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文檔簡(jiǎn)介
ICS
CCS
團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)
T/CVMAXXXXX—XXXX
犬貓細(xì)小病毒PCR檢測(cè)方法
PCRDetectionMethodofCanineandFelineParvovirus
(征求意見(jiàn)稿)
在提交反饋意見(jiàn)時(shí),請(qǐng)將您知道的相關(guān)專利連同支持性文件一并附上。
XXXX-XX-XX發(fā)布XXXX-XX-XX實(shí)施
中國(guó)獸醫(yī)協(xié)會(huì)??發(fā)布
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所提出。
本文件由中國(guó)獸醫(yī)協(xié)會(huì)歸口。
本文件起草單位:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所、上?;`生物科技有限公司、東莞博盛生
物科技有限公司、北京市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心
本文件主要起草人:梁瑞英、崔尚金、梁琳、湯新明、朱旭、王弋、劉昕、張啟龍
II
犬貓細(xì)小病毒PCR檢測(cè)方法
1范圍
本文件規(guī)定了PCR診斷技術(shù),可以同時(shí)檢測(cè)犬細(xì)小病毒、貓泛白細(xì)胞減少癥病毒(又稱貓細(xì)小病毒)
的通用PCR診斷技術(shù)。
本文件適用于檢測(cè)犬貓細(xì)小病毒核酸,適用于臨床樣品中不同型犬細(xì)小病毒和貓細(xì)小病毒的快速檢
測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB19289實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
GB/T27401實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范動(dòng)物檢疫
NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范。
3術(shù)語(yǔ)和定義
本文件沒(méi)有需要界定的術(shù)語(yǔ)和定義。
4縮略語(yǔ)
CPV:犬細(xì)小病毒(CanineParvovirus);
FPV:貓細(xì)小病毒(FelineParvovirus);
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction);
CPV-2、CPV-2a、CPV-2b、CPV-2c:不同的犬細(xì)小病毒分型
5主要儀器
冰箱、臺(tái)式離心機(jī)、高速臺(tái)式冷凍離心機(jī)、高壓蒸汽滅菌器、PCR儀、單道微量移液器(0.1-2.5
μl,0.5-10μl,1-100μl,1-1000μl)、組織研磨器、水平電泳儀、紫外觀察燈或凝膠成像儀。
6試劑和材料
試驗(yàn)用水均為滅菌超純水,應(yīng)符合GB/T6682中一級(jí)水的要求、醫(yī)用棉簽、槍頭(10μl,200
μl,1000μl)、1.5mlEP管、0.2mlPCR管、dNTP(含dATP、dTTP、dCTP、dGTP各10mmol/L,
-20℃保存。)、PCR檢測(cè)引物序列及反應(yīng)液配方見(jiàn)附錄B。10%十二烷基硫酸鈉:配制參見(jiàn)附
錄A.1、蛋白酶K貯備液:配制參見(jiàn)附錄A.2、5×TBE電泳緩沖液:配制參見(jiàn)附錄A.3。
1
7實(shí)驗(yàn)步驟
7.1樣品的采集與處理
7.1.1血清樣品采集
懷疑細(xì)小病毒感染的犬貓,使用非抗凝管采集全血,詳細(xì)標(biāo)記,登記,室溫靜置30min~1h,放入
離心機(jī)并配平,4000r/min,離心5min,用移液器取離心后的上層血清至做好標(biāo)記的EP管,保存?zhèn)溆谩?/p>
7.1.2糞便或肛拭子樣品采集
使用糞便盒收集發(fā)生腹瀉的犬貓新鮮糞便,或使用棉拭子肛門(mén)轉(zhuǎn)圈采集糞便樣品加適量PBS(pH7.0)
或滅菌超純水,充分混勻后,10000r/min離心5min;取上層水加蓋,編號(hào),保存?zhèn)溆谩?/p>
7.2核酸DNA提取
1)取樣品處理液465μl,加人25μl10%十二烷基硫酸鈉和10μl的20mg/mL蛋白酶K,56℃
水浴搖床上放置2h;
2)加入等量的飽和酚溶液500μl,振蕩混勻20s,12000g離心5min,取上清液;
3)加入等量的酚:三氯甲烷:異戊醇(25:24:1),振蕩混勻20s,12000r/min,離心5min,
取上清液;
4)再加入等量的三氯甲烷:異戊醇(24∶1),振蕩混勻20s,12000r/min離心5min,取上
清液;
5)最后加入兩倍體積的無(wú)水乙醇,上下顛倒混勻,12000r/min離心10min,棄上清;
6)室溫于燥后,加人30μl滅菌雙蒸水溶解沉淀,即得DNA模板,-20℃貯存?zhèn)溆谩?/p>
7)另外,DNA抽提也可采用市售的商品化DNA抽提試劑盒進(jìn)行。
7.3PCR檢測(cè)
反應(yīng)體系見(jiàn)附錄B.2。按下述條件進(jìn)行擴(kuò)增:96℃預(yù)變性5min、(96℃30s、52℃30s、72℃45s,
