新疆褐牛種牛遺傳評(píng)估方法TheTechnicalRegulationofGeneticEvaluationinXinjiangBrownCattle2017-05-20實(shí)施2017-05-20實(shí)施新疆維吾爾自治區(qū)質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布本標(biāo)準(zhǔn)根據(jù)GB/T1.1-2009《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分：標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)和編寫》的要求編寫。本標(biāo)準(zhǔn)由新疆維吾爾自治區(qū)畜牧廳提出并歸口。本標(biāo)準(zhǔn)由新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)負(fù)責(zé)起草。本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人：黃錫霞、王雅春、付雪峰、田可川、郭志I庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載1范圍2術(shù)語和定義種牛Cattlestud數(shù)量性狀Quantitativetrait經(jīng)濟(jì)性狀Economictrait1庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載是對(duì)兩個(gè)性狀間遺傳關(guān)系的強(qiáng)度和方向(正或負(fù))的估計(jì)，是由于基因不平衡造成的。系譜Pedigree系譜鑒定Thepedigreeappraising3遺傳參數(shù)估計(jì)4.2.1突出主要經(jīng)濟(jì)性狀，一般以2個(gè)~4個(gè)為宜；2DB65/T3991—20174.2.3對(duì)希望數(shù)值變小的性狀選擇，加權(quán)值為負(fù)；4.2.4對(duì)負(fù)相關(guān)的性狀盡可能合并為一個(gè)性狀來處理；4.2.5選擇指數(shù)法參照附錄C。4.3最佳線性無偏預(yù)測法BLUP(BestLinearUnbiasedPrediction)4.3.1適用于大群體中的育種值估計(jì)；4.3.2實(shí)際應(yīng)用時(shí)可用相關(guān)軟件進(jìn)行計(jì)算和估測；4.3.3BLUP育種值估計(jì)方法參照附錄D。3庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載..…..自由度母親平方和女兒平方和母女乘積和公牛間公牛內(nèi)4庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載rw——為各測量的表型值間的表型相關(guān)，當(dāng)信息來源是一個(gè)個(gè)體多次度量均值時(shí)，r,等于多次度量的重復(fù)率re;bw——公牛內(nèi)母女回歸系數(shù)；SSw——公牛內(nèi)組內(nèi)乘積和平方和；SPw——公牛內(nèi)平方和；D.,——為供測后裔該性狀的表型平均值；0——為供測后裔同期畜群該性狀的表型平均值；表A.2產(chǎn)奶量統(tǒng)計(jì)n233號(hào)274號(hào)435號(hào)5庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載由表1計(jì)算方差、協(xié)方差、自由度分析結(jié)果如下表A.3:表A.3公牛內(nèi)女母平方和及乘積和自由度母親平方和女兒平方和母女乘積和公牛間4公牛內(nèi)利用回歸系數(shù)計(jì)算遺傳力可得：利用相關(guān)系數(shù)計(jì)算遺傳力可得：A.2同胞資料估計(jì)遺傳力一般有半同胞組內(nèi)相關(guān)法和全同胞組內(nèi)相關(guān)法兩種，在牛的某些性狀遺傳力估計(jì)中，一般利用半同胞資料估計(jì)遺傳參數(shù)。