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文檔簡(jiǎn)介
昆蟲行為轉(zhuǎn)錄組研究方案一、研究概述
昆蟲行為轉(zhuǎn)錄組研究旨在通過高通量測(cè)序技術(shù)解析特定行為(如覓食、繁殖、遷徙等)相關(guān)的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制。本研究方案涵蓋實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣本采集、數(shù)據(jù)分析和功能驗(yàn)證等關(guān)鍵環(huán)節(jié),以期為昆蟲行為學(xué)、遺傳學(xué)和生態(tài)學(xué)提供分子生物學(xué)層面的理論支持。
二、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
(一)研究目標(biāo)
1.解析目標(biāo)行為(如社會(huì)性行為)的關(guān)鍵基因集
2.闡明行為調(diào)控相關(guān)信號(hào)通路和代謝網(wǎng)絡(luò)
3.評(píng)估環(huán)境因素對(duì)行為轉(zhuǎn)錄組的影響
(二)實(shí)驗(yàn)對(duì)象選擇
1.目標(biāo)昆蟲種類:選擇具有典型行為特征且易于培養(yǎng)的物種(如果蠅Drosophilamelanogaster或蜜蜂Apismellifera)
2.實(shí)驗(yàn)分組:
(1)行為處理組:模擬特定行為(如群體互動(dòng)、信息素暴露)
(2)對(duì)照組:未受行為刺激的靜息狀態(tài)樣本
(3)環(huán)境對(duì)照組:不同溫度/濕度條件下的樣本
三、樣本采集與處理
(一)樣本采集流程
1.行為誘導(dǎo):
(1)社會(huì)行為:設(shè)置群體密度梯度實(shí)驗(yàn)(密度范圍:5-50只/平方厘米)
(2)信息素刺激:使用濃度梯度(0.1-100ng/μL)進(jìn)行暴露實(shí)驗(yàn)
2.樣本采集:
(1)快速麻醉后置于液氮中速凍
(2)分部位取樣(腦、卵巢、肌肉等關(guān)鍵組織)
(3)樣本分裝:每份≤50毫克,標(biāo)記行為狀態(tài)和時(shí)間點(diǎn)
(二)RNA提取與質(zhì)量檢測(cè)
1.提取方法:采用TRIzol法或試劑盒法(如RNeasyMiniKit)
2.質(zhì)量控制:
(1)OD260/280比值:1.8-2.0
(2)RIN值:≥7.0(使用AgilentBioanalyzer檢測(cè))
四、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與分析
(一)文庫構(gòu)建
1.mRNA富集:基于Oligo(dT)磁珠分離
2.文庫指標(biāo):
(1)理想片段長(zhǎng)度:200-300bp
(2)平衡度:雙端測(cè)序比例≥70%
(二)數(shù)據(jù)分析流程
1.數(shù)據(jù)預(yù)處理:
(1)去除接頭序列和低質(zhì)量讀長(zhǎng)
(2)對(duì)齊參考基因組(如果蠅基因組DM6)
2.差異表達(dá)分析:
(1)FPKM值計(jì)算
(2)DESeq2包進(jìn)行p值校正(FDR<0.05)
3.功能注釋:
(1)BLAST比對(duì)KEGG數(shù)據(jù)庫
(2)GO富集分析(如GO:0009987行為調(diào)控)
五、實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
(一)qRT-PCR驗(yàn)證
1.引物設(shè)計(jì):選擇差異倍數(shù)>2且p<0.01的基因
2.實(shí)驗(yàn)條件:
(1)熒光染料:SYBRGreenI
(2)火山圖繪制:ΔΔCt法計(jì)算表達(dá)倍數(shù)
(二)基因功能驗(yàn)證
1.RNA干擾:構(gòu)建gRNA表達(dá)載體(如CRISPR/Cas9系統(tǒng))
2.表型觀察:記錄行為變化(如攻擊性/協(xié)作性評(píng)分)
六、預(yù)期成果
1.獲得至少50個(gè)行為特異性表達(dá)基因
2.構(gòu)建核心行為調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖
