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1、實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,1,行業(yè)重點(diǎn),一、實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理,熒光定量 PCR 通過(guò)熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性的探針,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,實(shí)時(shí)在線監(jiān)控反應(yīng)過(guò)程,結(jié)合相應(yīng)的軟件可以對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析,計(jì)算待測(cè)樣品的初始模板量。 熒光定量 PCR儀 熒光定量PCR儀是一種帶有激發(fā)光源和熒光信號(hào)檢測(cè)系統(tǒng)的PCR儀,通常配有電腦系統(tǒng)及相應(yīng)的分析軟件。,2,行業(yè)重點(diǎn),定量PCR技術(shù)的產(chǎn)生 1992年由Higuchi等人第一次報(bào)告:使用EB內(nèi)插染料法插至雙鏈DNA,經(jīng)改裝的帶有冷CCD的PCR儀檢測(cè)樣品的熒光強(qiáng)度 PCR循環(huán) = 雙鏈DNA = 染料 = 熒光 后來(lái)用與雙鏈DNA有更強(qiáng)結(jié)合力的SYB
2、R Green I取代EB,3,行業(yè)重點(diǎn),熒光定量實(shí)時(shí)PCR與普通PCR的比較 實(shí)時(shí)在線監(jiān)控 對(duì)樣品擴(kuò)增的整個(gè)過(guò)程進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控,能夠?qū)崟r(shí)地觀察到產(chǎn)物的增加,直觀地看到反應(yīng)的對(duì)數(shù)期 降低反應(yīng)的非特異性 使用引物和熒光探針同時(shí)與模板特異性結(jié)合,提高了PCR反應(yīng)的特異性 增加定量的精確性 全程監(jiān)控,準(zhǔn)確的算法進(jìn)行定量 結(jié)果分析更加快捷方便,無(wú)需跑膠,4,行業(yè)重點(diǎn),羅氏產(chǎn)品介紹以及與同類產(chǎn)品之間的對(duì)比,5,行業(yè)重點(diǎn),一、LC1.5和LC2.0,LightCycler熒光定量PCR系統(tǒng),LC1.5,LC2.0,6,行業(yè)重點(diǎn),Lightcycler 1.5 結(jié)構(gòu)分析,以空氣加熱及冷卻迅速改變溫度,帶有極高
3、表面積/容量比例的密封20l毛細(xì)管,加熱線圈,可容納32個(gè)樣品的卡盤,將熒光儀定位的 分檔器發(fā)動(dòng)機(jī),將樣品置于 光學(xué)儀上的 分檔器發(fā)動(dòng)機(jī),熱室,風(fēng)扇,濾器,免維護(hù)的 LED光源,光學(xué)倍增管,7,行業(yè)重點(diǎn),Lightcycler 2.0 結(jié)構(gòu)分析,空氣加熱系統(tǒng),LED激發(fā)光源,PMT檢測(cè)系統(tǒng),光纖,8,行業(yè)重點(diǎn),熱力學(xué)結(jié)構(gòu),特點(diǎn): 1、空氣加熱 2、毛細(xì)管反應(yīng)體系 優(yōu)點(diǎn): 1、升降溫速度快(0.05 -20/秒), 2、體系均一,不存在邊緣現(xiàn)象 3、把反應(yīng)體系縮小到0-20ul,節(jié)省試劑成本 實(shí)現(xiàn)快速PCR,9,行業(yè)重點(diǎn),光學(xué)結(jié)構(gòu),特點(diǎn): 1、免維護(hù)的LED冷光源,壽命長(zhǎng)達(dá)2萬(wàn)小時(shí)以上 2、光學(xué)
