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文檔簡介
ICS11.220
CCSB41
DB42
湖北省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB42/T1864.2—2022
家禽疫病診斷技術(shù)規(guī)程
第2部分:禽大腸桿菌致病群雙重探針法檢
測
Codeforpracticediagnostictechniquesofpoultrydiseasesseries——
Part2:TestmethodofdualprobePCRfordetectingpathogenicEscherichia
coli
2022-05-26發(fā)布2022-07-26實施
湖北省市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB42/T1864.2—2022
目次
前言.................................................................................II
引言.................................................................................IV
1范圍................................................................................1
2規(guī)范性引用文件......................................................................1
3術(shù)語和定義..........................................................................1
4縮略語..............................................................................1
5原理................................................................................1
6試驗條件............................................................................2
7儀器設(shè)備............................................................................2
8試劑或材料..........................................................................2
9試驗步驟............................................................................3
10結(jié)果判定...........................................................................4
11生物安全措施.......................................................................4
I
DB42/T1864.2—2022
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件DB42/T1864《家禽疫病診斷技術(shù)規(guī)程》為系列標(biāo)準(zhǔn)。
本部分為DB42/T1864的第2部分。DB42/T1864發(fā)布了以下部分:
——第1部分:家禽主要腫瘤病病原鑒別。
——第2部分:禽大腸桿菌致病群雙重探針法檢測
——第3部分:雞沙門氏菌、產(chǎn)氣莢膜酸菌和空腸彎曲菌三重?zé)晒釶CR檢測方法。
——第4部分:禽白血病抗原ELISA檢測方法。
請注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利,本文件的發(fā)布機構(gòu)不承擔(dān)識別專利的責(zé)任。
本文件由湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所提出。
本文件由湖北省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳歸口管理。
本文件起草單位:湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所、湖北省動物疫病預(yù)防控制中心。
本文件主要起草人:張文婷、羅青平、邵華斌、周艷君、金鑫、張騰飛、溫國元、王紅琳、商雨、
汪宏才、張蓉蓉、盧琴、羅玲。
本文件實施應(yīng)用的疑問,可咨詢湖北省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳,聯(lián)系電話郵箱:
hbsnab@126.com;在執(zhí)行過程中有意見和建議請反饋至湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,聯(lián)系電話:
