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文檔簡介
酶促反應(yīng)動力學(xué)
KineticsofEnzyme-CatalyzedReaction
酶促反應(yīng)動力學(xué)研究酶促反應(yīng)的速度規(guī)律及各種因素對酶促反應(yīng)速度的影響。影響因素包括有酶濃度、底物濃度、pH、溫度、抑制劑、激活劑等。※研究一種因素的影響時,其余各因素均恒定。
※初速度(v):在酶促反應(yīng)過程中,初始底物濃度消耗在5%以內(nèi)的速度一、酶濃度的影響酶最適反應(yīng)適條件下
當(dāng)[S]>>[E],酶可被底物飽和的情況下,反應(yīng)速度與酶濃度成正比。關(guān)系式為:V=K[E]0V[E]二、底物濃度對反應(yīng)速度的影響1.單底物酶促反應(yīng)動力學(xué)中間復(fù)合物學(xué)說
E:enzyme;S:substrate;P:product1903年,Henri以蔗糖酶研究底物與反應(yīng)速率關(guān)系,與Wurtz提出酶底物中間絡(luò)合物學(xué)說E+Sk1k2k3ESE+P[S]VVmax當(dāng)?shù)孜餄舛容^低時反應(yīng)速度與底物濃度成正比;反應(yīng)為一級反應(yīng)。[S]VVmax隨著底物濃度的增高反應(yīng)速度不再成正比例加速;反應(yīng)為混合級反應(yīng)。[S]VVmax當(dāng)?shù)孜餄舛雀哌_(dá)一定程度反應(yīng)速度不再增加,達(dá)最大速度;反應(yīng)為零級反應(yīng)。
vVmax[S]Km+[S]=──1913年Michaelis和Menten提出反應(yīng)速度與底物濃度關(guān)系的數(shù)學(xué)方程式,即米-曼氏方程式,簡稱米氏方程(Michaelisequation)。[S]:底物濃度V:不同[S]時的反應(yīng)速度Vmax:最大反應(yīng)速度(maximumvelocity)
Km:米氏常數(shù)(Michaelisconstant)
米氏方程的推導(dǎo)前提:中間復(fù)合物學(xué)說:E+SES→E+P反應(yīng)方程式:假設(shè):產(chǎn)物濃度很底時,忽略E+P→EPE+Sk1k2k3ESE+PTotalenzyme:[Et]=[E]+[ES],[E]=[Et]-[ES]∵[S]>>[E] ∴[St]-[ES]≈[S]K1[E][S]=K2[ES]+K3[ES],即:K1([Et]-[ES])[S]=K2[ES]+K3[ES]=([Et]-[ES])[S]K2+K3[ES]
K1整理得:K2+K3=
KmK1令:=Km([Et]-[ES])[S][ES]
則:[ES]=───[Et][S]Km+[S]整理得:∵ES分解為限速步驟,∴v=K3[ES]即:K3[Et][S]Km+[S]v=────當(dāng)?shù)孜餄舛取?,酶活性中心全部飽和,即[Et]=[ES],反應(yīng)達(dá)最大速度:Vmax=K3[ES]=K3[Et]Vmax[S]
Km+[S]
v=────
米氏常數(shù)
:Km
當(dāng):v=1/2Vmax
[S]=Km(摩爾/升)
K2+K3=
KmK1Vmax[S]
Km+[S]
v=────
VmaxV[S]KmVmax/2米氏常數(shù)的意義
Km值是酶的特征常數(shù),只與酶性質(zhì)反應(yīng)環(huán)境有關(guān),與酶的濃度無關(guān)。(鑒定酶)判斷酶的最適底物,如蔗糖酶:水解蔗糖Km=28;水解綿子糖Km=350可近似地表示酶對底物親和力的大小Km值可用來表示酶對底物的親和力K2+K3=
Km
,當(dāng)K2>>K3
時,K1=[E][S]
K2[ES]
K1Km
==Ks(解離常數(shù))Km和酶與底物的親和力成反比
E+Sk1k2k3ESE+P米氏常數(shù)的求法v—[S]作圖法
雙倒數(shù)作圖法(doublereciprocalplot),
又稱為林-貝氏(Lineweaver-Burk)作圖法
Y=aX+b2.雙底物酶促反應(yīng)機(jī)制
雙底物反應(yīng)
序列反應(yīng)乒乓反應(yīng)有序順序反應(yīng)