3.驗(yàn)證至少3個(gè)關(guān)鍵基因的功能關(guān)聯(lián)性
七、注意事項(xiàng)
1.樣本采集需在無菌條件下操作
2.測(cè)序數(shù)據(jù)需進(jìn)行多重重復(fù)驗(yàn)證
3.基因命名采用標(biāo)準(zhǔn)基因ID(如FBgn)
一、研究概述
昆蟲行為轉(zhuǎn)錄組研究旨在通過高通量測(cè)序技術(shù)解析特定行為(如覓食、繁殖、遷徙等)相關(guān)的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制。本研究方案涵蓋實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣本采集、數(shù)據(jù)分析和功能驗(yàn)證等關(guān)鍵環(huán)節(jié),以期為昆蟲行為學(xué)、遺傳學(xué)和生態(tài)學(xué)提供分子生物學(xué)層面的理論支持。通過系統(tǒng)性地比較不同行為狀態(tài)下昆蟲組織的基因表達(dá)譜,可以識(shí)別與行為直接相關(guān)的候選基因、信號(hào)通路和代謝網(wǎng)絡(luò),進(jìn)而深入理解行為的分子基礎(chǔ)和進(jìn)化機(jī)制。本研究的實(shí)施將依賴于現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù),特別是高通量RNA測(cè)序(RNA-Seq),并結(jié)合生物信息學(xué)分析方法,最終目標(biāo)是建立行為-基因-環(huán)境的關(guān)聯(lián)模型。
二、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
(一)研究目標(biāo)
1.解析目標(biāo)行為(如社會(huì)性行為)的關(guān)鍵基因集:通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選在特定行為處理組與對(duì)照組之間顯著差異表達(dá)的基因,重點(diǎn)關(guān)注上調(diào)或下調(diào)倍數(shù)大于2且統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(p值或FDR)小于0.05的基因,構(gòu)建行為特異性表達(dá)基因庫。
2.闡明行為調(diào)控相關(guān)信號(hào)通路和代謝網(wǎng)絡(luò):利用KEGG、Reactome等公共數(shù)據(jù)庫,對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行通路富集分析,識(shí)別與行為相關(guān)的核心信號(hào)通路(如神經(jīng)遞質(zhì)信號(hào)通路、激素信號(hào)通路)和代謝途徑(如能量代謝、神經(jīng)遞質(zhì)合成通路),繪制行為調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖。
3.評(píng)估環(huán)境因素對(duì)行為轉(zhuǎn)錄組的影響:比較不同環(huán)境條件(如溫度梯度10-30°C,濕度梯度40%-80%)下昆蟲樣本的轉(zhuǎn)錄組差異,分析環(huán)境因子對(duì)行為相關(guān)基因表達(dá)模式的調(diào)節(jié)作用,探究環(huán)境適應(yīng)的分子機(jī)制。
(二)實(shí)驗(yàn)對(duì)象選擇
1.目標(biāo)昆蟲種類:選擇具有典型行為特征且易于培養(yǎng)、遺傳背景清晰、基因組信息完善的物種。例如,果蠅Drosophilamelanogaster(模式生物,基因組注釋完善,行為研究深入)或蜜蜂Apismellifera(社會(huì)性昆蟲,行為復(fù)雜多樣)。選擇依據(jù)應(yīng)包括物種的可操作性、研究相關(guān)性的文獻(xiàn)積累以及實(shí)驗(yàn)資源的可獲得性。
2.實(shí)驗(yàn)分組:
(1)行為處理組:設(shè)計(jì)能夠有效誘導(dǎo)目標(biāo)行為的實(shí)驗(yàn)范式。例如:
