1、會計學1j目的基因的表達目的基因的表達第1頁/共168頁遺傳信息從DNA到蛋白質(zhì)的傳遞過程中心法則（central dogma）。 第2頁/共168頁外源基因在宿主細胞中表達。外源基因表達載體重組載體導入宿主細胞在宿主細胞中表達出蛋白質(zhì)提取蛋白宿主細胞：原核細胞或真核細胞。第3頁/共168頁用原核生物作宿主A dividing E. coli原核或噬菌體啟動子MCSSD序列終止子第4頁/共168頁識別原核細胞的啟動子，催化所有的RNA合成。數(shù)個相關的結(jié)構(gòu)基因與其調(diào)控區(qū)結(jié)合形成一個表達的協(xié)同單位。2. 以操縱子為單位1. 只有一種RNA聚合酶第5頁/共168頁53轉(zhuǎn)錄mRNA53翻譯蛋白質(zhì)NC5

2、3第6頁/共168頁第7頁/共168頁4. 不含內(nèi)含子，缺乏轉(zhuǎn)錄后的加工系統(tǒng)。5. 調(diào)控主要在轉(zhuǎn)錄水平上。 含有一個啟始密碼子和一段同核糖體16SrRNA3末端堿基互補的序列，叫Shine-Dalgarno（S-D）序列。6. mRNA的核糖體結(jié)合位點第8頁/共168頁外源基因不能帶有內(nèi)含子。2. 必須用cDNA3. 不能直接用真核基因組DNA。4. 必須利用原核細胞的調(diào)控原件（啟動子等）5. 防止外源基因產(chǎn)物對宿主細胞的毒害。第9頁/共168頁是DNA上的能與RNA聚合酶結(jié)合并能起始mRNA合成的序列。大腸桿菌的所有啟動子中都有兩段一致順序（consensus sequence）。1. 啟動

3、子-35 Box 和 -10 Box（1） 啟動子序列 第10頁/共168頁第11頁/共168頁5-TTGACA-35-TATAAT-3 -10box（Pribnow Box）TTGACATATAAT 轉(zhuǎn)錄起始位點17bp5核糖體結(jié)合位點RNA聚合酶 亞基的識別位點 。第12頁/共168頁第13頁/共168頁核糖體結(jié)合位點（ RBS）1）Shine-Dalgarno（SD） sequence：mRNA上與核糖體16sRNA結(jié)合的序列。ribosome binding sitemRNA 5AGGAGGUAUG16S rRNA3UCCUCCAS-D序列距離AUG的距離也影響翻譯第14頁/共168頁

4、AUG（91%）GUG（8%）UUG（1%）位于SD序列下游。第15頁/共168頁內(nèi)終止子intrinsic terminator：中促使轉(zhuǎn)錄終止的DNA位置有一段反向回文順序，其后緊接一串A，稱為內(nèi)終止子，形成終止信號。在表達載體克隆位點的下游一般設計一段轉(zhuǎn)錄終止子。啟動子操縱子S-D序列目的基因終止子第16頁/共168頁由于莖環(huán)3段緊接一串A/U的配對，穩(wěn)定性比較差，有利于轉(zhuǎn)錄物脫落而不利于轉(zhuǎn)錄延續(xù)。 反向回文順序被轉(zhuǎn)錄后，立即形成一個莖環(huán)結(jié)構(gòu)，使轉(zhuǎn)錄物與模板之間配對的堿基數(shù)降低，整個減弱了RNA 與DNA的互作 莖環(huán)結(jié)構(gòu) 多聚A/U第17頁/共168頁5-CCCACAGCCGCCAGTT

5、CCGCTGGCGGCATTTTAA CT TCT TTCT-33-GGGTGTCGGCGGTCAAGGCGACCGCCGTAAAATTGAAGAAAGA-5(模板)轉(zhuǎn)錄5-CCCACAGCCGCCAGUUCCGCUGGCGGCAUUUU-OH-3(RNA)RNA折疊mRNA折疊U CCU GGCAUCGCGGCCGCGGCA ACCCAC UUUU3DNARNA聚合酶脫落第18頁/共168頁第19頁/共168頁大腸桿菌偏愛UAA。一般安置上全部的三個終止密碼防止核糖體跳躍（skipping）。Translation enhancer能夠顯著增強外源基因在大腸桿菌細胞中的表達效率的特殊序列。T

6、7噬菌體基因10前導序列（簡稱g10-L序列）;大腸桿菌atpE基因mRNA5-UTR中富含U的區(qū)段。21第20頁/共168頁 必須是一種強啟動子能使外源基因的蛋白產(chǎn)量達到細胞總蛋白的10%-30%以上。應是可誘導型的用溫度或化學試劑誘導。第21頁/共168頁來自大腸桿菌的乳糖操縱子。用乳糖或其類似物IPTG充當誘導物，與阻遏蛋白結(jié)合，解除抑制。PlacO目的基因第22頁/共168頁trpRP1OtrpEtrpDP2trpCtrpBtrpAtrpR阻遏蛋白基因；P1P2啟動子；O操縱基因；衰減子來自大腸桿菌的色氨酸操縱子。第23頁/共168頁trpRP1OtrpEtrpDP2trpCtrpBt

