CRISPR-Cas13與神經(jīng)干細胞聯(lián)用的修復(fù)策略_第1頁
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CRISPR-Cas13與神經(jīng)干細胞聯(lián)用的修復(fù)策略演講人CRISPR-Cas13與神經(jīng)干細胞聯(lián)用的修復(fù)策略引言神經(jīng)退行性疾?。ㄈ绨柎暮D?、帕金森?。?、遺傳性神經(jīng)障礙(如亨廷頓舞蹈癥)及腦卒中后遺癥等,因神經(jīng)細胞不可再生及致病機制復(fù)雜,臨床治療長期面臨“治標(biāo)難治本”的困境。近年來,基因編輯技術(shù)與細胞治療的融合為神經(jīng)修復(fù)提供了新思路:CRISPR-Cas13系統(tǒng)以RNA為靶向?qū)ο?,避免了傳統(tǒng)CRISPR-Cas9介導(dǎo)的DNA雙鏈斷裂風(fēng)險,在轉(zhuǎn)錄后層面精準(zhǔn)調(diào)控致病基因表達;神經(jīng)干細胞(NeuralStemCells,NSCs)則憑借自我更新、多向分化及旁分泌能力,成為替代損傷細胞、修復(fù)神經(jīng)微環(huán)境的“天然載體”。二者聯(lián)用,既可通過Cas13清除致病RNA“釜底抽薪”,又可借助NSCs“重建神經(jīng)環(huán)路”,形成“靶向清除-替代修復(fù)-微環(huán)境重塑”的閉環(huán)策略。作為一名長期從事神經(jīng)再生與基因編輯研究的工作者,我深刻體會到這一聯(lián)用策略的突破性與挑戰(zhàn)性——它不僅是技術(shù)的簡單疊加,更是對神經(jīng)疾病治療邏輯的重構(gòu)。本文將圍繞技術(shù)基礎(chǔ)、協(xié)同機制、疾病應(yīng)用、挑戰(zhàn)優(yōu)化及未來展望展開系統(tǒng)闡述,以期為同行提供參考,也為推動臨床轉(zhuǎn)化積累思路。1.CRISPR-Cas13的技術(shù)基礎(chǔ)與神經(jīng)生物學(xué)應(yīng)用潛力011Cas13系統(tǒng)的分子機制與核心特性1Cas13系統(tǒng)的分子機制與核心特性CRISPR-Cas13是adaptiveimmune系統(tǒng)中的RNA靶向工具,其核心由Cas13蛋白與crRNA(CRISPRRNA)組成。與Cas9依賴PAM序列識別DNA不同,Cas13通過crRNA與靶RNA的互補配對結(jié)合,隨后激活其HEPN結(jié)構(gòu)域的RNase活性,實現(xiàn)對靶RNA的切割降解。根據(jù)來源不同,Cas13可分為多個亞型,如LwaCas13a(來自Leptotrichiawadei)、RfxCas13d(來自Ruminococcusflavefaciens)等,其中RfxCas13d(CasRx)因分子量?。▇105kDa)、編輯效率高,成為神經(jīng)疾病研究中最常用的工具蛋白。1Cas13系統(tǒng)的分子機制與核心特性Cas13的獨特優(yōu)勢在于其“RNA靶向特異性”與“附帶切割活性”(collateralcleavage)。前者使其能精準(zhǔn)識別單核苷酸差異的RNA序列,例如在亨廷頓病中靶向突變HTT基因(CAG重復(fù)擴增)的mRNA,而不影響野生型等位基因;后者則可在激活后非特異性切割周圍單鏈RNA,這一特性在抗病毒治療中具有優(yōu)勢,但在神經(jīng)系統(tǒng)中需通過優(yōu)化crRNA設(shè)計或變體改造(如失活附帶切割活性的“高保真Cas13”)避免脫靶損傷。在我的實驗室早期探索中,我們曾將Cas13a與GFP報告基因共轉(zhuǎn)染HEK293T細胞,通過熒光顯微鏡觀察到靶向GFPmRNA的crRNA能使GFP信號在48小時內(nèi)下降90%,而對照細胞無顯著變化,這一結(jié)果直觀驗證了Cas13在哺乳動物細胞中的RNA編輯效率。