常州市中醫(yī)院基因測序技術(shù)考核一、單選題（每題2分，共20題）1.常州地區(qū)常見遺傳病篩查中，以下哪種疾病最常通過基因測序技術(shù)進行診斷？A.溶血性貧血B.甲狀腺功能減退C.高血壓D.糖尿病2.在常州市中醫(yī)院的基因測序?qū)嶒炇抑?，常用的二代測序平臺是？A.Sanger測序儀B.IonTorrentC.IlluminaHiSeqD.PacBioSMRTbell3.針對常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性腫瘤，以下哪種基因檢測方案最適用于高風險人群篩查？A.染色體核型分析B.基因芯片檢測C.LDT（限制備訂檢測）D.WES（全外顯子組測序）4.常州市中醫(yī)院在腫瘤精準用藥中，常用哪種基因檢測來指導EGFR-TKIs用藥？A.BRAFV600E檢測B.KRASG12D檢測C.EGFR突變檢測D.ALK融合檢測5.在常州地區(qū)，以下哪種罕見病最常通過基因測序技術(shù)確診？A.多發(fā)性內(nèi)分泌腺瘤病B.甲狀腺功能亢進C.痛風D.肥胖癥6.常州市中醫(yī)院在進行基因測序數(shù)據(jù)分析時，常用的變異檢測軟件是？A.GATKB.SamtoolsC.VarScanD.Alloftheabove7.針對常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性心血管疾病，以下哪種基因檢測最適用于家系篩查？A.單基因檢測B.基因芯片檢測C.WES（全外顯子組測序）D.MTSS（全外顯子組+低覆蓋度全基因組）8.在常州市中醫(yī)院，以下哪種情況最需要進行基因測序技術(shù)輔助診斷？A.普通感冒B.細胞遺傳學異常C.免疫缺陷病D.常見代謝病9.常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性耳聾，最常檢測的基因是？A.GJB2B.CFTRC.TP53D.BRCA110.在常州市中醫(yī)院進行基因測序樣本制備時，以下哪種方法最適用于RNA-Seq？A.基因芯片雜交B.PCR擴增C.末端修復+加A尾+連接接頭D.染色體熒光顯微檢測二、多選題（每題3分，共10題）1.常州市中醫(yī)院基因測序?qū)嶒炇业馁|(zhì)控流程中，以下哪些步驟是必須的？A.DNA濃度和純度檢測B.測序儀跑板前校準C.變異檢測前的BAM文件比對D.實驗室環(huán)境菌落污染檢測2.針對常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性腫瘤，以下哪些基因檢測方案可用于腫瘤精準分型？A.NGS腫瘤靶向基因檢測B.全外顯子組測序（WES）C.染色體核型分析D.等位基因特異性PCR（AS-PCR）3.在常州市中醫(yī)院進行遺傳病基因測序時，以下哪些情況需要考慮倫理審查？A.家系遺傳病篩查B.罕見病診斷C.腫瘤用藥指導D.產(chǎn)前診斷4.常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性心血管疾病，以下哪些基因與疾病相關？A.LMNAB.MYH7C.FBN1D.KATP5.在常州市中醫(yī)院進行基因測序數(shù)據(jù)分析時，以下哪些工具可用于變異注釋？A.ANNOVARB.VEP（VariantEffectPredictor）C.SnpEffD.GnomAD6.針對常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性耳聾，以下哪些基因檢測方案最適用于篩查？A.GJB2、SLC26A4、MT-RNR1基因檢測B.全外顯子組測序（WES）C.基因芯片檢測D.產(chǎn)前基因檢測7.在常州市中醫(yī)院進行基因測序樣本制備時，以下哪些方法適用于DNA-Seq？A.磷酸化+連接接頭B.末端修復+加A尾+連接接頭C.基因芯片雜交D.PCR擴增8.常州市中醫(yī)院在腫瘤精準用藥中，以下哪些基因檢測可用于指導用藥？A.EGFR檢測B.ALK檢測C.BRAF檢測D.KRAS檢測9.針對常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性內(nèi)分泌疾病，以下哪些基因檢測方案最適用于篩查？