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自身免疫性疾病的基因編輯干預(yù)進(jìn)展演講人自身免疫性疾病的基因編輯干預(yù)進(jìn)展壹自身免疫性疾病概述:現(xiàn)狀與挑戰(zhàn)貳基因編輯技術(shù):從工具革新到臨床轉(zhuǎn)化叁基因編輯在自身免疫性疾病中的干預(yù)進(jìn)展肆面臨的挑戰(zhàn)與倫理考量伍未來展望與轉(zhuǎn)化路徑陸目錄總結(jié)與展望柒01自身免疫性疾病的基因編輯干預(yù)進(jìn)展02自身免疫性疾病概述:現(xiàn)狀與挑戰(zhàn)1定義與分類自身免疫性疾病(AutoimmuneDiseases,AIDs)是一類因機(jī)體免疫系統(tǒng)錯(cuò)誤攻擊自身組織器官而導(dǎo)致的慢性、進(jìn)展性炎癥性疾病。根據(jù)受累靶器官及病理機(jī)制,可分為器官特異性AIDs(如1型糖尿病、自身免疫性甲狀腺炎、多發(fā)性硬化等)和系統(tǒng)性AIDs(如系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、干燥綜合征等)。目前全球已確認(rèn)的AIDs超過80種,總患病率約占人口的3%-5%,且女性發(fā)病率顯著高于男性(男女比約1:3),嚴(yán)重威脅人類健康。2病理機(jī)制核心AIDs的發(fā)生是遺傳易感性、環(huán)境觸發(fā)因素與免疫失調(diào)共同作用的結(jié)果。核心病理機(jī)制包括:-遺傳背景:全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)已鑒定出超過300個(gè)易感基因,如HLA-II類基因(HLA-DR3/DR4與1型糖尿?。?、PTPN22(類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎)、IRF5(系統(tǒng)性紅斑狼瘡)等,這些基因多參與免疫識(shí)別(抗原呈遞)、免疫細(xì)胞活化(T/B細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo))及炎癥因子調(diào)控。-免疫失衡:調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg)功能缺陷、輔助性T細(xì)胞17(Th17)/Th1比例失調(diào)、B細(xì)胞異?;罨白陨砜贵w產(chǎn)生(如抗核抗體、抗CCP抗體)是共同特征。-環(huán)境因素:感染(如EB病毒與系統(tǒng)性紅斑狼瘡)、紫外線、吸煙、腸道菌群紊亂等可打破免疫耐受,誘發(fā)疾病。3臨床治療困境STEP5STEP4STEP3STEP2STEP1傳統(tǒng)治療以免疫抑制劑(糖皮質(zhì)激素、甲氨蝶呤)、生物制劑(抗TNF-α、抗CD20單抗)為主,雖可緩解癥狀,但存在顯著局限:-非特異性抑制:廣譜免疫抑制增加感染、腫瘤風(fēng)險(xiǎn),且無法根治疾??;-個(gè)體差異大:約30%患者對(duì)現(xiàn)有治療響應(yīng)不佳,易出現(xiàn)耐藥或復(fù)發(fā);-靶器官損傷不可逆:長(zhǎng)期慢性炎癥導(dǎo)致關(guān)節(jié)畸形、腎功能衰竭、神經(jīng)功能障礙等,嚴(yán)重影響生活質(zhì)量。這一背景下,針對(duì)AIDs核心病理機(jī)制的精準(zhǔn)干預(yù)策略——基因編輯技術(shù),已成為近年來的研究熱點(diǎn)。03基因編輯技術(shù):從工具革新到臨床轉(zhuǎn)化1技術(shù)原理與發(fā)展歷程1基因編輯技術(shù)通過靶向修飾基因組DNA序列,實(shí)現(xiàn)對(duì)致病基因的“修正”“敲除”或“插入”,從而從根本上干預(yù)疾病發(fā)生。