PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)檢索PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)檢索一、PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館(NLM)下屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開(kāi)發(fā)的、基于WWW的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢系統(tǒng)。PubMed的網(wǎng)址：/pubmed特點(diǎn)：收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備，可少部分獲取原文。P75一、PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館二、通過(guò)PubMed可檢索

到如下的信息

MEDLINEPreMedline出版商提供的書(shū)目信息NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄二、通過(guò)PubMed可檢索

到如下的信息MEDLINEMEDLINE

MEDLINE：是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館MEDLARS系統(tǒng)中最大的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄1966年以來(lái)70多個(gè)國(guó)家近4300種生物醫(yī)學(xué)期刊的書(shū)目信息和著者文摘，每周更新。每條記錄均帶有[PubMed--IndexedforMEDLINE]標(biāo)志。MEDLINEMEDLINE：是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館MEDLPreMedline：收集未正式給予MeSH詞、出版類(lèi)型等深度標(biāo)引信息的一個(gè)臨時(shí)庫(kù)。NLM每天把最新記錄加入到PreMedline庫(kù)中，每條記錄均帶有[PubMed--inProcess]標(biāo)志。工作人員在一周內(nèi)將這些記錄標(biāo)引，然后轉(zhuǎn)入MEDLINE，同時(shí)從PreMedline中刪去。PreMedlinePreMedline：收集未正式給予MeSH詞、出版類(lèi)型等深Pre-MedlineMedlineNewDataCollectPubMedProcessPubMedPre-MedlineMedlineNewDataColl出版商提供的書(shū)目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分沒(méi)有被MEDLINE收錄，PubMed仍保存，在記錄中做[PubMed--assuppliedbypublisher]的標(biāo)記。出版商提供的書(shū)目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分圖1以下是幾條PubMed的記錄，標(biāo)記不同，其出自的分庫(kù)也不同圖1以下是幾條PubMed的記錄，標(biāo)記不同，其出自的分庫(kù)也不NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄：PubMed建立了與NCBI其他數(shù)據(jù)庫(kù)之間聯(lián)系。它們是雙向網(wǎng)絡(luò)互連的關(guān)系（見(jiàn)下頁(yè)圖）。其它庫(kù)NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄：PubMed建立了與NCBI其N(xiāo)CBI中通過(guò)Entrez可互查的數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI中通過(guò)Entrez可互查的數(shù)據(jù)庫(kù)三、PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)

登錄PubMed主頁(yè)/entrez/query.fcgi

/PubMed/三、PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)登錄PubMed主頁(yè)網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)

檢索提問(wèn)區(qū)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接、

檢索提問(wèn)框

、輔助檢索工具檢索提示區(qū)對(duì)各項(xiàng)檢索功能的簡(jiǎn)單描述輔助功能區(qū)Entrez簡(jiǎn)介、PubMed服務(wù)、特有檢索、相關(guān)資源PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)檢索提問(wèn)區(qū)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接、檢索提問(wèn)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)Nucleotide：DNA序列數(shù)據(jù)庫(kù)Protein：蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)Genome：基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)Structure：分子結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫(kù)Popset：種群、種系發(fā)生或突變序列數(shù)據(jù)庫(kù)Taxonomy：微生物類(lèi)別數(shù)據(jù)庫(kù)OMIM：人類(lèi)孟德?tīng)栠z傳學(xué)在線數(shù)據(jù)庫(kù)。NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)Nucleotide：DNA序列數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed輔助檢索工具Limits（限制功能）Preview/Index（預(yù)覽/索引）History（檢索史）Clipboard（剪貼板或文件夾）Details（明細(xì)欄）PubMed輔助檢索工具Limits（限制功能）JournalBrowser-雜志瀏覽器MeSHBrowser-主題詞瀏覽器CitationMatcher-在表格輸入刊物的引文信息來(lái)定位特定文章。ClinicalQueries-與臨床相關(guān)的療法，診斷，病因，預(yù)后Cubby-提供檢索策略存儲(chǔ)空間OrderDocuments-購(gòu)買(mǎi)原文Grateful

