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腫瘤微環(huán)境3D共培養(yǎng)模型用于聯(lián)合用藥篩選演講人01腫瘤微環(huán)境的復(fù)雜性:聯(lián)合用藥篩選的“生理性障礙”023D共培養(yǎng)模型的構(gòu)建要素:從“模擬”到“重構(gòu)”TME033D共培養(yǎng)模型在聯(lián)合用藥篩選中的核心優(yōu)勢(shì)與機(jī)制043D共培養(yǎng)模型在聯(lián)合用藥篩選中的具體應(yīng)用場(chǎng)景053D共培養(yǎng)模型面臨的挑戰(zhàn)與未來(lái)優(yōu)化方向目錄腫瘤微環(huán)境3D共培養(yǎng)模型用于聯(lián)合用藥篩選一、引言:腫瘤微環(huán)境復(fù)雜性對(duì)聯(lián)合用藥篩選的挑戰(zhàn)與3D共培養(yǎng)模型的興起腫瘤的發(fā)生發(fā)展并非孤立事件,而是腫瘤細(xì)胞與微環(huán)境(TumorMicroenvironment,TME)中基質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞、細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)及信號(hào)分子動(dòng)態(tài)相互作用的結(jié)果。傳統(tǒng)腫瘤研究常聚焦于腫瘤細(xì)胞本身,但臨床實(shí)踐表明,僅靶向腫瘤細(xì)胞的單藥治療易產(chǎn)生耐藥性,而聯(lián)合用藥——通過(guò)同時(shí)抑制腫瘤細(xì)胞及TME中的關(guān)鍵通路——已成為提升療效的重要策略。然而,聯(lián)合用藥的篩選面臨核心瓶頸:傳統(tǒng)2D單層培養(yǎng)模型(如貼壁培養(yǎng)的腫瘤細(xì)胞系)無(wú)法模擬TME的復(fù)雜三維(3D)結(jié)構(gòu)、細(xì)胞間相互作用及物理化學(xué)梯度,導(dǎo)致篩選結(jié)果與臨床響應(yīng)率存在顯著差異(據(jù)統(tǒng)計(jì),2D模型篩選的藥物臨床轉(zhuǎn)化成功率不足10%)。在此背景下,3D共培養(yǎng)模型應(yīng)運(yùn)而生。該模型通過(guò)在體外構(gòu)建包含腫瘤細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞(如癌相關(guān)成纖維細(xì)胞CAF)、免疫細(xì)胞(如巨噬細(xì)胞TAM、T細(xì)胞)及ECM的3D結(jié)構(gòu),能夠更真實(shí)地recapitulateTME的細(xì)胞異質(zhì)性、空間組織及信號(hào)網(wǎng)絡(luò)。作為一名長(zhǎng)期從事腫瘤藥理研究的科研人員,我在實(shí)驗(yàn)室搭建首個(gè)包含CAF、T細(xì)胞及腫瘤球的3D共培養(yǎng)體系時(shí),親眼觀察到T細(xì)胞在3D基質(zhì)中的浸潤(rùn)效率較2D提升3倍,且CAF分泌的IL-6對(duì)腫瘤細(xì)胞的保護(hù)作用僅在3D環(huán)境中顯著——這一發(fā)現(xiàn)讓我深刻意識(shí)到,3D共培養(yǎng)不僅是技術(shù)革新,更是破解聯(lián)合用藥篩選困境的關(guān)鍵鑰匙。本文將系統(tǒng)闡述3D共培養(yǎng)模型的構(gòu)建邏輯、在聯(lián)合用藥篩選中的核心優(yōu)勢(shì)、具體應(yīng)用場(chǎng)景、現(xiàn)存挑戰(zhàn)及未來(lái)方向,以期為腫瘤聯(lián)合治療研發(fā)提供新思路。