其發(fā)展歷經(jīng)三個(gè)階段:2-ZFNs(鋅指核酸酶):2000年代初問世,由鋅指蛋白(ZFP)識(shí)別特異DNA序列+FokI核酸酶切割結(jié)構(gòu)域組成,設(shè)計(jì)復(fù)雜、成本高,脫靶效應(yīng)明顯;3-TALENs(轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶):2010年左右興起,利用TALE蛋白的重復(fù)可變雙氨基酸模塊(RVDM)識(shí)別DNA,設(shè)計(jì)靈活性優(yōu)于ZFNs,但蛋白體積大,遞送效率受限;4-CRISPR/Cas系統(tǒng):2012年首次被改造為基因編輯工具,以向?qū)NA(gRNA)介導(dǎo)Cas蛋白(如Cas9、Cas12a)靶向切割DNA,因其設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單、效率高、成本低,迅速成為AIDs研究的核心工具。2主流CRISPR/Cas技術(shù)平臺(tái)及優(yōu)化針對(duì)AIDs的復(fù)雜性,研究者已開發(fā)出多種CRISPR/Cas衍生技術(shù),以滿足不同編輯需求:-TypeIICRISPR/Cas9:最經(jīng)典的編輯系統(tǒng),通過sgRNA引導(dǎo)Cas9蛋白在PAM序列(如NGG)附近產(chǎn)生DSB(雙鏈斷裂),通過NHEJ(非同源末端連接)實(shí)現(xiàn)基因敲除,或通過HDR(同源定向修復(fù))實(shí)現(xiàn)精確基因修飾。目前已開發(fā)出高保真Cas9變體(如eSpCas9、SpCas9-HF1),顯著降低脫靶效應(yīng)。-TypeVCRISPR/Cas12a:無需tracrRNA,crRNA可直接識(shí)別靶序列,且切割后產(chǎn)生5'黏性末端,便于多基因編輯;同時(shí),Cas12a具有反式切割活性,可降解非靶向單鏈DNA,可用于基因編輯的伴隨檢測(cè)。2主流CRISPR/Cas技術(shù)平臺(tái)及優(yōu)化-堿基編輯器(BaseEditors,BEs):融合失活Cas9與脫氨酶(如APOBEC1),實(shí)現(xiàn)單堿基的A→G或C→T轉(zhuǎn)換,無需DSB,適用于點(diǎn)突變相關(guān)AIDs(如PTPN22基因R620W單核苷酸多態(tài)性)。-先導(dǎo)編輯器(PrimeEditors,PEs):由Cas9nickase(nCas9)、逆轉(zhuǎn)錄酶及逆轉(zhuǎn)錄模板組成,可實(shí)現(xiàn)任意堿基的精準(zhǔn)替換、小片段插入/刪除,編輯精度更高,適用于復(fù)雜基因修飾。3遞送系統(tǒng):從體外到體內(nèi)的橋梁基因編輯遞送系統(tǒng)是制約其臨床應(yīng)用的關(guān)鍵瓶頸。目前主要分為兩類:-體外編輯:分離患者自體細(xì)胞(如造血干細(xì)胞、T細(xì)胞),在體外編輯后回輸。該方法遞送效率高、安全性可控,已進(jìn)入臨床階段(如CAR-T細(xì)胞治療)。常用載體為慢病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒,可實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定整合;-體內(nèi)編輯:將編輯系統(tǒng)直接遞送至靶器官(如肝臟、脾臟、關(guān)節(jié))。常用載體包括:-病毒載體:腺相關(guān)病毒(AAV)具有低免疫原性、組織特異性(如AAV8靶向肝臟,AAV9穿越血腦屏障),但存在包裝容量限制(<4.7kb);-非病毒載體:脂質(zhì)納米粒(LNP)、聚合物納米粒、外泌體等可遞送編輯組分(mRNA、RNP),安全性高、可重復(fù)給藥,但組織靶向性和編輯效率仍需優(yōu)化。04基因編輯在自身免疫性疾病中的干預(yù)進(jìn)展1器官特異性自身免疫性疾病1.11型糖尿?。