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文檔簡介
1、動(dòng)物肝臟DNA的制備和鑒定,甘肅中醫(yī)藥大學(xué),核酸的分類,DNA (脫氧核糖核酸) 主要存在于細(xì)胞核的染色體中。 核外也有少量DNA,如線粒體DNA(mtDNA),葉綠體DNA(cpDNA),質(zhì)粒DNA。 RNA(核糖核酸) 存在于細(xì)胞質(zhì)中,如mRNA, rRNA, tRNA等。 除上述DNA,RNA外,還有非細(xì)胞形式存在的病毒和噬菌體,其或只含DNA,或只含有RNA。,核酸的理化性質(zhì),在細(xì)胞內(nèi)通常與蛋白質(zhì)結(jié)合,以復(fù)合物形式存在,微溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有機(jī)溶劑,在酸性溶液中容易降解,在中性或弱堿性溶液中較穩(wěn)定。,DNA溶液粘度很大,RNA的粘度較小,在強(qiáng)大離心力的作用下,可以從溶液中沉降下
2、來,濃鹽法:利用RNA和DNA在不同鹽濃度溶液中的溶解度不同將二者分離。 離子去污劑法:利用SDS、CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)等去污劑使蛋白質(zhì)變性,直接從生物材料中提取DNA。 苯酚抽提法:苯酚既是蛋白變性劑,又能抑制DNase的降解。用苯酚處理勻漿液時(shí),由于蛋白與DNA連接鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團(tuán)與苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。,基因組DNA的提取方法,核酸制備中常用的去垢劑 核酸本身帶負(fù)電荷,結(jié)合帶正電荷的蛋白質(zhì)。用于核酸提取的去垢劑,一般都是陰離子去垢劑。 去垢劑的作用: 1溶解膜蛋白及脂肪,使細(xì)胞膜破裂; 2溶解核糖體上面的蛋白質(zhì),使其解聚,將核
3、酸釋放出來; 3對(duì)RNase、DNase有一定的抑制作用。,如:SDS、脫氧膽酸鈉、4-氨基水楊酸鈉、萘-1.5-二磺酸鈉、三異丙基萘磺酸鈉,作用: 1.使蛋白質(zhì)變性、沉淀,從核酸提取液中分離除去,以防造成蛋白污染。 2.某些蛋白質(zhì)變性劑也有抑制 RNase活性和破裂細(xì)胞的作用。,如:苯酚、氯仿、鹽酸胍、DEPC,核酸制備中常用的蛋白質(zhì)變性劑,核酸制備中常用的酶 DNase:降解DNA RNase:降解RNA 蛋白酶K:降解蛋白質(zhì) 溶菌酶:破碎細(xì)胞,核酸提取的主要步驟,沉淀核酸,去除鹽類,有機(jī)溶劑等雜質(zhì),除去與核酸結(jié)合的蛋白質(zhì)以及多糖、脂類等生物大分子:酚/氯仿抽提、蛋白變性劑(SDS、異硫氰
4、酸胍等)、蛋白酶處理、高鹽洗滌,除去其它不需要的核酸分子,破碎細(xì)胞:研磨、組織勻漿、超聲、凍融;異硫氰酸胍、堿裂解;酶解(溶菌酶),注意事項(xiàng),加入RNA降解酶除RNA,加入DNA酶抑制劑:檸檬酸、氰化物、砷酸鹽、EDTA、SDS、苯酚等,蛋白變性劑反應(yīng)不宜過于劇烈,避免過酸、過堿及高溫,一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?1、學(xué)習(xí)并掌握用濃鹽法從動(dòng)物組織中的提取DNA方法及其原理。 2、學(xué)習(xí)和掌握二苯胺法測定DNA的原理和方法。,二、實(shí)驗(yàn)原理,核酸在真核細(xì)胞中都是以與蛋白質(zhì)結(jié)合的狀態(tài)存在,用DNP和RNP表示。 DNA-Pro(DNP) 細(xì)胞核 RNA-Pro(RNP) 核仁及細(xì)胞質(zhì),溶于高鹽溶液(1mol/L)
5、, 微溶于低鹽溶液(0.14mol/L) 溶于低鹽溶液(0.14mol/L) 微溶于高鹽溶液(1mol/L),核酸含量的測定方法:紫外吸收法、定磷法和分別針對(duì)DNA和RNA的顏色反應(yīng)方法。 脫氧核糖核酸中的脫氧核糖在酸性環(huán)境中變成-羥基-酮基戊醛與二苯胺試劑一起加熱產(chǎn)生藍(lán)色化合物,在595nm處有最大的吸收 。 DNA20400微克范圍內(nèi),光密度與DNA的濃度成正比,在反應(yīng)液中加入少量乙醛,可以提高反應(yīng)的靈敏度。,三、實(shí)驗(yàn)試劑,95%冷乙醇、NaCl固體,二苯胺:稱取純二苯胺1g溶于100ml冰醋酸中,加入10ml過氯酸,混勻。臨用時(shí)加1ml1.6%乙醛溶液,所配置試劑應(yīng)為無色。,0.14mo
6、lL NaCl0.05molL 檸檬酸鈉緩沖液(PH=6.8),DNA標(biāo)準(zhǔn)液200ug/ml:DNA鈉鹽用5mmol/L的NaOH配制。,氯仿/異戊醇=20:1(V/V),5% SDS,組織搗碎勻漿機(jī),除去蛋白質(zhì)的方法,SDS(十二烷基硫酸鈉)等去污劑使蛋白質(zhì)變性,可以直接從生物材料中提取DNA,防止DNA酶的降解,提取時(shí)可加入適量EDTA(乙二胺四乙酸)、檸檬酸,以降低DNA酶的活性,氯仿一異成醇使蛋白質(zhì)變性,離心除去變性蛋白質(zhì),DNA的定量測定,DNA粗品用5mmol/LNaOH溶解并定容至50ml,作為待測品。,混勻,60水浴保溫45min,冷卻后,595nm處,比色。,以吸光度A595nm對(duì)DNA含量(ug)作圖, 繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。 從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出樣品的DNA含量。 計(jì)算100g豬肝中DNA的含量: 待測樣品中DNA的質(zhì)量25(稀釋倍數(shù)) 稱取豬肝的質(zhì)量,=,勻漿(破碎細(xì)胞)要充分,需剪成小塊。 固體NaCl應(yīng)磨碎,加入應(yīng)分批緩慢加入,邊加邊搖,避免局部濃度過大或者
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