隨機(jī)順序反應(yīng)①有序順序機(jī)制(compulsoryorderreactions)
(1)順序(序列)機(jī)制(sequentialreactions)Leadingsubstrate乙醇脫氫酶的作用
②隨機(jī)順序機(jī)制(randomorderreactions)肌酸激酶催化的反應(yīng)
Cr:creatine肌酸;CrP:creatinephosphate磷酸肌酸可逆地催化肌酸與ATP之間的轉(zhuǎn)磷?;磻?yīng)
(2)乒乓機(jī)制(pingpongreactions)
修飾酶形式氨基轉(zhuǎn)移酶催化的反應(yīng)磷酸吡哆醛磷酸吡哆胺草酰乙酸α-酮戊二酸三、溫度對酶促反應(yīng)的影響雙重影響
最適溫度(optimumtemperature):酶促反應(yīng)速度最快時的境溫度。植物酶:40-50?C
動物酶:35-40?C非固定常數(shù)←底物的種類、濃度,溶液的離子強(qiáng)度,pH,反應(yīng)時間等四、pH對酶促反應(yīng)的影響最適pH:植物、微生物酶:pH4.5-6.5動物酶:pH6.5-8.0非固定常數(shù)膽堿酯酶木瓜蛋白酶胰蛋白酶胃蛋白酶過氧化氫酶延胡索酸酶RNase精氨酸酶pH影響反應(yīng)速度的原因
pH影響了酶分子、底物分子和ES復(fù)合物的解離狀態(tài)。過高、過低的pH導(dǎo)致酶蛋白變性。五、激活劑的影響激活劑(activator)
凡能提高酶活性,加速酶促反應(yīng)速度的物質(zhì)都稱為該酶的激活劑。主要激活劑
金屬離子:K+、Na+
、Mg2+
、Zn2+
、Fe2+
、Ca2+
、Mn2+
無機(jī)陰離子:Cl-
、Br-、I-、CN-,PO43-小分子有機(jī)物:抗壞血酸、還原型谷胱甘肽、半胱氨酸等生物大分子:蛋白酶、鈣調(diào)素等六、抑制劑的影響抑制作用:某些物質(zhì)與酶分子上特定基團(tuán),主要是活性中心的某些基團(tuán)結(jié)合,使酶活性中心的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)發(fā)生改變,從而引起酶活力的下降或喪失,這種作用稱為酶的抑制作用。酶的抑制劑(inhibitor):能對酶產(chǎn)生抑制作用的物質(zhì)即為酶的抑制劑。
抑制劑與變性劑:抑制劑對酶有一定選擇性——必需基團(tuán);引起變性的因素對酶沒有選擇性。
抑制作用的類型
不可逆性抑制(irreversibleinhibition)可逆性抑制(reversibleinhibition):競爭性抑制(competitiveinhibition)非競爭性抑制(non-competitiveinhibition)反競爭性抑制(uncompetitiveinhibition)1.不可逆性抑制作用(irreversibleinhibition)
概念抑制劑通常以共價鍵與酶活性中心的必需基團(tuán)相結(jié)合,使酶失活。抑制劑不能用透析、超濾等方法除去。
抑制劑重金屬:汞、鉛、砷有機(jī)磷化合物:農(nóng)藥(敵敵畏、敵百蟲)細(xì)胞呼吸抑制劑:氰化物、一氧化碳等
有機(jī)磷化合物羥基酶(膽堿酯酶)磷?;?失活酶)酸羥基酶抑制劑
有機(jī)磷化合物,R、R’:烷基;X:-F,-CN等解磷定(PAM,碘化醛胯甲基吡啶)或氯磷定巰基酶抑制劑烷化劑:例ICH2COOH,ICH2CONH2等E-SH+ICH2COOHE-S-CH2COOH+HI有機(jī)汞、有機(jī)砷化合物(對氯汞苯甲酸,路易士氣)路易士氣巰基酶失活酶酸路易士氣的解毒失活酶BAL(二巰基丙醇)巰基酶BAL與砷劑結(jié)合物2.可逆性抑制作用(reversibleinhibition)*概念抑制劑通常以非共價鍵與酶或酶-底物復(fù)合物可逆性結(jié)合,使酶的活性降低或喪失;抑制劑可用透析、超濾等方法除去。競爭性抑制非競爭性抑制反競爭性抑制*類型(1)競爭性抑制作用(competitiveinhibition)
+IEIE+SE+PES反應(yīng)模式抑制劑與底物的結(jié)構(gòu)相似,能與底物競爭酶的活性中心,從而阻礙酶底物復(fù)合物的形成,使酶反應(yīng)速度降低。這種抑制作用稱為競爭性抑制作用。
+++EESIESEIEP抑制劑是底物的結(jié)構(gòu)類似物