Med-連接到NLM提供的其他服務(wù)。ClinicalAlerts-公布NIH資助重要臨床研究結(jié)果ClinicalTrials-對(duì)公眾提供臨床科研的當(dāng)前信息PubMedCentral-可免費(fèi)提供全文生命科學(xué)文獻(xiàn)服務(wù)功能JournalBrowser-雜志瀏覽器服務(wù)功能四、PubMed的基本檢索功能詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配作者姓名檢索雜志名稱檢索截詞檢索短語(yǔ)檢索邏輯運(yùn)算符檢索四、PubMed的基本檢索功能詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配四、PubMed的基本檢索功能（一）詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配在檢索框中鍵入一到多個(gè)檢索詞，按“GO”鍵，即顯示檢索結(jié)果?！癱lear”按鈕可以幫你清除查詢框中的內(nèi)容，然后開(kāi)始一個(gè)新的查詢。四、PubMed的基本檢索功能（一）詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（一）自動(dòng)詞語(yǔ)匹配PubMed能自動(dòng)利用它的“自動(dòng)詞語(yǔ)匹配”功能將重要的詞語(yǔ)結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語(yǔ)轉(zhuǎn)換成規(guī)范的用詞。如：輸入vitaminccommoncold，系統(tǒng)會(huì)將自動(dòng)轉(zhuǎn)換成(“ascorbicacid”[MeSHTerms]ORvitaminc[TextWord])AND(“commoncold”[MeSHTerms]ORcommoncold[TextWord])進(jìn)行檢索。這種處理能使檢索結(jié)果更精確和全面。四、PubMed的基本檢索功能（一）自動(dòng)詞語(yǔ)匹配網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（二）作者姓名檢索在檢索框內(nèi)按照姓+名縮寫(xiě)(不用標(biāo)點(diǎn))的格式鍵入作者姓名，如Smithja，系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。如果想進(jìn)行更精確的檢索，可以用雙引號(hào)將作者名引起來(lái)，再加[au]，如“smithj”[au]四、PubMed的基本檢索功能（二）作者姓名檢索網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（三）雜志名檢索在檢索框中鍵入雜志全名molecularbiologyofthecell也可以直接鍵入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫(xiě)形式，如：molboilcell，鍵入刊物的ISSN(國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼）進(jìn)行檢索，如1059-1524。Celltransplantation[ta]四、PubMed的基本檢索功能（三）雜志名檢索網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（四）截詞檢索可利用系統(tǒng)的截詞功能獲取更多的相關(guān)文獻(xiàn)，這與Medline光盤(pán)中截詞檢索的用法是相同的：截詞符“*”可代表多個(gè)字符，將*加在檢索詞后可以表示對(duì)所有以該詞開(kāi)頭的詞進(jìn)行檢索；如：bacter*，可以檢出bacter,bacteria,bacterium,bacteriophage等詞。PubMed一次最多可以檢索出150個(gè)詞形變異詞。如staph*，可以產(chǎn)生150個(gè)起作用，可以采取加長(zhǎng)詞根的方法進(jìn)行檢索。四、PubMed的基本檢索功能（四）截詞檢索四、PubMed的基本檢索功能（五）短語(yǔ)檢索PubMed首先將鍵入的檢索詞（詞組）視為合理的短語(yǔ)在短語(yǔ)索引中進(jìn)行查找。如：poisonivy，PubMed將其視為詞組進(jìn)行查找。當(dāng)PubMed沒(méi)有找到該詞組時(shí)，系統(tǒng)將自動(dòng)把兩個(gè)詞分開(kāi)進(jìn)行檢索；如果不希望系統(tǒng)將兩詞分開(kāi)，則需要用“”把檢索詞括起來(lái)，即強(qiáng)迫PubMed進(jìn)行詞組檢索。如“singlecell”。當(dāng)用雙引號(hào)括起詞語(yǔ)時(shí)，PubMed將不執(zhí)行自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能。四、PubMed的基本檢索功能（五）短語(yǔ)檢索四、PubMed的基本檢索功能（六）邏輯運(yùn)算符檢索在檢索框中輸入邏輯運(yùn)算符，注意要大寫(xiě)，執(zhí)行順序從左向右，可用括號(hào)來(lái)改變此順序。如：lungcancerANDsmok*#1OR#2(#1OR#2)AND#3四、PubMed的基本檢索功能（六）邏輯運(yùn)算符檢索五、PubMed輔助檢索工具（一）1.Limits（限制功能）:對(duì)檢索詞的限定和修飾，包括字段、年齡、性別、研究對(duì)象、出版類(lèi)型、語(yǔ)種、出版或輸入日期以及子字段等。五、PubMed輔助檢索工具（一）1.Limits（限AllField（字段選擇）：共有23個(gè)字段可供選擇PublicationTypes（出版物類(lèi)型選擇）：有8種類(lèi)型Languages（語(yǔ)種選擇）：提供常用的7種語(yǔ)種Ages（年齡組選擇）：共有12個(gè)年齡段Gender（性別選擇）：男性、女性HumanorAnimal（人或動(dòng)物實(shí)驗(yàn)選擇）Subsets（子集）：8個(gè)子集Dates（日期）limitedAllField（字段選擇）：共有23個(gè)字段可供選擇lim五、PubMed輔助檢索工具（二）2.Preview/Index：Preview是對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行預(yù)覽，顯示檢索結(jié)果的條數(shù)和最近三次檢索式，用戶可根據(jù)具體情況在檢索提問(wèn)框中用邏輯運(yùn)算符組配新的檢索式。Index是對(duì)提交的檢索詞列出按字順排列的某一字段的索引詞表的位置和數(shù)量（括弧內(nèi)），可用流動(dòng)條來(lái)回進(jìn)行查看列表。選中的詞高亮顯示，然后選擇合適的邏輯運(yùn)算符進(jìn)行檢索。五、PubMed輔助檢索工具（二）2.Preview/Ipreview1檢索CommonColdANDVitaminCpreview1檢索CommonColdANDVi網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件3.History:

保留所有的檢索策略和結(jié)果，只有在執(zhí)行了一次檢索后，History才能有記錄。顯示檢索序號(hào)、檢索詞、檢索時(shí)間以及檢索結(jié)果數(shù)量?？稍跈z索序號(hào)之間添加邏輯運(yùn)算符進(jìn)行檢索，如#2AND#6單擊記錄條數(shù)超級(jí)鏈接可以重新顯示檢索結(jié)果。點(diǎn)擊ClearHistory按鍵可以清除History和Preiew/Index中的信息。最多存貯檢索式數(shù)為100個(gè)，檢索式的存貯時(shí)間為1小時(shí)。五、PubMed輔助檢索工具（三）3.History:五、PubMed輔助檢索工具（三）網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件五、PubMed輔助檢索工具（四）4.Clipboard：剪貼板或文件夾。用于用戶將檢索選中記錄的暫時(shí)保存，方便用戶集中打印、下載或索取原文。剪貼板中可存的最多記錄為500條，如果一小時(shí)內(nèi)無(wú)作何操作，記錄將自動(dòng)消失。

將文獻(xiàn)添加到Clipboard

在檢索結(jié)果界面點(diǎn)擊記錄左側(cè)的復(fù)選框，再點(diǎn)AddClip。被添加到Clipboard中的記錄，檢索記錄的數(shù)字將變成綠色。五、PubMed輔助檢索工具（四）4.Clipboard網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件五、PubMed輔助檢索工具（五）5.

Details：了解PubMed通過(guò)自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能、句法規(guī)則轉(zhuǎn)換出的實(shí)際檢索策略和調(diào)整、保存檢索策略。在檢索框下面，顯示出檢索結(jié)果的總數(shù)?？梢栽跈z索框中修改檢索策略，再點(diǎn)擊Search按鍵重新執(zhí)行檢索。點(diǎn)URL按鈕，檢索策略將顯示在URL框中，再用瀏覽器的書(shū)簽收藏功能保存該策略。五、PubMed輔助檢索工具（五）5.Details：了網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件六、特別檢索服務(wù)JournalBrowser：期刊瀏覽器MeSHBrowser：主題詞瀏覽器CitationMatcher：?jiǎn)纹?多篇引文匹配器

ClinicalQueries：臨床咨詢六、特別檢索服務(wù)JournalBrowser：期刊瀏覽器1.JournalBrowser：期刊瀏覽器

查找指定期刊上發(fā)表的文章?？煞謩e以期刊的全名或名稱某個(gè)詞、期刊名稱在MEDLINE的縮寫(xiě)或ISSN號(hào)來(lái)檢索；若點(diǎn)擊超鏈journalswithlinkstofull-textwebsites，可獲取與PubMed鏈接提供全文的期刊名單。1.JournalBrowser：期刊瀏覽器網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件2.MeSHBrowser：主題詞瀏覽器