7、rpA鄰氨基苯甲酸合成酶吲哚甘油硼酸合成酶色氨酸合成酶鏈鏈分支酸鄰氨基苯甲酸磷酸核糖基鄰氨基苯甲酸CDRP吲哚甘油-磷酸色氨酸阻遏物轉(zhuǎn)錄（P1是主要啟動子，P2的作用只有3%。）沒有色氨酸時，阻遏蛋白不能與操縱基因結(jié)合，能轉(zhuǎn)錄合成色氨酸所需要的酶。第24頁/共168頁trpRP1OtrpEtrpDP2trpCtrpBtrpA阻遏物色氨酸結(jié)合不轉(zhuǎn)錄用于表達載體的trp啟動子一般只包含啟動基因、操縱基因、和部分trpE基因。P1OtrpE目的基因有色氨酸時，阻遏蛋白與色氨酸結(jié)合后才能與操縱基因結(jié)合，從而阻止色氨酸合成酶類的轉(zhuǎn)錄（稱為corepressor）。第25頁/共168頁第26頁/共168頁

8、第27頁/共168頁1. 細胞質(zhì)中表達（1）包涵體（inclusion body） P93是存在于細胞質(zhì)中的一種不溶性蛋白質(zhì)聚集折疊而成的晶體結(jié)構(gòu)物。形成原理未知。第28頁/共168頁例：使重組蛋白易于分離、免受蛋白酶降解、不損害寄主細胞回收的蛋白生物活性差。 缺點 優(yōu)點第29頁/共168頁（1）周質(zhì)（periplasm）格蘭氏陰性大腸桿菌位于內(nèi)膜和外膜之間的細胞結(jié)構(gòu)部分。蛋白質(zhì)從細胞質(zhì)轉(zhuǎn)運到周質(zhì)的復雜機理目前不完全清楚優(yōu)點：容易被濃縮和純化、有利于正確折疊、被降解的少。第30頁/共168頁phoA、OmpA、OmpT、OmpF、LamB、-內(nèi)酰胺酶（lactamase）、腸毒素（entero

9、toxin）ST-II、LT-B等大腸桿菌的信號肽：能帶領蛋白穿過膜到達周質(zhì)。但以后需要正確切割掉。（2）信號肽（signal peptide）第31頁/共168頁鼠源RNase、人生長激素信號肽。也能在細菌中起作用。胡蘿卜歐氏桿菌的PelB蛋白。金黃色葡萄球菌的蛋白A?？莶菅挎邨U菌的內(nèi)切葡聚糖酶 （endoglucanase）。第32頁/共168頁由于需要穿過兩層膜，大腸桿菌只能分泌極少的蛋白質(zhì)到培養(yǎng)基中，效果都不太理想。用溶血素（hemolysin）基因構(gòu)建分泌性融合蛋白；使在大腸桿菌細胞中表達的外源蛋白分泌到細胞外的培養(yǎng)基中。或與細菌素釋放蛋白（bacteriocin release p

10、rotein)共表達。第33頁/共168頁第34頁/共168頁載體表達出的外源基因蛋白質(zhì)不與細菌的任何蛋白質(zhì)融合在一起。S-D序列ATG-外源基因-TAG優(yōu)點1. 非融合型表達載體產(chǎn)物結(jié)構(gòu)接近于真核細胞體內(nèi)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。缺點：容易被宿主菌的蛋白酶所破壞。第35頁/共168頁哈佛大學的Gilbert實驗室建立的。表達能力強。組成結(jié)構(gòu)： 強啟動子: tac（trp-lac）:trp的-35區(qū)lacUV5的-10區(qū)lac操縱基因操縱基因：乳糖操縱子系統(tǒng)。第36頁/共168頁終止子：調(diào)節(jié)基因：Lac I宿主菌染色體上的乳糖操縱子系統(tǒng)。 如JM105菌。rrnB的強終止子rrnB強終止子S-D插入位點區(qū)

11、S-D序列和插入位點區(qū)：第37頁/共168頁tac PLac OS-D插入位點區(qū)rrnB T宿主lac I載體的其余部分：來自pBR322質(zhì)粒。表達誘導物： IPTG（乳糖的類似物，不會被降解）阻遏物IPTG第38頁/共168頁必須選擇一個有l(wèi)acI的宿主菌。條件：第39頁/共168頁載體表達出的外源蛋白質(zhì)與細菌的分泌信號肽連在一起，可被宿主菌分泌到細胞周質(zhì)中。如：pIN III系列： pIN III-comA1, pIN III-comA2, pIN III-comA3,（1）組成結(jié)構(gòu)第40頁/共168頁Ipplac Plac OS-D/ATGompa插入位點Ipp（脂蛋白基因啟動子）和la

