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蛋白質(zhì)有關(guān)計(jì)算預(yù)期目標(biāo):
(1)加深理解:氨基酸間的脫水縮合
(2)逆向思維:理解蛋白質(zhì)的水解過程
(3)知識(shí)遷移:?jiǎn)翁强s合成多糖
(4)鋪墊:核苷酸縮合成核酸H2N-C-
C
-OHHR1ON-C-COOHHR4HHC
-OHON-C-HR2HHC
-OHON-C-HR3HHH2N–C-CHR1OCON-C-HR2HCON-C-HR3HN-C-COOHHR4HH2OH2OH2O蛋白質(zhì)合成蛋白質(zhì)水解1.核心依據(jù)(1)每形成1個(gè)肽鍵,就失去1分子水(失去2個(gè)H+1個(gè)O)(2)每打斷1個(gè)肽鍵,消耗1分子水H2N--COOHH2OH2O2.建立模型N個(gè)氨基酸肽鍵數(shù)(失水?dāng)?shù))游離氨基(或羧基)至少氨基總數(shù)羧基總數(shù)1條鏈3.肽鍵數(shù)(失水?dāng)?shù))、游離氨基酸(或羧基)至少數(shù)、氨基(或羧基)總數(shù)N-11R氨+1R羧
+1N個(gè)氨基酸肽鍵數(shù)(失水?dāng)?shù))游離氨基(或羧基)至少氨基總數(shù)羧基總數(shù)m條鏈3.肽鍵數(shù)(失水?dāng)?shù))、游離氨基酸(或羧基)至少數(shù)、氨基(或羧基)總數(shù)H2NCOOH肽鏈1H2NCOOH肽鏈2H2NCOOH肽鏈m…x1個(gè)氨基酸x2個(gè)氨基酸xm個(gè)氨基酸N個(gè)氨基酸建立模型蛋白質(zhì)總肽鍵數(shù):N–m肽鏈1中肽鍵數(shù):x1-1肽鏈2中肽鍵數(shù):x2-1肽鏈m中肽鍵數(shù):xm-1……+推理過程N(yùn)–mmR氨+mR羧+m例1:綠色熒光蛋白(GFP)的相關(guān)數(shù)據(jù)如下圖所示,下列有關(guān)敘述正確的是A.GFP有2條肽鏈B.GFP中含有125個(gè)肽鍵C.GFP的R基上的氨基有16個(gè)D.經(jīng)高溫處理后,GFP仍能發(fā)出綠色熒光C游離羧基總數(shù)16=R基上的羧基15+肽鏈數(shù)氨基酸數(shù)126-肽鏈數(shù)2=肽鍵數(shù)游離氨基總數(shù)18=R基上的羧基
+肽鏈數(shù)2高溫使GFP變性例2:如圖是由820個(gè)氨基酸組成的某蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)圖,下列相關(guān)敘述正確的是A.該蛋白質(zhì)的功能僅由氨基酸的種類、數(shù)量、排列順序三方面決定B.水解該蛋白質(zhì)的過程中需要817個(gè)水分子C.該蛋白質(zhì)至少有2個(gè)游離的羧基和2個(gè)游離的氨基D.該蛋白質(zhì)至少含有820個(gè)肽鍵Cx個(gè)氨基酸y個(gè)氨基酸820-x-y個(gè)氨基酸(x-1)+y+(820-x-y1)=8184.蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量氨基酸N個(gè)平均相對(duì)分子質(zhì)量為a蛋白質(zhì)M條肽鏈?zhǔn)?N-m)分子水每個(gè)-S-S-失去2H蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量=N×a–(N-M)×18–
二硫鍵數(shù)×2
☆若肽鏈間有肽鍵,也失去水例3:下圖為某種蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)示意圖,其中的★▲■●等表示不同氨基酸,數(shù)字表示氨基酸的序號(hào),“-S-S-”是蛋白質(zhì)加工過程中由兩個(gè)“-SH”脫下2個(gè)H形成,“-”代表化學(xué)鍵。這些氨基酸合成此蛋白質(zhì)過程,相對(duì)分子質(zhì)量減少了______。686A.該分子中含有200個(gè)肽鍵B.這200個(gè)氨基酸中至少有200個(gè)游離氨基C.合成該蛋白質(zhì)時(shí)相對(duì)分子質(zhì)量減少了3600D.該蛋白質(zhì)分子中至少含有4個(gè)游離的羧基例4:下圖表示一個(gè)由200個(gè)氨基酸構(gòu)成的蛋白質(zhì)分子,下列敘述正確的是A所有氨基酸中C(N、S)原子數(shù)
