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1、磁珠式核酸提取體系,核酸提取的總體要求,高質(zhì)量:純度高并且盡可能不破壞核酸 高產(chǎn)量:樣本量一定時(shí)盡可能提取多的核酸 高通量:同時(shí)提取多個(gè)標(biāo)本 自動(dòng)化:降低勞動(dòng)量;生物科技的飛速發(fā)展,需要處理的核酸樣本迅速增多,自動(dòng)化提取核酸成為一種迫切需要的選擇。,磁粒法核酸提取的特點(diǎn),步驟: 裂解核酸結(jié)合洗滌洗脫 特點(diǎn): 提取時(shí)間短 不使用酚、氯仿 用磁分離替代離心分離易于自動(dòng)化,可以實(shí)現(xiàn)高通量提取 目前處于市場(chǎng)發(fā)育階段,是未來(lái)發(fā)展的方向 主要產(chǎn)品為國(guó)外產(chǎn)品:Promega、Roche、KingFisher、Dynal等,大多需要與專用儀器配套,各種提取方式操作比較,磁粒法核酸提取基本步驟,裂解細(xì)胞或病毒顆
2、粒 核酸與磁粒結(jié)合 磁分離棄上清 洗滌緩沖液洗滌磁粒 磁分離棄上清 洗脫液將核酸從磁粒洗脫 磁分離棄磁粒,收集上清,磁粒法提取核酸示意圖,磁粒提取試劑操作方式,磁架 磁筆 自動(dòng)提取儀,裂解,結(jié)合,磁分離,吸去廢液,洗滌,洗脫,磁架提取核酸示意圖,裂解,結(jié)合,轉(zhuǎn)移磁粒,洗滌,洗脫,轉(zhuǎn)移磁粒,磁筆提取核酸示意圖,自動(dòng)儀器提取,自動(dòng)提取的原理與磁筆提取相同,只是用機(jī)器的運(yùn)轉(zhuǎn)代替手工操作,實(shí)現(xiàn)高通量提取和減少工作量。,磁珠提取方法的優(yōu)化,裂解:裂解液配方,作用時(shí)間和溫度等 結(jié)合:結(jié)合液的選擇和用量等 洗滌:洗滌液配方等 洗脫:洗脫時(shí)間和溫度等,主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果,與其他方法或類似商業(yè)化試劑盒的比較 核酸提取
3、的靈敏度: HCV RNA,HIV RNA,HBV DNA,與Qiagen 磁珠式核酸提取試劑盒的比較,HCV RNA提取比較,HBV DNA提取比較,提取靈敏度實(shí)驗(yàn),陽(yáng)性樣本梯度稀釋 國(guó)家靈敏度參考品,HCV RNA提取,HCV陽(yáng)性樣本10倍稀釋梯度:100,10-1,10-2,10-3,10-4,磁珠提取與柱提取法比較(數(shù)據(jù)見(jiàn)下頁(yè)),磁珠提取方法與柱提取法及水溶液梯度稀釋樣本比較,磁珠提取與柱提法的提取效果相當(dāng)。在低濃度樣本提取方面,熒光增量與稀釋組無(wú)顯著差異,此方法在去除樣本中抑制物方面效果良好。,HCV RNA國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)品檢測(cè),10份陽(yáng)性參考品: P1P10,HIV RNA提取,HIV陽(yáng)性樣本梯度稀釋成1/5,1/25,1/50,1/100和1/200 五個(gè)濃度,提取RNA,原樣本提取后用TE按相同比例稀釋 ,上機(jī)比較。,HIV 樣本稀釋梯度: 1/5,1/25,1/50,1/100和1/200,HIV核酸國(guó)家參考品檢測(cè),HIV RNA靈敏度和定量參考品:B2B5(至少檢出B2-B3),HIV RNA線性參考品:A2A5。,HIV RNA熒光定量標(biāo)準(zhǔn)曲線, 線形相關(guān)系數(shù):0.9907,HIV 陽(yáng)性參考品:P1, P2, P3, P5, P7, P8,HIV陽(yáng)性參考品檢測(cè),中檢所HBV核酸
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