═1D):靶向免疫耐受與β細(xì)胞保護(hù)T1D以胰島β細(xì)胞自身免疫性破壞為特征,遺傳易感基因包括HLA-DQ/DR、INS、PTPN22等?;蚓庉嫴呗跃劢褂冢?調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg)增強(qiáng):FoxP3是Treg發(fā)育和功能的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,通過CRISPR/Cas9敲除Treg細(xì)胞中負(fù)調(diào)控基因(如DNMT3a),可增強(qiáng)其抑制自身反應(yīng)性T細(xì)胞的能力。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示,編輯后的Treg回輸可顯著改善NOD小鼠(T1D模型)的血糖控制,減少胰島炎。-β細(xì)胞自身抗原呈遞阻斷:胰島β細(xì)胞表面表達(dá)MHC-I類分子,呈遞自身抗原(如胰島素、谷氨酸脫羧酶)激活CD8+T細(xì)胞。通過CRISPR/Cas9敲除β細(xì)胞中的β2-微球蛋白(β2m,MHC-I類分子組成部分),可阻斷抗原呈遞,保護(hù)β細(xì)胞免受免疫攻擊。近期研究利用AAV遞送β2m-sgRNA,成功在NOD小鼠中實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)期β細(xì)胞保護(hù),延緩T1D發(fā)病。1器官特異性自身免疫性疾病1.11型糖尿?。═1D):靶向免疫耐受與β細(xì)胞保護(hù)-易感基因修正:T1D風(fēng)險(xiǎn)基因INSVNTR(可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列)影響胰島素表達(dá),通過堿基編輯器修正VNTR長(zhǎng)度,可恢復(fù)胰島素正常轉(zhuǎn)錄,從源頭減少自身抗原產(chǎn)生。1器官特異性自身免疫性疾病1.2多發(fā)性硬化(MS):靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)免疫微環(huán)境MS是以中樞神經(jīng)系統(tǒng)脫髓鞘為特征的自身免疫病,與Th17細(xì)胞浸潤(rùn)、小膠質(zhì)細(xì)胞活化密切相關(guān)?;蚓庉嫺深A(yù)包括:-趨化因子受體調(diào)控:CCR6是Th17細(xì)胞遷移的關(guān)鍵受體,通過CRISPR/Cas9敲除T細(xì)胞中的CCR6,可減少其穿越血腦屏障(BBB)。實(shí)驗(yàn)表明,CCR6-KO小鼠在實(shí)驗(yàn)性自身免疫性腦脊髓炎(EAE,MS模型)中發(fā)病延遲、癥狀減輕,腦內(nèi)Th17細(xì)胞浸潤(rùn)顯著減少。-小膠質(zhì)細(xì)胞M1/M2極化轉(zhuǎn)換:小膠質(zhì)細(xì)胞活化后呈M1型(促炎)或M2型(抗炎),通過靶向編輯IRF5(M1極化關(guān)鍵因子)或PPARγ(M2極化關(guān)鍵因子),可重塑中樞免疫微環(huán)境。2023年研究顯示,利用LNP遞送IRF5-sgRNA至小膠質(zhì)細(xì)胞,可促進(jìn)其向M2型轉(zhuǎn)化,減輕EAE小鼠脫髓鞘損傷。1器官特異性自身免疫性疾病1.2多發(fā)性硬化(MS):靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)免疫微環(huán)境-髓鞘相關(guān)抗原基因編輯:髓鞘堿性蛋白(MBP)、蛋白脂質(zhì)蛋白(PLP)是MS自身靶抗原,通過CRISPR/Cas9敲除少突膠質(zhì)細(xì)胞中的MBP基因,可減少自身抗原釋放,但需權(quán)衡髓鞘修復(fù)功能,目前多采用條件性敲除策略。