利用半同胞組內(nèi)相關(guān)法估計(jì)遺傳力，所有隨機(jī)模型如下：式中：y;;為觀測值；u為總體均值；s;為公牛效應(yīng)；e,為隨機(jī)誤差效應(yīng)；各效應(yīng)均以偏差形式表示，即，如有S頭公牛，每一頭公牛有ni個(gè)半同胞子女，其中第j個(gè)子女的表型值為X;,利用單因素方差分析方法得到表2的結(jié)果，k?是有效平均子女?dāng)?shù)，在近似條件下，因半同胞間的親緣系數(shù)r(HS=0.25;因此遺傳力估計(jì)值為公式(A.4):6o3——公牛間方差；k?——種公牛的有效(加權(quán))平均女兒頭數(shù)，如各公牛(s)子女?dāng)?shù)不相等需要套用加權(quán)平均自由度平方和公牛間公牛內(nèi)估計(jì)值的準(zhǔn)確性(抽樣方差):7庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載當(dāng)后代總數(shù)(N=sn)固定時(shí)，可使抽樣方差達(dá)到最小。k?種公牛的有效(加權(quán))平均女兒頭數(shù)，如各公牛(s)子女?dāng)?shù)不相等需要套用加權(quán)平均8表A.5半同胞資料遺傳力估計(jì)顯著所需最低樣本量遺傳力9876549庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載庫七七www.kqqw庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載公牛號(hào)123456789X12自由度公牛間公牛內(nèi)a)模塊一，MTDFNRM是用來計(jì)算分子血緣相量的影響不顯著(P>0.05);年*季、年*胎次2組交互作用對(duì)產(chǎn)奶量有極顯著影響(P<0.01);季*初產(chǎn)月齡、產(chǎn)犢間隔*初產(chǎn)月齡2組交互作用對(duì)產(chǎn)奶(2)利用單性狀重復(fù)觀測值模型，把所有個(gè)體的各種效應(yīng)直接列入MME(混合模型方程組)中，運(yùn)(3)方差組分和遺傳力估計(jì)值，結(jié)果在76,如下表A.8重復(fù)力遺傳力殘差比例信息表型值可剖分為決定該表型值的育種值和剩余值，P'=A+R,一般情況下均設(shè)可得庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載—h2(這時(shí)n=2)非近交，兩親本解：代入公式(B.1):根據(jù)半同胞表型值估算個(gè)體育種值的公式為：n——半同胞個(gè)數(shù)；bAP——個(gè)體育種值對(duì)信息表型值的回歸系數(shù)或加權(quán)系數(shù)；P?——供選個(gè)體該性狀的平均表型值；P——供選個(gè)體同胞同期畜群該性狀的平均表型值；B.2.4根據(jù)后裔資料估計(jì)育種值根據(jù)后裔的生產(chǎn)性能和外貌等特征來估測種畜的育種值和遺傳組成，以評(píng)定其種用價(jià)值，是家畜選種的重要技術(shù)和方法。同胞測定的最宜數(shù)目，設(shè)測定總?cè)萘繛門,若選留S頭公畜，則每一公畜可測定的子女?dāng)?shù)，測定比為k=T/S.若每一公畜測定n個(gè)子女，則可測定的公畜數(shù)為。因此公畜留種率p:式中：S——選留的公畜數(shù)；S-——可測定的公畜數(shù)；k——測定比。……庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載解：將已知數(shù)據(jù)代入公式(B.5)、(B.6):利用半同胞兄妹信息可得：根據(jù)計(jì)算結(jié)果，可與其他個(gè)體相應(yīng)的估計(jì)育種值進(jìn)行高低對(duì)比，確定是否選留。B.3多種親屬信息育種值估計(jì)利用各種親屬信息估計(jì)個(gè)體育種值時(shí)，單獨(dú)利用一項(xiàng)信息總有一定的局限性，不能達(dá)到充分利用信息、盡可能提高育種效率的目的。利用多種親屬信息估計(jì)育種值時(shí)，可用多元回歸的方法，公式如下：X?——第i種親屬信息的表型值；b,——被估個(gè)體育種值的偏回歸系數(shù)；X——信息表型值向量；b——偏回歸系數(shù)向量。