12、cUV5啟動子。調(diào)節(jié)基因：lac IS-D序列和起始密碼ATG。分泌信號肽：大腸桿菌外膜蛋白基因ompa。插入位點區(qū)（多克隆位點）。 強啟動子：第41頁/共168頁以pBR322為基礎構(gòu)建的。調(diào)節(jié)基因不必借助于宿主的lacI.第42頁/共168頁表達出的外源基因產(chǎn)物蛋白是與質(zhì)粒載體上的菌體蛋白連接在一起的。啟動子：tac操縱基因：lacP調(diào)節(jié)基因：lacIS-D序列（1）優(yōu)點（2）組成結(jié)構(gòu)便于融合蛋白的分離和純化。22第43頁/共168頁lacItac lac OS-D/ATGGST插入位點TGAlacPori：pBR322 ori融合肽：GST(谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶）GST融合蛋白用Gluta

13、thione Sepharose親和層析柱分離純化。第44頁/共168頁用凝血酶或Xa因子可以把外源蛋白從GST上切下來。柱（column）GST外源蛋白凝血酶外源蛋白柱（column）GSTGST洗脫柱（column）可再利用第45頁/共168頁插入?yún)^(qū)：pGEX-1TCTG GTT CCG CGT GGA TCC CCG GAA TTC ATC GTG ACT GAC TGA CGALeu Val Pro Arg Gly Ser Pro Glu Phe Ile Val Thr AspEcoR IBamH I凝血酶第46頁/共168頁CTG GTT CCG CGT GGA TCC CCG GG

14、A ATT CAT CGT GAC TGA CTGACGLeu Val Pro Arg Gly Ser Pro Gly Ile His Arg AspEcoR IBamH I凝血酶ATC GAA GGT CGT GGG ATC CCC GGG AAT TCA TCG TGA CTGACTGACIle Giu Gly Arg Gly Ile Pro Gly Asn Ser SerEcoR IBamH IXa因子pGEX-2X的插入?yún)^(qū)：pGEX-3X的插入?yún)^(qū)：Sma ISma I第47頁/共168頁His-tag（組氨酸標簽）：在外源多肽的N端或C端接上6個組氨酸（His）。His-tag能與Ni

15、2+柱結(jié)合，但很容易被EDTA（或咪唑溶液）洗脫下來，可以純化蛋白質(zhì)。第48頁/共168頁5-TTGACA-35-TATAAT-3 -35box -10box（Pribnow Box）1. 啟動子的結(jié)構(gòu)對表達效率的影響RNA聚合酶 亞基的識別位點（1）一致順序第49頁/共168頁間隔為17bp時，啟動子最強。（3） -35區(qū)和-10區(qū)的堿基順序越接近一致順序，啟動子越強。5-TTGACATATAAT一致順序lactrpPLrecAtac Itac II5-TTTACATATGTT5-TTGACATTAACT5-TTGACAGATACT5-TTGATATATAAT5-TTGACATATAAT5-

16、TTGACATTTAAT-35box-10box第50頁/共168頁5-AGGAGGU-3S-D序列后面的4個堿基：如果是A（T）, 翻譯效率最高；如果是G（C）,效率只有50%或25%。（1）S-D序列？第51頁/共168頁AUG左側(cè)的三個堿基也有影響。-半乳糖苷酶的mRNA中：AUG左側(cè)如果是UAU或CUU時，最為有效；如果是UUC、UCA或AGG時下降20倍。第52頁/共168頁SD序列與翻譯起始密碼子之間的距離為3-9個堿基。 在翻譯起始區(qū)周圍的序列不易形成明顯的二級結(jié)構(gòu)。第53頁/共168頁3. 啟動子與外源基因之間的距離第54頁/共168頁轉(zhuǎn)錄終止區(qū)的存在保證載體不會轉(zhuǎn)錄非必須基因

17、，不必浪費源量和能量、不會干擾正常的表達。增加載體的拷貝數(shù)會增加轉(zhuǎn)錄出的mRNA數(shù)目。增加表達效率。5.載體拷貝數(shù)及穩(wěn)定性對表達效率的影響6.外源蛋白在菌體中的穩(wěn)定性對表達效率的影響但過度的外源基因的表達會影響宿主的正常生長。第55頁/共168頁選擇強啟動子序列，如tac 等2. 調(diào)整S-D序列與AUG堿的距離距離過長或過短都影響真核基因的表達。根據(jù)不同的啟動子選擇不同的距離。3. 改變起始密碼下面的幾組密碼子一般為3-9bp。能提高翻譯的起始效率。第56頁/共168頁4. 增加mRNA的拷貝數(shù)和穩(wěn)定性5. 減輕宿主細胞的代謝負荷合理地調(diào)節(jié)代謝負荷與外源基因高效表達的關系。將宿主生長代謝與外源