4、倍增管(Rodenstock ) 3、多達(dá)6通道(LC2.0)和3通道(LC1.5)實(shí)時(shí)檢 測(cè) 優(yōu)點(diǎn): 1、毛細(xì)管光學(xué)特性將光線散射、衍射降至最低, 避免LED 功率低的問(wèn)題 2、免維護(hù),帶自動(dòng)檢驗(yàn)功能 3、輕易實(shí)現(xiàn)內(nèi)標(biāo)、內(nèi)對(duì)照及多重PCR,10,行業(yè)重點(diǎn),LightCycler 結(jié)構(gòu)分析,11,行業(yè)重點(diǎn),LightCycler 軟件 4.0 更先進(jìn)的自動(dòng)定量方法 全新的相對(duì)定量軟件 全自動(dòng)熔點(diǎn)曲線分組 全自動(dòng)熔點(diǎn)溫度提示 簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)和用戶管理,12,行業(yè)重點(diǎn),PCR領(lǐng)域最聰明的革新 LightCycler熒光定量PCR系統(tǒng),超高速 30至40分鐘完成PCR過(guò)程 實(shí)時(shí)在線監(jiān)測(cè) 收集每一循環(huán)的數(shù)據(jù)
5、并立即顯示于聯(lián)機(jī)電腦上 高靈敏 在一個(gè)基因組當(dāng)量中可檢測(cè)出單基因拷貝 范圍廣 可檢測(cè)101010拷貝線性范圍,無(wú)需稀釋樣品 開(kāi)放性 全開(kāi)放,成為國(guó)內(nèi)外試劑廠家的首選開(kāi)發(fā)平臺(tái) 六個(gè)熒光通道 輕易實(shí)現(xiàn)內(nèi)標(biāo)、內(nèi)對(duì)照或多重PCR 最小化 定量反應(yīng)體積降至1020ul,費(fèi)用低廉 靈活性 支持水解探針、雜交探針及 SYBR Green I 閉管分析 消除污染風(fēng)險(xiǎn),13,行業(yè)重點(diǎn),Lightcycler 的分析模式,適用于所有的通用探針及染料分析模式: SYBR Green I(熒光染料) TaqMan(水解探針) Molecular beacon(分子信標(biāo)) Lightcycler上開(kāi)發(fā)獨(dú)有的分析模式:
6、Hybridization Probe Format(雜交探針) SimpleProbe (單探針),14,行業(yè)重點(diǎn),SYBR-Green I 檢測(cè)模式 SYBR Green I能選擇性地與雙鏈DNA結(jié)合,在外界光源激發(fā)下產(chǎn)生強(qiáng)烈熒光。在PCR過(guò)程中, SYBR Green I可與新合成地雙鏈DNA結(jié)合,產(chǎn)生地?zé)晒庑盘?hào)強(qiáng)度與雙鏈DNA含量成正比,熒光檢測(cè)在每一循環(huán)的延期后進(jìn)行。 SYBR Green I與非特異性雙鏈DNA(如引物二聚體)結(jié)合產(chǎn)生的干擾可通過(guò)融解曲線分析而得到解決。,15,行業(yè)重點(diǎn),水解探針(Taqman )檢測(cè)模式 同時(shí)標(biāo)記有熒光發(fā)光分子和熒光淬滅分子的一條探針在激發(fā)光作用下
7、,發(fā)光分子所產(chǎn)生的熒光可被淬滅分子吸收,因而檢測(cè)不到熒光。在PCR延伸時(shí),因Taq酶具有的5,3,核酸外切酶活性,可降解熒光探針,使熒光發(fā)光分子與熒光淬滅分子分開(kāi),在外界光源激發(fā)下即可發(fā)出熒光,熒光強(qiáng)度與PCR擴(kuò)增產(chǎn)物量有關(guān)。,16,行業(yè)重點(diǎn),分子信標(biāo)(Molecular Beacon Probe) 獨(dú)特的頸環(huán)結(jié)構(gòu),由非特異的頸和特異的環(huán)組成,探針的5端標(biāo)記熒光分子,3端 標(biāo)記一個(gè)吸收或淬滅熒光的分子 。自身環(huán)化時(shí)儀器檢測(cè)不到熒光,在PCR反應(yīng)的退火階段,探針因與模板鏈雜交而打開(kāi),使5端熒光分子與3端吸收或淬滅熒光的分子分開(kāi),儀器就會(huì)檢測(cè)到熒光信號(hào)。每一個(gè)循環(huán),隨著PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的增加,熒光信