-社會(huì)性行為:設(shè)置不同密度梯度的群體培養(yǎng)皿(如5只/平方厘米、20只/平方厘米、50只/平方厘米),收集特定時(shí)間點(diǎn)(如處理后1小時(shí)、6小時(shí)、24小時(shí))的腦或特定社會(huì)相關(guān)組織;或構(gòu)建同源/異源群體混合實(shí)驗(yàn),觀察排斥/融合反應(yīng)。
-信息素刺激:使用已知行為效應(yīng)的昆蟲信息素(如性信息素、聚集信息素),設(shè)置梯度濃度系列(如0.1ng/μL、1ng/μL、10ng/μL、100ng/μL),暴露時(shí)間設(shè)定為1小時(shí)或6小時(shí),收集處理后的樣本。
-覓食行為:針對(duì)特定食物源(如糖水、酵母提取物)進(jìn)行剝奪-供給實(shí)驗(yàn),比較饑餓組和供給組頭部組織的表達(dá)差異。
(2)對(duì)照組:設(shè)立必要的生物學(xué)和操作對(duì)照組,以排除非行為因素的干擾:
-生物學(xué)重復(fù):每個(gè)處理組設(shè)置至少3個(gè)生物學(xué)重復(fù),確保結(jié)果的可靠性。
-時(shí)間對(duì)照:在行為處理開始時(shí)即采集樣本,作為0時(shí)點(diǎn)對(duì)照,用于監(jiān)測(cè)基因表達(dá)的時(shí)間動(dòng)態(tài)。
-載體對(duì)照:在基因功能驗(yàn)證的RNA干擾實(shí)驗(yàn)中,使用不含gRNA的載體作為陰性對(duì)照。
-靜息對(duì)照組:選取未接受任何特定行為刺激、處于常規(guī)飼養(yǎng)環(huán)境下的昆蟲組織作為總體表達(dá)水平的參照。
(3)環(huán)境對(duì)照組:為了研究環(huán)境因素本身的影響,可額外設(shè)置僅在環(huán)境條件(溫度、濕度)改變但無行為刺激的組別,與行為處理組進(jìn)行對(duì)比,區(qū)分行為誘導(dǎo)效應(yīng)與環(huán)境效應(yīng)。
三、樣本采集與處理
(一)樣本采集流程
1.行為誘導(dǎo):
(1)社會(huì)行為:對(duì)于果蠅,可在直徑90mm的培養(yǎng)皿中設(shè)置不同密度的同源群體(如野生型或特定品系);對(duì)于蜜蜂,可在標(biāo)準(zhǔn)化巢框中設(shè)置不同規(guī)模的蜂群。行為觀察需在恒定的光照和溫濕度條件下進(jìn)行,使用行為學(xué)評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)記錄攻擊頻率、清潔行為等指標(biāo),確保持續(xù)刺激效果。
(2)信息素刺激:采用頂空捕集法或直接點(diǎn)滴法施加信息素。頂空法需使用密閉容器,通過更換含有不同濃度信息素的濾紙條進(jìn)行梯度設(shè)置;點(diǎn)滴法需精確控制信息素溶液的體積。刺激后需確保持素能在樣本采集前達(dá)到穩(wěn)定濃度。
2.樣本采集:在行為誘導(dǎo)結(jié)束后,迅速進(jìn)行樣本采集以捕捉動(dòng)態(tài)變化的基因表達(dá):
(1)快速麻醉:將昆蟲置于盛有少量雪片(干冰+乙醇)的密閉容器中短暫麻醉,避免劇烈運(yùn)動(dòng)導(dǎo)致的生理應(yīng)激。麻醉時(shí)間嚴(yán)格控制在1分鐘以內(nèi)。
(2)組織分離:根據(jù)研究需求,精確分離目標(biāo)組織。例如,果蠅腦部分離需在解剖鏡下進(jìn)行,沿頭部中線縱向切開,剝離頭部外殼,取出整個(gè)腦組織;對(duì)于蜜蜂,需分離頭部(包括腦、觸角、復(fù)眼)和卵巢。操作過程中使用無RNase的解剖針和吸水紙。
(3)樣本分裝:將每個(gè)昆蟲個(gè)體的特定組織放入預(yù)冷的RNA提取管中,每個(gè)管子包含1-50毫克的組織樣本(根據(jù)后續(xù)提取試劑盒要求),立即標(biāo)記清晰的實(shí)驗(yàn)標(biāo)識(shí)(組別、時(shí)間點(diǎn)、重復(fù)編號(hào))??焖俎D(zhuǎn)移至液氮中速凍,或直接投入-80°C冰箱冷凍保存。
(二)RNA提取與質(zhì)量檢測(cè)
1.提取方法:
(1)TRIzol法:適用于少量組織或混合組織的快速提取。操作步驟包括:加入TRIzol試劑,裂解組織;加入氯仿,混合后靜置,離心分離有機(jī)相;將水相轉(zhuǎn)移至新的離心管,加入異丙醇,-20°C沉淀RNA;洗滌RNA沉淀,干燥后用DEPC水溶解。