18、基因表達分開。（1）誘導表達 一般采用溫度誘導或藥物誘導。去除轉(zhuǎn)錄物內(nèi)的衰減和非特異終止，加入抗終止的序列元件，加放正常轉(zhuǎn)錄終止序列。選用RNase缺失的受體菌第57頁/共168頁cI857阻遏物有活性，抑制PL啟動子，外源基因不表達，宿主大量生長。32C:42C:cI857阻遏物失活，PL啟動子啟動，外源基因高水平表達，宿主生長受到限制。cI857PL外源基因PO第58頁/共168頁調(diào)節(jié)基因lac I（位于宿主基因組內(nèi)或載體上）始終產(chǎn)生阻遏物。無IPTG:阻遏物與lac操縱基因結(jié)合，抑制外源基因轉(zhuǎn)錄。宿主大量生長。有IPTG:阻遏物與IPTG結(jié)合，lac操縱基因解放，外源基因大量轉(zhuǎn)錄。宿主生

19、長受抑制。第59頁/共168頁將宿主的生長與載體的復制分開。當宿主大量生長后，再誘導載體制粒的復制，增加拷貝數(shù)。當需要宿主大量生長時，抑制載體質(zhì)粒的復制。第60頁/共168頁N末端：由原核基因編碼一段多肽，C末端：是完整的真核外源基因。這是避免被降解的最好措施。質(zhì)?；虍a(chǎn)物目的基因產(chǎn)物NC切割6. 提高表達產(chǎn)物的穩(wěn)定性防止被宿主的酶降解。第61頁/共168頁使用次黃嘌呤核苷（lon）缺陷型菌株，減少宿主菌的蛋白酶合成。大腸桿菌的htp R基因突變也減少蛋白酶的降解作用。T4噬菌體的pin基因產(chǎn)物能抑制細菌的蛋白酶?？砂裵in增加到載體上。減少宿主菌本身的蛋白酶的表達。第62頁/共168頁細胞質(zhì)

20、外膜內(nèi)膜周間質(zhì)質(zhì)粒染色體“外排”： 蛋白質(zhì)從細胞質(zhì)跨過內(nèi)外膜到培養(yǎng)液中?！胺置凇保?蛋白質(zhì)從細胞質(zhì)跨過內(nèi)膜到周間質(zhì)中。第63頁/共168頁位于N端，一般為15-30aa 。真核與原核的結(jié)構(gòu)相似, 功能相似，可以互換。 堿性氨基酸N疏水氨基酸核心區(qū)切割位點Arg、LysLeu、IleAlaGlySer信號肽酶外源蛋白 有信號肽。第64頁/共168頁 細胞內(nèi)的轉(zhuǎn)運機制。真核細胞中的分泌蛋白能在大腸桿菌中很好地分泌表達；但非分泌蛋白很難在大腸桿菌中分泌。信號肽酶I、信號肽酶II等近20多種蛋白質(zhì)的參與。 蛋白質(zhì)內(nèi)有與分泌相關的aa 序列。為蛋白指明目的地。第65頁/共168頁分子內(nèi)二硫鍵、分子間二硫

21、鍵。二硫鍵異構(gòu)酶催化。使蛋白質(zhì)能夠正確折疊。1. 形成正確的二硫鍵 第66頁/共168頁第67頁/共168頁抗體分子人血紅蛋白分子第68頁/共168頁如信號肽、內(nèi)含肽（intein）等序列的切割。第69頁/共168頁（1）O-糖基化（Ser, Thr）增加蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性和某些特殊性質(zhì)。糖基第70頁/共168頁（2）N-糖基化（Asn）Dol：長醇Mannose：甘露糖Glucose：葡萄糖N-AcGlc：N乙酰氨基葡萄糖第71頁/共168頁磷酸化、乙?；?、硫酸化、丙烯酸化、羰基化、豆冠酸化、軟脂化羥脯氨酸甲基組氨酸羥賴氨酸羧基谷氨酸第72頁/共168頁缺乏蛋白質(zhì)的加工。（如糖基化、氨基酸修飾等

