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1、第二章 核酸結(jié)構(gòu)與功能,核酸的概念和重要性,核酸的組成成分,DNA的結(jié)構(gòu),DNA和基因組及基因組學,RNA的結(jié)構(gòu)和功能,核酸的性質(zhì),核酸的序列測定,核酸的生物學功能和實踐意義,一、核酸的概念和重要性,1869年Miescher從細胞核中分離出核素(nuclein)。,1889年Altman制備了核酸(nucleic acid)。,193040年,Kossel (5,368 堿基對)完全測序,成為第一個測定的基因組。,1995年,嗜血流感菌(Haemophilus influenzae,1.8Mb)測序完成,是第一個測定的自由生活物種。從這時起,基因組測序工作迅速展開。 2001年,人類基因組計
2、劃公布了人類基因組草圖,為基因組學研究揭開新的一頁。 基因組學是研究生物基因組的組成,組內(nèi)各基因的精確結(jié)構(gòu)、相互關(guān)系及表達調(diào)控的科學。,五、RNA的結(jié)構(gòu)與功能,RNA分子是含短的不完全的螺旋區(qū)的多核苷酸鏈。,(一)tRNA,tRNA約占RNA總量的15%,主要作用是轉(zhuǎn)運氨基酸用于合成蛋白質(zhì)。,tRNA分子量為4S,1965年Holley 測定AlatRNA一級結(jié)構(gòu),提出三葉草二級結(jié)構(gòu)模型。,主要特征:1.四臂四環(huán);2.氨基酸臂3端有CCAOH的共有結(jié)構(gòu);3.D環(huán)上有二氫尿嘧啶(D);4.反密碼環(huán)上的反密碼子與mRNA相互作用;5.可變環(huán)上的核苷酸數(shù)目可以變動;6.TC環(huán)含有T和;7.含有修飾堿
3、基和不變核苷酸。,(二)rRNA,占細胞RNA總量的80%,與蛋白質(zhì)(40%)共同組成核糖體。,(三)mRNA與hnRNA,mRNA約占細胞RNA總量的35%,是蛋白質(zhì)合成的模板。,真核生物mRNA的前體在核內(nèi)合成,包括整個基因的內(nèi)含子和外顯子的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,形成分子大小極不均勻的hnRNA。,(四)snRNA和asRNA,snRNA主要存于細胞核中,占細胞RNA總量的0.11%,與蛋白質(zhì)以RNP(核糖核酸蛋白)的形式存在,在hnRNA和rRNA的加工、細胞分裂和分化、協(xié)助細胞內(nèi)物質(zhì)運輸、構(gòu)成染色質(zhì)等方面有重要作用。,asRNA可通過互補序列與特定的mRNA結(jié)合,抑制mRNA的翻譯,還可抑制DNA
4、的復制和轉(zhuǎn)錄。,(五)RNA的其它功能,1981年,Cech發(fā)現(xiàn)RNA的催化活性,提出核酶(ribozyme)。,大部分核酶參加RNA的加工和成熟,也有催化C-N鍵的合成。23SrRNA具肽酰轉(zhuǎn)移酶活性。,RNA在DNA復制、轉(zhuǎn)錄、翻譯中均有一定的調(diào)控作用,與某些物質(zhì)的運輸與定位有關(guān)。,六、核酸的性質(zhì),(一)一般理化性質(zhì),1.為兩性電解質(zhì),通常表現(xiàn)為酸性。,2.DNA為白色纖維狀固體,RNA為白色粉末,不溶于有機溶劑。,3.DNA溶液的粘度極高,而RNA溶液要小得多。,4.RNA能在室溫條件下被稀堿水解而DNA對堿穩(wěn)定。,5.利用核糖和脫氧核糖不同的顯色反應鑒定DNA與RNA。,(二)核酸的紫
5、外吸收性質(zhì),核酸的堿基具有共扼雙鍵,因而有紫外吸收性質(zhì),吸收峰在260nm(蛋白質(zhì)的紫外吸收峰在280nm)。,核酸的光吸收值比各核苷酸光吸收值的和少3040%,當核酸變性或降解時光吸收值顯著增加(增色效應),但核酸復性后,光吸收值又回復到原有水平(減色效應)。,(三)核酸結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,1.堿基對間的氫鍵;2.堿基堆積力;3.環(huán)境中的正離子。,(四)核酸的的變性,:雙螺旋區(qū)氫鍵斷裂,空間結(jié)構(gòu)破壞,形成單鏈無規(guī)線團狀,只涉及次級鍵的破壞。,DNA變性是個突變過程,類似結(jié)晶的熔解。將紫外吸收的增加量達到最大增量一半時的溫度稱熔解溫度(melting temperature, Tm)。,Tm,Tm,