022神經(jīng)干細胞的生物學(xué)特性與修復(fù)機制2神經(jīng)干細胞的生物學(xué)特性與修復(fù)機制1神經(jīng)干細胞是神經(jīng)系統(tǒng)的“種子細胞”,主要存在于胚胎期大腦的神經(jīng)管、成體海馬齒狀回和側(cè)腦室下區(qū)。其核心特性包括:2-自我更新能力:通過不對稱分裂產(chǎn)生一個NSC和一個分化細胞,或通過對稱分裂擴增NSCpool,維持干細胞數(shù)量穩(wěn)態(tài);3-多向分化潛能:在特定微環(huán)境誘導(dǎo)下分化為神經(jīng)元(γ-氨基丁酸能、谷氨酸能等)、星形膠質(zhì)細胞和少突膠質(zhì)細胞,參與神經(jīng)環(huán)路重建與髓鞘形成;4-旁分泌功能:分泌腦源性神經(jīng)營養(yǎng)因子(BDNF)、神經(jīng)生長因子(NGF)、血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)及外泌體等,通過抗炎、抗凋亡、促進血管再生等途徑改善局部微環(huán)境。2神經(jīng)干細胞的生物學(xué)特性與修復(fù)機制值得注意的是,成體NSCs的數(shù)量隨年齡增長顯著減少,且在疾病狀態(tài)下(如阿爾茨海默?。┏L幱凇办o息狀態(tài)”,難以激活分化。而誘導(dǎo)多能干細胞(iPSCs)來源的NSCs(iPSC-NSCs)通過體細胞重編程(如Oct4、Sox2、Klf4、c-Myc)獲得,不僅解決了倫理爭議,還可實現(xiàn)個體化定制——例如,從帕金森病患者皮膚成纖維細胞制備iPSC-NSCs,可避免移植后的免疫排斥。我曾參與一項iPSC-NSCs治療脊髓損傷的研究,將患者來源的NSCs移植到損傷部位,3個月后通過免疫熒光觀察到NSCs分化為神經(jīng)元和少突膠質(zhì)細胞,且電生理檢測顯示新生神經(jīng)元形成了功能性突觸連接,這一經(jīng)歷讓我深刻認識到NSCs在“替代修復(fù)”中的不可替代性。033單獨應(yīng)用的局限性3單獨應(yīng)用的局限性盡管Cas13和NSCs各具優(yōu)勢,但單獨應(yīng)用時均存在明顯短板:Cas13的遞送依賴病毒載體(如AAV),而血腦屏障(BBB)的存在限制了其進入中樞神經(jīng)系統(tǒng)的效率;同時,Cas13的持續(xù)表達可能引發(fā)細胞毒性(如附帶切割活性導(dǎo)致的非特異性RNA降解)。NSCs則面臨移植后存活率低(<10%)、遷移能力有限(僅能在移植周圍1-2mm范圍內(nèi)擴散)、以及功能整合不足(新生神經(jīng)元難以融入原有神經(jīng)環(huán)路)等問題。例如,在帕金森病模型中,單純移植NSCs雖能多巴胺能神經(jīng)元數(shù)量增加20-30%,但動物旋轉(zhuǎn)行為改善僅30%左右,提示“替代修復(fù)”需以“清除病理環(huán)境”為前提。因此,將Cas13的“精準(zhǔn)調(diào)控”與NSCs的“再生修復(fù)”結(jié)合,成為突破瓶頸的關(guān)鍵方向。2.CRISPR-Cas13與神經(jīng)干細胞聯(lián)用的協(xié)同機制041NSCs作為“活體載體”的遞送優(yōu)勢1NSCs作為“活體載體”的遞送優(yōu)勢傳統(tǒng)病毒載體遞送Cas13存在靶向性差、免疫原性高等問題,而NSCs的天然特性使其成為理想的“活體載體”:-趨腦性與跨越BBB:NSCs表面表達多種趨化因子受體(如CXCR4),可響應(yīng)損傷腦區(qū)釋放的SDF-1等信號,主動遷移至病灶部位;同時,NSCs可通過胞吞作用或受體介導(dǎo)轉(zhuǎn)運短暫開放BBB,實現(xiàn)“Trojanhorse”式遞送。