22、）。第73頁/共168頁酵母菌、植物原生質(zhì)體、動物培養(yǎng)細胞等。真核或病毒啟動子MCSPolyA信號終止子外源基因第74頁/共168頁 能在中克隆和擴增。1. 酵母克隆載體Leu2+、His+、Ura3+、Trp1+; 有合適的克隆位點。 有酵母的選擇標記Ori有大腸桿菌的選擇標記Ampr、Tetr。第75頁/共168頁Dividing Saccharomyces cerevisiae (bakers yeast) cells第76頁/共168頁由大腸桿菌質(zhì)粒和酵母的DNA片斷（選擇標記）構(gòu)成。ColE1酵母Leu 2+如 PYeleu10:第77頁/共168頁轉(zhuǎn)化率低（1-10轉(zhuǎn)化子/微克DN

23、A）。載體上只有細菌的復制區(qū)，沒有酵母的自主復制區(qū)?？膳c受體細胞的染色體DNA同源重組，隨染色體一起復制。不能在酵母細胞中自主復制整合到酵母的染色體上不能從酵母細胞中提取載體。第78頁/共168頁由大腸桿菌質(zhì)粒和酵母的DNA片斷(選擇標記和酵母DNA自主復制順序ARS）構(gòu)成。大腸桿菌質(zhì)粒酵母ARS酵母選擇標記第79頁/共168頁ARS（automously replicating sequence）:ATTTTATATTTAT G T250bp保守區(qū)第80頁/共168頁轉(zhuǎn)化率高（102-103轉(zhuǎn)化子/微克DNA) 。不穩(wěn)定，容易丟失?？蓮拇竽c桿菌和酵母中提取質(zhì)粒。既能在大腸桿菌中復制，又能在酵

24、母細胞中自主復制。穿梭載體（shuttle vector）第81頁/共168頁在YRp質(zhì)粒中插入酵母染色體的著絲粒區(qū)。特點：YRp質(zhì)粒酵母著絲粒不易從細胞中提取。行為像染色體，能穩(wěn)定遺傳。單拷貝存在。第82頁/共168頁由大腸桿菌質(zhì)粒、2m質(zhì)粒及酵母染色體DNA選擇標記構(gòu)成。大腸桿菌質(zhì)粒酵母選擇標記2m質(zhì)粒如pYF92:pBR3222m 酵母his 3+第83頁/共168頁釀酒酵母的內(nèi)源質(zhì)粒，長度是2m 。含有自主復制起始區(qū)ori和STB序列（使質(zhì)粒在供體中維持穩(wěn)定）。第84頁/共168頁很高的轉(zhuǎn)化活性（103-105轉(zhuǎn)化子/微克DNA）.拷貝數(shù)多（25-100分子/細胞）。比YRp穩(wěn)定。第8

25、5頁/共168頁YEp24第86頁/共168頁Leu- 酵母原生質(zhì)體感受態(tài)酶去壁CaCl2、PEG整合到染色體上，或獨立在酵母細胞內(nèi)轉(zhuǎn)化Leu營養(yǎng)缺陷型培養(yǎng)基篩選轉(zhuǎn)化子克隆生長酵母載體大腸桿菌提取插入外源基因鑒定克隆發(fā)酵表達外源基因產(chǎn)物分離、純化第87頁/共168頁 （1）優(yōu)點對其遺傳學和生理學的研究比較深入。小量培養(yǎng)和大規(guī)模反應器中都能生長。已經(jīng)分離出很強的啟動子。有翻譯后的加工。本身自然分泌很少，便于胞外蛋白的純 化。安全性高（FDA確認的安全生物），不 需要宿主的安全性檢驗。第88頁/共168頁常常發(fā)生質(zhì)粒丟失。重組蛋白常常超糖基化表達量普遍低。每個N-寡糖鏈上含有100多個甘露糖，分泌

26、困難。正常的高甘露糖寡糖鏈上僅有8-13個甘露糖。分泌型蛋白有時會留在壁膜間隙，第89頁/共168頁第90頁/共168頁24第91頁/共168頁（1）細胞質(zhì)內(nèi)表達例：人Cu/Zn-SOD在酵母中表達：超氧化物H+H2O2H2O過氧化物酶表達出的SOD修飾正確：起始氨基酸被切掉，第二個氨基酸丙氨酸也被乙?；?。SOD(超氧化物歧化酶)第92頁/共168頁宿主：亮氨酸合成缺陷型酵母。GAPD：甘油醛磷酸脫氫酶第93頁/共168頁在啤酒酵母中，只有分泌型的蛋白質(zhì)才能被糖基化。需要糖基化的重組蛋白必須是分泌蛋白。方法：在重組蛋白的前面加一段編碼酵母菌交配類型因子a1的前導肽，與重組蛋白的N端通過Lys-