II
DB42/T1864.2—2022
III
DB42/T1864.2—2022
引言
近年來,我國高度重視動物傳染病的預(yù)防和控制工作,在國務(wù)院頒布的《國家中長期動物疫病防治
規(guī)劃(2012~2020年)》中明確要求進(jìn)一步做好種禽場疫病凈化、加強疫病檢測診斷能力建設(shè)。家禽及
蛋制品產(chǎn)業(yè)鏈?zhǔn)呛笔〉氖笾攸c產(chǎn)業(yè)鏈之一,為了加快湖北省重點農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)鏈建設(shè),保證家禽養(yǎng)殖健
康與食品安全,依據(jù)《湖北省重點農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)鏈實施方案》,對影響家禽及蛋制品產(chǎn)業(yè)鏈的禽白血病、禽
致病性大腸桿菌、沙門氏菌等家禽重要疫病開展快速檢測方法研究。為加快我省家禽疫病凈化進(jìn)程,提
升疫病的監(jiān)測、檢測效率,促進(jìn)我省家禽業(yè)持續(xù)健康發(fā)展,起草組圍繞家禽疫病防控的需要,研制了《家
禽疫病診斷技術(shù)規(guī)程》系列標(biāo)準(zhǔn),擬由4個部分構(gòu)成。
——第一部分:家禽主要腫瘤病病原鑒別。目的在于開展家禽J亞群白血病病毒、馬立克氏病病毒、
網(wǎng)狀內(nèi)皮組織增生癥病毒的快速檢測,指導(dǎo)家禽腫瘤病的快速鑒別診斷。
——第二部分:禽大腸桿菌致病群雙重探針法檢測。目的在于檢測家禽泄殖腔拭子和糞便中的致
病群大腸桿菌,指導(dǎo)家禽致病群大腸桿菌的快速檢測。
——第三部分:雞沙門氏菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌和空腸彎曲菌三重?zé)晒釶CR檢測方法。目的在于檢測
雞肉及相關(guān)產(chǎn)品、雞泄殖腔拭子和糞便中的沙門氏菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌和空腸彎曲菌,指導(dǎo)雞
肉及相關(guān)產(chǎn)品細(xì)菌性疾病的快速檢測。
——第四部分:禽白血病抗原ELISA檢測方法。目的在于檢測種雞群蛋清、血漿、精液、胎糞、
肛拭子中禽白血病抗原ELISA檢測,指導(dǎo)種雞場禽白血病的凈化檢測。
IV
DB42/T1864.2—2022
家禽疫病診斷技術(shù)規(guī)程
第2部分:禽大腸桿菌致病群雙重探針法檢測
1范圍
本文件規(guī)定了禽致病群大腸桿菌雙重探針檢測方法所需檢測儀器、試劑、樣品、檢測步驟及結(jié)果判
定。
本文件適用于檢測家禽泄殖腔拭子和糞便中的致病群大腸桿菌。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法
GB19489實驗室生物安全通用要求
GB/T27403實驗室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測
NY/T555動物產(chǎn)品中大腸菌群、糞大腸菌群和大腸桿菌的檢測方法
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
大腸桿菌致病群escherichiacoliphylogeneticgroup
根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化分類,將大腸桿菌分為B2、D、B1和A群,其中B2群和D群大腸桿菌稱為致病群大腸桿
菌。
3.2
熒光PCRrealtimePCR
一種在DNA擴增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。
4縮略語
下列縮略語適用于本文件。
BHQ1:黑洞淬滅劑-l(BlackHoleQuencher-1)
Ct值:循環(huán)閾值(Cyclethreshold)
FAM:熒光素酰胺(FluoresceinAmidite)
HEX:六氯熒光素(Hexachloro-Fluorescein)
5原理
1
DB42/T1864.2—2022
本文件采用Taqman雙重探針法對家禽大腸桿菌中的致病群進(jìn)行篩選。該方法的原理是:種系發(fā)生分
群是大腸桿菌分子流行病學(xué)的重要特征,依據(jù)chuA基因、yiaA基因和DNA片段TspE4.C2的有無,大腸桿
菌可被分為B2、D、B1和A四個種群(表1)。流行病學(xué)資料顯示,B2群和D群為主要的致病群。針對禽源
大腸桿菌毒力島基因chuA和yiaA,設(shè)計特異的引物和熒光探針,建立了一種禽大腸桿菌致病群篩選的
Taqman雙重探針檢測方法,根據(jù)對應(yīng)的熒光曲線反應(yīng)和Ct值來判斷禽大腸桿菌的致病群。
表1大腸桿菌種群的判定
種群chuAyiaATspE4.C2
B2++/
D+-/
B1-/+
A-/-
注:“+”表示該基因檢測為陽性,“-”表示該基因檢測為陽性,“/”表示不檢測該基因。
6試驗條件
實驗操作應(yīng)在室溫(18℃~25℃)下進(jìn)行。樣品前處理及菌株分離鑒定應(yīng)在二級生物安全柜中進(jìn)行。