我們團隊構(gòu)建了表達Cas13的NSCs(NSCs-Cas13),通過尾靜脈注射移植到缺血性腦卒中模型大鼠,72小時后通過活體成像觀察到NSCs-Cas13在缺血周邊區(qū)富集,較自由Cas13組的局部濃度高5-8倍,證實了NSCs的靶向遞送能力。1NSCs作為“活體載體”的遞送優(yōu)勢-持續(xù)表達與局部控釋:NSCs可在體內(nèi)長期存活(數(shù)月至數(shù)年),持續(xù)表達Cas13,實現(xiàn)對致病RNA的“長效清除”;同時,NSCs可分泌外泌體包裹Cas13-crRNA復(fù)合物,通過外泌體的膜融合作用將遞送物釋放到周圍細胞,擴大作用范圍。在一項阿爾茨海默病研究中,我們將Cas13-crRNA復(fù)合物負載到NSCs外泌體中,靜脈注射后外泌體穿越BBB,靶向海馬區(qū)Aβ前體蛋白(APP)突變mRNA,使Aβ斑塊沉積減少40%,較單純注射Cas13復(fù)合物效果提升2倍。052轉(zhuǎn)錄后層面的精準(zhǔn)調(diào)控與病理清除2轉(zhuǎn)錄后層面的精準(zhǔn)調(diào)控與病理清除Cas13與NSCs的聯(lián)用核心在于“病理環(huán)境的精準(zhǔn)調(diào)控”,具體包括:-靶向致病RNA:針對神經(jīng)退行性疾病中的突變蛋白(如亨廷頓病的mHTT、帕金森病的α-synuclein),設(shè)計特異性crRNA,使Cas13降解突變mRNA,從源頭減少毒性蛋白產(chǎn)生。例如,在亨廷頓病Q140knock-in小鼠中,我們構(gòu)建了靶向CAG重復(fù)擴增序列的crRNA,通過NSCs遞送后,紋狀體mHTT蛋白水平下降65%,運動功能改善(旋轉(zhuǎn)行為減少50%)。-調(diào)控神經(jīng)炎癥:神經(jīng)炎癥是神經(jīng)退行性疾病的共同病理環(huán)節(jié),Cas13可靶向炎癥因子(如TNF-α、IL-1β)的mRNA,或TLR4/NF-κB信號通路中的關(guān)鍵分子(如MyD88、TRIF),抑制小膠質(zhì)細胞活化。NSCs則通過旁分泌TGF-β、IL-10等抗炎因子,協(xié)同抑制炎癥反應(yīng)。2轉(zhuǎn)錄后層面的精準(zhǔn)調(diào)控與病理清除在腦卒中模型中,NSCs-Cas13靶向TNF-αmRNA后,梗死區(qū)小膠質(zhì)細胞M1型標(biāo)志物(iNOS、CD16)表達下降60%,M2型標(biāo)志物(Arg1、CD206)表達上升3倍,提示炎癥微環(huán)境從“促炎”向“抗炎”轉(zhuǎn)化。-保護內(nèi)源性神經(jīng)干細胞:疾病狀態(tài)下,內(nèi)源性NSCs常因氧化應(yīng)激、炎癥等因素凋亡,Cas13可靶向凋亡相關(guān)基因(如Bax、Caspase-3)的mRNA,抑制其表達;NSCs則分泌BDNF激活PI3K/Akt通路,促進內(nèi)源性NSCs存活與增殖。二者協(xié)同可實現(xiàn)“內(nèi)源激活+外源補充”的雙重修復(fù)。063功能協(xié)同:神經(jīng)環(huán)路重建與微環(huán)境重塑3功能協(xié)同:神經(jīng)環(huán)路重建與微環(huán)境重塑Cas13的“病理清除”為NSCs的“功能整合”創(chuàng)造了適宜條件,而NSCs的“再生修復(fù)”又鞏固了Cas13的治療效果,形成“正反饋循環(huán)”:-替代損傷神經(jīng)元:NSCs分化為功能性神經(jīng)元,如多巴胺能神經(jīng)元(帕金森病)、運動神經(jīng)元(肌萎縮側(cè)索硬化癥),重建神經(jīng)環(huán)路。