幫助用戶查找MeSH詞進(jìn)行檢索，瀏覽器提供了每個(gè)主題詞的信息和層次結(jié)構(gòu)，此外，用戶可以直接選用副主題詞來(lái)限制主題詞的主要領(lǐng)域。如果輸入的詞在MeSH詞表中沒(méi)有，MeSH瀏覽器將顯示相關(guān)的MeSH詞。2.MeSHBrowser：主題詞瀏覽器幫網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件3.CitationMatcher

單篇/多篇引文匹配器

單篇引文匹配器可通過(guò)已知的刊名、日期、卷、期、論文首頁(yè)碼、作者名等任一項(xiàng)信息查找論文的題錄。經(jīng)常用于核對(duì)參考文獻(xiàn)的著錄細(xì)節(jié)。

多篇引文匹配器是給出版商用的，一般用戶不使用。3.CitationMatcher

單篇/多篇引文匹配器網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件4.ClinicalQueries臨床咨詢(一)為了幫助臨床醫(yī)生更有效地獲取PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中一般疾病的病因?qū)W、預(yù)后、診斷、預(yù)防以及治療等方面的信息，PubMed系統(tǒng)設(shè)置了Clinicalqueries功能項(xiàng)。該項(xiàng)具備特殊的過(guò)濾器裝置能將上述主題文獻(xiàn)集中提供檢索，這樣可以濾除部分不相關(guān)或相關(guān)性差的文獻(xiàn)。

4.ClinicalQueries臨床咨詢(一)4.ClinicalQueries臨床咨詢（二）

治療（therapy)研究范疇診斷(diagnosis)

(Category)病因(etiology)預(yù)后(prognosis)強(qiáng)調(diào)程度靈敏度Sensitivity(Emphasis)專(zhuān)指度Specificity4.ClinicalQueries臨床咨詢（二）網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件七、檢索結(jié)果的處理（一）顯示檢索結(jié)果(Display)：PubMed可用6種不同的格式顯示檢索結(jié)果，默認(rèn)Summary格式。可通過(guò)Display下拉菜單選擇其它顯示方式：Brief，Abstract，Citation，MEDLINEandASN.1等，可以根據(jù)需要進(jìn)行選擇。點(diǎn)擊Text鍵，系統(tǒng)顯示記錄的純文本形式。

點(diǎn)擊Show鍵，可選擇每頁(yè)顯示的記錄條數(shù)。

點(diǎn)擊SelectPage的數(shù)字，顯示相應(yīng)Web頁(yè)的記錄

點(diǎn)擊Sort鍵，可以分類(lèi)顯示。七、檢索結(jié)果的處理（一）顯示檢索結(jié)果(Display)：DisplayDisplaytexttexttext1text1showshowpagepagesoresore各種顯示方式的主要內(nèi)容Summary——作者姓名、文章題目、出處、記錄狀態(tài)、語(yǔ)種、出版物類(lèi)型、PMID。Brief——作者姓名、文章題目的前30個(gè)字母、PMIDAbstract——出處、記錄狀態(tài)、文章題目、作者姓名、作者單位、文摘、出版物類(lèi)型、縮寫(xiě)、注釋、PMID等。Citation——出處、記錄狀態(tài)、文章題目、作者姓名、作者單位、文摘、出版物類(lèi)型、縮寫(xiě)、注釋、MeSH、化學(xué)物質(zhì)名稱、SI數(shù)據(jù)庫(kù)索取號(hào)、基金號(hào)、PMID等。MEDLINE——所有記錄字段都是以兩個(gè)字目格式顯示，應(yīng)用該格式保存套錄記錄可以用文獻(xiàn)管理者軟件保存。各種顯示方式的主要內(nèi)容Summary——作者姓名、文章題目、七、檢索結(jié)果的處理（二）保存(Save)瀏覽器提供的保存功能可保存當(dāng)前屏幕上的結(jié)果；點(diǎn)擊senttofile，可以保存所有的檢索結(jié)果或選擇保存；系統(tǒng)允許以不同的顯示格式保存檢索結(jié)果；最多一次可以保存10000條。可以保存Clipboard中的記錄，Clipboard中最多可有500條記錄。存盤(pán)時(shí)PubMed默認(rèn)文件名為“query.fcgi”。該文件名可以修改，文件格式也可在“.fcgi”和“.txt”中選擇。七、檢索結(jié)果的處理（二）保存(Save)save直接全部存在本地盤(pán)save直接全部存在本地盤(pán)save1save1save2save2七、檢索結(jié)果的處理（三）打印(Print)可以利用瀏覽器的打印鍵進(jìn)行屏幕上內(nèi)容的打印。如果要選擇打印，可以先將所選的文獻(xiàn)添加到Clipboard，然后再打印。七、檢索結(jié)果的處理（三）打印(Print)七、檢索結(jié)果的處理（四）鏈接(Links)鏈接相關(guān)文獻(xiàn)(RelatedArticlesLinks)PubMed系統(tǒng)中的每條文獻(xiàn)記錄均有一個(gè)相關(guān)文獻(xiàn)鏈接，在檢索結(jié)果的顯示狀態(tài)下，每條記錄的右邊均有“RelatedArticles”超鏈接。點(diǎn)擊該鏈接，系統(tǒng)按文獻(xiàn)的相關(guān)度從高到低顯示相關(guān)文獻(xiàn)。鏈接NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)Protein數(shù)據(jù)庫(kù)、Nucleutide數(shù)據(jù)庫(kù)、PopSet數(shù)據(jù)庫(kù)、分子三維結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫(kù)（MMDB）、Genome數(shù)據(jù)庫(kù)。七、檢索結(jié)果的處理（四）鏈接(Links)網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件七、檢索結(jié)果的處理（四）鏈接(Links)之二鏈接外部資源——LinkOutLinkOut是鏈接到本站點(diǎn)外部信息的出口。可以與出版商、信息集成者、圖書(shū)館、生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、序列中心等鏈接來(lái)獲取更多的相關(guān)信息。鏈接帶星號(hào)的LinkOut是表明提供者需要訂閱、會(huì)員資格或需要交費(fèi)進(jìn)入。