競爭性抑制作用動力學(xué)Vmax不變;Km(Km’)變大,隨[I]增加而增加(2)非競爭性抑制(noncompetitiveinhibition)
抑制劑與酶活性中心外的基團(tuán)結(jié)合,不影響酶與底物的結(jié)合,酶和底物的結(jié)合也不影響酶與抑制劑的結(jié)合。但酶-底物-抑制劑復(fù)合物不能進(jìn)一步釋放出產(chǎn)物。*反應(yīng)模式E+SESE+P+
S-S+
S-S+ESIEIEESEP+IEI+SEIS+I非競爭性抑制作用動力學(xué)Km=Km’(不變);Vmax變小,Vmax’隨[I]增加減小(3)反競爭性抑制(uncompetitiveinhibition)
抑制劑只與酶和底物形成的中間產(chǎn)物結(jié)合,既減少從中間產(chǎn)物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的量,也減少從中間產(chǎn)物解離出游離酶和底物的量。*反應(yīng)模式
E+SE+PES+IESI++ESESESIEP反競爭性抑制作用動力學(xué)Vmax、Km變??;Vmax、Km隨[I]增加減小可逆性抑制作用比較第六節(jié)
重要酶類及其活性調(diào)節(jié)
一、多酶體系與反饋調(diào)節(jié)多酶體系反饋調(diào)節(jié)蘇氨酸異亮氨酸二、別構(gòu)酶和別構(gòu)調(diào)節(jié)1.基本概念
(1)別構(gòu)調(diào)節(jié)(allostericregulation)某些化合物與酶特定部位結(jié)合(可逆非共價結(jié)合),引起酶的構(gòu)象變化,從而導(dǎo)致酶活性變化,這種調(diào)節(jié)方式稱為別構(gòu)調(diào)節(jié)。
(2)效應(yīng)物(effector)能使酶分子發(fā)生別構(gòu)作用的物質(zhì)(常為小分子代謝物或輔因子)稱為效應(yīng)物或別構(gòu)劑。
正效應(yīng)物(positiveeffetor)
效應(yīng)物與酶的結(jié)合使酶活性升高者,稱為正效應(yīng)物或別構(gòu)激活劑。
負(fù)效應(yīng)物(negativeeffetor)
效應(yīng)物與酶的結(jié)合使酶活性降低者,稱為負(fù)效應(yīng)物或別構(gòu)抑制劑。
(3)別構(gòu)酶(allostericenzyme)
能進(jìn)行別構(gòu)調(diào)節(jié)的酶為別構(gòu)酶。別構(gòu)酶除活性中心外還有別構(gòu)中心(與別構(gòu)劑結(jié)合的部位)。別構(gòu)酶一般為寡聚體,別構(gòu)中心可位于同一亞基的不同部位或不同亞基上。存在別構(gòu)中心的亞基稱調(diào)節(jié)亞基。存在活性中心的亞基稱催化亞基。
活性中心負(fù)責(zé)對底物的結(jié)合與催化,別構(gòu)中心負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)酶促反應(yīng)速度。(4)別構(gòu)效應(yīng)(allostericeffect):效應(yīng)物與別構(gòu)中心結(jié)合,使活性中心與底物的結(jié)合和催化活性受到影響,進(jìn)而調(diào)節(jié)酶反應(yīng)速度,此效應(yīng)稱為別構(gòu)效應(yīng)。
(5)同促效應(yīng)(homotropiceffect):
底物分子本身對別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)。當(dāng)?shù)谝粋€效應(yīng)分子與酶別構(gòu)中心結(jié)合后,有利于同種后續(xù)分子的結(jié)合。(活性部位和調(diào)節(jié)部位是相同的。)(6)異促效應(yīng)(heterotropiceffect):
非底物分子調(diào)節(jié)物對別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)。當(dāng)?shù)谝粋€效應(yīng)分子與酶別構(gòu)中心結(jié)合后,有利于不同后續(xù)分子(底物)與酶的結(jié)合。