6、影響Tm的因素:,(1)G-C的相對含量 (G+C)% =(Tm 69.3) 2.44,(2)介質(zhì)離子強度低,Tm低。,(3)高pH下堿基廣泛去質(zhì)子而喪失形成氫鍵的能力。,(4)變性劑如甲酰胺、尿素、甲醛等破壞氫鍵,妨礙堿基堆積,使Tm下降。,(五)核酸的復性(退火),:變性核酸的互補鏈在適當條件下重新締合成雙螺旋的過程。,影響復性速度的因素:,(1)單鏈片段濃度,(2)單鏈片段的大小,(3)片段內(nèi)重復序列的多少,(4)溶液離子強度的大小,(5)溶液溫度的高低 (T 25),(六)分子雜交,:在退火條件下,不同來源的DNA互補區(qū)形成氫鍵,或DNA單鏈和RNA鏈的互補區(qū)形成DNA-RNA雜合雙鏈
7、的過程。,探針:用放射性同位素或熒光標記的DNA或RNA片段。,原位雜交技術(shù):直接用探針與菌落或組織細胞中的核酸雜交,未改變核酸所在的位置。,點雜交:將核酸直接點在膜上,再與核酸雜交。,Southern印跡法:將電泳分離后的DNA片段從凝膠轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,再進行雜交。,Northern印跡法:將電泳分離后的RNA吸印到纖維素膜上再進行分子雜交。,七、核酸的序列測定,目前多采用Sanger的酶法和Gilbert的化學法,|,八、核酸的生物學功能和實踐意義,核酸是基本遺傳物質(zhì),在蛋白質(zhì)的生物合成上又占有重要位置,因而在個體的生長、生殖、遺傳、變異和轉(zhuǎn)化等一系列生命現(xiàn)象中起決定性作用。,(一)
8、核酸與遺傳信息的傳遞,DNA是基本遺傳物質(zhì) 有了一定結(jié)構(gòu)的DNA,才能產(chǎn)生一定結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),由一定結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)才有一定形態(tài)和生理特征,所以根據(jù)DNA的特定遺傳密碼產(chǎn)生的蛋白質(zhì)就代表特定生物的遺傳性。在遺傳過程中DNA的具體作用:(1)在細胞分裂時按照自己的結(jié)構(gòu)精確復制傳給后代;(2)作為模板將所貯遺傳信息傳給mRNA。,RNA在傳遞遺傳信息上的作用 mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板;tRNA識別mRNA上的遺傳密碼,轉(zhuǎn)運特定氨基酸到核糖體上合成肽鏈;rRNA是核糖體的主要成分,是翻譯工作的場所。,(二)核酸與蛋白質(zhì)的生物合成,DNA轉(zhuǎn)錄為mRNA是有選擇的,tRNA和rRNA也是DNA的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。,
9、(三)核酸結(jié)構(gòu)改變與生物變異,一切生物的變異和進化都可以說是由于DNA的結(jié)構(gòu)改變而引起蛋白質(zhì)改變的結(jié)果。,生物遺傳的變異起源于DNA堿基配對的改變,有的由于DNA堿基的顛倒(如TA被顛倒為AT)或被調(diào)換(如GC被換為TA);有的由于在DNA復制過程中被遺漏了一對或多了一對核苷酸,或者在轉(zhuǎn)譯時發(fā)生了差誤,如氨酰tRNA合成酶錯將一個結(jié)構(gòu)與正常氨基酸十分相似的物質(zhì)交給tRNA。還有一些生物的遺傳性狀發(fā)生了突變。,(四)DNA與細菌轉(zhuǎn)化,一種細菌的遺傳性狀因吸收了另一種細菌的DNA而發(fā)生改變的現(xiàn)象,稱為細菌的轉(zhuǎn)化。,(五)核酸與病變,遺傳性疾病是由于遺傳缺陷而產(chǎn)生的,也就是DNA結(jié)構(gòu)改變的結(jié)果。鐮刀
