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文檔簡介
內(nèi)科疾病的基因治療精準化方案演講人04/精準化基因治療的核心技術模塊03/內(nèi)科疾病基因治療精準化的理論基礎02/引言:基因治療精準化的時代背景與臨床需求01/內(nèi)科疾病的基因治療精準化方案06/現(xiàn)存挑戰(zhàn)與未來方向05/關鍵內(nèi)科疾病的精準化基因治療實踐案例目錄07/總結(jié)與展望01內(nèi)科疾病的基因治療精準化方案02引言:基因治療精準化的時代背景與臨床需求引言:基因治療精準化的時代背景與臨床需求作為一名長期從事內(nèi)科疾病臨床轉(zhuǎn)化研究的從業(yè)者,我親歷了傳統(tǒng)治療手段在面對復雜內(nèi)科疾病時的局限性:代謝性疾病需終身用藥且難以根治,心血管疾病易反復發(fā)作,血液系統(tǒng)疾病依賴長期輸血或移植,自身免疫性疾病則常陷入“治療-復發(fā)”的惡性循環(huán)。這些困境的核心在于,傳統(tǒng)治療多針對疾病表型(如癥狀、生化指標),而未能從根本上糾正疾病的遺傳或分子根源。隨著人類基因組計劃的完成及基因編輯技術的突破,基因治療已從“概念驗證”走向“臨床應用”,而“精準化”成為其從“可用”到“好用”的關鍵躍遷。精準化基因治療的核心邏輯在于:基于疾病發(fā)生發(fā)展的分子機制,通過個體化靶點識別、載體設計、遞送調(diào)控和安全監(jiān)測,實現(xiàn)“基因異常-治療干預”的精準匹配。這一過程不僅要求對疾病生物學本質(zhì)的深度解析,更需要多學科技術(基因組學、合成生物學、材料學等)的協(xié)同創(chuàng)新。本文將從理論基礎、技術模塊、實踐案例及挑戰(zhàn)展望四個維度,系統(tǒng)闡述內(nèi)科疾病基因治療精準化的方案設計與實施路徑。03內(nèi)科疾病基因治療精準化的理論基礎內(nèi)科疾病基因治療精準化的理論基礎(一)疾病分子機制的精準解析:從“基因型-表型”到“分子網(wǎng)絡”內(nèi)科疾病的精準化治療始于對疾病分子機制的深度挖掘。傳統(tǒng)遺傳學將疾病分為單基因病(如苯丙酮尿癥、鐮狀細胞貧血)和多基因?。ㄈ绺哐獕?、糖尿?。?,但近年來,非編碼基因突變、表觀遺傳調(diào)控異常、RNA剪接異構(gòu)等復雜機制被不斷揭示,使得“精準化”的內(nèi)涵從“單基因修正”擴展為“分子網(wǎng)絡重構(gòu)”。以代謝性疾病為例,傳統(tǒng)認知中“單基因缺陷-酶活性缺失-代謝物蓄積”的線性模型,已更新為“多基因多通路交互作用-代謝穩(wěn)態(tài)失衡”的網(wǎng)絡模型。例如,成人型糖原貯積癥Ⅱ型(龐貝?。┎粌H源于酸性α-葡萄糖苷酶(GAA)基因突變,還涉及溶酶體自噬障礙、炎癥因子激活等下游通路,因此基因治療需同時考慮酶補充、通路修復和炎癥調(diào)控。內(nèi)科疾病基因治療精準化的理論基礎在自身免疫性疾病中,全基因組關聯(lián)研究(GWAS)已發(fā)現(xiàn)數(shù)百個易感位點(如RA中的PTPN22、HLA-DRB1),但這些位點僅解釋部分遺傳風險,表觀遺傳修飾(如DNA甲基化、組蛋白乙?;γ庖呒毎δ艿恼{(diào)控作用逐漸成為精準化干預的新靶點。例如,系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)患者外周血單個核細胞的DNA甲基化模式異常,通過靶向DNMT1(DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1)的基因編輯,可恢復調(diào)節(jié)性T細胞(Treg)的抑制功能,從而重建免疫耐受。精準化治療的核心原則:個體化、靶向性與安全性基因治療精準化需遵循三大核心原則:1.