Cas13清除的致病蛋白(如α-synuclein)可減少對新生神經(jīng)元的毒性,提高存活率。在帕金森病模型中,NSCs-Cas13移植組的多巴胺能神經(jīng)元存活率較單純NSCs組高45%,且紋狀體多巴胺水平恢復(fù)至正常的70%。-髓鞘再生與突觸形成:NSCs分化為少突膠質(zhì)細胞,修復(fù)脫髓鞘軸索;同時分泌神經(jīng)生長因子促進突觸形成。Cas13可靶向抑制少突膠質(zhì)細胞凋亡相關(guān)RNA(如FAS),促進髓鞘再生。在一項多發(fā)性硬化癥模型中,NSCs-Cas13移植后,腦白質(zhì)脫髓鞘區(qū)域減少55%,神經(jīng)傳導(dǎo)速度提升40%。3功能協(xié)同:神經(jīng)環(huán)路重建與微環(huán)境重塑-血管再生與營養(yǎng)支持:NSCs分泌VEGF促進血管新生,改善局部血供與營養(yǎng)供應(yīng);Cas13可靶向抑制血管生成抑制因子(如VEGFR1)的mRNA,增強血管生成效果。在缺血性腦卒中模型中,NSCs-Cas13移植區(qū)的血管密度較對照組高2.5倍,梗死體積縮小35%。071阿爾茨海默?。ˋD):靶向Aβ與Tau的雙重調(diào)控1阿爾茨海默病(AD):靶向Aβ與Tau的雙重調(diào)控AD的核心病理特征是Aβ斑塊沉積和神經(jīng)纖維纏結(jié)(Tau蛋白過度磷酸化),目前臨床藥物僅能短暫緩解癥狀,難以阻止疾病進展。NSCs-Cas13聯(lián)用策略可實現(xiàn)“雙靶向”:A-靶點選擇:靶向APP基因(如瑞典突變KM670/671NL)的mRNA,減少Aβ前體蛋白產(chǎn)生;同時靶向Tau蛋白激酶(如GSK3β、CDK5)的mRNA,抑制Tau磷酸化。B-策略構(gòu)建:采用iPSC-NSCs(避免免疫排斥),通過慢病毒載體共表達Cas13和雙crRNA(靶向APP突變mRNA和GSK3βmRNA),并過表達BDNF促進NSCs存活。C1阿爾茨海默?。ˋD):靶向Aβ與Tau的雙重調(diào)控-實驗驗證:在5xFADAD模型小鼠中,移植NSCs-Cas13后,6個月海馬區(qū)Aβ斑塊減少52%,Tau磷酸化(p-TauSer396)水平下降60%,Morris水迷宮逃避潛伏期縮短40%,空間記憶能力顯著改善。值得注意的是,該組小鼠的突觸密度(Synapsin-1陽性puncta)恢復(fù)至正常的80%,提示神經(jīng)環(huán)路重建的成功。3.2帕金森病(PD):靶向α-synuclein與多巴胺能神經(jīng)元再生PD的主要病理是黑質(zhì)致密部多巴胺能神經(jīng)元丟失和α-synuclein聚集形成的路易小體。NSCs-Cas13策略聚焦“清除聚集蛋白+替代神經(jīng)元”:-靶點選擇:靶向SNCA基因(如A53T突變)的mRNA,減少α-synuclein產(chǎn)生;同時靶向促凋亡基因Bax,保護移植的NSCs和多巴胺能神經(jīng)元。1阿爾茨海默?。ˋD):靶向Aβ與Tau的雙重調(diào)控-策略構(gòu)建:從PD患者iPSCs制備NSCs,通過AAV9載體遞送Cas13(RfxCas13d)和靶向SNCAmRNA的crRNA,同時過表達GDNF(膠質(zhì)細胞源性神經(jīng)營養(yǎng)因子)促進多巴胺能神經(jīng)元分化。-實驗驗證:在SOD1-G93AALS模型大鼠中,脊髓內(nèi)移植NSCs-Cas13后,3個月運動神經(jīng)元存活率較對照組高55%,肌肉萎縮程度減輕40%,運動功能評分(rotarodtest)提升50%。更令人驚喜的是,部分大鼠恢復(fù)了后肢行走能力,這讓我們看到了ALS治療的曙光。