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蛋白質(zhì)是否能夠發(fā)揮功能的調(diào)控環(huán)節(jié)(1)量:量:降解或清除結(jié)構(gòu):構(gòu)象,折疊,裝配位置:去向和定位活性:剪切或有限水解修飾(磷酸化、泛素化、SUMO化、乙?;绦盘?hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的?√蛋白質(zhì)分選核糖體內(nèi)質(zhì)網(wǎng)高爾基體泛素-蛋白酶體系統(tǒng)溶酶體蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)
、加工、折疊蛋白質(zhì)加工、分選蛋白質(zhì)降解蛋白質(zhì)降解細(xì)胞結(jié)構(gòu)*蛋白質(zhì)數(shù)量的控制環(huán)節(jié)之二:降解環(huán)節(jié)尤其是蛋白質(zhì)數(shù)量需要快速調(diào)節(jié)時(shí)*蛋白質(zhì)質(zhì)量的控制環(huán)節(jié)降解*蛋白質(zhì)降解產(chǎn)物為短肽和氨基酸,可作為蛋白質(zhì)重新 的原料來源之一.蛋白質(zhì)降解相關(guān)細(xì)胞器蛋白質(zhì)為什么被降解清除?不需要的快速應(yīng)答應(yīng)激的錯(cuò)誤的多余的“外來的”“蛋白質(zhì)質(zhì)量和數(shù)量的控制”蛋白質(zhì)降解2條途徑
蛋白酶體途徑溶酶體途徑蛋白質(zhì)降解相關(guān)細(xì)胞器I、蛋白酶體(proteasome)一、形態(tài):光鏡、電鏡下均看不到*蛋白質(zhì)復(fù)合體(大小:20S、26S)*
無膜核糖體:80S,15-20nm比較:核糖體(電鏡)二、結(jié)構(gòu)及化學(xué)成分化學(xué)成分:蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu):桶狀19S
調(diào)節(jié)顆粒
“帽”20S
顆粒最常見的蛋白酶體:26S蛋白酶體19S調(diào)節(jié)顆粒*ATP水解活性位點(diǎn):水解ATP*泛素結(jié)合活性位點(diǎn):識(shí)別“泛素連接的底物
蛋白質(zhì)”(泛素化修飾蛋白質(zhì))泛素底物20S
顆粒頂面正面α亞基β亞基
α亞基)“錨著(docking蛋白酶活性位點(diǎn)水解蛋白質(zhì)為短肽或氨基酸三、功能:蛋白質(zhì)降解降解“不需要的、損傷的”蛋白質(zhì)To
degrade
unneeded
or
damaged
proteinsProteasomes
are
part
of
a
major
mechanism
bywhich
cells
regulate
the
concentration
of
particular
proteins
and
degrade
misfolded
proteins
byproteolysis.例1:細(xì)胞周期蛋白(cyclin)周期性降解,細(xì)胞才能進(jìn)入下一個(gè)周期G1
cyclin,S期“不需要”例2:細(xì)胞周期相關(guān)的蛋白質(zhì)降解p53-UbP53degradation例3:P53降解抑癌蛋白: 安全衛(wèi)士DNA修復(fù)、細(xì)胞周期阻滯、細(xì)胞衰老、細(xì)胞凋亡(
調(diào)控蛋白:調(diào)節(jié)下游
轉(zhuǎn)錄)組安全時(shí),不需要p53“降解”例4:HIF1-a降解低氧誘導(dǎo)因子,常氧時(shí)不需要,降解例5.內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的蛋白質(zhì)質(zhì)量控制未正確折疊和裝配的蛋白質(zhì)(錯(cuò)誤的)蛋白酶體(降解)正確折疊和裝配的蛋白質(zhì)發(fā)揮功能正確折疊蛋白質(zhì)伴侶蛋白小泡Staining
with
20S
proteasome
marker
protein(Sun
X,Yan
S
et
al.