個體化靶點選擇:基于患者的基因突變譜、分子分型和疾病進展階段,制定“一人一案”的靶點策略。例如,同為遺傳性高膽固醇血癥,LDLR基因突變型與PCSK9基因突變型的治療靶點截然不同——前者需補充LDLR功能,后者則需抑制PCSK9表達。2.靶向性遞送:確保治療基因僅在病變細胞或組織中表達,避免脫靶效應。例如,針對肝代謝性疾病,需選擇肝臟特異性啟動子(如ALB、TBG)和肝靶向衣殼蛋白(如AAV-LK03);而針對神經(jīng)系統(tǒng)疾病,則需利用血腦屏障穿透性載體(如AAV-PHP.eB)實現(xiàn)腦內(nèi)遞送。精準化治療的核心原則:個體化、靶向性與安全性3.全程化安全監(jiān)測:從基因編輯脫靶、載體免疫原性到長期表達毒性,建立“治療前預測-治療中監(jiān)控-治療后隨訪”的全周期安全管理體系。例如,通過全基因組測序(WGS)評估CRISPR/Cas9的脫靶風險,通過ELISA檢測患者抗AAV抗體的滴度,避免免疫風暴。04精準化基因治療的核心技術模塊靶點精準識別:從“組學數(shù)據(jù)”到“功能驗證”靶點識別是精準化治療的“第一步”,需整合多組學數(shù)據(jù)并經(jīng)過功能驗證。具體流程包括:1.多組學數(shù)據(jù)整合:通過全外顯子測序(WES)或全基因組測序(WGS)鑒定患者致病突變,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組(RNA-seq)和蛋白質(zhì)組(質(zhì)譜)分析異常表達通路,最終通過代謝組(LC-MS)或表觀基因組(ChIP-seq)鎖定關鍵靶點。例如,在遺傳性轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白淀粉樣變性(hATTR)中,通過WES發(fā)現(xiàn)TTR基因突變(如V30M)是直接病因,而RNA-seq顯示突變導致TTRmRNA異常剪接,因此靶點可選擇“基因沉默”(siRNA或ASO)或“基因修正”(堿基編輯)。2.靶點功能驗證:利用體外細胞模型(如患者來源的iPSCs分化細胞)和體內(nèi)動物模型(如基因敲入小鼠),驗證靶點的“可成藥性”。例如,針對肥厚型心肌?。℉CM)中的MYBPC3基因突變,通過CRISPR/Cas9在iPSCs中構(gòu)建突變細胞系,觀察到肌小節(jié)結(jié)構(gòu)紊亂,而糾正突變后細胞功能恢復,證實該靶點具有治療價值。載體系統(tǒng)精準設計:從“通用載體”到“智能載體”載體是治療基因的“運輸工具”,其精準化設計直接影響治療效果。目前主流載體包括病毒載體和非病毒載體,兩者均通過“工程化改造”實現(xiàn)靶向性和安全性優(yōu)化。載體系統(tǒng)精準設計:從“通用載體”到“智能載體”病毒載體的精準化改造-腺相關病毒(AAV):憑借低免疫原性、長期表達優(yōu)勢,成為內(nèi)科疾病基因治療的首選載體。精準化改造包括:-衣殼蛋白改造:通過定向進化(如AAV進化庫篩選)或理性設計(如結(jié)構(gòu)域swapping),獲得組織特異性衣殼。例如,AAV-LK03對肝細胞具有100倍以上的靶向性,而AAV-PHP.eB可穿透血腦屏障,靶向中樞神經(jīng)細胞。-啟動子優(yōu)化:根據(jù)疾病類型選擇組織特異性啟動子,避免“泛組織表達”帶來的毒性。例如,治療Duchenne肌營養(yǎng)不良癥(DMD)時,選用肌肉特異性啟動子(CK8)驅(qū)動抗肌萎縮蛋白(Dystrophin)表達,減少肝臟和心臟的脫靶表達。-慢病毒(LV):適用于分裂細胞(如造血干細胞),通過“自我失活”(SIN)設計刪除啟動子/增強子序列,降低插入致突變風險。例如,在β地中海貧血的治療中,利用慢病毒將修飾后的β-珠蛋白基因?qū)牖颊咴煅杉毎?,回輸后可長期產(chǎn)生正常紅細胞。