8、號(hào)會(huì)增強(qiáng),從而根據(jù)熒光信號(hào)的增強(qiáng)來(lái)計(jì)算PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的增加量。,17,行業(yè)重點(diǎn),雜交探針(HybProbe)檢測(cè)模式 設(shè)計(jì)與檢測(cè)區(qū)互補(bǔ)的分別帶有不同染料標(biāo)記的一對(duì)寡核苷酸(既雜交探針),在與擴(kuò)增的DNA片斷雜交時(shí),兩種染料互相接近。其中供體熒光染料受外來(lái)光源激發(fā)后,將能量傳遞給附近的受體染料,既發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),從而釋放出受體染料分子的發(fā)射波長(zhǎng)熒光信號(hào)。熒光信號(hào)的強(qiáng)度和DNA的產(chǎn)量成正比。其他非特異性產(chǎn)物由于不會(huì)與探針雜交,因而不產(chǎn)生信號(hào)干擾。,18,行業(yè)重點(diǎn),for sequence specific detection of DNA,雜交探針檢測(cè)羅氏專利性技術(shù),19,行業(yè)重
9、點(diǎn),Template: Plasmid; Target: CycA; Detection Format: Hybridization Probes,Standard Calculated concentration,9.522E+9 1.024E+9 9.433E+7 1.127E+7 1.029E+6 9.902E+4 1.021E+4 9.217E+2 9.276E+1 1.085E+1 H2O,1.0E+10 1.0E+9 1.0E+8 1.0E+7 1.0E+6 1.0E+5 1.0E+4 1.0E+3 1.0E+2 1.0E+1 H2O,雜交探針的優(yōu)點(diǎn): 1.靈敏度高 2.寬動(dòng)力學(xué)范
10、圍 3.特異性高 4.可用于突變分析,Monitoring of PCR with the LightCyclerUsing Hybridization Probes,20,行業(yè)重點(diǎn),專用于SNP基因分型和突變檢測(cè)的 SimpleProbe SimpleProbe作為一種獨(dú)特的雜交探針只含有一條寡核苷酸探針,能夠特異性的與目的基因上含有SNP位點(diǎn)的靶序列結(jié)合。探針與靶序列結(jié)合后,釋放出能夠被檢測(cè)到的熒光信號(hào),通過(guò)對(duì)熔點(diǎn)曲線分析中探針釋放的熒光信號(hào)強(qiáng)度的分析,可以得到對(duì)目的基因的多態(tài)位點(diǎn)的準(zhǔn)確分析結(jié)果。,21,行業(yè)重點(diǎn),Denaturation phase: SimpleProbe free i
11、n solution; emission of reporter dye is quenched,Annealing phase: Fluorescence from reporter dye increases when probe is annealed to its complementary target,New Probe Format : SimpleProbe Format-高效低成本的新型探針,R = Reporter (Fluorescein) Q = Quencher,22,行業(yè)重點(diǎn),熒光定量PCR儀的部分應(yīng)用,醫(yī)學(xué)相關(guān)研究 疾病的臨床早期診斷 病原體的含量檢測(cè) 合理用藥分