unpublished)細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)均有定位蛋白酶體介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解功能特征1修高度選擇性:泛素化修飾的降解底物功能特征2.泛素(ubiquitin):一種含76個(gè)氨基酸的多肽,作為
共價(jià)結(jié)合到要被降解的蛋白質(zhì)上,稱為“泛素化飾”(ubiquitination)。泛素的廣泛性(ubiquitous)存在于不同組織細(xì)胞,進(jìn)化保守。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)(ubiquitin-proteasome
system,
UPS)功能特征3.泛素化修飾是一個(gè)精細(xì)的過程*多步驟反應(yīng)過程*多種不同蛋白質(zhì)參與*耗能泛素化修飾:要被降解的蛋白在三類酶(E1、E2、E3)的次第作用下,與至少4個(gè)泛素分子結(jié)合(多聚泛素化),從而被泛素分子“標(biāo)記”。功能特征4.蛋白酶水解底物為短肽或氨基酸Protease
active
sites:蛋白水解反應(yīng)底物蛋白質(zhì)泛素化修飾:被蛋白酶體識(shí)別蛋白質(zhì)去折疊(移位)泛素重利用被水解蛋白質(zhì)泛素化降解的過程123,4總結(jié)功能:識(shí)別并結(jié)合特異的底物:“泛素連接的底物蛋白質(zhì)”(泛素化修飾蛋白質(zhì)具有蛋白水解酶的活性,將底物蛋白質(zhì)降解成短肽和氨基酸。細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核內(nèi)均有分布。蛋白質(zhì)的數(shù)量和質(zhì)量控制,參與細(xì)胞功能和生命活動(dòng)例:蛋白酶體、蛋白質(zhì)快速降解蛋白質(zhì)數(shù)量控制:細(xì)胞周期相關(guān)蛋白P53(
穩(wěn)定性的“安全衛(wèi)士”)低氧誘導(dǎo)因子(HIF1a)蛋白質(zhì)質(zhì)量控制:錯(cuò)誤折疊蛋白例1:細(xì)胞周期相關(guān)的蛋白質(zhì)降解Securin:
降解,最終導(dǎo)致姐妹染色單體分離特異的E3連接酶:APC/C
CDC20底物:Securin蛋白酶體E3連接酶:APC/CCDC20例2:P53降解DNA損傷時(shí),細(xì)胞不能進(jìn)入S期發(fā)生DNA
,或者誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,機(jī)制在于:p53快速增多。減少降解方法:增加MDM2的降解Substrate
protein:P53,MDM2E3
ligase
for
p53:MDM2例3:HIF1-a降解降解常氧低氧不降解調(diào)控蛋白,可促進(jìn)EPO轉(zhuǎn)錄,抵抗低氧。Unneeded
and
damaged短壽蛋白(
short
life
time);應(yīng)激應(yīng)答蛋白(
p53, HIF-1)3.錯(cuò)誤折疊蛋白ttyeiannsdquanlity
control
systemQ1:哪類蛋白質(zhì)在蛋白酶體降解?tyquanlity與細(xì)胞周期,表達(dá)調(diào)控,應(yīng)激應(yīng)答活動(dòng)有關(guān)The
Nobel
Prize
in
Chemistry
2004“Thanks
to
the
work
of
the
three
Laureates
it
is
now
possible
to
understand
atmolecularlevel
how
the
cell
controls
a
number
of
central
processes
by
breaking
down
certainproteins
and
not
others.
Examples
ofprocesses erned
by
ubiquitin-mediated
proteindegradation
are
cell
division,
DNA
repair,
quality
control
of
newly-produced
proteins,
andimportant
parts
of
the
immune
defence.
When
the
degradation
does
not
work
correctly,
wefall
ill.
Cervical
cancer
and
cystic
fibrosis
are
two
examples.
Knowledge
of
ubiquitin-mediated
protein
degradation
offers
an
opportunity
to
develop
drugs
against
thesediseases
and
others.
”“for
the
discovery
of
ubiquitin-mediated
protein
degradation"蛋白酶體抑制劑:bortezomib
(硼替佐米抗癌藥物用于多發(fā)性骨髓瘤其他類型腫瘤動(dòng)物水平驗(yàn)證;早期臨床試驗(yàn)。淡藍(lán)色顯示Bortezomib,結(jié)合在蛋白酶體的β亞基總結(jié):泛素-蛋白酶體與蛋白質(zhì)降解*快速調(diào)節(jié)數(shù)量的蛋白質(zhì)(短壽的)、應(yīng)激產(chǎn)生的、錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)的降解。*蛋白質(zhì)降解前首先加上 :泛素化修飾*這種蛋白質(zhì)降解方式是相對(duì)保守的,在酵母、線蟲、果蠅中可看到,在古菌和部分細(xì)菌中也可看到。蛋白質(zhì)降解相關(guān)細(xì)胞器II、溶酶體(lysosome)與“蛋白質(zhì)分選”聯(lián)系,與“內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體”聯(lián)系一、形態(tài)和特性*單層膜包圍的