2系統(tǒng)性自身免疫性疾病3.2.1系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE):靶向自身抗體產(chǎn)生與炎癥風(fēng)暴SLE以抗核抗體(ANA)、抗dsDNA抗體大量產(chǎn)生及多系統(tǒng)受累為特征,易感基因包括IRF5、STAT4、BLK等?;蚓庉嫴呗跃劢褂冢?B細(xì)胞耗竭與功能抑制:CD19是B細(xì)胞表面特異性標(biāo)志物,通過CAR-T細(xì)胞敲除CD19(如CD19-CAR-T),可清除自身反應(yīng)性B細(xì)胞。早期臨床數(shù)據(jù)顯示,1例難治性SLE患者接受CD19-CAR-T治療后,ANA、抗dsDNA抗體轉(zhuǎn)陰,疾病活動(dòng)指數(shù)(SLEDAI)顯著下降,且緩解期超過1年。-I型干擾素(IFN-Ⅰ)通路阻斷:IFN-α是SLE關(guān)鍵致病因子,IRF5是IFN-Ⅰ信號(hào)通路的正調(diào)控因子。通過CRISPR/Cas9敲除B細(xì)胞中的IRF5,可抑制IFN-α產(chǎn)生,減輕炎癥反應(yīng)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示,IRF5-KOBXSB小鼠(SLE模型)的血清IFN-α水平降低,腎小球沉積減少,生存期延長(zhǎng)。2系統(tǒng)性自身免疫性疾病-自身抗體基因編輯:B細(xì)胞受體(BCR)可變區(qū)基因(如IghV)編碼自身抗體,通過堿基編輯器修正BCR基因中的高變區(qū),可阻斷自身抗體產(chǎn)生,但需解決B細(xì)胞多樣性維持問題,目前多采用體外編輯造血干細(xì)胞后回輸。2系統(tǒng)性自身免疫性疾病2.2類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA):靶向滑膜炎癥與骨破壞RA以關(guān)節(jié)滑膜增生、血管翳形成及骨侵蝕為特征,與滑膜成纖維細(xì)胞(FLS)活化、RANKL介導(dǎo)的破骨細(xì)胞分化密切相關(guān)?;蚓庉嫺深A(yù)包括:-FLS侵襲性調(diào)控:FLS的高侵襲性是關(guān)節(jié)破壞的關(guān)鍵,通過CRISPR/Cas9敲除FLS中的MMP9(基質(zhì)金屬蛋白酶9)或CXCR4(趨化因子受體),可抑制其遷移和侵襲。體外實(shí)驗(yàn)顯示,編輯后的FLS穿過基質(zhì)膠的能力下降60%,與T細(xì)胞共培養(yǎng)時(shí)炎癥因子(IL-6、TNF-α)分泌減少。-RANKL/OPG通路平衡:RANKL促進(jìn)破骨細(xì)胞分化,OPG(骨保護(hù)素)抑制該過程,RA患者滑液中RANKL/OPG比例失衡。通過CRISPR/Cas9過表達(dá)OPG或敲除RANKL,可減輕骨侵蝕。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明,關(guān)節(jié)內(nèi)注射AAV-OPG可顯著降低膠原誘導(dǎo)關(guān)節(jié)炎(CIA,RA模型)小鼠的骨破壞評(píng)分,且無明顯不良反應(yīng)。2系統(tǒng)性自身免疫性疾病2.2類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA):靶向滑膜炎癥與骨破壞-易感基因PTPN22編輯:PTPN22R620W突變是RA最強(qiáng)遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素,通過堿基編輯器將620位色氨酸(TGG)修正為酪氨酸(TAC),可恢復(fù)PTPN22對(duì)T細(xì)胞受體(TCR)信號(hào)的正調(diào)控,糾正T細(xì)胞過度活化。目前該策略已在原代T細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)高效編輯(>40%),且編輯后T細(xì)胞增殖和IL-2分泌恢復(fù)正常。