1、 Illumina Genome Analyzer系統(tǒng)應(yīng)用方向DNA Fragment文庫(kù)測(cè)序DNA Mate-pair文庫(kù)測(cè)序Small RNA測(cè)序數(shù)字化表示譜測(cè)序轉(zhuǎn)錄組測(cè)序DNA甲基化測(cè)序ChIP-seqMeta-Genomics DNA測(cè)序血漿微量DNA測(cè)序高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第1頁(yè)基因組DNA隨機(jī)打斷DNA片段末端修復(fù)將A堿基加入到DNA片段3末端在DNA片段末端加上特定接頭PCR擴(kuò)增連上接頭DNA片段文庫(kù)檢測(cè)DNA在Cluster Station成簇?cái)U(kuò)增IlluminaGenome Analyzer上測(cè)序生物信息組裝/分析 Illumina DNA Fragment文庫(kù)測(cè)序流

2、程 高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第2頁(yè) Illumina Mate-pair文庫(kù)測(cè)序流程 基因組DNA隨機(jī)打斷特定大小片段（2-10kb范圍可選）末端修復(fù)生物素標(biāo)識(shí)環(huán)化取得來(lái)自大片段兩端共計(jì)400-600 bpDNA片段修飾、加接頭PCR擴(kuò)增連上接頭DNA片段文庫(kù)檢測(cè)DNA在Cluster Station上成簇?cái)U(kuò)增Illumina Genome Analyzer上測(cè)序生物信息組裝/分析高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第3頁(yè) Illumina Small RNA測(cè)序流程 從總 RNA中分離 small RNA5接頭連接和純化3接頭連接純化RT-PCR擴(kuò)增Small RNA文庫(kù)純化文庫(kù)檢測(cè)DNA在Cl

3、uster Station成簇?cái)U(kuò)增Illumina Genome Analyzer上測(cè)序生物信息學(xué)分析高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第4頁(yè) Illumina 數(shù)字化表示譜測(cè)序流程 mRNA分離和cDNA第一鏈合成cDNA第二鏈合成限制性?xún)?nèi)切酶NlaIII酶切連接GEX NlaIII Adapter 1限制性?xún)?nèi)切酶 MmeI 酶切連接GEX Adapter 2Adapter連接cDNA產(chǎn)物和PCR富集文庫(kù)檢測(cè)DNA在Cluster Station上成簇?cái)U(kuò)增IlluminaGenome Analyzer上測(cè)序生物信息學(xué)分析高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第5頁(yè)Total RNADNase I 酶消化mR

4、NA 分離和隨機(jī)打斷cDNA第一鏈和第二鏈合成DNA片段末端修復(fù)將“A”堿基加入到DNA片段3末端在DNA片段末端加上特定接頭PCR擴(kuò)增連上接頭DNA片段文庫(kù)檢測(cè)DNA在Cluster Station上成簇?cái)U(kuò)增IlluminaGenome Analyzer上測(cè)序生物信息學(xué)分析 Illumina 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序流程 高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第6頁(yè)基因組DNA隨機(jī)打斷DNA片段末端修復(fù)將 A 堿基加入到 DNA片段3末端DNA片段末端加上尤其處理甲基化接頭重亞硫酸鹽處理去鹽處理PCR擴(kuò)增連上接頭DNA片段文庫(kù)檢測(cè)DNA 在Cluster Station上成簇?cái)U(kuò)增Illumina Genome An

5、alyzer上測(cè)序生物信息學(xué)分析 Illumina DNA甲基化測(cè)序流程 高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第7頁(yè)染色質(zhì)免疫共沉淀目標(biāo)DNA片段DNA片段末端修復(fù)將 A 堿基加入到 DNA片段3末端DNA片段末端加上接頭PCR擴(kuò)增加上接頭DNA片段文庫(kù)檢測(cè)DNA在Cluster Station成簇?cái)U(kuò)增Illumina Genome Analyzer上測(cè)序生物信息學(xué)分析 Illumina ChIP-seq測(cè)序流程 高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第8頁(yè)Meta基因組提取DNA隨機(jī)打斷DNA片段末端修復(fù)將A堿基加入到DNA片段3末端在DNA片段末端加上接頭純化連接產(chǎn)物PCR擴(kuò)增連上接頭DNA片段文庫(kù)檢測(cè)DNA在Cluster Station成簇?cái)U(kuò)增Illumina Genome Analyzer上測(cè)序生物信息組裝/分析 Illumina Meta-Genomics DNA測(cè)序流程 高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)流程與應(yīng)用第9頁(yè)搜集10-15ml孕婦外周血提取血漿中游離DNAQ-PCR定量總DNA含量構(gòu)建DNA文庫(kù)Agilent和Q-PCR檢測(cè)文庫(kù)濃度Cluster制備和Genome Analyzer上測(cè)序Pipeline 和Eland分析計(jì)算每