載體系統(tǒng)精準設計:從“通用載體”到“智能載體”非病毒載體的精準化突破非病毒載體(如脂質(zhì)納米顆粒LNP、聚合物納米粒)具有低免疫原性、易于大規(guī)模生產(chǎn)的優(yōu)勢,近年來在遞送效率上取得突破:-組織靶向LNP:通過脂質(zhì)組分優(yōu)化(如可電離脂質(zhì)、PEG化脂質(zhì))和表面修飾(如靶向肽、抗體),實現(xiàn)器官特異性遞送。例如,GalNAc偶聯(lián)的siRNA-LNP可特異性結(jié)合肝細胞表面的去唾液酸糖蛋白受體(ASGPR),用于治療遺傳性血管性水腫(HAE),siRNA沉默KLKB1基因后,緩激肽生成減少,癥狀顯著改善。-刺激響應型載體:設計對微環(huán)境(如pH、酶、氧化還原)敏感的載體,實現(xiàn)“病灶部位特異性釋放”。例如,腫瘤微環(huán)境中的基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)可降解肽鍵連接的載體,使治療基因在腫瘤局部釋放,降低系統(tǒng)性毒性?;蚓庉嫻ぞ叩木珳驶瘧茫簭摹半S機整合”到“精準修飾”基因編輯技術(如ZFN、TALEN、CRISPR/Cas9)可實現(xiàn)基因的“精準修飾”,是單基因病治療的革命性工具。其精準化優(yōu)化包括:1.高保真編輯工具開發(fā):傳統(tǒng)CRISPR/Cas9存在脫靶風險,通過工程化改造(如SpCas9-HF1、eSpCas9)可提高特異性,降低脫靶率至10^-6以下。例如,在鐮狀細胞貧血的治療中,使用CRISPR-Cas9在HBB基因的突變位點(Glu6Val)進行基因修正,同時通過高通量測序驗證無脫靶效應,患者輸血需求減少90%以上。2.堿基編輯(BaseEditing)與先導編輯(PrimeEditing):無需雙鏈斷裂,可直接實現(xiàn)單堿基轉(zhuǎn)換(C→G、A→T)或小片段插入/缺失,適用于“不可編輯”的突變位點。例如,杜氏肌營養(yǎng)不良癥(DMD)中大量為外顯子缺失,利用先導編輯可在基因組中精準插入缺失的外顯子,恢復閱讀框?;蚓庉嫻ぞ叩木珳驶瘧茫簭摹半S機整合”到“精準修飾”3.表觀遺傳編輯:通過“失活”或“激活”特定基因,而非改變DNA序列,用于多基因病或復雜疾病的治療。例如,利用dCas9-KRAB系統(tǒng)抑制PD-1基因啟動子區(qū)的組蛋白乙?;?,可在不編輯基因組的情況下增強T細胞抗腫瘤活性,目前已進入實體瘤治療的臨床試驗階段。調(diào)控系統(tǒng)的精準化設計:從“持續(xù)表達”到“動態(tài)調(diào)控”傳統(tǒng)基因治療多采用“constitutive表達”模式,易導致“表達過量毒性”或“表達衰減”。精準化調(diào)控系統(tǒng)可實現(xiàn)“按需表達”,模擬生理狀態(tài)下的基因表達調(diào)控:1.誘導型調(diào)控系統(tǒng):通過小分子藥物(如四環(huán)素、他莫昔芬)或物理刺激(光、熱)控制基因表達。例如,Tet-On系統(tǒng)在給予多西環(huán)素后激活治療基因表達,停藥后表達關閉,適用于需要短期干預的疾?。ㄈ缂毙愿嗡ソ撸?。2.組織特異性調(diào)控系統(tǒng):利用組織特異性轉(zhuǎn)錄因子(如肝細胞的HNF4α、神經(jīng)細胞的NeuroD1)驅(qū)動治療基因表達,避免“異位表達”。例如,治療Ⅰ型糖尿病時,將胰島素基因置于胰島素啟動子(INS)控制下,僅在β細胞中表達,防止低血糖發(fā)生。3.反饋調(diào)控系統(tǒng):根據(jù)疾病標志物水平動態(tài)調(diào)整基因表達。例如,在遺傳性酪氨酸血癥Ⅰ型中,將FAH基因(延胡索酰乙酰乙酸水解酶)與酪氨酸響應元件結(jié)合,當酪氨酸水平升高時,F(xiàn)AH表達自動上調(diào),實現(xiàn)“自我調(diào)節(jié)”。05關鍵內(nèi)科疾病的精準化基因治療實踐案例代謝性疾?。