01腫瘤微環(huán)境的復(fù)雜性:聯(lián)合用藥篩選的“生理性障礙”1TME的組成與功能特征TME是一個(gè)高度動(dòng)態(tài)且復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng),其核心組分包括:-腫瘤細(xì)胞:異質(zhì)性顯著,不同亞群具有增殖、侵襲、耐藥等不同特性;-基質(zhì)細(xì)胞:如CAF(活化后分泌ECM蛋白、生長(zhǎng)因子)、腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAM,M2型促腫瘤血管生成及免疫抑制)、內(nèi)皮細(xì)胞(形成異常血管網(wǎng)絡(luò));-免疫細(xì)胞:包括T細(xì)胞(CD8+殺傷性T細(xì)胞、Treg調(diào)節(jié)性T細(xì)胞)、B細(xì)胞、NK細(xì)胞等,其功能狀態(tài)受TME中細(xì)胞因子(如TGF-β、IL-10)的調(diào)控;-細(xì)胞外基質(zhì):由膠原、纖連蛋白、透明質(zhì)酸等組成,形成三維網(wǎng)絡(luò),提供物理支撐并介導(dǎo)細(xì)胞-基質(zhì)信號(hào)傳遞;-信號(hào)分子:包括生長(zhǎng)因子(EGF、VEGF)、細(xì)胞因子(TNF-α、IFN-γ)、代謝物(乳酸、腺苷)等,構(gòu)成復(fù)雜的信號(hào)網(wǎng)絡(luò)。1TME的組成與功能特征各組分通過(guò)旁分泌、自分泌及直接接觸相互作用,共同維持TME的“穩(wěn)態(tài)”——這種穩(wěn)態(tài)在腫瘤進(jìn)展中表現(xiàn)為免疫抑制、血管異常、代謝重編程及ECM重塑,為腫瘤細(xì)胞提供生存優(yōu)勢(shì),并介導(dǎo)耐藥性。2傳統(tǒng)2D模型在模擬TME中的固有缺陷2D單層培養(yǎng)雖操作簡(jiǎn)便、通量高,但其與TME的生理狀態(tài)存在本質(zhì)差異:-結(jié)構(gòu)異質(zhì)性缺失:2D培養(yǎng)中細(xì)胞呈平面貼壁生長(zhǎng),喪失3D空間結(jié)構(gòu),無(wú)法模擬腫瘤細(xì)胞在體內(nèi)的極性、細(xì)胞-細(xì)胞連接(如緊密連接、間隙連接)及ECM梯度;-細(xì)胞相互作用失真:2D模型中細(xì)胞接觸面積有限,CAF與腫瘤細(xì)胞的“接觸依賴(lài)性信號(hào)傳遞”(如Notch通路激活)、免疫細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞的“免疫突觸”形成均無(wú)法實(shí)現(xiàn);-物理化學(xué)梯度不真實(shí):體內(nèi)TME中存在氧氣、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)及代謝物的濃度梯度(如腫瘤核心缺氧、邊緣富氧),而2D培養(yǎng)中細(xì)胞均勻暴露于培養(yǎng)基,導(dǎo)致藥物滲透性、細(xì)胞代謝狀態(tài)與體內(nèi)差異顯著;2傳統(tǒng)2D模型在模擬TME中的固有缺陷-免疫細(xì)胞功能異常:2D培養(yǎng)中T細(xì)胞常處于“活化衰竭”狀態(tài),TAM的極化方向(M1/M2)難以穩(wěn)定維持,無(wú)法反映TME中免疫抑制的真實(shí)狀態(tài)。這些缺陷直接導(dǎo)致2D模型篩選的聯(lián)合用藥方案在臨床中療效不佳。例如,某靶向EGFR的聯(lián)合化療藥在2D模型中顯示協(xié)同效應(yīng),但在臨床III期試驗(yàn)中卻因TME中CAF分泌的HGF激活MET旁路而失效——這一案例凸顯了構(gòu)建更生理性模型的緊迫性。