解：先求矩陣V、C,計(jì)算偏回歸系數(shù)b?:庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載(規(guī)范性附錄)I Ih;第i個(gè)性狀的遺傳加權(quán)值(遺傳力);P.待評(píng)估性狀表型值之間的方差-協(xié)方差矩陣；A各信息性狀與目標(biāo)性狀育種值之間的協(xié)方差矩陣；x'--[x?X?…xm].在制定選擇指數(shù)時(shí)，首先獲得性狀遺傳力、表型方差、經(jīng)濟(jì)加權(quán)值、表型相關(guān)和遺傳相關(guān)等參數(shù)，然后建立性狀表型方差、協(xié)方差矩陣和育種值方差，根據(jù)公式求解出各偏回歸系數(shù)，最后將各個(gè)性狀表型值X,或它的離均差值代入公式計(jì)算個(gè)體的指數(shù)值。示例8:對(duì)某公牛站的青年公牛進(jìn)行綜合選擇指數(shù)計(jì)算，目標(biāo)性狀為乳脂量和日增重。已知一狀記錄：母親乳脂量PDi=170kg,對(duì)應(yīng)均數(shù)為140kg;父親日增重Ps?=1180g,對(duì)應(yīng)均數(shù)為1290g;本身日增重兩性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值和有關(guān)遺傳參數(shù)為：W乳脂率(1)日增重(2)1.3元解：先求矩陣V,D,A,w,結(jié)果如下：Cov(PD?,PE?)=rA(P?,Pr?)·Cov(A?,A?)=0.5×6Cov(P?,Pe?)=Cov(As?,Az?)=FACP?P?)×σ2?=0.5于是：…新疆烏魯木齊種牛場1985年6月-2008年8月754頭新疆褐牛4014個(gè)泌乳期和17962條月測定記PTAM——PTAF——產(chǎn)奶量育種值；PTASDC——外貌評(píng)分育種值；其中，公式中20為指數(shù)系數(shù)，50、22.5、5為各性狀相對(duì)經(jīng)濟(jì)重要性加權(quán)指數(shù)，分母為各性狀表型值的遺傳標(biāo)準(zhǔn)差，分子為各性狀估計(jì)育種值。將產(chǎn)奶量、乳脂率、乳蛋白率和體型評(píng)分的EBV值(EstimatedBreedingValue)依據(jù)相對(duì)經(jīng)濟(jì)重要性加權(quán)構(gòu)成一個(gè)總性能指數(shù)(TPI,TotalPerformanceIndex),TPI值反映育種目標(biāo)性狀的綜合育種值，公式如下：制定出新疆褐?？傂阅苤笖?shù)如下：EBVM——產(chǎn)奶量育種值；EBVP——乳蛋白率育種值；其中，公式中20為指數(shù)系數(shù)，50、22.5、5為各性狀相對(duì)經(jīng)濟(jì)重要性加權(quán)指數(shù)，分母為各性狀表型值的遺傳標(biāo)準(zhǔn)差，分子為各性狀估計(jì)育種值。庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載庫七七標(biāo)準(zhǔn)下載(規(guī)范性附錄)D.1BLUP的混合模型公式a——該個(gè)體的加性遺傳效應(yīng)(育種值),是隨機(jī)效應(yīng)；e隨機(jī)殘差(主要由隨機(jī)環(huán)境效應(yīng)所致)。如有n個(gè)個(gè)體的觀察值，需要對(duì)s個(gè)個(gè)體估計(jì)育種值(s≥n),則對(duì)這n個(gè)觀測值用下面的以矩陣表b——所有(固定)環(huán)境效應(yīng)的向量；差矩陣為：var(e)=R=Io2。e——隨機(jī)殘差(主要由隨機(jī)環(huán)境效應(yīng)所致)。對(duì)公式(D.5)用矩陣形式表示為令b?——所有(固定)環(huán)境效應(yīng)的向量；Z?——a?的關(guān)聯(lián)矩陣；第二個(gè)性狀的模型為Y?——所有n個(gè)觀測值的向量；b?——所有(固定)環(huán)境效應(yīng)的向量；a?——s個(gè)個(gè)體的育種值向量；e2——隨機(jī)殘差效應(yīng)向量。令則令y=Xb+Za+e其中g(shù)?和g?2分別為第一個(gè)性狀和第二個(gè)性