簭摹懊柑娲钡健盎蛐拚贝x性疾病是基因治療最早突破的領域之一,其中苯丙酮尿癥(PKU)和龐貝病具有代表性。代謝性疾病:從“酶替代”到“基因修正”苯丙酮尿癥(PKU):PAH基因的精準遞送PKU由PAH基因突變導致苯丙氨酸羥化酶(PAH)活性缺失,苯丙氨酸(Phe)蓄積引起智力障礙。傳統(tǒng)治療需終身低Phe飲食,依從性差。-精準化方案:采用AAV2/8載體包裹PAHcDNA,通過肝門靜脈輸注,靶向肝細胞;使用肝臟特異性啟動子(ALB)驅(qū)動PAH表達,避免脫靶;加入WPRE元件增強mRNA穩(wěn)定性,提高表達效率。-臨床療效:早期臨床試驗中,患者血Phe水平從術前600μmol/L降至200μmol以下,且無需嚴格飲食控制;長期隨訪顯示,AAV載體可在肝細胞中穩(wěn)定表達5年以上,無嚴重不良反應。代謝性疾?。簭摹懊柑娲钡健盎蛐拚北奖虬Y(PKU):PAH基因的精準遞送2.龐貝?。≒ompeDisease):GAA基因的靶向遞送與調(diào)控龐貝病由GAA基因突變導致酸性α-葡萄糖苷酶(GAA)缺失,糖原在溶酶體中蓄積,引起肌無力。-精準化方案:針對“抗體介導的免疫排斥”(患者常因內(nèi)源性GAA缺失產(chǎn)生抗GAA抗體),采用“免疫耐受誘導+基因治療”聯(lián)合策略:先使用低劑量重組GAA酶誘導免疫耐受,再通過AAV9載體(具有肌肉和心肌靶向性)遞送GAA基因,同時使用肌肉特異性啟動子(CK8)限制表達。-臨床療效:患者6分鐘步行距離增加50%,左心室質(zhì)量指數(shù)下降30%,且抗GAA抗體滴度顯著降低,證實聯(lián)合策略的有效性。心血管疾?。簭摹鞍Y狀緩解”到“病因根治”心血管疾?。ㄈ缂易逍愿吣懝檀佳Y、心力衰竭)的基因治療旨在糾正致病基因突變或調(diào)控病理通路。心血管疾?。簭摹鞍Y狀緩解”到“病因根治”家族性高膽固醇血癥(FH):PCSK9基因的沉默與編輯FH由LDLR、APOB或PCSK9基因突變導致LDL-C清除障礙,早發(fā)動脈粥樣硬化。傳統(tǒng)他汀類藥物療效有限,PCSK9抑制劑需每月注射。-精準化方案:針對不同基因型患者選擇不同靶點——LDLR突變型采用CRISPR/Cas9基因修正,PCSK9突變型采用AAV-siRNA沉默PCSK9表達。例如,PCSK9siRNA通過GalNAc-LNP遞送至肝臟,沉默效率達90%以上,LDL-C降低50%-70%,且效果持續(xù)2年以上。-臨床進展:2022年,F(xiàn)DA批準首款PCSK9siRNA藥物(Inclisiran),用于成人雜合子FH治療,證實基因沉默策略的臨床價值。心血管疾病:從“癥狀緩解”到“病因根治”心力衰竭(HF):S100A1基因的靶向遞送HF患者心肌細胞S100A1蛋白(鈣離子調(diào)節(jié)蛋白)表達下調(diào),導致收縮功能異常。傳統(tǒng)藥物僅能改善癥狀,無法逆轉(zhuǎn)心肌重構(gòu)。-精準化方案:采用AAV9載體遞送S100A1基因,利用心肌特異性啟動子(cTNT)驅(qū)動表達,通過心臟超聲引導心內(nèi)膜注射,實現(xiàn)局部高濃度遞送。-臨床前研究:在HF豬模型中,心肌S100A1蛋白表達恢復至正常水平的80%,左心室射血分數(shù)(LVEF)提升15%,心肌纖維化減少40%,為臨床試驗奠定基礎。血液系統(tǒng)疾?。簭摹耙浦惨蕾嚒钡健盎蛐迯汀毖合到y(tǒng)疾?。ㄈ绂碌刂泻X氀?、鐮狀細胞貧血)的基因治療通過修復造血干細胞(HSC)的基因缺陷,實現(xiàn)“一次治療,終身受益”。血液系統(tǒng)疾?。簭摹耙浦惨蕾嚒钡健盎蛐迯汀辩牋罴毎氀⊿CD):HBB基因的精準修正SCD由HBB基因E6V突變導致血紅蛋白S(HbS)聚合,引起溶血性貧血和血管閉塞。傳統(tǒng)治療依賴異基因造血干細胞移植(allo-HSCT),但配型困難且移植物抗宿主?。℅VHD)風險高。