(2)試劑盒法(如RNeasyMini/MidKit):適用于標(biāo)準(zhǔn)化流程操作。操作步驟包括:使用裂解緩沖液(含DTT)裂解組織并homogenize;加入苯酚-氯仿,去除蛋白質(zhì);使用離心柱純化RNA;使用無RNase水洗脫RNA。選擇哪種方法取決于樣本量、純度和后續(xù)實(shí)驗(yàn)要求。
2.質(zhì)量控制:
(1)OD260/280比值:使用分光光度計(jì)(如NanoDrop)測(cè)定RNA樣品的吸光度。理想OD260/280比值應(yīng)在1.8-2.0之間,表明RNA純度良好,無蛋白質(zhì)或酚類污染物。OD260/230比值也建議檢測(cè)(應(yīng)>2.0),以評(píng)估鹽分和酚類污染。
(2)RIN值(RNAIntegrityNumber):使用AgilentBioanalyzer和對(duì)應(yīng)的RNATapeStation試劑盒進(jìn)行檢測(cè)。RIN值范圍0-10,數(shù)值越高表示RNA質(zhì)量越好。對(duì)于轉(zhuǎn)錄組研究,通常要求RIN值≥7.0,表明RNA片段完整,適合進(jìn)行高通量測(cè)序。需檢查RNA降解曲線,確保不存在明顯的降解峰。
(3)理化指標(biāo):通過1%瓊脂糖凝膠電泳觀察RNA條帶,應(yīng)能看到清晰的18S和28SrRNA條帶,且主條帶銳利,表明RNA完整性良好。同時(shí)記錄RNA濃度(通常以ng/μL表示)。
四、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與分析
(一)文庫構(gòu)建
1.mRNA富集:使用Oligo(dT)磁珠或反轉(zhuǎn)錄試劑盒(如SMARTer?RNAKit)從總RNA中特異性富集poly(A)+mRNA。
(1)Oligo(dT)磁珠法:將含Oligo(dT)的磁珠與poly(A)+mRNA混合,mRNA會(huì)結(jié)合到磁珠上。通過磁力分離,去除未結(jié)合的RNA和其他雜質(zhì)。洗滌磁珠后,即可用于后續(xù)的cDNA合成。
(2)SMARTer?反轉(zhuǎn)錄法:利用SMART(SwitchingMechanismat5'endofRNATemplate)技術(shù),在mRNA5'端添加一個(gè)可選擇的RNA引物結(jié)合位點(diǎn),并延長(zhǎng)形成一個(gè)長(zhǎng)鏈cDNA,便于后續(xù)的片段化。
2.文庫指標(biāo):根據(jù)目標(biāo)物種和測(cè)序平臺(tái)要求,優(yōu)化文庫構(gòu)建參數(shù)。
(1)理想片段長(zhǎng)度:對(duì)于Illumina平臺(tái),通常構(gòu)建插入片段長(zhǎng)度(InsertSize)在200-300bp左右的文庫??赏ㄟ^調(diào)整反轉(zhuǎn)錄酶濃度、片段化方法(如隨機(jī)打斷或超聲處理)來控制片段大小。
(2)平衡度:確保文庫中雙端測(cè)序讀長(zhǎng)(Paired-endReads)能夠良好對(duì)齊,且兩端讀長(zhǎng)對(duì)齊質(zhì)量相似。理想情況下,雙端對(duì)齊率應(yīng)≥70%,且兩端對(duì)齊長(zhǎng)度的差異較小??赏ㄟ^評(píng)估文庫的插入特異性(如通過Bowtie等軟件對(duì)齊到模擬基因組或僅對(duì)齊第一端讀長(zhǎng))來衡量平衡度。
3.文庫定量與檢測(cè)試驗(yàn):
(1)定量:使用Qubit熒光計(jì)或KAPALibraryQuantificationKit精確定量cDNA文庫濃度。
(2)檢測(cè):使用AgilentBioanalyzer和D1000TapeStation檢測(cè)文庫的片段大小分布和濃度,確保符合測(cè)序平臺(tái)的要求。
(二)數(shù)據(jù)分析流程
1.數(shù)據(jù)預(yù)處理:
(1)去除接頭序列和低質(zhì)量讀長(zhǎng):使用Trimmomatic或Cutadapt等工具,去除測(cè)序接頭、引物序列,并根據(jù)質(zhì)量閾值(如Q值<20)剔除低質(zhì)量讀長(zhǎng)(如3'端讀長(zhǎng)質(zhì)量低于指定值)。對(duì)于雙端測(cè)序,還需檢查配對(duì)讀長(zhǎng)之間的距離是否符合預(yù)期(如IlluminaHiSeq通常為150-200bp),剔除異常距離的讀長(zhǎng)。