12、子水平的療效研究 疾病的發(fā)病監(jiān)控研究 腫瘤相關(guān)基因腫瘤、耐藥基因的檢測(cè) 研究組織或培養(yǎng)細(xì)胞中mRNA的表達(dá)水平 各種處理對(duì)細(xì)胞mRNA含量變化的影響 比較染病組織與正常組織中各種mRNA含量差異 DNA或RNA的轉(zhuǎn)染量與實(shí)驗(yàn)結(jié)果關(guān)系的研究 基因分型及SNP分析 轉(zhuǎn)基因動(dòng)物及植物研究,23,行業(yè)重點(diǎn),重點(diǎn)問(wèn)題說(shuō)明,超高速的熱循環(huán) 由于采用空氣迅速改變溫度,以及利用有高表面積/體積比的光學(xué)玻璃毛細(xì)管模式,使升降溫速度最高可達(dá)20/秒,溫控0.2 , 每2030分鐘便能完成3040個(gè)循環(huán)。 升降溫?cái)?shù)率唯一可調(diào)可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)的需要調(diào)整升降溫速率的系統(tǒng)0.0520 /秒,優(yōu)化實(shí)驗(yàn)。,24,行業(yè)重點(diǎn),配套功
13、能強(qiáng)大的分析軟件: (1)絕對(duì)定量(具“單點(diǎn)定標(biāo)”功能) (2)相對(duì)定量(可進(jìn)行效率校正) (3)自動(dòng)基因分型(SNP) (4) 顏色干擾校正 獨(dú)特的熔點(diǎn)曲線分析功能,可進(jìn)一步作PCR后分析: - 檢測(cè)非特異擴(kuò)增并作矯正 - 鑒別基因型而又無(wú)需采用測(cè)序凝膠 - 檢測(cè)點(diǎn)突變,并可利用雙色檢測(cè)及顏色補(bǔ)償軟 件在同 一反應(yīng)中分析較復(fù)雜的突變,25,行業(yè)重點(diǎn),為什么使用DNase-Free & RNase-Free 的光學(xué)玻璃 毛細(xì)管? 玻璃反應(yīng)管可加快熱傳導(dǎo)速率. 毛細(xì)管增加表面積/體積比,確??諝夂头磻?yīng)成分之間的 溫度迅速平衡,溫度均一. 縮短了PCR反應(yīng)時(shí)間,特別是熒光激發(fā)的時(shí)間,保證了 反應(yīng)成
14、分的穩(wěn)定性,尤其是熒光染料的穩(wěn)定性。 縮小反應(yīng)體系, 降低檢測(cè)成本。 光學(xué)玻璃毛細(xì)管的材料適合熒光訊號(hào)的測(cè)定,類似光纖 的形狀,保證熒光訊號(hào)的準(zhǔn)確捕獲。沒(méi)有邊緣效應(yīng).,26,行業(yè)重點(diǎn),LightCycler / 毛細(xì)管 / 試劑的成本核算 儀器的維護(hù)費(fèi)用 LightCycler是免維護(hù)的儀器,采用的光源是普通的發(fā)光二極管,壽命長(zhǎng)達(dá)20000小時(shí)以上,非常穩(wěn)定,價(jià)格低廉。而鹵素?zé)艄庠?,壽?000小時(shí),發(fā)光強(qiáng)度衰減明顯,需要定期更換,價(jià)格昂貴。 單一反應(yīng)成本的計(jì)算 單一反應(yīng)成本包括試劑成本和反應(yīng)管成本,由于毛細(xì)管的反應(yīng)體系是1020ul,而其他同類機(jī)器的反應(yīng)體系是50ul,所以使用LC試劑的成本
15、可以減少至少一半。,27,行業(yè)重點(diǎn),28,行業(yè)重點(diǎn),LC1.5與同質(zhì)產(chǎn)品的對(duì)比,29,行業(yè)重點(diǎn),30,行業(yè)重點(diǎn),LC2.0與同質(zhì)產(chǎn)品的對(duì)比,31,行業(yè)重點(diǎn),二、LC480,LightCycler480實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng),32,行業(yè)重點(diǎn),高靈敏 可檢測(cè)單拷貝基因動(dòng)力學(xué)范圍廣 可檢測(cè)101010個(gè)拷貝高重復(fù)性 重復(fù)性高,CV0.3高分辨率 輕松區(qū)分1000拷貝以下2倍濃度差異高速 40分鐘完成40個(gè)PCR循環(huán)技術(shù)創(chuàng)新 采用Therma-BaseTM熱循環(huán)專利技術(shù) 和先進(jìn)的光學(xué)檢測(cè)系 統(tǒng),徹底消除邊緣效應(yīng),保持穩(wěn)定優(yōu)異的檢測(cè)結(jié)果。靈活 分析模式多樣,絕對(duì)定量,相對(duì)定量,融解曲線分析等幾乎 適用所