10、型紅細胞貧血和白化病(albinism)。,病毒對活細胞的侵染是寄主發(fā)生疾病,主要是由于核酸的的作用。流感、肝炎、帶狀皰疹、脊髓灰質(zhì)炎、白血病、煙草斑紋病。,(六)遺傳工程,遺傳工程是用人工方法改組DNA,從而培育新型生物品種的技術(shù)。,實驗室中將細菌作材料研究遺傳工程過程可分為:(1)重組DNA分子(基因重組);(2)將重組DNA引入受體細胞(轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導)。,有利:(1)有可能培育出高產(chǎn)抗病、耐旱、耐寒、耐鹽堿的優(yōu)良性能的動植物新品種;(2)改良微生物品種使產(chǎn)生人工難以制得的生物活性物質(zhì)如胰島素、干擾素等;(3)解決某些疾病病因和控制這些疾病。,不利:引起某些疾病的廣泛流行和使某些細菌失去對抗
11、菌素的敏感性,或者使某些酶或激素失去應有的生物活性等。,(七)克隆與克隆化,由單一親代細胞用無性繁殖產(chǎn)生的子代細胞稱克隆,形成克隆的過程稱克隆化。,提要,本章主要介紹核酸的化學本質(zhì)、結(jié)構(gòu)和功能。總的要求是: 1.了解核酸的化學本質(zhì)及DNA和RNA在組分、結(jié)構(gòu)和功能上的差異。 2.弄清嘌呤、嘧啶、核苷、核苷酸和核酸在分子結(jié)構(gòu)上的關(guān)系。 3.了解核酸的結(jié)構(gòu)和它們的性質(zhì)、功能的相互關(guān)系。 認識核酸在生物科學上的重要性及其實踐意義。,注意:(1)核苷酸是核酸的基本組成單位,應以腺苷酸和胞苷酸為代表,徹底弄清核苷酸的化學結(jié)構(gòu)和化學性質(zhì)。結(jié)合有機化學把嘌呤和嘧啶的基本結(jié)構(gòu)搞清楚,同時把核酸中存在的A、T、
12、U、C、G的結(jié)構(gòu)記熟。(2)注意嘌呤、嘧啶同核糖在哪個部位連接成核苷,核苷如何同磷酸連接成核苷酸,核苷酸又如何連接成一級結(jié)構(gòu)的核苷酸鏈。要特別注意核酸的二、三級結(jié)構(gòu)中堿基的配對規(guī)律。(3)從分析比較核酸分子的組成和結(jié)構(gòu)上的特點,進而聯(lián)系它們的性質(zhì)和生物功能。,主要特征:1.四臂四環(huán);2.氨基酸臂3端有CCAOH的共有結(jié)構(gòu);3.D環(huán)上有二氫尿嘧啶(D);4.反密碼環(huán)上的反密碼子與mRNA相互作用;5.可變環(huán)上的核苷酸數(shù)目可以變動;6.TC環(huán)含有T和;7.含有修飾堿基和不變核苷酸。,模板,引物,GGC,GGCC,GGCCATC,C,ddCTP,GGCCA,GGCCATCGTTGA,ddATP,A,
13、GGCCATCG,GGCCATCGTTG,G,ddGTP,GGCCAT,GGCCATCGT,GGCCATCGTT,T,ddTTP,核酸的種類、分布、功能,種類,脫氧核糖核酸(DNA):是主要的遺傳物質(zhì)。,核糖核酸(RNA),tRNA (15%),mRNA (3-5%),rRNA (80%),其它RNA:如反義RNA等,所有生物細胞都含有DNA和RNA這兩類核酸,而病毒只含DNA或RNA。 真核生物染色體DNA是線型雙鏈DNA。原核生物的染色體DNA、質(zhì)粒DNA和真核生物的細胞器DNA都是環(huán)狀雙鏈DNA。 細胞RNA通常都是線型單鏈,但病毒RNA則有線型與環(huán)狀、雙鏈與單鏈之分。,分布,DNA,原
14、核生物,真核生物,擬核,質(zhì)粒,染色體(質(zhì)),細胞器:如線粒體、葉綠體等,RNA:核內(nèi)(snRNA、hnRNA)、胞質(zhì)(scRNA)、細胞器,質(zhì)粒DNA為cccDNA。類病毒為環(huán)狀ssRNA。 衛(wèi)星病毒或衛(wèi)星RNA是指沒有輔助性病毒協(xié)助時,不能在宿主細胞內(nèi)復制的病毒或RNA。,功能,DNA:是主要的遺傳物質(zhì),遺傳信息以密碼形式編碼在核酸分子上,表現(xiàn)為特定的核苷酸序列。,RNA,參與蛋白質(zhì)合成,tRNA: 轉(zhuǎn)運、識別,rRNA: 裝配、催化,mRNA:信使、模板,多種細胞功能,RNA的5種功能,控制蛋白質(zhì)合成,作用于RNA轉(zhuǎn)錄后加工與修飾,基因表達與細胞功能調(diào)節(jié):如反義RNA、RNAi (RNA干