A.MEN1、MEN2A、RET基因檢測B.基因芯片檢測C.全外顯子組測序（WES）D.單基因檢測10.在常州市中醫(yī)院進行基因測序?qū)嶒灂r，以下哪些情況需要記錄實驗日志？A.樣本接收與處理B.測序儀運行參數(shù)C.數(shù)據(jù)分析結(jié)果D.實驗室環(huán)境溫濕度三、判斷題（每題1分，共10題）1.常州市中醫(yī)院基因測序?qū)嶒炇业乃袠颖径夹枰M行DNA濃度和純度檢測。（正確/錯誤）2.基因測序技術(shù)可以完全替代傳統(tǒng)病理診斷。（正確/錯誤）3.常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性耳聾，最常檢測的基因是CFTR。（正確/錯誤）4.基因測序數(shù)據(jù)分析中，所有變異都需要進行臨床意義注釋。（正確/錯誤）5.在常州市中醫(yī)院，所有腫瘤患者的用藥都需要通過基因測序指導。（正確/錯誤）6.RNA-Seq實驗中，所有樣本都需要進行rRNA去除。（正確/錯誤）7.常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性心血管疾病，最常檢測的基因是LMNA。（正確/錯誤）8.基因測序?qū)嶒炛?，所有樣本都需要進行重復實驗以確保結(jié)果可靠性。（正確/錯誤）9.在常州市中醫(yī)院，所有遺傳病診斷都需要通過基因測序技術(shù)。（正確/錯誤）10.基因測序數(shù)據(jù)分析中，所有變異都需要進行致病性預測。（正確/錯誤）四、簡答題（每題5分，共5題）1.簡述常州市中醫(yī)院基因測序?qū)嶒炇业臉颖局苽淞鞒獭?.簡述常州市中醫(yī)院基因測序數(shù)據(jù)分析的基本步驟。3.簡述常州市中醫(yī)院基因測序?qū)嶒灥馁|(zhì)控標準。4.簡述常州市中醫(yī)院基因測序技術(shù)的倫理審查要點。5.簡述常州市中醫(yī)院基因測序技術(shù)在臨床應用中的優(yōu)勢。五、論述題（每題10分，共2題）1.結(jié)合常州地區(qū)高發(fā)的遺傳病特點，論述基因測序技術(shù)在臨床診斷中的應用價值。2.結(jié)合常州市中醫(yī)院的實際情況，論述基因測序技術(shù)在未來臨床應用的挑戰(zhàn)與機遇。答案與解析一、單選題答案與解析1.A解析：常州地區(qū)高發(fā)的遺傳病中，溶血性貧血（如地中海貧血）較常見，基因測序是診斷金標準。2.C解析：IlluminaHiSeq是常州地區(qū)中醫(yī)院的常用二代測序平臺，具有高通量和高精度特點。3.D解析：WES適用于腫瘤精準分型，可檢測大量癌癥相關基因，常州地區(qū)腫瘤患者常用。4.C解析：EGFR突變檢測是常州地區(qū)腫瘤精準用藥的常用方案，指導EGFR-TKIs用藥。5.A解析：多發(fā)性內(nèi)分泌腺瘤病（MEN）是常州地區(qū)較常見的罕見病，基因測序是確診金標準。6.D解析：GATK、Samtools、VarScan是常州地區(qū)中醫(yī)院的常用變異檢測軟件。7.A解析：單基因檢測適用于家系篩查，常州地區(qū)遺傳性心血管疾病常用。8.B解析：細胞遺傳學異常（如染色體異常）需要基因測序輔助診斷，常州地區(qū)醫(yī)院常用。9.A解析：GJB2是常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性耳聾基因，檢測率最高。10.C解析：RNA-Seq樣本制備需末端修復+加A尾+連接接頭，常州地區(qū)醫(yī)院常用此方法。二、多選題答案與解析1.A、B、C、D解析：所有選項都是常州地區(qū)中醫(yī)院基因測序?qū)嶒炇业馁|(zhì)控流程必須步驟。2.A、B解析：NGS腫瘤靶向基因檢測和WES是常州地區(qū)腫瘤精準分型的常用方案。3.A、B、C、D解析：所有選項都需要倫理審查，常州地區(qū)醫(yī)院嚴格遵循規(guī)定。4.A、B、C解析：LMNA、MYH7、FBN1是常州地區(qū)高發(fā)的遺傳性心血管疾病相關基因。5.A、B、C解析：ANNOVAR、VEP、SnpEff是常州地區(qū)醫(yī)院常用的變異注釋工具。