3其他自身免疫性疾病3.3.1自身免疫性甲狀腺炎(AITD):靶向甲狀腺細(xì)胞保護(hù)與免疫調(diào)節(jié)AITD以甲狀腺組織淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)、甲狀腺抗體(如TPOAb、TgAb)產(chǎn)生為特征,與HLA-DR3/DR4、TSHR基因多態(tài)性相關(guān)?;蚓庉嫴呗园ǎ?甲狀腺細(xì)胞表面抗原修飾:通過CRISPR/Cas9敲除甲狀腺細(xì)胞中的TSHR基因,可減少自身抗體結(jié)合,保護(hù)甲狀腺細(xì)胞免受抗體依賴細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒性(ADCC)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示,TSHR-KO小鼠在免疫誘導(dǎo)后甲狀腺細(xì)胞存活率提高3倍,甲狀腺功能維持正常。-調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg)過繼治療:分離患者外周血Treg,通過CRISPR/Cas9敲除PD-1(免疫檢查點(diǎn)分子),增強(qiáng)其抑制功能,回輸后可抑制甲狀腺自身反應(yīng)性T細(xì)胞活化。早期臨床前研究顯示,PD-1-KOTreg可顯著減輕實(shí)驗(yàn)性自身免疫性甲狀腺炎(EAT)小鼠的甲狀腺淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)。3其他自身免疫性疾病3.3.2炎癥性腸?。↖BD):腸道屏障修復(fù)與菌群-免疫互作調(diào)控IBD包括克羅恩?。–D)和潰瘍性結(jié)腸炎(UC),以腸道黏膜屏障破壞、菌群失調(diào)及異常免疫反應(yīng)為特征?;蚓庉嫴呗跃劢褂冢?緊密連接蛋白基因編輯:ZO-1、Occludin是腸道緊密連接關(guān)鍵蛋白,通過CRISPR/Cas9過表達(dá)ZO-1,可修復(fù)腸黏膜屏障。DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎小鼠模型中,結(jié)腸局部注射AAV-ZO1可降低腸道通透性,減少細(xì)菌易位,減輕炎癥。-NOD2基因修正:NOD2突變是CD最強(qiáng)遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素,通過先導(dǎo)編輯器修正NOD2基因中的frameshift突變(如L1007fsinsC),可恢復(fù)其對(duì)細(xì)菌產(chǎn)物的識(shí)別能力,糾正異常免疫應(yīng)答。目前該策略已在患者原代腸上皮細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)成功修正,編輯效率達(dá)25%。05面臨的挑戰(zhàn)與倫理考量1技術(shù)層面的核心瓶頸-脫靶效應(yīng):盡管高保真Cas9變體可降低脫靶率,但sgRNA非特異性結(jié)合仍可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定。全基因組測(cè)序(WGS)和GUIDE-seq等技術(shù)雖可檢測(cè)脫靶位點(diǎn),但體內(nèi)編輯的長(zhǎng)期脫靶風(fēng)險(xiǎn)仍需評(píng)估。12-編輯后細(xì)胞功能與安全性:體外編輯的細(xì)胞回輸后可能存在存活時(shí)間短、功能異常(如Treg編輯后失去抑制功能);體內(nèi)編輯可能引發(fā)插入突變(如HDR效率低導(dǎo)致NHEJ占主導(dǎo)),增加致癌風(fēng)險(xiǎn)。3-遞送效率與組織特異性:AAV載體存在免疫原性(部分患者預(yù)存中和抗體)、包裝容量限制;LNP等非病毒載體的器官靶向性不足(如難以穿越血腦屏障、關(guān)節(jié)腔滲透性差)。