鏈接相關(guān)圖書(shū)——Books為幫助用戶解決對(duì)檢索結(jié)果中不熟悉的要領(lǐng)提供背景資料七、檢索結(jié)果的處理（四）鏈接(Links)之二網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件八、PubMed與MEDLINE光盤(pán)檢索比較

PubMedMEDLINE收錄范圍√數(shù)據(jù)更新√檢索的規(guī)范性√提供相關(guān)鏈接√速度及費(fèi)用√八、PubMed與MEDLINE光盤(pán)檢索比較PubMedM實(shí)習(xí)近十年維生素C在普通感冒中的作用的文獻(xiàn)（帶有文摘）VitaminCCommoncold登錄PubMed實(shí)習(xí)近十年維生素C在普通感冒中的作用的文獻(xiàn)（帶有文摘PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)檢索PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)檢索一、PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館(NLM)下屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開(kāi)發(fā)的、基于WWW的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢系統(tǒng)。PubMed的網(wǎng)址：/pubmed特點(diǎn)：收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備，可少部分獲取原文。P75一、PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館二、通過(guò)PubMed可檢索

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MEDLINEPreMedline出版商提供的書(shū)目信息NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄二、通過(guò)PubMed可檢索

到如下的信息MEDLINEMEDLINE

MEDLINE：是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館MEDLARS系統(tǒng)中最大的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄1966年以來(lái)70多個(gè)國(guó)家近4300種生物醫(yī)學(xué)期刊的書(shū)目信息和著者文摘，每周更新。每條記錄均帶有[PubMed--IndexedforMEDLINE]標(biāo)志。MEDLINEMEDLINE：是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館MEDLPreMedline：收集未正式給予MeSH詞、出版類(lèi)型等深度標(biāo)引信息的一個(gè)臨時(shí)庫(kù)。NLM每天把最新記錄加入到PreMedline庫(kù)中，每條記錄均帶有[PubMed--inProcess]標(biāo)志。工作人員在一周內(nèi)將這些記錄標(biāo)引，然后轉(zhuǎn)入MEDLINE，同時(shí)從PreMedline中刪去。PreMedlinePreMedline：收集未正式給予MeSH詞、出版類(lèi)型等深Pre-MedlineMedlineNewDataCollectPubMedProcessPubMedPre-MedlineMedlineNewDataColl出版商提供的書(shū)目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分沒(méi)有被MEDLINE收錄，PubMed仍保存，在記錄中做[PubMed--assuppliedbypublisher]的標(biāo)記。出版商提供的書(shū)目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分圖1以下是幾條PubMed的記錄，標(biāo)記不同，其出自的分庫(kù)也不同圖1以下是幾條PubMed的記錄，標(biāo)記不同，其出自的分庫(kù)也不NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄：PubMed建立了與NCBI其他數(shù)據(jù)庫(kù)之間聯(lián)系。它們是雙向網(wǎng)絡(luò)互連的關(guān)系（見(jiàn)下頁(yè)圖）。其它庫(kù)NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄：PubMed建立了與NCBI其N(xiāo)CBI中通過(guò)Entrez可互查的數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI中通過(guò)Entrez可互查的數(shù)據(jù)庫(kù)三、PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)