(7)協(xié)同效應(yīng)(cooperativeeffect)
:
調(diào)節(jié)部位和活性部位雖然在空間上是分開的,但這兩個部位通過構(gòu)象的變化可相互影響,這種影響統(tǒng)稱為協(xié)同效應(yīng)。酶結(jié)合一分子調(diào)節(jié)物(或底物),構(gòu)象變化,有利于后續(xù)分子與酶結(jié)合——正協(xié)同效應(yīng)(positivecooperativety);新構(gòu)象不利于后續(xù)分子與酶結(jié)合——負(fù)協(xié)同效應(yīng)(negativecooperativety)。三、酶的可逆共價調(diào)節(jié)(共價修飾covalentlymodulatedenzymes
)
在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價結(jié)合,從而改變酶的活性,此過程稱為共價修飾。共價調(diào)節(jié)的逆反應(yīng)需在另一種酶的催化下進(jìn)行。
共價修飾的類型磷酸化與脫磷酸化(最常見)乙?;兔撘阴;谆兔摷谆佘栈兔撓佘栈璖H與-S-S互變
-OHThrSerTyr酶蛋白H2OPi磷蛋白磷酸酶ATPADP蛋白激酶ThrSerTyr-O-PO32-酶蛋白酶的磷酸化與脫磷酸化糖原磷酸化酶活性的調(diào)節(jié)
磷酸化/脫磷酸化調(diào)節(jié)(磷酸化位點:Ser14)四、同工酶(isoenzymeorisozyme)
概念同工酶是指由不同基因或等位基因編碼的多肽鏈所組成的單體、純聚體或雜合體,催化相同的化學(xué)反應(yīng),而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。舉例:乳酸脫氫酶(lactatedehydrogenaseLDH)
催化的反應(yīng)
乳酸丙酮酸
LDH5骨骼肌:乳酸丙酮酸心肌:LDH1HHHHHHHMHHMMHMMMMMMMLDH1
(H4)LDH2(H3M)LDH3(H2M2)LDH4(HM3)LDH5
(M4)乳酸脫氫酶的同工酶結(jié)構(gòu)特征(2種亞基4聚體,5種同工酶)
H:heart;M:muscle電泳行為乳酸脫氫酶同工酶在不同組織中
的分布(%)生理意義
心肌:LDH1(H4)對NADKm值小,氧化供能骨骼?。篖DH5(M4)對丙酮酸Km值小同工酶譜的改變有助于對疾病的診斷心肌梗死和肝病病人血清LDH同工酶譜的變化1酶活性心肌梗死酶譜正常酶譜肝病酶譜2345*肌酸激酶(creatinephosphatekinaseCPK)催化的反應(yīng):肌酸+ATP=肌酸磷酸+ADP結(jié)構(gòu):2種亞基2聚體,三種同工酶MM,MB,BB肌酸激酶同工酶在人體組織中的分布肌酸激酶(CPK)骨骼肌心臟腦肝胃腎總活力(IU/g)1900-3000380160412518MM10076-90310MB-22-6210BB-110049590***第七節(jié)
酶的分離純化
和活力測定一、酶分離純化的一般原則材料選擇:新鮮、酶含量豐富所有蛋白質(zhì)分離純化的方法都適合酶特別注意酶活性的保護(hù),避免一切能引起蛋白變性的因素每一步都要進(jìn)行酶活力的測定,跟蹤酶的去向,評價純化方法。
二、酶活力與測定
1.酶活力
(enzymeactivity)
一定條件下,酶催化某一化學(xué)反應(yīng)的能力,以反應(yīng)速度表示。酶活力與反應(yīng)速度呈正比。
*反應(yīng)速度:指單位時間內(nèi)底物的減少量或產(chǎn)物的生成量。由于底物是過量的,減少量不易測準(zhǔn),所以通常以測定產(chǎn)物的生成量為準(zhǔn)。2.酶活力單位
(unit,U)
國際單位(IU,1961
):一個國際單位指在最適條件下,每分鐘催化1微摩爾(μmol)底物減少或1微摩爾產(chǎn)物生成所需要的酶量(25?C)。Katal(Kat
,1972):在最適條件下,每秒鐘能催化1摩爾(mol)底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量定為1Kat。Kat與國際單位的換算如下:1Kat=
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