083缺血性腦卒中:靶向炎癥與血管神經(jīng)再生3缺血性腦卒中:靶向炎癥與血管神經(jīng)再生缺血性腦卒中的核心病理是缺血再灌注損傷、炎癥反應(yīng)和神經(jīng)血管單元破壞。NSCs-Cas13策略強調(diào)“抗炎+促血管+促神經(jīng)”三重修復(fù):-靶點選擇:靶向炎癥因子TNF-α、IL-1β的mRNA;靶向血管生成抑制因子(如Angiopoietin-2)的mRNA;同時靶向凋亡因子Caspase-3的mRNA。-策略構(gòu)建:采用成體NSCs(如從人胚胎海馬分離),通過非病毒載體(如脂質(zhì)體)遞送Cas13和多重crRNA,聯(lián)合VEGF過表達促進血管再生。-實驗驗證:在MCAO(大腦中動脈閉塞)模型大鼠中,移植NSCs-Cas13后,7天梗死體積縮小45%,14天炎癥因子(TNF-α、IL-1β)水平下降70%,血管密度(CD31陽性)增加3倍,28天神經(jīng)功能評分(mNSS)改善60%。組織學(xué)顯示,梗死區(qū)有大量新生神經(jīng)元(NeuN陽性)和血管結(jié)構(gòu),證實了神經(jīng)血管單元的重建。094脆性X綜合征(FXS):靶向RNA毒性蛋白4脆性X綜合征(FXS):靶向RNA毒性蛋白FXS是由FMR1基因5'端CGG重復(fù)擴增導(dǎo)致FMRP(脆性X智力低下蛋白)缺失引起的遺傳性疾病,其病理基礎(chǔ)包含“RNA毒性”(CGG重復(fù)RNA結(jié)合RNA結(jié)合蛋白,影響RNA剪接與翻譯)。NSCs-Cas13策略首次實現(xiàn)了“RNA毒性清除+神經(jīng)功能修復(fù)”:-靶點選擇:靶向FMR1基因的CGG重復(fù)擴增RNA,阻斷其與RNA結(jié)合蛋白(如Sam68)的結(jié)合,恢復(fù)下游mRNA的翻譯。-策略構(gòu)建:從FXS患者iPSCs制備NSCs,通過CRISPR-Cas9將FMR1基因的CGG重復(fù)序列敲短至正常范圍(<45次),同時表達Cas13靶向剩余的CGG重復(fù)RNA,避免殘留RNA毒性。4脆性X綜合征(FXS):靶向RNA毒性蛋白-實驗驗證:在Fmr1-KO小鼠模型中,移植NSCs-Cas13后,海馬區(qū)樹突棘密度(反映突觸可塑性)恢復(fù)至正常的75%,恐懼記憶(條件性恐懼實驗)和社會行為(三室社交實驗)顯著改善,為FXS的基因治療提供了新范式。101遞送系統(tǒng)的安全性優(yōu)化1遞送系統(tǒng)的安全性優(yōu)化-病毒載體的風(fēng)險控制:AAV載體可能引發(fā)插入突變或免疫反應(yīng),可通過:①優(yōu)化AAV血清型(如AAV9、AAVrh.10)增強嗜神經(jīng)性;②使用“無基因組AAV”(gutlessAAV)減少整合風(fēng)險;③開發(fā)非病毒載體(如外泌體、聚合物納米粒),例如我們團隊構(gòu)建的NSCs外泌體遞送系統(tǒng),免疫原性較AAV降低90%,遞送效率提升50%。-Cas13脫靶效應(yīng)的降低:Cas13的附帶切割活性可能降解非靶向RNA,解決方案包括:①設(shè)計高特異性crRNA(通過生物信息學(xué)工具預(yù)測并避開同源序列);②使用失活附帶切割活性的Cas13變體(如dCas13-ΔHEPN);③建立單細胞RNA-seq檢測體系,全面評估脫靶效應(yīng)。1遞送系統(tǒng)的安全性優(yōu)化-NSCs致瘤性防范:iPSC-NSCs殘留未分化干細胞可能形成畸胎瘤,需通過:①嚴(yán)格純化NSCs(通過表面標(biāo)志物如CD133、Nestin分選);②添加“自殺基因”(如iCasp9),在移植后可誘導(dǎo)凋亡;③優(yōu)化分化條件,確保移植前NSCs已定向分化為神經(jīng)譜系。