(2)對(duì)齊參考基因組:將預(yù)處理后的讀長(zhǎng)比對(duì)到目標(biāo)物種的參考基因組(如果蠅DM6基因組)或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(如EnsemblmRNA)。常用工具包括Hisat2或STAR。比對(duì)時(shí)需指定合適的參數(shù)(如splicedalignment參數(shù)),并去除無法對(duì)齊或?qū)R到非目標(biāo)區(qū)域(如基因組注釋外)的讀長(zhǎng)。生成比對(duì)文件(如SAM/BAM格式)。
2.差異表達(dá)分析:
(1)FPKM/TPM計(jì)算:使用featureCounts或HTSeq-count等工具統(tǒng)計(jì)每個(gè)基因在不同樣本中的讀長(zhǎng)數(shù)量。隨后計(jì)算FPKM(FragmentsPerKilobaseoftranscriptperMillionfragmentsmapped)或TPM(TranscriptsPerMillion)值,以標(biāo)準(zhǔn)化基因表達(dá)量,消除樣本大小和基因長(zhǎng)度差異的影響。
(2)差異表達(dá)基因篩選:使用DESeq2或edgeR等R語言包進(jìn)行差異表達(dá)分析。模型中需指定樣本分組和設(shè)計(jì)矩陣。計(jì)算基因表達(dá)差異的倍數(shù)變化(FoldChange,FC)和統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(如p值或FDR,通常設(shè)為0.05)。篩選出在特定組別(如行為處理組vs對(duì)照組)中表達(dá)顯著變化的基因(如|FC|>2,FDR<0.05)。
3.功能注釋與分析:
(1)基因ID映射與注釋:將篩選出的差異表達(dá)基因ID映射到通用基因標(biāo)識(shí)符(如GeneSymbol、EnsemblID),并利用BioMart或ENSEMBL等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行功能注釋,獲取基因的基本信息。
(2)GO富集分析:使用GOseq或g:Profiler等工具,對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO(GeneOntology)術(shù)語富集分析,包括生物過程(BP)、細(xì)胞組分(CC)和分子功能(MF)三個(gè)方面。評(píng)估顯著富集的GO術(shù)語,以揭示差異表達(dá)基因在生物學(xué)功能上的共性。例如,可能發(fā)現(xiàn)一組基因顯著富集在“行為調(diào)控”或“神經(jīng)元活性”等BP術(shù)語中。
(3)KEGG通路富集分析:使用KEGGMapper或KOBAS等工具,對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)通路富集分析,識(shí)別這些基因參與的信號(hào)通路和代謝網(wǎng)絡(luò)。例如,可能發(fā)現(xiàn)一組基因富集在“神經(jīng)遞質(zhì)受體”通路或“能量代謝”通路中。
(4)通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建:整合GO和KEGG分析結(jié)果,構(gòu)建行為調(diào)控相關(guān)的基因-功能-通路網(wǎng)絡(luò)圖,可視化展示基因表達(dá)變化背后的生物學(xué)機(jī)制。
五、實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
(一)qRT-PCR驗(yàn)證
1.引物設(shè)計(jì):從差異表達(dá)基因列表中,選擇表達(dá)變化顯著(|FC|>4)、統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著(FDR<0.01)且無明顯引物二聚體或非特異性結(jié)合的基因(通常選擇3-5個(gè))。使用Primer-BLAST在線工具設(shè)計(jì)特異性引物,確保引物位于不同的外顯子上(如果可能),以檢測(cè)RNA剪接異構(gòu)體。引物設(shè)計(jì)完成后,通過Geneious或Primer3軟件評(píng)估引物特異性(Tm值通常在55-65°C)。