重復(fù)此循環(huán)30次)72℃延伸10min。反應(yīng)完畢,取PCR反應(yīng)液進(jìn)行1%的瓊脂糖凝膠電泳。
7.4結(jié)果判定
若待檢樣品可擴(kuò)增出大小為669bp的核酸片段(參考核酸序列見(jiàn)附錄C),則判定細(xì)小病毒核酸
陽(yáng)性;若待檢樣品未擴(kuò)增出核酸片段,同時(shí)加入的陰性對(duì)照(即核酸模板用滅菌水替代)成立,則判定
核酸檢測(cè)陰性。
2
附錄A
(資料性)
溶液配方
A.110%十二烷基硫酸鈉(SDS)
在45ml三蒸水溶解5g十二烷基硫酸鈉(電泳級(jí)),加熱至60℃溶解,用鹽酸調(diào)pH值至7.8,
加三蒸水定容至50ml。
A.2蛋白酶K貯備液(20mg/mL)
每升三蒸水中加人三羥甲基氨基甲烷(Tris)1.21mg,乙二胺四乙酸(EDTA)1.86mg,十二
烷基硫酸鈉(SDS)5g,用鹽酸調(diào)pH值至7.8。取該溶液按每毫升加入20mg蛋白酶K,充分溶解后分裝。
A.35×TBE電泳緩沖液
每升三蒸水中加入三羥甲基氨基甲烷(Tris)54.0g,乙二胺四乙酸(EDTA)2.9mg,硼酸27.5g,
用5mol/L的鹽酸調(diào)pH值至8.0。
3
附錄B
(資料性)
引物序列、PCR反應(yīng)體系
B.1引物序列
B.1.1犬貓細(xì)小病毒核酸PCR檢測(cè)方法通用引物序列見(jiàn)表B.1。
表B.1引物序列
引物引物序列(5’-3’)犬貓細(xì)小病毒擴(kuò)增片段(bp)
上游GTAAGCTTCCAGGAGACTTT
669
下游GTAAGCTTCGTCGTGTTC
B.2PCR反應(yīng)液配方
B.2.1犬貓細(xì)小病毒核酸PCR反應(yīng)液配方見(jiàn)表B.2。
表B.2PCR反應(yīng)液配方
PCR反應(yīng)液組分反應(yīng)體系
10×PCRBuffer(withMg2+)5μl
TaqDNAPolymerase(5U/μL)0.5μl
dNTP(2.5mMeach)4μl(終濃度0.2mMeach)
上游引物(100mM)0.2μl(終濃度0.2μM)
下游引物(100mM)0.2μl(終濃度0.2μM)
待檢樣品DNA模板2.0μl(推薦0.1~1μg)
滅菌超純水(至終體積50μl)38.1μl
B.2.2注意事項(xiàng)
通常引物終濃度為0.2μM時(shí)可以獲得良好的檢測(cè)效果,可根據(jù)情況在0.1~1μM范圍內(nèi)調(diào)整引物的終
濃度。擴(kuò)增效率不高時(shí),可提高引物濃度,發(fā)生非特異性反應(yīng)時(shí),可降低引物濃度。
4
附錄C
(資料性)
擴(kuò)增核酸序列
AAGCTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGT
TAAACATGGTTATGAATCAACCATGGCTAACTATACACATCATTGGGGAAAAGTACCAGAATGG
GATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTGCAAAGACTTAG
AGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGACGT
AGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAA
CAATCAAACCAACTTGGCGTTACTCACAAAGACGTACAAGCGAGTCCGACGTGGTCCGAAATAG
AGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACAATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGAT
TAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTAAAGTGGG
GGGAGGGGAAAGATTTAATAACTTAACTAAGTATGTGTTTTCTTATAGGACTTGTGCCTCCAGGT
TATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGC
TGCAAAAGAACACGACGAAGCTTAC
_________________________________
5
目次
前言.......................................................................................................................................................................II
1范圍...................................................................................................................................................................1
2規(guī)范性引用文件...............................................................................................................................................1