登錄PubMed主頁(yè)/entrez/query.fcgi

/PubMed/三、PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)登錄PubMed主頁(yè)網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)

檢索提問(wèn)區(qū)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接、

檢索提問(wèn)框

、輔助檢索工具檢索提示區(qū)對(duì)各項(xiàng)檢索功能的簡(jiǎn)單描述輔助功能區(qū)Entrez簡(jiǎn)介、PubMed服務(wù)、特有檢索、相關(guān)資源PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu)檢索提問(wèn)區(qū)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接、檢索提問(wèn)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)Nucleotide：DNA序列數(shù)據(jù)庫(kù)Protein：蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)Genome：基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)Structure：分子結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫(kù)Popset：種群、種系發(fā)生或突變序列數(shù)據(jù)庫(kù)Taxonomy：微生物類(lèi)別數(shù)據(jù)庫(kù)OMIM：人類(lèi)孟德?tīng)栠z傳學(xué)在線數(shù)據(jù)庫(kù)。NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)Nucleotide：DNA序列數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed輔助檢索工具Limits（限制功能）Preview/Index（預(yù)覽/索引）History（檢索史）Clipboard（剪貼板或文件夾）Details（明細(xì)欄）PubMed輔助檢索工具Limits（限制功能）JournalBrowser-雜志瀏覽器MeSHBrowser-主題詞瀏覽器CitationMatcher-在表格輸入刊物的引文信息來(lái)定位特定文章。ClinicalQueries-與臨床相關(guān)的療法，診斷，病因，預(yù)后Cubby-提供檢索策略存儲(chǔ)空間OrderDocuments-購(gòu)買(mǎi)原文Grateful