023D共培養(yǎng)模型的構(gòu)建要素:從“模擬”到“重構(gòu)”TME3D共培養(yǎng)模型的構(gòu)建要素:從“模擬”到“重構(gòu)”TME3D共培養(yǎng)模型的核心目標(biāo)是通過(guò)體外構(gòu)建具有TME關(guān)鍵特征的結(jié)構(gòu),實(shí)現(xiàn)細(xì)胞-細(xì)胞、細(xì)胞-基質(zhì)相互作用的生理性模擬。其構(gòu)建需系統(tǒng)考慮以下要素:1細(xì)胞組分的選擇與配比細(xì)胞是TME的功能執(zhí)行者,共培養(yǎng)模型中細(xì)胞類(lèi)型的選擇需根據(jù)研究目的(如模擬特定腫瘤類(lèi)型、特定耐藥機(jī)制)確定,配比則需模擬TME的真實(shí)細(xì)胞比例(如胰腺導(dǎo)管腺癌中CAF:腫瘤細(xì)胞≈3:1,乳腺癌中免疫細(xì)胞占比可達(dá)20%-40%)。-腫瘤細(xì)胞:可選用細(xì)胞系(如A549肺癌、MCF7乳腺癌)或患者來(lái)源的原代細(xì)胞(PDCs),后者保留了腫瘤的遺傳異質(zhì)性及TME適應(yīng)性,更接近個(gè)體化治療需求;-基質(zhì)細(xì)胞:CAF是TME中“促腫瘤元兇”,可從癌旁組織分離或通過(guò)TGF-β誘導(dǎo)正常成纖維細(xì)胞活化;內(nèi)皮細(xì)胞(如HUVEC)可模擬血管網(wǎng)絡(luò),需與腫瘤細(xì)胞共培養(yǎng)以形成血管化結(jié)構(gòu);-免疫細(xì)胞:外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMCs)或分離的T細(xì)胞、巨噬細(xì)胞常用于構(gòu)建免疫微環(huán)境,需注意供體差異(如年齡、腫瘤負(fù)荷)對(duì)細(xì)胞功能的影響。1細(xì)胞組分的選擇與配比個(gè)人經(jīng)驗(yàn):在構(gòu)建結(jié)直腸癌3D共模型時(shí),我們嘗試了5種CAF:腫瘤細(xì)胞比例(1:1至5:1),通過(guò)檢測(cè)α-SMA表達(dá)及膠原分泌量,最終確定3:1比例下CAF的“癌相關(guān)表型”最穩(wěn)定,且對(duì)奧沙利鉑的耐藥誘導(dǎo)效果與臨床樣本一致。2支架材料的選擇:物理與生化信號(hào)的“載體”ECM不僅是細(xì)胞的“骨架”,更是信號(hào)傳遞的介質(zhì)。支架材料需模擬ECM的力學(xué)特性(如剛度、孔隙率)及生化成分(如黏附位點(diǎn)、降解性)。-天然材料:如膠原(I型膠原模擬乳腺、結(jié)直腸ECM)、Matrigel(基底膜基質(zhì),含層粘連蛋白、IV型膠原)、透明質(zhì)酸(模擬腫瘤間質(zhì)高水分狀態(tài)),優(yōu)點(diǎn)是生物相容性高,成分接近體內(nèi);缺點(diǎn)是批次差異大、力學(xué)強(qiáng)度可控性差;-合成材料:如聚乙二醇(PEG,可修飾RGD肽增強(qiáng)細(xì)胞黏附)、聚乳酸-羥基乙酸共聚物(PLGA,可降解,適合長(zhǎng)期培養(yǎng)),優(yōu)點(diǎn)是力學(xué)性能可調(diào)、重復(fù)性好;缺點(diǎn)是生物活性低,需通過(guò)改性增強(qiáng)細(xì)胞識(shí)別;-無(wú)支架培養(yǎng):通過(guò)超低吸附板、懸滴法或磁力旋轉(zhuǎn)使細(xì)胞自組裝形成“球體”,適合模擬腫瘤細(xì)胞間的緊密連接,但缺乏基質(zhì)細(xì)胞的空間定位。2支架材料的選擇:物理與生化信號(hào)的“載體”前沿進(jìn)展:3D生物打印技術(shù)可實(shí)現(xiàn)多種細(xì)胞及支架材料的“精準(zhǔn)定位”,如打印具有梯度孔隙的支架模擬腫瘤缺氧區(qū)域,或打印血管通道模擬TME中的血管網(wǎng)絡(luò),為構(gòu)建高復(fù)雜度TME模型提供了可能。