16、有的檢測(cè)模式(SYBR Green ,Taqman Probe, Hybprobe,SimpleProbe等)模塊化 可互換的96孔,384孔加熱模塊,用戶可以自助更換模塊, 不需要工程師到場(chǎng)自動(dòng)化平臺(tái) 配以LIMS系統(tǒng)及自動(dòng)進(jìn)樣機(jī)械臂,可實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)程操作及全 自動(dòng)化運(yùn)作用戶界面友好 軟件直觀簡(jiǎn)潔,易操作,LightCycler480系統(tǒng)主要特點(diǎn),33,行業(yè)重點(diǎn),LightCycler480系統(tǒng)主要參數(shù),34,行業(yè)重點(diǎn),創(chuàng)新的PCR熱循環(huán)模塊設(shè)計(jì),Therma-BaseTM 是一個(gè)內(nèi)壁布滿燈芯狀毛細(xì)管結(jié)構(gòu)的腔體,通過(guò)一系列的冷凝合蒸發(fā),Therma-BaseTM 高效地傳遞熱量,從而實(shí)現(xiàn)整板最大的
17、溫度均一性。,Therma-BaseTM核心優(yōu)勢(shì) 優(yōu)異的空間溫度均一性 快速、準(zhǔn)確的溫度調(diào)控 40個(gè)循環(huán)40分鐘(384孔板),35,行業(yè)重點(diǎn),36,行業(yè)重點(diǎn),先進(jìn)獨(dú)特的光學(xué)系統(tǒng),LC480系統(tǒng)使用寬光譜、高強(qiáng)度的氙燈作為光源。激發(fā)光經(jīng)過(guò)多次反射后形成與孔板大小相同、光強(qiáng)均一的光柱,有效消除邊緣效應(yīng)。激發(fā)波長(zhǎng)和發(fā)射波長(zhǎng)的任意組合,使得多種熒光染料和檢測(cè)模式可用于目前所有的實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)。 LC480光學(xué)系統(tǒng)的核心優(yōu)勢(shì): 最靈活地選擇熒光染料及檢測(cè)模式 整板數(shù)據(jù)的精確捕獲 強(qiáng)大的多重PCR能力,37,行業(yè)重點(diǎn),多檢測(cè)通道支持所有的檢測(cè)模式 LightCycler 480系統(tǒng)支持目前所有檢
18、測(cè)模式的使用,包括雜交探針、 SYBR Green I DNA結(jié)合染色、單探針、水解探針和分子信標(biāo)等等。多色熒光檢 測(cè)系統(tǒng),提供五色激發(fā)通道(450 nm, 483 nm, 523 nm, 558 nm, 615 nm)和六色熒 光檢測(cè)通道( 500 nm, 533 nm, 568 nm, 610 nm, 640 nm, 670 nm),并具有顏色補(bǔ)償 功能;可自由選擇,輕松實(shí)現(xiàn)多重或多色PCR。,38,行業(yè)重點(diǎn),公認(rèn)的性能獨(dú)特的軟件,基于用戶公認(rèn)的LC480軟件,新的LC480軟件采用羅氏獨(dú)特的算法來(lái) 進(jìn)行高度精確、自動(dòng)化的數(shù)據(jù)分析。而且,新軟件還提供了許多新的的 特性,讓用戶能夠輕松、省時(shí)地處理高通量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。 LC480軟件設(shè)計(jì)宗旨是為了用戶需求量身定做。支持絕對(duì)定量、融解 曲線分析、相對(duì)定量和自動(dòng)基因分型等功能。 LC480軟件的核心優(yōu)勢(shì): 采用公認(rèn)的優(yōu)秀算法來(lái)分析數(shù)據(jù) 友好的用戶界面,簡(jiǎn)單的快捷方式,便于進(jìn)行高通量樣品編輯及數(shù)據(jù)處理。 軟件模塊化,用戶可根據(jù)自己的研究情況選擇性安裝。,39,行業(yè)重點(diǎn),40,行業(yè)重點(diǎn),模塊系統(tǒng)概念,LightCycler 480在系統(tǒng)初始配置的基礎(chǔ)上,還可根據(jù)客戶的特別要求,通過(guò)在系統(tǒng)中添加各種先進(jìn)的軟件分析模塊進(jìn)行系統(tǒng)升級(jí),滿足用戶不同階段的研究需求。目前可提供的系
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