6.A、C解析：GJB2、SLC26A4、MT-RNR1基因檢測和基因芯片檢測是常州地區(qū)遺傳性耳聾篩查常用方案。7.B、D解析：DNA-Seq樣本制備需末端修復+加A尾+連接接頭或PCR擴增，常州地區(qū)醫(yī)院常用。8.A、B、C、D解析：EGFR、ALK、BRAF、KRAS檢測是常州地區(qū)腫瘤精準用藥的常用方案。9.A、B、C解析：MEN1、MEN2A、RET基因檢測、基因芯片檢測和WES是常州地區(qū)遺傳性內(nèi)分泌疾病篩查常用方案。10.A、B、C、D解析：所有選項都是常州地區(qū)醫(yī)院基因測序?qū)嶒炐枰涗浀膬?nèi)容。三、判斷題答案與解析1.正確解析：DNA濃度和純度檢測是基因測序?qū)嶒灥幕疽?，常州地區(qū)醫(yī)院嚴格執(zhí)行。2.錯誤解析：基因測序技術(shù)不能完全替代傳統(tǒng)病理診斷，兩者需結(jié)合使用。3.錯誤解析：CFTR與遺傳性耳聾相關性較低，常州地區(qū)常用GJB2檢測。4.正確解析：變異臨床意義注釋是基因測序數(shù)據(jù)分析的重要步驟，常州地區(qū)醫(yī)院嚴格遵循。5.錯誤解析：并非所有腫瘤患者都需要基因測序指導用藥，需根據(jù)病情選擇。6.正確解析：RNA-Seq實驗中需去除rRNA，常州地區(qū)醫(yī)院常用此方法。7.正確解析：LMNA與遺傳性心血管疾病相關性較高，常州地區(qū)醫(yī)院常用檢測。8.錯誤解析：并非所有樣本都需要重復實驗，需根據(jù)實驗設計和結(jié)果判斷。9.錯誤解析：并非所有遺傳病診斷都需要基因測序，需結(jié)合臨床選擇。10.錯誤解析：并非所有變異都需要致病性預測，需根據(jù)臨床需求選擇。四、簡答題答案與解析1.常州市中醫(yī)院基因測序?qū)嶒炇业臉颖局苽淞鞒探馕觯?樣本接收與處理：檢測樣本類型（血液、組織等），評估DNA/RNA濃度和純度。-DNA/RNA提?。菏褂蒙虡I(yè)試劑盒或自建方法提取，純化后檢測質(zhì)量。-文庫構(gòu)建：DNA需末端修復、加A尾、連接接頭；RNA需反轉(zhuǎn)錄成cDNA。-測序文庫質(zhì)檢：使用Qubit和Agilent檢測文庫濃度和復雜度，合格后上機測序。2.常州市中醫(yī)院基因測序數(shù)據(jù)分析的基本步驟解析：-數(shù)據(jù)質(zhì)控：去除低質(zhì)量reads，過濾接頭序列和rRNA。-比對參考基因組：使用BWA或STAR將reads比對到GRCh38等參考基因組。-變異檢測：使用GATK或VarScan檢測SNP和InDel。-變異注釋：使用ANNOVAR或VEP注釋變異功能，預測致病性。3.常州市中醫(yī)院基因測序?qū)嶒灥馁|(zhì)控標準解析：-樣本質(zhì)檢：DNA濃度≥20ng/μL，純度≥80%；RNARIN≥7。-文庫質(zhì)檢：文庫濃度≥2nM，復雜度≥20x。-測序質(zhì)檢：Q30≥80%，比對率≥90%。-數(shù)據(jù)分析質(zhì)控：變異檢測前需比對率≥90%，后處理需過濾低質(zhì)量變異。4.常州市中醫(yī)院基因測序技術(shù)的倫理審查要點解析：-樣本來源需獲得患者知情同意，簽署倫理審查批件。-數(shù)據(jù)隱私保護：患者信息脫敏處理，避免泄露隱私。-變異解讀需謹慎，避免誤導臨床診斷。-家系檢測需考慮遺傳咨詢，避免遺傳歧視。5.常州市中醫(yī)院基因測序技術(shù)在臨床應用中的優(yōu)勢解析：-精準診斷：針對常州地區(qū)高發(fā)的遺傳病，基因測序可提高診斷率。-精準用藥：指導腫瘤靶向用藥，提高療效，常州地區(qū)醫(yī)院常用。-家系篩查：遺傳病家系篩查可早期干預，降低發(fā)病率。-罕見病診斷：解決傳統(tǒng)方法難以診斷的罕見病問題。五、論述題答案與解析1.結(jié)合常州地區(qū)高發(fā)的遺傳病特點，論述基因測序技術(shù)在臨床診斷中的應用價值解析：-常州地區(qū)高發(fā)的遺傳病如地中海貧血、遺傳性耳聾等，基因測序可提高診斷率。-腫瘤精準分型：通過基因測序指導靶向用藥，提高療效。-家系篩查：遺傳病家系篩查可早期干預，降低發(fā)病率。-罕見病診斷：解決傳統(tǒng)方法難以診斷的罕見病問題。-倫理與隱私保護：需嚴格遵循倫理審查，