=蛋白質(zhì)中C(N、S)原子數(shù)所有氨基酸中H原子數(shù)
-失去的水分子數(shù)×2-二硫鍵數(shù)×2=蛋白質(zhì)中H原子數(shù)所有氨基酸中O原子數(shù)
-失去的水分子數(shù)=蛋白質(zhì)中O原子數(shù)5.蛋白質(zhì)合成過程中,原子數(shù)的變化例5:由820個(gè)氨基酸組成的某蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)圖。該蛋白質(zhì)分子至少有_______個(gè)N原子,至少有_____個(gè)S原子,至少有______個(gè)O原子,至少有_________個(gè)H原子。8204820例5:由820個(gè)氨基酸組成的某蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)圖。82016406.特殊氨基酸個(gè)數(shù)的推算例6:有一個(gè)十肽鏈,分子式為CxHyOpNqS,將它徹底水解后,只得到下列4種氨基酸。水解后得到的半胱氨酸個(gè)數(shù)、賴氨酸個(gè)數(shù)分別為______,其中p=______。10-q111例7:一條肽鏈分子式為C79H97N15O24S。這條多肽鏈經(jīng)水解后的產(chǎn)物中有4種氨基酸:
半胱氨酸(C3H7NO2S)丙氨酸(C3H7NO2)天冬氨酸(C4H7NO4)苯丙氨酸(C9H11NO2)則水解產(chǎn)物中,天冬氨酸有_______個(gè)。先判斷是十五肽再根據(jù)O原子算天冬氨酸47.蛋白質(zhì)水解的計(jì)算核心思想:建立肽鏈水解模型例8:某條肽鏈由89個(gè)氨基酸縮合而成,其中共有游離氨基6個(gè),5個(gè)甲硫氨酸在肽鏈中的位置為13、25、56、78、89,甲硫氨酸的分子式為C5H11O2NS。下列敘述正確的是
A.合成該多肽的氨基酸共有N原子數(shù)目94個(gè)
B.該肽鏈脫掉甲硫氨酸后形成的短肽中,肽鍵數(shù)目會(huì)減少10個(gè)
C.該肽鏈脫掉甲硫氨酸后形成的短肽中,氨基和羧基均分別增加5個(gè)
D.該肽鏈脫掉甲硫氨酸后形成的短肽中,氧原子數(shù)目增加9個(gè)H2N-COOH1325567889R基5個(gè)-NH2A例9:蛋白質(zhì)內(nèi)切酶作用于肽鏈內(nèi)部特定區(qū)域,若蛋白酶1作用于苯丙氨酸(C9H11NO2)兩側(cè)的肽鍵,蛋白酶2作用于賴氨酸(C6H14N2O2)氨基端構(gòu)成的肽鍵,某四十九肽經(jīng)酶1和酶2作用后的情況如圖。(1)短肽A、B、C比四十九肽的氧原子數(shù)減少_____個(gè),氫原子數(shù)目減少______個(gè)。(2)在該四十九肽中,苯丙氨酸存在于第_________________號(hào)位上,而第_________________號(hào)位為賴氨酸。H2NCOOH116183033491212348酶1酶2ABCDE12317、31、3222、23、49例10:蛋白酶3作用于苯丙氨酸(C9H11NO2)兩側(cè)的肽鍵。某四十九肽經(jīng)酶3作用后的情況如圖。CH2NCOOH11618263348酶2831ABD獲得的4條肽鏈,與原四十九肽相比;(1)肽鍵數(shù)目的改變:__________個(gè);(2)游離的氨基數(shù)目的改變:_________個(gè);(3)H原子數(shù)目的改變:__________個(gè);(4)O原子數(shù)目的改變:__________個(gè)。
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