2.實(shí)驗(yàn)條件:
(1)cDNA合成:使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(如PrimeScriptRTReagentKit)將總RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,反應(yīng)體系需包含RNA模板、反轉(zhuǎn)錄酶、dNTPs、隨機(jī)引物等。設(shè)置無模板對(duì)照(NTC)以檢測(cè)基因組DNA污染。每個(gè)樣本進(jìn)行3個(gè)技術(shù)重復(fù)。
(2)qPCR反應(yīng):使用SYBRGreenI熒光染料法或TaqMan探針法在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(如ABIQuantStudio系列)上進(jìn)行。反應(yīng)體系包含cDNA模板、上下游引物(或探針)、SYBRGreenMasterMix(或TaqManMasterMix)。設(shè)置合適的循環(huán)參數(shù)(如預(yù)變性、變性、退火/延伸)。使用β-actin或GAPDH等內(nèi)參基因進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。
(3)數(shù)據(jù)分析:采用2^-ΔΔCt法計(jì)算目的基因相對(duì)于內(nèi)參基因在不同處理組間的相對(duì)表達(dá)倍數(shù)。使用GraphPadPrism或Excel繪制箱線圖展示結(jié)果,進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)(如t檢驗(yàn)或ANOVA)。
(二)基因功能驗(yàn)證
1.RNA干擾(RNAi):針對(duì)qRT-PCR驗(yàn)證中確認(rèn)的關(guān)鍵差異表達(dá)基因,設(shè)計(jì)并構(gòu)建gRNA表達(dá)載體(如基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的sgRNA表達(dá)盒)。通過顯微注射或基因槍等方法將gRNA表達(dá)載體導(dǎo)入昆蟲胚胎或幼蟲中(根據(jù)物種選擇合適的實(shí)驗(yàn)系統(tǒng))。
(1)gRNA設(shè)計(jì):使用CRISPRonline或CHOPCHOP等在線工具設(shè)計(jì)高效的gRNA序列,避免脫靶效應(yīng)。合成gRNA表達(dá)質(zhì)粒。
(2)載體轉(zhuǎn)染:選擇合適的轉(zhuǎn)染方法(如電穿孔、脂質(zhì)體介導(dǎo)),將gRNA表達(dá)質(zhì)粒導(dǎo)入昆蟲細(xì)胞或胚胎。
2.表型觀察與行為學(xué)分析:
(1)轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證:通過PCR或測(cè)序檢測(cè)gRNA在目標(biāo)昆蟲中的成功導(dǎo)入和切割效率。
(2)行為表型:在轉(zhuǎn)染gRNA的昆蟲個(gè)體中,觀察并記錄目標(biāo)行為的改變。例如,對(duì)于攻擊性相關(guān)的基因,可以測(cè)量同籠飼養(yǎng)時(shí)的攻擊次數(shù)、攻擊持續(xù)時(shí)間;對(duì)于社會(huì)性相關(guān)的基因,可以觀察群體中的合作行為頻率、信息素反應(yīng)閾值等。
(3)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì):使用非參數(shù)檢驗(yàn)(如Mann-WhitneyU檢驗(yàn))或參數(shù)檢驗(yàn)(如t檢驗(yàn))比較RNAi處理組與對(duì)照(如空載體對(duì)照組)在行為指標(biāo)上的差異。
六、預(yù)期成果
1.獲得至少50個(gè)行為特異性表達(dá)基因:通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和差異表達(dá)分析,篩選出在目標(biāo)行為處理組中相對(duì)于
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