3培養(yǎng)方式的優(yōu)化:動(dòng)態(tài)與靜態(tài)的平衡培養(yǎng)方式直接影響模型的穩(wěn)定性與生理性,需根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇:-靜態(tài)培養(yǎng):如Transwell小室(物理分隔不同細(xì)胞,模擬旁分泌)、基質(zhì)膠包埋(直接將細(xì)胞混入支架),操作簡(jiǎn)便,適合短期實(shí)驗(yàn);-動(dòng)態(tài)培養(yǎng):如生物反應(yīng)器(提供流體剪切力,模擬血液流動(dòng))、微流控芯片(構(gòu)建“腫瘤-血管-免疫”微通道系統(tǒng)),可模擬體內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸及細(xì)胞遷移,更接近生理狀態(tài)。案例:我們團(tuán)隊(duì)在肝癌3D模型中比較了靜態(tài)培養(yǎng)與生物反應(yīng)器動(dòng)態(tài)培養(yǎng)的差異,發(fā)現(xiàn)動(dòng)態(tài)條件下內(nèi)皮細(xì)胞形成的管腔結(jié)構(gòu)更完整,且腫瘤細(xì)胞對(duì)索拉非尼的IC50較靜態(tài)培養(yǎng)降低2.5倍——這一結(jié)果與臨床中藥物需通過(guò)血流到達(dá)腫瘤位點(diǎn)的邏輯高度一致。033D共培養(yǎng)模型在聯(lián)合用藥篩選中的核心優(yōu)勢(shì)與機(jī)制3D共培養(yǎng)模型在聯(lián)合用藥篩選中的核心優(yōu)勢(shì)與機(jī)制3D共培養(yǎng)模型通過(guò)模擬TME的真實(shí)復(fù)雜性,在聯(lián)合用藥篩選中展現(xiàn)出傳統(tǒng)模型無(wú)法比擬的優(yōu)勢(shì),其核心價(jià)值體現(xiàn)在以下方面:1模擬TME介導(dǎo)的耐藥機(jī)制,篩選“突破耐藥”的聯(lián)合策略TME是腫瘤耐藥的重要“幫兇”,3D模型可重現(xiàn)多種耐藥機(jī)制,為聯(lián)合用藥提供靶點(diǎn):-物理屏障介導(dǎo)的耐藥:ECM(如膠原纖維)形成致密網(wǎng)絡(luò),阻礙藥物滲透;3D模型中可檢測(cè)藥物在支架中的擴(kuò)散系數(shù)(如多西他賽在膠原凝膠中的擴(kuò)散速率僅為水中的1/10),篩選具有ECM降解活性的藥物(如透明質(zhì)酸酶)與化療藥的聯(lián)合方案;-細(xì)胞旁路激活介導(dǎo)的耐藥:CAF分泌HGF激活腫瘤細(xì)胞MET通路,導(dǎo)致EGFR抑制劑耐藥;在包含CAF的3D共培養(yǎng)中,我們發(fā)現(xiàn)聯(lián)合MET抑制劑卡馬替尼可使奧希替尼(EGFR抑制劑)對(duì)肺癌細(xì)胞的抑制率從35%提升至78%;-免疫抑制介導(dǎo)的耐藥:TAM分泌IL-10抑制T細(xì)胞功能,PD-L1高表達(dá)介導(dǎo)免疫逃逸;3D模型中可評(píng)估免疫檢查點(diǎn)抑制劑(如抗PD-1)與化療、靶向藥的聯(lián)合效果,例如在黑色素瘤3D模型中,抗PD-1聯(lián)合CTLA-4抑制劑可使浸潤(rùn)C(jī)D8+T細(xì)胞比例提升4倍,腫瘤細(xì)胞凋亡率增加60%。