泡*有較高電子密度*形態(tài)多型性大小不一,直徑一般0.25~0.8μm,結(jié)構(gòu)特征特別的膜:*質(zhì)子泵,腔內(nèi)酸性(pH=5);*很多轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白;*
膜蛋白:高度糖基化;特別的腔:酸性水解酶酸性水解酶蛋白酶核酸酶酯酶
糖苷酶磷脂酶等糖基二、溶酶體的形成2條路:two
ways內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體的參與,與胞吞過程的內(nèi)體相關(guān)。難點(diǎn)多泡體Multivesicularbody早期內(nèi)體晚期內(nèi)體Early
EndosomeLate
Endosome早期內(nèi)體膜內(nèi)陷形成內(nèi)部小泡,形成多泡體質(zhì)膜高爾基體分選(sorting)胞吞(endocytosis)高爾基體溶酶體溶酶體膜蛋白、膜脂、溶酶體酶
到晚期內(nèi)體內(nèi)體含內(nèi)吞的液體、顆粒內(nèi)體逐漸演化為溶酶體多泡體Multivesicularbody早期內(nèi)體晚期內(nèi)體Early
EndosomeLate
Endosome早期內(nèi)體膜內(nèi)陷形成內(nèi)部小泡,形成多泡體質(zhì)膜溶酶體細(xì)胞外液體/質(zhì)膜內(nèi)體(endosome)含內(nèi)吞的液體、顆粒內(nèi)體膜:膜蛋白早期內(nèi)體靠近細(xì)胞膜;內(nèi)吞過程開始時(shí)經(jīng)由的小的、不規(guī)則的細(xì)胞器。高爾基體
晚期內(nèi)體靠近溶酶體;內(nèi)環(huán)境開始變?yōu)樗嵝?;?nèi)吞物質(zhì)開始消化的部位。溶酶體三、溶酶體的功能—“消化”Q:哪些物質(zhì)和蛋白質(zhì)在溶酶體消化?外來胞吞物質(zhì)的消化細(xì)胞自身物質(zhì)的消化自體吞噬,
自噬物質(zhì)細(xì)胞外物質(zhì)的消化胞吞endocytosis吞噬(phagocytosis)*吞噬的大的固體顆粒物質(zhì),專職吞噬細(xì)胞特有吞飲(pinocytosis)*隨機(jī)胞吞的水溶性大分子,所有哺乳動(dòng)物細(xì)胞共有受體介導(dǎo)的胞吞作用(receptor-mediated
endocytosi*特異胞吞水溶性大分子,如某些信號(hào)分子、膽固醇、鐵離子/載鐵蛋白等。所有哺乳動(dòng)物細(xì)胞共有功能1.胞吞物質(zhì)的消化吞噬吞飲多泡體Multivesicularbody早期內(nèi)體晚期內(nèi)體Early
EndosomeLate
Endosome早期內(nèi)體膜內(nèi)陷形成內(nèi)部小泡,形成多泡體質(zhì)膜高爾基體溶酶體內(nèi)體(endosome)含內(nèi)吞的液體、顆粒內(nèi)體膜:膜蛋白溶酶體消化:
外來蛋白、膜蛋白多泡體形成:膜蛋白內(nèi)翻細(xì)胞外液體/質(zhì)膜2.自噬物質(zhì)的消化(1)自噬(Autophagy)*細(xì)胞內(nèi)一部分細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞器及其內(nèi)含物由雙
層膜
形成自噬小體。自噬小體與溶酶體融合,形成自噬溶酶體,內(nèi)容物被消化,這種現(xiàn)象為自噬。自噬的過程經(jīng)典自噬過程1.雙層膜包圍的胞質(zhì)物質(zhì)自噬小體溶酶體4.自噬溶酶體Autophogosome自噬小體Autolysosome自噬溶酶體*雙層膜,來源未知,可能為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)*雙層膜
可溶性細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)成分或細(xì)胞器(線粒體或過氧化物酶體等).*自噬小體與溶酶體或晚期內(nèi)體融合,內(nèi)層膜開始消化,內(nèi)容物開始消化。自噬功能意義生理狀態(tài):基礎(chǔ)水平的自噬清除衰老、損壞細(xì)胞器提供原料和能量用于細(xì)胞成分的更新病理狀態(tài):誘導(dǎo)性自噬增多或減少Impairment
or
activation
of
autophagy
contributesto
pathogenesis
of
diverse
diseases,
from
neuro-degenerative
disease
such
as
Parkinson
disease
toinflammatory
disorderssuch
as
Crohn
disease.氧化應(yīng)激Oxidative
stressMitochondriondamaged細(xì)胞命運(yùn)Cell
fate例1:損傷線粒體的降解細(xì)胞生存細(xì)胞例2:胞質(zhì)蛋白p62的降解P62廣泛存在于細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì),其累積不能降解被發(fā)現(xiàn)在許多疾病中,包括神經(jīng)退行AlzheimerDisease,腫瘤等。細(xì)胞穩(wěn)態(tài)(homeostasis)異常營(yíng)養(yǎng)缺乏-饑餓細(xì)胞,自噬明顯增多自噬小體自噬溶酶體內(nèi)質(zhì)網(wǎng)片段例3.營(yíng)養(yǎng)饑餓的小鼠胚胎成纖維細(xì)胞Yi
J,
et
al.
