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文檔簡介
ICS65.020.30
CCSB44
15
內(nèi)蒙古自治區(qū)地方標(biāo)準(zhǔn)
DB15/T2407—2021
興羔肉羊分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)規(guī)程
Technicalcodeofbreedingpracticewithmolecularmarkerassisted
selectionforXinggaomuttonsheep
2021-10-15發(fā)布2021-11-15實施
內(nèi)蒙古自治區(qū)市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB15/T2407—2021
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件由內(nèi)蒙古自治區(qū)畜牧業(yè)標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)委員會(SAM/TC19)歸口。
本文件起草單位:內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院、內(nèi)蒙古賽諾種羊科技有限公司、內(nèi)蒙古杜美牧業(yè)生
物科技有限公司。
本文件主要起草人:付紹印、劉永斌、王標(biāo)、祁云霞、何小龍、達(dá)賴、孫素珍、特日格勒、何江峰、
王力偉、李俊龍、馬躍軍、劉學(xué)文、郝宸昉、陳欣、方勤圓。
I
DB15/T2407—2021
興羔肉羊分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)規(guī)程
1范圍
本文件規(guī)定了興羔肉羊分子標(biāo)記輔助育種的基本要求和操作要求。
本文件適用于興羔肉羊的育種。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
NY/T1236綿、山羊生產(chǎn)性能測定技術(shù)規(guī)范
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
分子標(biāo)記輔助選擇molecularmarkerassistedselection;MAS
利用性狀關(guān)聯(lián)的主效基因或者緊密連鎖的DNA分子標(biāo)記對目標(biāo)性狀進行選擇的育種技術(shù)。
3.2
標(biāo)記輔助最佳線性無偏預(yù)測marker-assistedbestlinearunbiasedprediction;MA-BLUP
適用于羊MAS的一種混合線性模型方法。該混合線性模型同時利用分子標(biāo)記和表型信息,通過混合
模型方程組(MME)求解分子標(biāo)記效應(yīng)和微效多基因效應(yīng),羊個體估計育種值為分子標(biāo)記效應(yīng)和微效多基
因效應(yīng)之和。
4基本要求
4.1分子標(biāo)記輔助選擇的適用范圍和條件應(yīng)滿足以下基本要求:
4.1.1分子標(biāo)記類型一般為單核苷酸多態(tài)。
4.1.2已知目標(biāo)性狀的主效基因或與之緊密連鎖的標(biāo)記,且分型標(biāo)記來自于主效基因內(nèi)部或與之緊密
連鎖的側(cè)翼標(biāo)記。
4.1.3單基因或寡基因的標(biāo)記輔助選擇適用于質(zhì)量性狀、閾性狀以及數(shù)量性狀已知主效基因或大效應(yīng)
位點的情形。
4.1.4多基因標(biāo)記輔助選擇的適用對象主要為數(shù)量性狀或微效多基因的性狀。
4.2實施分子標(biāo)記輔助選擇的基本要求:
1
DB15/T2407—2021
具備表型測定與采集,樣品采集、運輸、標(biāo)識和存儲,基因分型的實驗條件和技術(shù)人員。
4.3分子標(biāo)記輔助選擇包含內(nèi)容:
分子標(biāo)記輔助選擇的活動應(yīng)包括檢驗(血液或組織樣品采集、DNA提取和純化、DNA定量、PCR擴增
與產(chǎn)物分型)、有利與有害基因型的判定、個體育種值估計、目標(biāo)個體的保留與淘汰等環(huán)節(jié)。
5操作要求
5.1采樣
5.1.1采樣時,需要填寫采樣日期、采樣地點、被采個體信息(耳號、年齡、性別)、樣品編號、采樣
人等,并妥善保存相關(guān)記錄。
5.1.2樣品可以是血液、組織樣品,也可以是其它生物學(xué)樣品。
5.1.3樣品采集過程避免個體交叉污染。
5.1.4樣品采集后應(yīng)冷凍保存和運輸。
5.2DNA提取與純化
按照農(nóng)業(yè)農(nóng)村部2406號公告-7-2016執(zhí)行。
5.3基因分型
5.3.1標(biāo)記位點或基因的來源
宜選公開文獻報道且已公開并獲使用許可的專利;也可由實施單位或委托單位前期研究獲得影響同
一性狀的標(biāo)記或基因。標(biāo)記的最小等位基因頻率應(yīng)滿足多態(tài)性的定義。
5.3.2分型與結(jié)果判讀
單基因標(biāo)記可采用PCR擴增產(chǎn)物的相關(guān)方法判讀基因型(PCR-RFLP、單分辨率熔解曲線、KASP等)。
多基因標(biāo)記可采用分別針對每個標(biāo)記分型的策略,亦可采用適合多基因標(biāo)記分型的其他方法進行分型。
5.4表型測定
生產(chǎn)性能測定按NY/T1236要求執(zhí)行。單基因標(biāo)記輔助選擇無需進行表型測定。
5.5分子標(biāo)記輔助選擇
5.5.1直接選擇
直接根據(jù)育種群的基因分型結(jié)果,淘汰不利基因型(或有害基因型)或基因型組合的個體,保留有
利基因型(或理想基因型)或基因型組合的個體。根據(jù)育種規(guī)模,可按照一次選擇或者多次選擇的方法
進行選種留種。
5.5.2兩階段選擇
對于在進行生產(chǎn)性能測定前必須進行預(yù)選的情形,宜使用兩階段選擇法。第一階段,根據(jù)育種群目
標(biāo)基因檢測分型結(jié)果,保留全部有利基因型或基因型組合的個體,淘汰不利基因型或基因型組合的個體。
2
DB15/T2407—2021
第二階段,對保留個體組成的育種群進行性能測定獲得表型信息,實施基于傳統(tǒng)育種的遺傳評估(如
BLUP),根據(jù)目標(biāo)性狀的個體育種值選留優(yōu)秀親本。
5.5.3MA-BLUP選擇
對于多基因或者微效多基因控制的數(shù)量性狀,宜采用MA-BLUP進行選擇:利用MA-BLUP模型見附錄A
整合系譜、表型和分子標(biāo)記信息,估計個體MA-BLUP育種值并排序,按預(yù)設(shè)留種率選留優(yōu)秀親本。
3
DB15/T2407—2021
A
A
附錄A
(資料性)
MA-BLUP模型及說明
MA-BLUP基本模型計算見式A.1:
y=Xb+Wa+Zu+e………………(A.1)
式中:
y—為羊性狀表型值向量,
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