2安全性評(píng)估與長(zhǎng)期隨訪基因編輯治療的安全性需從“短期急性毒性”和“長(zhǎng)期慢性風(fēng)險(xiǎn)”兩方面評(píng)估:-急性毒性:病毒載體相關(guān)免疫反應(yīng)(如細(xì)胞因子風(fēng)暴)、LNP的肝毒性等,可通過優(yōu)化載體設(shè)計(jì)(如組織特異性啟動(dòng)子、劑量控制)降低;-慢性風(fēng)險(xiǎn):脫靶突變導(dǎo)致的遲發(fā)性腫瘤、編輯細(xì)胞克隆性增生等,需建立長(zhǎng)期隨訪隊(duì)列(>10年),結(jié)合單細(xì)胞測(cè)序、克隆追蹤等技術(shù)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)。目前全球已開展的基因編輯臨床試驗(yàn)(如治療鐮狀細(xì)胞病、β-地中海貧血)中,最長(zhǎng)隨訪時(shí)間約5年,未發(fā)現(xiàn)嚴(yán)重不良反應(yīng),但AIDs多為慢性進(jìn)展性疾病,長(zhǎng)期安全性仍需謹(jǐn)慎驗(yàn)證。3倫理與監(jiān)管框架-體細(xì)胞vs生殖系編輯:當(dāng)前研究聚焦體細(xì)胞編輯(如造血干細(xì)胞、T細(xì)胞),不涉及生殖系細(xì)胞,避免遺傳修飾傳遞給后代;但需明確編輯邊界,防止“基因增強(qiáng)”等非治療性應(yīng)用。-知情同意與風(fēng)險(xiǎn)溝通:患者需充分了解基因編輯的潛在風(fēng)險(xiǎn)(如脫靶、未知長(zhǎng)期效應(yīng)),避免“治療誤解”(如認(rèn)為“一次性根治”)。知情同意書需以通俗語言解釋技術(shù)原理,并提供多語言版本,確保公平可及。-監(jiān)管與標(biāo)準(zhǔn)化:各國(guó)監(jiān)管機(jī)構(gòu)(如FDA、EMA、NMPA)已陸續(xù)發(fā)布基因編輯產(chǎn)品指導(dǎo)原則,強(qiáng)調(diào)“風(fēng)險(xiǎn)-獲益平衡”和“個(gè)體化評(píng)估”。需建立統(tǒng)一的編輯效率檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)(如NGS深度、脫靶位點(diǎn)鑒定方法)、質(zhì)量控制體系,推動(dòng)臨床轉(zhuǎn)化規(guī)范化。12306未來展望與轉(zhuǎn)化路徑1技術(shù)優(yōu)化方向-高精度編輯工具開發(fā):基于AI的sgRNA設(shè)計(jì)工具(如DeepCRISPR)可提升靶點(diǎn)特異性;新型Cas蛋白(如Cas12f、CasΦ)體積更小,適合AAV遞送;表觀編輯技術(shù)(如dCas9-DNMT3A、dCas9-p300)可通過表觀遺傳修飾而非改變DNA序列實(shí)現(xiàn)基因沉默,避免DSB相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。-智能遞送系統(tǒng)構(gòu)建:組織特異性肽修飾的LNP(如腦靶向、關(guān)節(jié)靶向)、雙功能AAV(同時(shí)攜帶編輯組件和調(diào)控元件)可提升遞送效率;外泌體作為天然納米載體,具有低免疫原性、高生物相容性,有望成為下一代遞送工具。-多基因編輯協(xié)同:AIDs多基因遺傳背景復(fù)雜,通過多sgRNA-Cas9系統(tǒng)同時(shí)編輯多個(gè)易感基因(如T1D中的HLA-DQ、INS、PTPN22),可實(shí)現(xiàn)“多靶點(diǎn)協(xié)同干預(yù)”,提高治療效果。2個(gè)體化治療策略-基于患者基因型的編輯方案:通過GWAS和全外顯子測(cè)序(WES)鑒定患者特異性易感突變(如SLE中的IRF5rs2004640),設(shè)計(jì)個(gè)體化sgRNA,實(shí)現(xiàn)“精準(zhǔn)

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