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文檔簡介
ICS11.020
CCSC04
團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)
T/CPMA030—2023
病原微生物菌(毒)種國家標(biāo)準(zhǔn)株
真菌菌株評價(jià)規(guī)范
Nationalstandardstrainsofpathogenicmicroorganism-
Fungispecificationevaluation
2023-10–XX發(fā)布2023-10-XX實(shí)施
中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會(huì)發(fā)布
T/CPMA030—2023
目次
前言.................................................................................II
1范圍...............................................................................1
2規(guī)范性引用文件.....................................................................1
3術(shù)語和定義.........................................................................1
4基本信息評價(jià).......................................................................1
5生物學(xué)特性評價(jià).....................................................................2
培養(yǎng)信息.......................................................................2
形態(tài)學(xué)特征.....................................................................2
分子信息.......................................................................2
藥敏信息.......................................................................2
生理生化特征...................................................................2
致病性.........................................................................2
6活性評價(jià)...........................................................................2
7穩(wěn)定性評價(jià).........................................................................2
傳代明確、可溯源...............................................................2
培養(yǎng)條件穩(wěn)定...................................................................2
形態(tài)學(xué)特征穩(wěn)定.................................................................2
分子信息穩(wěn)定...................................................................3
藥敏信息穩(wěn)定...................................................................3
8質(zhì)量控制評價(jià).......................................................................3
數(shù)據(jù)質(zhì)量控制...................................................................3
菌株質(zhì)量控制...................................................................3
附錄A4(資料性)病原微生物菌(毒)種國家標(biāo)準(zhǔn)株(真菌菌株)申請?jiān)u價(jià)示例表.............4
參考文獻(xiàn)..............................................................................7
I
T/CPMA030—2023
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
請注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任。
