件下,由于其過渡態(tài)活化能比較高,異構(gòu)化速率很慢,當(dāng)存在廣義酸(堿)情況下,過渡態(tài)活化能明顯降低,異構(gòu)化速率加快。第10頁(yè),共19頁(yè)。氨基酸殘基廣義酸基團(tuán)(質(zhì)子供體)廣義堿基團(tuán)(質(zhì)子受體)Glu,AspR—COOHR—COO-Lys,ArgR—NH3R—NH2CysR—SHR—S-HisTyr第11頁(yè),共19頁(yè)。酶蛋白中His殘基咪唑基的pKa約為6-7,說明咪唑基上解離下來的質(zhì)子濃度與水中H+也就是說咪唑基既可以作為質(zhì)子供體,又可以作為質(zhì)子的受體在酶促反應(yīng)中發(fā)揮作用。咪唑基供給質(zhì)子和接受質(zhì)子的速率非??欤┙o和接受質(zhì)子速率幾乎相等His是酶的酸堿催化作用中最活潑的一個(gè)催化功能性氨基酸第12頁(yè),共19頁(yè)。咪唑基作為廣義酸催化酯水解機(jī)制第13頁(yè),共19頁(yè)。咪唑基作為廣義堿催化酯水解機(jī)制第14頁(yè),共19頁(yè)。催化反應(yīng)機(jī)制的實(shí)例(一)溶菌酶
1.溶菌酶的作用是水解多糖鏈,細(xì)菌細(xì)胞壁上的多糖鏈可被溶菌酶水解而破壞。溶菌酶廣泛存在于微生物及各種動(dòng)植物組織及分泌液中。2.作用:使細(xì)胞壁不溶性黏多糖分解成可溶性糖肽,導(dǎo)致細(xì)胞壁破裂內(nèi)容物逸出而使細(xì)菌溶解。溶菌酶還可與帶負(fù)電荷的病毒蛋白直接結(jié)合,與DNA、RNA、脫輔基蛋白形成復(fù)鹽,使病毒失活。因此,該酶具有抗菌、消炎、抗病毒等作用。一些人體細(xì)胞分泌液中含有溶菌酶在,如唾液、眼淚、鼻涕;溶菌酶也存在于粒線體中的細(xì)胞質(zhì)顆粒體和蛋清中。3.酶的催化活性
底物:N-乙酰氨基葡糖N-乙酰氨基葡糖乳酸的共聚物或幾丁質(zhì)催化機(jī)理:底物長(zhǎng)度要求六個(gè)糖殘基以上,與酶活性部位相適應(yīng);酶活性中心的Glu和Asp參與水解作用,將第四和第五殘基間的糖苷鍵水解,水分子羥基結(jié)合C1,具體機(jī)理為:①底物進(jìn)入活性中心,酶活性中心空間效應(yīng)和Asp的作用下,誘導(dǎo)并使第四(D)殘基由椅式變?yōu)榘胍问剑纬蛇^渡態(tài)構(gòu)象②Glu35的羧基提供一個(gè)H+,進(jìn)行酸催化,使得四五殘基間1-4糖苷鍵籪裂D殘基C1與氧原子分開,并形成正碳離子過渡態(tài)③D殘基正碳離子過渡態(tài)與溶劑中OH-結(jié)合。第15頁(yè),共19頁(yè)。3.
催化的特點(diǎn)
經(jīng)測(cè)定發(fā)現(xiàn)酶與底物構(gòu)象都發(fā)生變化;誘導(dǎo)契合的證據(jù)表示了靠近及定向;Asp與Glu的協(xié)同作用表現(xiàn)為酸堿催化;Glu提供質(zhì)子,Asp是穩(wěn)定的因素;底物變形作用由椅
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