27、Arg相連。前導肽（leader peptide）：第94頁/共168頁蛋白質(zhì)分泌到壁膜間隙時，酵母菌的內(nèi)切蛋白酶識別這個切點信號，把重組蛋白正確切下來。前導肽Lys-Arg重組蛋白（水蛭素）內(nèi)切蛋白酶第95頁/共168頁（1）乙肝表面抗原在嗜甲烷酵母中表達在大型發(fā)酵反應器中容易生長；以甲醇作唯一的碳源和能源，成本低。有甲醇時，表達的乙醇氧化酶高達胞內(nèi)總蛋白的40%！嗜甲烷酵母（Pichia pastoris）的特點第96頁/共168頁HBsAg: 乙肝表面抗原?？梢宰鳛橐呙?。Aox1：乙醇氧化酶基因1啟動子（受甲醇激活調(diào)控）。His4：組氨酸合成所需的組氨酸脫氫酶基因。3-aox1：整合到特

28、定染色體的位點序列。誘導物：甲醇。產(chǎn)量：9106劑疫苗/240L發(fā)酵罐。第97頁/共168頁第98頁/共168頁作為飼料添加劑促進反芻動物消化。產(chǎn)量：10L，200h連續(xù)發(fā)酵產(chǎn)出50g溶菌酶。第99頁/共168頁1. 桿狀病毒（Baculovirus）廣泛侵染包括許多昆蟲在內(nèi)的無脊椎動物。（1）侵染周期：兩種形式單獨病毒粒子形式病毒粒子宿主細胞病毒粒子侵染釋放第100頁/共168頁病毒粒子宿主細胞侵染宿主細胞侵染合成多角體蛋白裂解釋放多面體溶解一般使用苜蓿銀紋夜蛾細胞核型多角體病毒（Autographa california multiple nuclear polyhedrosis viru

29、s，AcMNPV）第101頁/共168頁感染后36-48h，病毒開始合成大量的 多角蛋白。多角蛋白的啟動子特別強。多角蛋白基因可以被替換掉而不影響 病毒的繁殖。第102頁/共168頁多角體基因被外源基因取代后，病毒仍然能形成有感染能力的病毒粒子，但不能形成多面體。通過顯微鏡檢查看是否有多面體形成。源自草地夜蛾的細胞株，在這種細胞中，多角蛋白的啟動子特別活躍。第103頁/共168頁（1）轉(zhuǎn)移載體的構(gòu)建大腸桿菌質(zhì)粒，插入兩段AcMNPV序列以供同源重組。桿狀病毒的基因組太大（13kb環(huán)狀DNA），不能直接插入。必須使用同源重組的辦法。多角蛋白的啟動子和終止子及polyA加尾信號。啟動子與終止子之間

30、插入多克隆位點第104頁/共168頁第105頁/共168頁 轉(zhuǎn)移載體中插入外源基因 轉(zhuǎn)移載體與野生型AcMNPV DNA共同轉(zhuǎn)染宿主細胞 轉(zhuǎn)移載體與病毒基因組發(fā)生雙交換 外源基因被交換轉(zhuǎn)入病毒基因組中 重組病毒侵染宿主4-5天后即可收獲重組蛋白。第106頁/共168頁第107頁/共168頁第108頁/共168頁桿狀病毒侵染昆蟲幼蟲，在幼蟲體內(nèi)表達外源蛋白，成為“低成本蛋白工廠”。22只粉蚊夜蛾幼蟲4天后表達的人腺苷酸脫氫酶占幼蟲總蛋白的2%-5%。共產(chǎn)出9mg很純的產(chǎn)物。（1）壽命短感染4-5天后宿主細胞裂解或幼蟲死亡。（2）共同轉(zhuǎn)染率低重組率更低。0.1%-1%。第109頁/共168頁存在于

31、能引起植物形成冠癭瘤的土壤農(nóng)桿菌中，誘導冠癭瘤形成，又稱腫瘤誘導質(zhì)粒（tumor inducing plasmid）。第110頁/共168頁第111頁/共168頁環(huán)狀雙鏈DNA，105105bp（185kb）(相當于細菌染色體的3%-5%）。第112頁/共168頁 轉(zhuǎn)移DNA，編碼冠癭堿的合成，能隨機整合到植物的染色體上。長度一般為12-24kb，是Ti質(zhì)粒最重要的部分。左邊界右邊界生長素基因細胞分裂素基因冠癭堿合成生長素基因:iaaM（tms1）和iaaH（tms2）編碼合成吲哚乙酸（植物生長激素）的酶iaaM: 色氨酸-2-單加氧酶第113頁/共168頁色氨酸-2-單加氧酶色氨酸吲哚-3-