本文件由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院皮膚病醫(yī)院(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院皮膚病研究所)提出。
本文件由中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會(huì)歸口。
本文件起草單位:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院皮膚病醫(yī)院(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院皮膚病研究所)、中國疾病預(yù)防控
制中心、北京大學(xué)第一醫(yī)院、海軍軍醫(yī)大學(xué)長征醫(yī)院、中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所、濟(jì)
寧市第一人民醫(yī)院。
本文件主要起草人:劉維達(dá)、李筱芳、梅嬛、魏強(qiáng)、李若瑜、潘煒華、姜孟楠、龔杰、孔雪、鄭海
林、宋營改、方文捷、史冬梅。
II
T/CPMA030—2023
病原微生物菌(毒)種國家標(biāo)準(zhǔn)株
真菌菌株評價(jià)規(guī)范
1范圍
本文件規(guī)范了人間傳染的真菌國家標(biāo)準(zhǔn)株評價(jià)的技術(shù)要求和質(zhì)量控制規(guī)范。
本文件適用于全國各級人間傳染的病原微生物菌(毒)種保藏機(jī)構(gòu),以及涉及人間傳染的真菌研究、
教學(xué)、檢測、診斷等相關(guān)活動(dòng)的機(jī)構(gòu)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T37864生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求
GB/T7408數(shù)據(jù)元和交換格式信息交換日期和時(shí)間表示法
WS315人間傳染的病原微生物菌(毒)種保藏機(jī)構(gòu)設(shè)置技術(shù)規(guī)范
WS/T812病原微生物菌(毒)種國家標(biāo)準(zhǔn)株評價(jià)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)
T/CPMA011病原微生物菌(毒)種保藏?cái)?shù)據(jù)描述通則
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
病原微生物pathogenicmicroorganisms
可以侵犯人、動(dòng)物,引起其感染甚至傳染病的微生物。
注:包括病毒、細(xì)菌、真菌、立克次體等。
[來源:WS/T812-2022,3.1]
真菌fungi
一類具有真核、可產(chǎn)孢、無葉綠體的,以寄生或者腐生方式進(jìn)行異養(yǎng)生存,進(jìn)行有性或/和無性繁
殖,可以單細(xì)胞或分枝分隔的絲狀體存在的微生物。
國家標(biāo)準(zhǔn)株nationalstandardstrains
具有該菌(毒)種典型生物學(xué)特征,遺傳學(xué)特性得到確認(rèn)和保證、可追溯,且能反映該種及其亞種、
型的代表性,由國家病原微生物保藏中心分中心復(fù)核、鑒定,并給予國家保藏編號的菌(毒)株。
[來源:WS/T812-2022,3.4]
評價(jià)evaluation
確定菌(毒)株是否符合國家標(biāo)準(zhǔn)株相關(guān)要求的過程。
4基本信息評價(jià)
國家標(biāo)準(zhǔn)株評價(jià)的基本要求應(yīng)符合WS/T812。
菌株相關(guān)基礎(chǔ)信息完整,應(yīng)包括菌株的原始編號、保藏編號、中文名稱、拉丁名稱、分離部位、
分離時(shí)間、分離地點(diǎn)、來源歷史、所致疾病名稱等。
注:已經(jīng)明確為國際培養(yǎng)物保藏單位(InternationalDepositoryAuthorities,簡稱IDA)等機(jī)構(gòu)收錄菌種,其信
1
T/CPMA030—2023
息應(yīng)溯源至該國際標(biāo)準(zhǔn)株保藏單位的菌株編號,如在原始編號處體現(xiàn)“=ATCCXXX”。
菌株背景可溯源,可提供菌株其他相關(guān)信息:如患者情況、遞送者、代次信息等。
注:對于4.1及4.2中部分信息不完整,但具有重要保藏價(jià)值的菌(毒)株,根據(jù)具體情況確定。
應(yīng)根據(jù)《人間傳染的病原微生物目錄》,明確該菌株的危害程度分類級別。
注:未在目錄中的菌種不做要求。
應(yīng)經(jīng)國家病原微生物保藏中心分中心全面鑒定,明確分類學(xué)地位,具備某種菌種的特性。
應(yīng)提供代表性信息,即該菌株典型的生物學(xué)特征或遺傳學(xué)特性的描述,如臨床首報(bào)、血清型、基
因型、有性型、基因變異株、耐藥性等。
5生物學(xué)特性評價(jià)
培養(yǎng)信息
應(yīng)具有菌株合適的培養(yǎng)條件,如培養(yǎng)溫度范圍、培養(yǎng)時(shí)間、適用培養(yǎng)基等(注明是否添加額外營養(yǎng)
物質(zhì)或抗生素等)。
形態(tài)學(xué)特征
應(yīng)具有全面的形態(tài)學(xué)描述并配備典型圖片,包括不同培養(yǎng)基或培養(yǎng)溫度條件下菌落的形態(tài)、質(zhì)地、