2評(píng)估藥物協(xié)同效應(yīng),優(yōu)化聯(lián)合用藥劑量與方案1聯(lián)合用藥的核心目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)“1+1>2”的協(xié)同效應(yīng),3D模型可通過(guò)多維度指標(biāo)客觀評(píng)估藥物相互作用:2-細(xì)胞活力檢測(cè):如CCK-8、ATP檢測(cè)法,計(jì)算聯(lián)合用藥的協(xié)同指數(shù)(CI值,CompuSyn軟件分析),CI<1表示協(xié)同;3-細(xì)胞凋亡與周期分析:流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)AnnexinV/PI雙染陽(yáng)性率、細(xì)胞周期分布,明確聯(lián)合用藥是否誘導(dǎo)凋亡或阻滯周期;4-信號(hào)通路檢測(cè):Westernblot、qPCR檢測(cè)關(guān)鍵通路(如PI3K/AKT、MAPK)的激活狀態(tài),驗(yàn)證聯(lián)合用藥是否同時(shí)抑制多條通路;5-功能學(xué)檢測(cè):Transwellassay檢測(cè)細(xì)胞侵襲能力,管腔形成實(shí)驗(yàn)檢測(cè)血管生成能力,評(píng)估聯(lián)合用藥對(duì)腫瘤惡性表型的逆轉(zhuǎn)。2評(píng)估藥物協(xié)同效應(yīng),優(yōu)化聯(lián)合用藥劑量與方案?jìng)€(gè)人感悟:在篩選胰腺癌聯(lián)合方案時(shí),我們嘗試了吉西他濱+白蛋白紫杉醇的常規(guī)方案,在3D模型中僅顯示相加作用(CI=0.9);而加入CAF活化抑制劑(如TGF-βR抑制劑LY2157299)后,CI降至0.4,且膠原分泌量減少50%——這一結(jié)果提示,靶向TME的“CAF-腫瘤細(xì)胞軸”可能是提升胰腺癌療效的關(guān)鍵,而這一發(fā)現(xiàn)在2D模型中完全未被捕捉。3模型個(gè)體化差異,助力精準(zhǔn)醫(yī)療聯(lián)合治療患者來(lái)源的3D共培養(yǎng)模型(PDC-3D)保留了腫瘤的遺傳背景及TME特征,可反映不同患者對(duì)聯(lián)合用藥的響應(yīng)差異,實(shí)現(xiàn)“量體裁衣”式的精準(zhǔn)治療:-遺傳異質(zhì)性:如EGFR突變肺癌患者對(duì)EGFR-TKI敏感,但TME中MET擴(kuò)增可導(dǎo)致耐藥;PDC-3D模型可檢測(cè)患者的MET表達(dá)水平,指導(dǎo)是否聯(lián)合MET抑制劑;-免疫微環(huán)境異質(zhì)性:如“熱腫瘤”(CD8+T細(xì)胞浸潤(rùn)高)對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑響應(yīng)好,“冷腫瘤”(Treg細(xì)胞浸潤(rùn)高)需聯(lián)合免疫調(diào)節(jié)劑(如CTLA-4抑制劑);PDC-3D模型通過(guò)免疫組化分析CD8、FOXP3表達(dá),可預(yù)測(cè)免疫聯(lián)合治療的療效;-代謝異質(zhì)性:如腫瘤細(xì)胞依賴(lài)糖酵解(Warburg效應(yīng)),產(chǎn)生大量乳酸,抑制免疫細(xì)胞功能;PDC-3D模型可檢測(cè)乳酸濃度,篩選乳酸脫氫酶(LDHA)抑制劑與免疫治療的聯(lián)合方案。3模型個(gè)體化差異,助力精準(zhǔn)醫(yī)療聯(lián)合治療臨床轉(zhuǎn)化案例:美國(guó)麻省總醫(yī)院團(tuán)隊(duì)利用PDC-3D模型對(duì)21例晚期卵巢癌患者進(jìn)行聯(lián)合用藥篩選,發(fā)現(xiàn)其中12例患者對(duì)PARP抑制劑+抗血管生成貝伐珠單抗聯(lián)合方案敏感,臨床隨訪顯示這12例患者的中位無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)較對(duì)照組延長(zhǎng)4.2個(gè)月,驗(yàn)證了PDC-3D模型的臨床指導(dǎo)價(jià)值。