15、擾),生物催化與細胞持家功能(細胞基本功能),遺傳信息的加工與進化,生物體通過DNA復制將遺傳信息由親代傳遞給子代。通過RNA轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)翻譯使遺傳信息在子代中得以表達。 基因是指具有遺傳效應的DNA片段或RNA,它能編碼蛋白質(zhì)或功能RNA。某些病毒的基因組是RNA。,核酸結(jié)構(gòu),核酸分子的組成 核酸的四級結(jié)構(gòu),基本內(nèi)容,核 酸,核酸分子組成,核苷酸,磷酸,核苷,戊糖,堿基,A,G,T,C,U,核糖,脫氧 核糖,堿基結(jié)構(gòu)、稀有堿基、核苷三磷酸、環(huán)化核苷酸,磷酸基的位置 在RNA分子中,磷酸在2、3、5均可;在DNA分子中,磷酸在3、5( D-2-脫氧核糖 )。 核酸分子的形成 由多個核苷酸分子聚
16、合而成,無分支結(jié)構(gòu)。核苷酸分子之間以 3,5磷酸二酯鍵相連。磷酸二酯鍵的走向為3 5。 DNA與RNA的四級結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)比較。,DNA的四級結(jié)構(gòu),一級結(jié)構(gòu):由多個4種脫氧核苷酸分子通過3,5磷酸二酯鍵連接形成的直線型或環(huán)型多聚體。,二級結(jié)構(gòu):在堿基互補配對的基礎(chǔ)上形成的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)。,三級結(jié)構(gòu):在二級結(jié)構(gòu)上,DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)通過折疊和扭曲所形成的特定構(gòu)象。如超螺旋等。,四級結(jié)構(gòu):指DNA與蛋白質(zhì)形成的復合物。如染色體(質(zhì))。,重要概念,堿基互補配對與Chargaff規(guī)則 DNA雙螺旋結(jié)構(gòu) DNA雙螺旋的幾種構(gòu)象 超螺旋 染色體(質(zhì))的結(jié)構(gòu),堿基互補配對 指堿基A、T配對,堿基G、
17、C配對。它們之間分別通過2個氫鍵和3個氫鍵配對。即A=T G =C 。 Chargaff規(guī)則 在雙鏈DNA分子中,堿基摩爾數(shù)存在下列關(guān)系:A=T G=C A+C=G+T A+G=T+C DNA雙螺旋結(jié)構(gòu) 1953年,Watson和Crick在前人工作的基礎(chǔ)上提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。該模型的特征如下: 兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞同一中心軸相互纏繞,且兩條鏈均為右手螺旋。堿基平面與縱軸垂直,糖環(huán)平面與縱軸平行;,嘌呤與嘧啶堿基位于雙螺旋的內(nèi)側(cè); 雙螺旋的平均直徑為2nm, 兩個相鄰堿基對之間的距離為0.34nm,即堿基堆積距離為0.34nm;沿中心軸每旋轉(zhuǎn)一周有10個核苷酸,故每一轉(zhuǎn)的高度為3.4nm,即螺距為3.4nm;兩個核苷酸之間的夾角為36; 兩條核苷酸鏈依靠堿基之間形成的氫鍵而結(jié)合在一起,即A與T配對,C與G配對; 堿基在一條鏈上的排列順序不受限制,但一旦確定后,即可決定另一條互補鏈上的序列。 該模型中的DNA結(jié)構(gòu)稱為B型構(gòu)象,表示DNA鈉鹽在較高濕度下制得的纖維的結(jié)構(gòu),可能比較接近大部分DNA在細胞中的構(gòu)象;DNA能以多
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