3術(shù)語(yǔ)和定義.......................................................................................................................................................1
4主要儀器...........................................................................................................................................................1
5試劑和材料.......................................................................................................................................................1
6實(shí)驗(yàn)步驟...........................................................................................................................................................2
附錄A(資料性)溶液配方..............................................................................................................................3
附錄B(資料性)引物序列、PCR反應(yīng)體系..................................................................................................4
附錄C(資料性)擴(kuò)增核酸序列..........................................................................................................................5
I
犬貓細(xì)小病毒PCR檢測(cè)方法
1范圍
本文件規(guī)定了PCR診斷技術(shù),可以同時(shí)檢測(cè)犬細(xì)小病毒、貓泛白細(xì)胞減少癥病毒(又稱貓細(xì)小病毒)
的通用PCR診斷技術(shù)。
本文件適用于檢測(cè)犬貓細(xì)小病毒核酸,適用于臨床樣品中不同型犬細(xì)小病毒和貓細(xì)小病毒的快速檢
測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB19289實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
GB/T27401實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范動(dòng)物檢疫
NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范。
3術(shù)語(yǔ)和定義
本文件沒(méi)有需要界定的術(shù)語(yǔ)和定義。
4縮略語(yǔ)
CPV:犬細(xì)小病毒(CanineParvovirus);
FPV:貓細(xì)小病毒(FelineParvovirus);
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction);
CPV-2、CPV-2a、CPV-2b、CPV-2c:不同的犬細(xì)小病毒分型
5主要儀器
冰箱、臺(tái)式離心機(jī)、高速臺(tái)式冷凍離心機(jī)、高壓蒸汽滅菌器、PCR儀、單道微量移液器(0.1-2.5
μl,0.5-10μl,1-100μl,1-1000μl)、組織研磨器、水平電泳儀、紫外觀察燈或凝膠成像儀。
6試劑和材料
試驗(yàn)用水均為滅菌超純水,應(yīng)符合GB/T6682中一級(jí)水的要求、醫(yī)用棉簽、槍頭(10μl,200
μl,1000μl)、1.5mlEP管、0.2mlPCR管、dNTP(含dATP、dTTP、dCTP、dGTP各10mmol/L,
-20℃保存。)、PCR檢測(cè)引物序列及反應(yīng)液配方見(jiàn)附錄B。10%十二烷基硫酸鈉:配制參見(jiàn)附
錄A.1、蛋白酶K貯備液:配制參見(jiàn)附錄A.2、5×TBE電泳緩沖液:配制參見(jiàn)附錄A.3。
1
7實(shí)驗(yàn)步驟
7.1樣品的采集與處理
7.1.1血清樣品采集
懷疑細(xì)小病毒感染的犬貓,使用非抗凝管采集全血,詳細(xì)標(biāo)記,登記,室溫靜置30min~1h,放入
離心機(jī)并配平,4000r/min,離心5min,用移液器取離心后的上層血清至做好標(biāo)記的EP管,保存?zhèn)溆谩?/p>
7.1.2糞便或肛拭子樣品采集
使用糞便盒收集發(fā)生腹瀉的犬貓
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