32、乙酰胺iaaH:吲哚-3-乙酰胺水解酶吲哚-3-乙酰胺水解酶吲哚-3-乙酰胺吲哚乙酸t(yī)mr（ipt）：異戊烯轉(zhuǎn)移酶, 催化：二磷酸異戊烯（IPP）異戊烯酰嘌呤單磷酸（IPA）5-AMP第114頁/共168頁章魚堿（octopine)胭脂堿（nopaline）NH-(CH2)3-CH-COOHNHCH3-CH-COOHHN=CNH2NH-(CH2)3-CH-COOHNHHOOC-(CH2)2-CH-COOHHN=CNH2Arg與丙酮酸縮合成Arg與酮戊二醛縮合成第115頁/共168頁農(nóng)桿堿（agropine）冠癭堿是在冠癭瘤內(nèi)合成并分泌出來的，是農(nóng)桿菌的碳源和氮源。大部分其他土壤微生物都不能利用

33、冠癭堿。Glu的二環(huán)糖衍生物。第116頁/共168頁決定土壤農(nóng)桿菌對植物的感染和T-DNA的轉(zhuǎn)移， 進入和整合。vir的產(chǎn)物能誘導Ti質(zhì)粒產(chǎn)生T-DNA區(qū)域的單鏈拷貝。單鏈拷貝從Ti質(zhì)粒脫離后，可與vir的產(chǎn)物VIR D2蛋白結(jié)合，并在VIR D4和VIR B蛋白的幫助下穿過濃桿菌內(nèi)膜、外膜、壁和植物細胞壁、細胞膜及核膜，最后整合到植物染色體上。單鏈的5端是右邊界區(qū)域，含有25bp重復序列，參與整合。第117頁/共168頁章魚堿代謝基因和胭脂堿代謝基因： 分別編碼代謝這兩種冠癭堿的酶。維持農(nóng)桿菌生長。第118頁/共168頁（1）第一步:植物受傷植物受傷后能分泌酚類化合物（如乙酰丁香酮、羥基乙酰

34、丁香酮），誘導Ti質(zhì)粒上的毒性基因表達。第119頁/共168頁（1）第二步 感染植物（3）第三步 毒性基因（vir）表達T-DNA上的產(chǎn)物催化產(chǎn)生過量的生長素和細胞分裂素，形成植物冠癭瘤。膿桿菌吸附于植物的表面?zhèn)诓课唬ǔＴ谇o的基部）。virA、virG、virD、virB（4）第四步 T-DNA轉(zhuǎn)移T-DNA被vir基因產(chǎn)物切下來，并運送到植物細胞核里，整合到植物基因組中。（5）第五步 誘導冠癭瘤第120頁/共168頁第121頁/共168頁（6）第六步 土壤農(nóng)桿菌代謝冠癭堿。第122頁/共168頁根據(jù)所編碼的冠癭堿（opine），分為（1）章魚堿（octopine)型質(zhì)粒第123頁/共168

35、頁（3）農(nóng)桿堿（agropine）型質(zhì)粒第124頁/共168頁裸子植物、雙子葉被子植物、禾谷類單子葉植物（玉米）。（1）能夠自發(fā)地整合到植物的染色體上。（2）能轉(zhuǎn)化多種植物。（3）強啟動子5. Ti質(zhì)粒作為載體的可能性T-DNA的opine合成酶基因上有一個強啟動子，能啟動外源基因的表達。25第125頁/共168頁（1）分子量太大（120kb）?。?）限制性酶切位點太多。（3）被轉(zhuǎn)化的植物細胞成為腫瘤，不能 再分化。（4）在大腸桿菌中不能復制。第126頁/共168頁（4）冠癭堿合成對于植物無意義。應剔除掉。（5）加入大腸桿菌的ori和選擇標記。（6）加上真核生物的轉(zhuǎn)錄信號和結(jié)束信號以 及添加p

36、olyA的信號序列。（1）保留T-DNA的轉(zhuǎn)移功能部分（vir基因， 左右邊界）。（2）減少限制性酶切位點，引入單一插入位 點。（3）取消T-DNA的致瘤基因，使被轉(zhuǎn)化的植 物細胞不再成為腫瘤，能正常分化。第127頁/共168頁leftrightMCSAMProriVirselect第128頁/共168頁最早獲得廣泛應用的Ti質(zhì)粒是比利時科學家等1983年改造的pGV3850需要同源重組才能插入外源基因。是一種受體質(zhì)粒，外源基因不能直接插入，而是需要借助于pBR322質(zhì)粒作為中間載體。第129頁/共168頁第130頁/共168頁宿主土壤農(nóng)桿菌的選擇標記是位于中間載體pBR322上的卡那霉素抗性

37、（Kanr）基因。1）膿桿菌選擇標記2）最終受體植物的選擇標記卡那霉素抗性（ Kanr ）基因（卡那霉素對植物有劇毒?。┑?31頁/共168頁第132頁/共168頁第133頁/共168頁既有大腸桿菌復制起點也有農(nóng)桿菌復制起點，是個穿梭載體。Ti質(zhì)粒被剔除了T-DNA、冠癭堿代謝基因、vir基因。大幅度減小質(zhì)粒的體積。（10kb）雙元載體的結(jié)構(gòu)Ti的精髓：Vir基因（轉(zhuǎn)移）和左右界（整合）第134頁/共168頁第135頁/共168頁轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌之前，所有的克隆步驟都在大腸桿菌里操作。受體農(nóng)桿菌內(nèi)要求帶有整套vir基因（但缺失T-DNA及左右邊界）的“幫助質(zhì)粒”提供vir產(chǎn)物。1）基因插入2）幫助質(zhì)