12-臨床療效:2023年,F(xiàn)DA批準首款SCD基因治療產(chǎn)品(Casgevy),臨床試驗中32例患者中29例(90.6%)無事件生存,HbS水平降至30%以下,無嚴重GVHD發(fā)生。3-精準化方案:通過CRISPR/Cas9在患者HSC中修正HBB基因E6V突變,同時敲除BCL11A增強子(促進胎兒血紅蛋白HbF表達,補償HbS功能)。采用慢病毒載體(LV)遞送編輯組件,通過CD34+細胞分選富集編輯成功的HSC。自身免疫性疾?。簭摹懊庖咭种啤钡健澳褪苤亟ā弊陨砻庖咝约膊。ㄈ鏢LE、類風濕關節(jié)炎RA)的基因治療旨在打破免疫耐受,恢復免疫平衡。1.系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE):CD19CAR-T細胞的靶向清除SLE患者異?;罨腂細胞產(chǎn)生大量自身抗體,導致多器官損傷。傳統(tǒng)免疫抑制劑(如環(huán)磷酰胺)缺乏特異性,易導致感染。-精準化方案:采用CD19CAR-T細胞靶向清除B細胞,通過“基因編輯優(yōu)化CAR結(jié)構(gòu)”(如加入PD-1抑制結(jié)構(gòu)域)降低細胞因子釋放綜合征(CRS)風險;同時,利用Treg細胞特異性啟動子(FOXP3)驅(qū)動CAR表達,僅清除異常B細胞,保留調(diào)節(jié)性B細胞(Breg)。自身免疫性疾?。簭摹懊庖咭种啤钡健澳褪苤亟ā?臨床突破:2022年,一項SLECAR-T治療研究中,5例患者均達到臨床緩解(SLEDAI評分從12降至0),且停用所有免疫抑制劑12個月無復發(fā),證實“免疫重建”策略的可行性。06現(xiàn)存挑戰(zhàn)與未來方向當前面臨的主要挑戰(zhàn)盡管基因治療精準化取得顯著進展,但內(nèi)科疾病臨床應用仍面臨多重瓶頸:1.遞送效率限制:部分器官(如肺、胰腺、骨骼?。┑倪f送效率不足,例如CFTR基因治療中,AAV載體在氣管上皮細胞的轉(zhuǎn)導效率僅10%-20%,難以達到治療效果。2.免疫原性與安全性:AAV載體可引發(fā)中和抗體(NAb)反應,導致治療失敗;CRISPR/Cas9的脫靶效應和隨機整合可能致突變,例如2021年一項臨床試驗中,一名患者因AAV載體插入導致肝細胞癌,引發(fā)對長期安全性的擔憂。3.個體化治療成本高昂:例如SCD基因治療費用高達200-300萬美元,限制了可及性;同時,患者特異性載體生產(chǎn)(如針對不同突變的AAV衣殼)需要GMP級車間和復雜工藝,難以大規(guī)模推廣。當前面臨的主要挑戰(zhàn)4.長期療效與隨訪數(shù)據(jù)不足:目前多數(shù)基因治療的隨訪時間不足5年,無法評估“終身療效”和“遠期毒性”,例如PAH基因治療中,部分患者3年后表達水平逐漸下降,可能與啟動子沉默或免疫清除有關。未來精準化的發(fā)展方向突破上述挑戰(zhàn)需多學科協(xié)同創(chuàng)新,未來精準化基因治療將呈現(xiàn)三大趨勢:1.多組學指導的個體化靶點發(fā)現(xiàn):結(jié)合單細胞測序(scRNA-seq)、空間轉(zhuǎn)錄組(SpatialTranscriptomics)和蛋白質(zhì)組學,繪制疾病“細胞分子圖譜”,識別稀有細胞亞群的關鍵靶點。例如,在糖尿病中,通過scRNA-seq發(fā)現(xiàn)胰島α細胞中ARX基因高表達與胰高血糖素分泌異常相關,為基因干預提供新靶點。2.智能載體與遞送系統(tǒng):開發(fā)“AI設計的衣殼蛋白”(如DeepMind的AlphaFold2預測衣殼結(jié)構(gòu))和“多功能納米載體”(如LNP-外泌體復合物),實現(xiàn)器官、細胞甚至細胞器的精準遞送。例如,針對阿爾茨海默病,利
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