Functional
implication
of
autophagy
in
steroidsecreting
cells
of
the
rat.
The
Anatomical
Record,1995,242:137大鼠Leydig
細(xì)胞,制造X激素的細(xì)胞M:
MitochondrionL:
lysosomeMVB:
multivesicular
body(late
endosome)Autophagosome例4.Take-homemessages:自噬可以被誘導(dǎo)增多, 是否可以控制自噬量?How
can
we
manipulate
autophagy?Methods:
small
molecules,
genetic
methods
or
anything
else?自噬性細(xì)胞
? Autophagic
cell
death?*細(xì)胞內(nèi)一部分細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞器及其內(nèi)含物由雙層
膜
形成自噬小體。自噬小體與溶酶體融合,形成自噬溶酶體,內(nèi)容物被消化。生理和病理狀態(tài)下均可出現(xiàn)。自噬的意義:清除細(xì)胞內(nèi)某些細(xì)胞器及蛋白質(zhì);消化產(chǎn)物及節(jié)約的能量被重新利用.細(xì)胞更新(renovation)和細(xì)胞穩(wěn)態(tài)(homeostasis)Physiological
and
pathological
of
Autophagy自噬物質(zhì)的消化(2)
自噬內(nèi)
細(xì)胞,可以 激素并以
顆粒的形式保存在細(xì)胞質(zhì),接受外界信號(hào)時(shí)才
,多余的即形成 自噬泡。與溶酶體融合后,該激素被降解,氨基酸重新利用。胰島素 細(xì)胞自噬泡顆粒溶酶體的種類內(nèi)體2.吞飲1.吞噬3.自噬溶酶體4.
顆粒顆粒與溶酶體或晚期內(nèi)體融合自噬泡:殘余體常見溶酶體的類型(根據(jù)底物來源和消化程度)異噬溶酶體:吞噬小體與溶酶體或晚期內(nèi)體融合異體吞噬泡(heterophagic
vacuole)自噬溶酶體:自噬小體與溶酶體或晚期內(nèi)體融合自體吞噬泡(autophagic
vacuole)3.細(xì)胞外物質(zhì)的消化在破骨細(xì)胞溶酶體酶 ,消化有機(jī)骨質(zhì);在
細(xì)胞溶酶體酶 ,消化卵外膜濾泡細(xì)胞;溶酶體對(duì)細(xì)胞功能和活動(dòng)的貢獻(xiàn)Not
just
“Cellular
Garbage
Can”消除異物(吞噬細(xì)胞,吞噬物的降解)提供營(yíng)養(yǎng)(吞飲的大分子營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的降解)更新細(xì)胞成分(細(xì)胞器和蛋白質(zhì)的自噬)調(diào)節(jié)激素
(多余激素降解,
自噬)四.溶酶體與疾病硅肺、石棉肺、類風(fēng)濕等儲(chǔ)積病(lysosome
storage
disease,LSD)I-細(xì)胞病(Inclusion
cell
disease)1.溶酶體、吞噬與塵肺、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎等硅粉末、石棉、自身免疫病巨噬細(xì)胞吞噬溶酶體酶溶酶體膜破裂周圍細(xì)胞壞死成纖維細(xì)胞增生2.溶酶體儲(chǔ)積病缺乏某種溶酶體酶,導(dǎo)致底物大分子堆積。*遺傳??;*60多種;*致死性;*主要累積腦、內(nèi)臟、骨、軟骨http://w/healthcare.aspx肝脾腫大的Gaucher
disease兒童溶酶體儲(chǔ)積病與自噬、蛋白質(zhì)降解有關(guān)毒性、多余蛋白質(zhì)累積異常線粒體累積細(xì)胞Autophagy,2012,8:719病因LSD自噬異常M-6-P形成缺陷溶酶體酶分選3.溶酶體與I-細(xì)胞病
(Inclusion
cell
disease)N-乙酰氨基葡萄糖磷酸轉(zhuǎn)移酶缺乏溶酶體酶出現(xiàn)在血液,類似 性蛋白質(zhì)溶酶體中無酶底物堆積Q1:why?外來的、多余的、錯(cuò)誤的、不需要的短壽的、錯(cuò)誤折疊的、
應(yīng)激產(chǎn)生的“外來的”、長(zhǎng)壽的、多余的Q2:where,how?蛋白酶體溶酶體Two
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