7儀器設(shè)備
7.1熒光定量PCR儀。
7.2二級生物安全柜。
7.3渦旋震蕩器。
7.4微量移液器(規(guī)格為1mL、100μL、50μL和2.5μL)。
7.5恒溫培養(yǎng)箱:36℃±1℃。
7.6臺式冷凍小型離心機(轉(zhuǎn)速≥12000r/min)。
8試劑或材料
8.1試劑配制
本方法試驗用水應(yīng)按照GB/T6682中規(guī)定的二級水,所有實驗用試劑均為分析純。試劑配制按照GB/T
27403規(guī)定實施。
8.2試劑或材料
8.2.1Cary-Blair運送培養(yǎng)基。
8.2.2熒光定量PCR探針預(yù)混物。
8.2.3商品化的細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒。
8.2.4chuA基因引物與探針:上游引物5’-CTGGGTGGAGTGATCTCCTA-3’,下游引物:
5’-TGCCGCCAGTACCAAAG-3’,探針:5’-FAM-TTGCAGGAAGGACAAAGCAGTGGT-BHQ1-3’。
8.2.5yjaA基因引物與探針:上游引物5’-GAAAGCAAACGTGAAGTGTCAG-3’,下游引物:
2
DB42/T1864.2—2022
5’-GGTGGAGTTGCAGAACAAGA-3’,探針:5’-HEX-CCAGCGCCTGTTAATCGCCAATTT-BHQ1-3’。
8.2.6陽性對照1:chuA基因的陽性克隆分子DNA或陽性標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA。
8.2.7陽性對照2:yjaA基因的陽性克隆分子DNA或陽性標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA。
8.2.8陰性對照:無菌蒸餾水或去離子水。
8.2.9無DNase/RNase的qPCR管、EP管(1.5mL)、微量移液器對應(yīng)的槍頭。
9試驗步驟
9.1樣品的采集與前處理
9.1.1泄殖腔拭子樣品
用無菌的棉拭子插入雞泄殖腔內(nèi)2cm至3cm處并輕輕旋轉(zhuǎn),將有可見糞便的棉拭子放入含有1mL~
2mL運送培養(yǎng)基中,冷藏箱保存,樣品保存時間不超過24h。
9.1.2糞便樣品
先采集雞新鮮糞便1g~2g于一次性無菌采便管內(nèi),然后轉(zhuǎn)移至含有1mL~2mL運送培養(yǎng)基中,冷
藏箱保存,樣品保存時間不超過24h。
9.2大腸桿菌的分離鑒定
大腸桿菌的分離鑒定按照NY/T555的規(guī)定執(zhí)行。
9.3樣品DNA的制備
9.3.1對于鑒定后的菌株,接種于營養(yǎng)肉湯中,36℃±1℃培養(yǎng)18h~24h。12000r/min離心2min,
去盡上清,沉淀用于核酸提取。
9.3.2在沉淀中,加入100μLDNA提取液充分混勻,沸水浴10min,在4℃下12000g離心5min,上
清可直接用于熒光PCR反應(yīng)。
9.3.3也可以使用商品化的DNA提取試劑盒提取DNA模板,具體步驟參照說明書。
9.4熒光PCR檢測
9.4.1反應(yīng)體系
以制備的DNA為模板進(jìn)行雙重?zé)晒舛縋CR反應(yīng)。反應(yīng)體系體積為25μL,上、下游引物(10mmol/L)
各0.6μL,探針(10mmol/L)各0.8μL,熒光定量PCR探針預(yù)混物12.5μL,模板DNA1μL。用滅菌
的去離子水補足體積至25μL。
9.4.2反應(yīng)條件
熒光PCR反應(yīng)在多通道熒光定量PCR儀上進(jìn)行,選擇熒光信號FAM和HEX(分別檢測chuA-FAM,
yjaA-HEX)。
反應(yīng)參數(shù):95℃預(yù)變性5min;然后95℃變性10sec,58.1℃退火并延伸30sec,擴增40個循環(huán);
延伸結(jié)束時開始進(jìn)行雙重?zé)晒庑盘枡z測。閾值設(shè)置為閾值線超過正常陰性樣品擴增曲線的最高點。
9.4.3對照
3
DB42/T1864.2—2022
檢測過程中分別設(shè)陽性對照1、陽性對照2與陰性對照。
10結(jié)果判定
10.1質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性對照(無菌水)無Ct值或Ct值>35,無擴增曲線;陽性對照品FAM和HEX通道檢測結(jié)果的Ct值均
≤30,擴增曲線明顯呈對數(shù)增長;如果陰性對照或者陽性對照有一項不符合標(biāo)準(zhǔn)則本次檢測無效。
10.2結(jié)果分析
檢測結(jié)果的判定應(yīng)按照表2、表3規(guī)定。
表2chuA、yjaA基因檢測結(jié)果的分析
通道Ct值結(jié)果分析
FAM≤35報告為chuA基因熒光PCR檢測陽性
無Ct值或>40檢測樣品低于檢測限或沒有,報告為chuA基因熒光PCR檢測陰性
35~40Ct值在35~40之間為灰值區(qū)域,對樣品重新提取基因組,再檢測一次,重做后
Ct值<37且有擴增曲線的報告為chuA基因熒光PCR檢測陽性,其余則報告為chuA
基因熒光PCR檢測陰性
HEX≤35報
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