顏色、菌落直徑,鏡下的菌絲形態(tài)、產(chǎn)孢特征、孢子形態(tài)等。
分子信息
應(yīng)具有分子生物學(xué)鑒定信息,如全基因組序列信息,或系統(tǒng)分類鑒定時(shí)通用的靶基因序列信息等。
藥敏信息
可具有該菌株的抗真菌藥物譜敏感信息。如菌株為耐藥株,應(yīng)必須提供藥敏信息且確保其穩(wěn)定耐受
單一或多種抗真菌藥物。
生理生化特征
可具有該菌株生理生化反應(yīng)的特征性數(shù)據(jù),如糖同化試驗(yàn)、糖發(fā)酵試驗(yàn)、尿素酶試驗(yàn)等。
致病性
應(yīng)明確菌株的致病性或標(biāo)注所致疾病的名稱,且附注支持性文獻(xiàn)。
6活性評價(jià)
應(yīng)具有生長、繁殖能力。
應(yīng)具有特定條件下長期、穩(wěn)定存活的能力,且在保存周期內(nèi)可復(fù)蘇及擴(kuò)增培養(yǎng)。
培養(yǎng)后濃度能達(dá)到相應(yīng)實(shí)驗(yàn)功能的需求。
7穩(wěn)定性評價(jià)
傳代明確、可溯源
在提交保藏機(jī)構(gòu)鑒定并記錄生物學(xué)特性前,原則上傳代不超過5代。傳代信息應(yīng)包含代次、傳代時(shí)
間、傳代培養(yǎng)條件等信息。
培養(yǎng)條件穩(wěn)定
不同代次的菌株在復(fù)蘇及傳代過程中所涉及的培養(yǎng)基、培養(yǎng)溫度、pH值、氧需求程度等培養(yǎng)條件應(yīng)
一致。
形態(tài)學(xué)特征穩(wěn)定
2
T/CPMA030—2023
不同代次的菌株應(yīng)保持形態(tài)特征相對穩(wěn)定,如鏡下結(jié)構(gòu)、菌落形態(tài)、產(chǎn)色素等情況應(yīng)落在文獻(xiàn)支持
的變化范圍內(nèi)。
分子信息穩(wěn)定
不同代次的菌株其靶基因序列應(yīng)一致。
藥敏信息穩(wěn)定
不同代次菌株的抗真菌藥物敏感性數(shù)據(jù)應(yīng)穩(wěn)定。
8質(zhì)量控制評價(jià)
數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
8.1.1過程記錄
國家標(biāo)準(zhǔn)株的接收、鑒定、制備、保存等環(huán)節(jié)應(yīng)可溯源,參照GB/T37864及WS315執(zhí)行。
8.1.2時(shí)間記錄
關(guān)鍵階段的日期應(yīng)按照標(biāo)準(zhǔn)時(shí)間格式進(jìn)行記錄,如保藏時(shí)間、傳代時(shí)間,日期和時(shí)間記錄參照國標(biāo)
GB/T7408的規(guī)定。
8.1.3數(shù)據(jù)受控
數(shù)據(jù)的紙質(zhì)記錄和電子記錄應(yīng)受控,設(shè)置數(shù)據(jù)瀏覽和修改等級權(quán)限并具備溯源能力。
8.1.4信息公布
國家標(biāo)準(zhǔn)株相關(guān)信息應(yīng)制定成文并有限公布。
菌株質(zhì)量控制
8.2.1純培養(yǎng)物
菌株應(yīng)是純培養(yǎng)物,無雜菌等外源因子污染。
8.2.2制備和保存的過程、方法受控
制定菌株制備和保存過程的程序控制文件,鑒定、擴(kuò)增、保存等技術(shù)方法應(yīng)依據(jù)可循證方法(國際、
國內(nèi)公開共識(shí)的標(biāo)準(zhǔn)或方法)制定,進(jìn)行必要的室間比對(能力驗(yàn)證)等。
8.2.3多形式冗余備份
國家標(biāo)準(zhǔn)株應(yīng)采用2種及以上保藏形式進(jìn)行冗余備份。
8.2.4定期抽檢
需定期抽樣檢查,以確定菌株的活力和純度,并記錄抽查結(jié)果。
3
T/CPMA030—2023
A
A
附錄A
(資料性)
病原微生物菌(毒)種國家標(biāo)準(zhǔn)株(真菌菌株)申請?jiān)u價(jià)示例表
病原微生物菌(毒)種國家標(biāo)準(zhǔn)株(真菌菌株)申請?jiān)u價(jià)示例見表A.1
表A.1病原微生物菌(毒)種國家標(biāo)準(zhǔn)株(真菌菌株)申請?jiān)u價(jià)示例表
信息說明
中文名稱*馬爾尼菲籃狀菌
拉丁名稱*Talaromycesmarneffei
[生物]分類學(xué)*發(fā)菌科-籃狀菌屬(Trichocomaceae-Talaromyces)
生物危害程度*第三類BSL-2
模式株*否
原始編號*B33v
分離時(shí)間*2017-01-11
分離地點(diǎn)*中國江蘇省南京市
分離部位*患者,血液
致病對象*人、動(dòng)物
基本所致疾病名稱*馬爾尼菲籃狀菌病
背景信息
信息傳播方式*接觸傳播、空氣傳播
←中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原微生物菌(毒)種保藏中心醫(yī)學(xué)真菌分中心←東部戰(zhàn)
來源歷史*
區(qū)總醫(yī)院
患者情況男,53歲,安徽籍,腎移植患者
遞送者基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室
代次信息SDA培養(yǎng)基,2次傳代,最后一次傳代時(shí)間:2021-10-15
保藏編號*CAMS-CCPM-D02998
資源庫編號NPRC3.8.128
保藏信息保藏時(shí)間*2017-1-20
室溫斜面保存-80°C深低溫保存
保藏形式a
液氮冷凍保存冷凍干燥保存其他()
25℃~37℃均能生長;其中在25℃培養(yǎng)條件下為菌絲相,在37℃培養(yǎng)條件下為
培養(yǎng)溫度*
酵母相;