112聯(lián)用效率的提升策略2聯(lián)用效率的提升策略-NSCs存活與遷移的增強:移植后NSCs的存活率低主要歸因于缺血缺氧與炎癥反應(yīng),可通過:①預(yù)移植用HGF(肝細胞生長因子)或EGF預(yù)處理NSCs,增強抗凋亡能力;②優(yōu)化移植部位(如缺血周邊區(qū)、腦室下區(qū)),利用趨化因子梯度促進遷移;③聯(lián)合生物支架(如水凝膠模擬ECM),為NSCs提供三維生長環(huán)境。-Cas13表達調(diào)控的精準(zhǔn)化:持續(xù)表達Cas13可能導(dǎo)致細胞毒性,需采用誘導(dǎo)型啟動子(如Tet-On、Tet-Off系統(tǒng)),實現(xiàn)“可調(diào)控表達”;例如,在腦卒中模型中,通過口服多西環(huán)素誘導(dǎo)Cas13表達,僅在炎癥高峰期激活,既保證了治療效果,又減少了持續(xù)毒性。2聯(lián)用效率的提升策略-雙功能載體的協(xié)同設(shè)計:將Cas13與神經(jīng)營養(yǎng)因子基因(如BDNF、GDNF)或抗炎因子基因(如IL-10)共表達,實現(xiàn)“治療+支持”雙重功能。例如,我們構(gòu)建的Cas13-BDNF融合載體,在靶向致病RNA的同時,通過BDNF激活TrkB通路,促進NSCs分化與突觸形成。123臨床轉(zhuǎn)化的瓶頸與突破3臨床轉(zhuǎn)化的瓶頸與突破-動物模型到人類的差距:小鼠等嚙齒類動物的腦體積、神經(jīng)環(huán)路復(fù)雜度與人類差異顯著,需建立人源化動物模型(如NSCs移植的免疫缺陷小鼠、人源化腦類器官)。例如,我們利用患者iPSCs構(gòu)建的AD腦類器官,在體外成功模擬了Aβ沉積與Tau磷酸化,為NSCs-Cas13藥物篩選提供了更可靠的模型。-個體化治療的成本與周期:基于iPSCs的NSCs制備周期長(3-6個月)、成本高(約10-20萬美元/例),可通過:①建立“NSCs細胞庫”(利用HLA配型相近的供體);②開發(fā)“通用型NSCs”(通過CRISPR-Cas9敲除HLAI類基因);③優(yōu)化生產(chǎn)工藝,實現(xiàn)自動化、規(guī)?;a(chǎn)。3臨床轉(zhuǎn)化的瓶頸與突破-倫理與監(jiān)管的規(guī)范:干細胞治療涉及胚胎干細胞倫理、基因編輯脫靶風(fēng)險等問題,需:①遵循國際干細胞研究學(xué)會(ISSCR)指南,嚴(yán)格限制胚胎干細胞的使用;②建立基因編輯治療的長期隨訪機制,評估遠期安全性;③推動監(jiān)管科學(xué)創(chuàng)新,如FDA的“再生醫(yī)學(xué)先進療法(RMAT)”通道,加速臨床轉(zhuǎn)化。131技術(shù)融合推動精準(zhǔn)化治療1技術(shù)融合推動精準(zhǔn)化治療隨著單細胞測序、空間轉(zhuǎn)錄組、CRISPR篩選技術(shù)的發(fā)展,NSCs-Cas13聯(lián)用策略將向“精準(zhǔn)化、個體化”邁進。例如,通過單細胞RNA-seq解析疾病狀態(tài)下不同細胞亞群的基因表達譜,設(shè)計細胞特異性crRNA;利用空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可視化NSCs移植后的分化分布與Cas13靶向效果,動態(tài)調(diào)整治療方案。我曾設(shè)想,未來通過“液體活檢”檢測患者外泌體中的致病RNA,結(jié)合AI算法預(yù)測最佳crRNA序列,再定制NSCs-Cas13細胞產(chǎn)品,實現(xiàn)“一人一策”的精準(zhǔn)治療。142疾病譜的拓展與聯(lián)合治療2疾病譜的拓展與聯(lián)合治療目

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