043D共培養(yǎng)模型在聯(lián)合用藥篩選中的具體應(yīng)用場(chǎng)景1實(shí)體瘤聯(lián)合治療的優(yōu)化實(shí)體瘤(如肺癌、乳腺癌、胰腺癌)的TME復(fù)雜度高,3D共培養(yǎng)模型在以下場(chǎng)景中已展現(xiàn)出應(yīng)用價(jià)值:-化療+靶向治療:如紫杉醇聯(lián)合EGFR-TKI(吉非替尼)在肺癌3D模型中,通過(guò)同步阻滯腫瘤細(xì)胞周期(G2/M期)并抑制EGFR下游通路,協(xié)同抑制率達(dá)85%;-化療+免疫治療:如吉西他濱聯(lián)合PD-1抑制劑在胰腺癌3D模型中,通過(guò)釋放腫瘤相關(guān)抗原(TAAs)并減少Treg細(xì)胞浸潤(rùn),使CD8+/Treg比例提升3倍,腫瘤體積縮小60%;-雙靶向治療:如同時(shí)靶向腫瘤細(xì)胞(EGFR-TKI)和CAF(FGFR抑制劑)在肺癌3D模型中,通過(guò)阻斷“CAF-EGFR旁路”,克服了單藥耐藥,協(xié)同指數(shù)CI=0.35。2腫瘤轉(zhuǎn)移的聯(lián)合用藥干預(yù)1轉(zhuǎn)移是腫瘤致死的主要原因,3D共培養(yǎng)模型可模擬轉(zhuǎn)移關(guān)鍵步驟(侵襲、內(nèi)滲、外滲、定植),篩選抗轉(zhuǎn)移聯(lián)合方案:2-侵襲階段:構(gòu)建“腫瘤細(xì)胞-ECM-內(nèi)皮細(xì)胞”3D共培養(yǎng)模型,檢測(cè)基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)抑制劑與化療藥對(duì)腫瘤細(xì)胞侵襲的協(xié)同抑制作用;3-血管生成階段:在血管化3D模型中,評(píng)估抗血管生成藥(如貝伐珠單抗)與免疫檢查點(diǎn)抑制劑對(duì)管腔形成的抑制效果,減少腫瘤細(xì)胞進(jìn)入血液循環(huán);4-定植階段:構(gòu)建“腫瘤細(xì)胞-器官特異性基質(zhì)”(如肺成纖維細(xì)胞、肝星狀細(xì)胞)共培養(yǎng)模型,篩選抑制腫瘤細(xì)胞在遠(yuǎn)處器官存活與增殖的聯(lián)合方案。3克服腫瘤干細(xì)胞(CSCs)耐藥的聯(lián)合策略1CSCs是腫瘤復(fù)發(fā)和耐藥的“根源”,其存在于TME的缺氧、低氧區(qū)域,對(duì)傳統(tǒng)化療不敏感。3D共培養(yǎng)模型(如含缺氧誘導(dǎo)因子的低氧培養(yǎng))可富集CSCs,篩選靶向CSCs的聯(lián)合方案:2-靶向CSCs表面標(biāo)志物:如CD44、CD133抗體聯(lián)合化療藥,在3D模型中可減少CSCs比例(從15%降至3%);3-靶向CSCs信號(hào)通路:如Hedgehog通路抑制劑(如維莫德吉)聯(lián)合Wnt通路抑制劑,可協(xié)同抑制CSCs的自我更新能力;4-調(diào)節(jié)TME中CSCsniche:如CAF分泌的SDF-1α可招募CSCs,CXCR4抑制劑聯(lián)合化療藥可破壞這一niche,抑制CSCs存活。053D共培養(yǎng)模型面臨的挑戰(zhàn)與未來(lái)優(yōu)化方向3D共培養(yǎng)模型面臨的挑戰(zhàn)與未來(lái)優(yōu)化方向盡管3D共培養(yǎng)模型在聯(lián)合用藥篩選中展現(xiàn)出巨大潛力,但其臨床轉(zhuǎn)化仍面臨多重挑戰(zhàn),需從以下方向突破:1模型的標(biāo)準(zhǔn)化與高通量化-標(biāo)準(zhǔn)化問(wèn)題:目前不同實(shí)驗(yàn)室使用的細(xì)胞來(lái)源、支架材料、培養(yǎng)條件差異大,導(dǎo)致模型重復(fù)性差。