38、粒（ helper plasmid）Vir產(chǎn)物使雙元載體上的T-DNA左右邊界及其外源基因轉(zhuǎn)入到植物細胞，并整合到植物染色體上。第136頁/共168頁左右外源基因雙元載體Vir幫助質(zhì)粒農(nóng)桿菌Vir農(nóng)桿菌左右外源基因感染植物轉(zhuǎn)化左右外源基因進入植物細胞核，整合，表達第137頁/共168頁含雙元載體的大腸桿菌：含有外源基因和左右邊界。含有幫助質(zhì)粒的輔助細菌：含vir基因。受體農(nóng)桿菌（空）：三種菌混合培養(yǎng)，然后通過各自的抗菌素抗性標記選擇吸收了外源基因、左右界、和Vir的農(nóng)桿菌。第138頁/共168頁1.動物細胞基因克隆和表達載體-SV40病毒常用的SV40載體，是從猿猴空泡病毒SV40（simia

39、n vacuolating virus40）改造而來的。第139頁/共168頁 20面體外殼：由VP1、VP2和VP3三種病毒外殼蛋白構(gòu)成。5243bp的環(huán)狀雙鏈。 DNA：第140頁/共168頁SV40猿猴細胞細胞裂解釋放SV40嚙齒類細胞細胞癌變SV40DNA整合到寄主染色體上permissivenonpermissive第141頁/共168頁T-抗原（tumor antigen）:兩個6聚體的T抗原結(jié)合在SV40 DNA的復制起始點上，分別向相反方向移動，將雙鏈DNA解螺旋。隨后單鏈DNA結(jié)合蛋白（ssB）與解開的單鏈DNA結(jié)合維持解旋狀態(tài)。解鏈SV40編碼的蛋白。功能是在SV40 DN

40、A復制的時候解開DNA雙鏈。第142頁/共168頁第143頁/共168頁第144頁/共168頁T抗原SV40 DNA雙鏈第145頁/共168頁5-CTCACTACTTCTGGAATAGC3-GAGTGATGAAGACCTTATCG120早期回文序列TCAGAGGCCGAGGCGGCCTCGGCCTCTAGTCTCCGGCTCCGCCGGAGCCGGAGA2147T抗原結(jié)合位點GCATAAATAAAAAAAATTAGTCCGTATT TATTTT TTTTAATCAG富含AT區(qū)4869第146頁/共168頁早期表達區(qū)：編碼大T抗原（控制DNA復制）和小t抗原。晚期表達區(qū)：在DNA復制一段時間后表

41、達，產(chǎn)物是VP1、VP2和VP3三種外殼蛋白。第147頁/共168頁對非受納細胞（non permissive cells），只有T 抗原表達，隨后病毒基因組隨機整合到宿主染色體上。SV40整合有嚴格的包裝限制。如果插入的外源基因過大，就無法包裝。第148頁/共168頁去掉一部分DNA(T抗原或者VP基因）。助手型SV40去掉T抗原基因的病毒，保留晚期復制啟動子。提供外殼蛋白。不能復制，但能包裝。第149頁/共168頁需要這兩種缺陷型病毒混合感染，才能互補。既能使插入SV40的外源基因復制，又能使外源基因被包裝進病毒顆粒，得以擴增。去掉VP基因，插入外源基因的病毒，保留早期表達啟動子。不能包裝

42、，但能復制。重組型SV40包裝重組型SV40提供重組DNA和T抗原。第150頁/共168頁助手型SV40: 提供VP外殼蛋白。重組型SV40： 提供T抗原。包裝成的病毒顆粒中，既有含外源基因的重組型，又有助手型DNA。感染細胞，整合第151頁/共168頁用復制起點有缺陷的SV40病毒侵染的猴細胞株CV-1得到的。所以稱COS（CV-1，Origin, SV40）病毒不能復制，但能產(chǎn)生T抗源（類似重組型SV40）。DNA整合到猴染色體上。所以COS細胞中只有T抗原，無游離的SV40DNA。 COS細胞的特點：有SV40的T抗原。有利于SV40來源的載體復制第152頁/共168頁第153頁/共168頁利用COS細胞擴增外源基因第154頁/共168頁只保留SV40的復制起始區(qū)（ori）、早期區(qū)域（T抗原）的啟動子、Poly A化位置以及t抗原的內(nèi)含子。如p