培養(yǎng)
培養(yǎng)時(shí)間*3d~7d
信息
馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA)、沙氏葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(SDA)、麥芽浸
適用培養(yǎng)基*
膏瓊脂培養(yǎng)基(MEA)
在SDA/PDA培養(yǎng)基上37℃培養(yǎng)時(shí)呈白色酵母樣菌落,48小時(shí)菌落直徑約1cm-
菌落特征*2cm。在27℃PDA培養(yǎng)基上形成平坦、緊密的絲狀菌落,會(huì)產(chǎn)生紅色、橘色等
色素。
鏡下部分菌絲螺旋狀,分生孢子梗匍匐或呈束狀,
菌絲形態(tài)b
(70-150)μm×(2.5-3.0)μm。
產(chǎn)孢特征及27℃PDA培養(yǎng)為帚狀枝雙輪生,分生孢子橢球形,壁光滑,(2.5-4.0)μm×
孢子形態(tài)*(2-3)μm,單細(xì)胞,呈短鏈排列。37℃酵母態(tài)時(shí)形成橢圓形、長形孢子。
生物
學(xué)信形態(tài)學(xué)特征
息
形態(tài)圖片*
PDA,27℃孵育7d
4
T/CPMA030—2023
信息說明
PDA,27℃孵育7d,棉蘭染色,×400
CTTCCCGGTTAAGGGTGACCTGCGGAAGGATCATTACCGAGTGCGGGCCCTCGCGGCCC
AACCTCCCCCCCCTTGTCTCTATACACCTGTTGCTTTGGCGGGCCCACCGGGGCCACCC
GGTCGCCGGGGGACGTTTGTCCCCGGGCCCGCGCCCGCCGAAGCGCCCTGTGAACCCTG
ATGAAGATGGACTGTCTGAGTACCATGAAAATTGTCAAAACTTTCAACAATGGATCTCT
TGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAAT
ITS區(qū)
TCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGCATTCCGGGGGGCATG
CCTGTCCGAGCGTCATTTCTGCCCTCAAGCACGGCTTGTGTGTTGGGTGTGGTCCCTCC
GGGGACCTGCCCGAAAGGCAGCGGCGACGTCCGTCTGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTCT
GTCACTCGCTCGGGAAGGACCTGCGGGGGTTGGTCACCACCATATTTACCACGGTTGAC
靶基因序列信息
CTCGGATCAGGTAGGAGTTACCCGCTGAACTTAAGCATATCAAAAGCCCGGAGGAAA
分子信息*c
TGGTAACCCAAAAACGGTGCTGCTTTCTGGTGAGTTTGGCTCTCAACAAACACATCACA
ACTTTCAGTCACTTGTCGCGACAACACGCTGACTCTTTTCCAGGCAAATCATCTCCGCC
GAGCACGGCCTCGACGGCTCCGGTGTGTAAGTATTACACGATTCAAATCCAGCTACAAT
CCGACAATTATCTGATGATCAACAGCTACAATGGCTCCTCCGACCTCCAGTTGGAGCGT
BenA區(qū)ATGAACGTTTACTTCAACGAGGTGCGTCAGACCCTTCCACCTAATAAACCGAAGACGAA
CTCATCATCATCGATATAGGCTTCCGGCAACAAATATGTCCCCCGTGCTGTCCTCGTCG
ACTTGGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGCGCTGGTCCTTTTGGTCAGCTCTTCCGT
CCCGACAACTTTGTTTTCGGTCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACAA
CTTTTGAAGGGTAA
全基因組序列無
生理生化特征無
藥敏信息d無
臨床首報(bào)無
血清型無
代表基因型無
性信有性型/無性型無
息e基因變異株無
耐藥性無
其它特征血液分離株
生長、繁殖能力是否(備注:)
活性
保存周期內(nèi)穩(wěn)定存活能力是否(備注:)
*
培養(yǎng)后濃度達(dá)到功能需求能力是否(備注:)
傳代明確可溯源是否(備注:見背景信息部分)
不同代次菌株培養(yǎng)條件穩(wěn)定是否(備注:見培養(yǎng)信息部分)
穩(wěn)定
不同代次菌株形態(tài)學(xué)特征穩(wěn)定是否(備注:見形態(tài)學(xué)特征部分)
性*
不同代次菌株分子信息穩(wěn)定是否(備注:見靶基因序列信息部分)
不同代次菌株抗真菌藥物敏感信息
是否(備注:未檢測)
穩(wěn)定d
5
T/CPMA030—2023
信息說明
[1]Wortman,P.D.InfectionwithPenicilliummarneffei.IntJDermatol.1996,Jun;35(6):393-399
[2]NVanittanakom,TSirisanthana.Penicilliummarneffeiinfectioninpatientsinfectedwithhuman
immunodeficiencyvirus.CurrTopMedMycol.1997Dec;8(1-2):35-42
[3]SSWong,TYHo,AHNgan,
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