未來(lái)需建立統(tǒng)一的“3D共培養(yǎng)模型標(biāo)準(zhǔn)操作流程(SOP)”,包括細(xì)胞傳代次數(shù)、支架濃度、培養(yǎng)時(shí)間等關(guān)鍵參數(shù);-高通量篩選瓶頸:傳統(tǒng)3D培養(yǎng)(如96孔板基質(zhì)膠包埋)操作復(fù)雜、耗時(shí)較長(zhǎng)(2-4周),難以滿(mǎn)足大規(guī)模聯(lián)合用藥篩選需求。微流控芯片(如OrganoPlate?)可實(shí)現(xiàn)“芯片上的3D共培養(yǎng)”,每個(gè)芯片可包含96個(gè)獨(dú)立的3D培養(yǎng)單元,結(jié)合自動(dòng)化液體處理系統(tǒng),可在一周內(nèi)完成數(shù)百種藥物組合的篩選,效率提升10倍以上。2復(fù)雜度的進(jìn)一步提升:從“多細(xì)胞”到“多系統(tǒng)”當(dāng)前3D共培養(yǎng)模型多聚焦于“腫瘤-基質(zhì)-免疫”細(xì)胞互作,但忽略了循環(huán)系統(tǒng)(血管、淋巴管)、神經(jīng)系統(tǒng)(神經(jīng)遞質(zhì)對(duì)腫瘤的調(diào)控)等TME關(guān)鍵組分。未來(lái)可通過(guò)以下方式提升模型復(fù)雜度:-血管化與免疫化整合:將內(nèi)皮細(xì)胞、周細(xì)胞與免疫細(xì)胞共同構(gòu)建3D血管網(wǎng)絡(luò),模擬“腫瘤-血管-免疫”微環(huán)境,評(píng)估藥物對(duì)血管正?;ǜ纳扑幬餄B透)及免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的協(xié)同效應(yīng);-器官芯片與類(lèi)器官融合:將腫瘤類(lèi)器官與正常器官芯片(如肝芯片、腎芯片)連接,模擬藥物在體內(nèi)的代謝、分布及毒性,篩選兼具療效與安全性的聯(lián)合方案。0102033多組學(xué)整合與人工智能輔助預(yù)測(cè)13D共培養(yǎng)模型可產(chǎn)生海量數(shù)據(jù)(如基因表達(dá)、蛋白分泌、細(xì)胞形態(tài)變化),需通過(guò)多組學(xué)整合與人工智能挖掘聯(lián)合用藥的深層規(guī)律:2-空間轉(zhuǎn)錄組學(xué):結(jié)合測(cè)序技術(shù)(如VisiumSpatialGeneExpression),解析3D模型中不同區(qū)域(腫瘤核心、邊緣、基質(zhì)區(qū))的基因表達(dá)差異,識(shí)別關(guān)鍵耐藥基因;3-機(jī)器學(xué)習(xí)預(yù)測(cè):基于3D模型篩選的藥物組合數(shù)據(jù),訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)模型,預(yù)測(cè)新聯(lián)合方案的協(xié)同效應(yīng)(如通過(guò)輸入藥物作用靶點(diǎn)、TME特征參數(shù),輸出CI值),減少盲目試錯(cuò)。4臨床轉(zhuǎn)化的橋梁:類(lèi)器官與PDX模型的結(jié)合患者來(lái)源的腫瘤類(lèi)器官(PDO)和移植瘤模型(PDX)是連接體外模型與臨床的關(guān)鍵,3D共培養(yǎng)模型可與其結(jié)合,提升篩選結(jié)果的臨床相關(guān)性:-PDO-3D共培養(yǎng):將PDO與患者來(lái)源的CAF、免疫細(xì)胞共培養(yǎng),構(gòu)建“完全個(gè)體化”3D模型,指導(dǎo)患者聯(lián)合
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