Med-連接到NLM提供的其他服務(wù)。ClinicalAlerts-公布NIH資助重要臨床研究結(jié)果ClinicalTrials-對(duì)公眾提供臨床科研的當(dāng)前信息PubMedCentral-可免費(fèi)提供全文生命科學(xué)文獻(xiàn)服務(wù)功能JournalBrowser-雜志瀏覽器服務(wù)功能四、PubMed的基本檢索功能詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配作者姓名檢索雜志名稱檢索截詞檢索短語(yǔ)檢索邏輯運(yùn)算符檢索四、PubMed的基本檢索功能詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配四、PubMed的基本檢索功能（一）詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配在檢索框中鍵入一到多個(gè)檢索詞，按“GO”鍵，即顯示檢索結(jié)果?！癱lear”按鈕可以幫你清除查詢框中的內(nèi)容，然后開(kāi)始一個(gè)新的查詢。四、PubMed的基本檢索功能（一）詞語(yǔ)檢索及自動(dòng)詞語(yǔ)匹配網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（一）自動(dòng)詞語(yǔ)匹配PubMed能自動(dòng)利用它的“自動(dòng)詞語(yǔ)匹配”功能將重要的詞語(yǔ)結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語(yǔ)轉(zhuǎn)換成規(guī)范的用詞。如：輸入vitaminccommoncold，系統(tǒng)會(huì)將自動(dòng)轉(zhuǎn)換成(“ascorbicacid”[MeSHTerms]ORvitaminc[TextWord])AND(“commoncold”[MeSHTerms]ORcommoncold[TextWord])進(jìn)行檢索。這種處理能使檢索結(jié)果更精確和全面。四、PubMed的基本檢索功能（一）自動(dòng)詞語(yǔ)匹配網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（二）作者姓名檢索在檢索框內(nèi)按照姓+名縮寫(xiě)(不用標(biāo)點(diǎn))的格式鍵入作者姓名，如Smithja，系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。如果想進(jìn)行更精確的檢索，可以用雙引號(hào)將作者名引起來(lái)，再加[au]，如“smithj”[au]四、PubMed的基本檢索功能（二）作者姓名檢索網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（三）雜志名檢索在檢索框中鍵入雜志全名molecularbiologyofthecell也可以直接鍵入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫(xiě)形式，如：molboilcell，鍵入刊物的ISSN(國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼）進(jìn)行檢索，如1059-1524。Celltransplantation[ta]四、PubMed的基本檢索功能（三）雜志名檢索網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件四、PubMed的基本檢索功能（四）截詞檢索可利用系統(tǒng)的截詞功能獲取更多的相關(guān)文獻(xiàn)，這與Medline光盤(pán)中截詞檢索的用法是相同的：截詞符“*”可代表多個(gè)字符，將*加在檢索詞后可以表示對(duì)所有以該詞開(kāi)頭的詞進(jìn)行檢索；如：bacter*，可以檢出bacter,bacteria,bacterium,bacteriophage等詞。PubMed一次最多可以檢索出150個(gè)詞形變異詞。如staph*，可以產(chǎn)生150個(gè)起作用，可以采取加長(zhǎng)詞根的方法進(jìn)行檢索。四、PubMed的基本檢索功能（四）截詞檢索四、PubMed的基本檢索功能（五）短語(yǔ)檢索PubMed首先將鍵入的檢索詞（詞組）視為合理的短語(yǔ)在短語(yǔ)索引中進(jìn)行查找。如：poisonivy，PubMed將其視為詞組進(jìn)行查找。當(dāng)PubMed沒(méi)有找到該詞組時(shí)，系統(tǒng)將自動(dòng)把兩個(gè)詞分開(kāi)進(jìn)行檢索；如果不希望系統(tǒng)將兩詞分開(kāi)，則需要用“”把檢索詞括起來(lái)，即強(qiáng)迫PubMed進(jìn)行詞組檢索。如“singlecell”。當(dāng)用雙引號(hào)括起詞語(yǔ)時(shí)，PubMed將不執(zhí)行自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能。四、PubMed的基本檢索功能（五）短語(yǔ)檢索四、PubMed的基本檢索功能（六）邏輯運(yùn)算符檢索在檢索框中輸入邏輯運(yùn)算符，注意要大寫(xiě)，執(zhí)行順序從左向右，可用括號(hào)來(lái)改變此順序。如：lungcancerANDsmok*#1OR#2(#1OR#2)AND#3四、PubMed的基本檢索功能（六）邏輯運(yùn)算符檢索五、PubMed輔助檢索工具（一）1.Limits（限制功能）:對(duì)檢索詞的限定和修飾，包括字段、年齡、性別、研究對(duì)象、出版類(lèi)型、語(yǔ)種、出版或輸入日期以及子字段等。五、PubMed輔助檢索工具（一）1.Limits（限AllField（字段選擇）：共有23個(gè)字段可供選擇PublicationTypes（出版物類(lèi)型選擇）：有8種類(lèi)型Languages（語(yǔ)種選擇）：提供常用的7種語(yǔ)種Ages（年齡組選擇）：共有12個(gè)年齡段Gender（性別選擇）：男性、女性HumanorAnimal（人或動(dòng)物實(shí)驗(yàn)選擇）Subsets（子集）：8個(gè)子集Dates（日期）limitedAllField（字段選擇）：共有23個(gè)字段可供選擇lim五、PubMed輔助檢索工具（二）2.Preview/Index：Preview是對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行預(yù)覽，顯示檢索結(jié)果的條數(shù)和最近三次檢索式，用戶可根據(jù)具體情況在檢索提問(wèn)框中用邏輯運(yùn)算符組配新的檢索式。Index是對(duì)提交的檢索詞列出按字順排列的某一字段的索引詞表的位置和數(shù)量（括弧內(nèi)），可用流動(dòng)條來(lái)回進(jìn)行查看列表。選中的詞高亮顯示，然后選擇合適的邏輯運(yùn)算符進(jìn)行檢索。五、PubMed輔助檢索工具（二）2.Preview/Ipreview1檢索CommonColdANDVitaminCpreview1檢索CommonColdANDVi網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件3.History:

保留所有的檢索策略和結(jié)果，只有在執(zhí)行了一次檢索后，History才能有記錄。顯示檢索序號(hào)、檢索詞、檢索時(shí)間以及檢索結(jié)果數(shù)量?？稍跈z索序號(hào)之間添加邏輯運(yùn)算符進(jìn)行檢索，如#2AND#6單擊記錄條數(shù)超級(jí)鏈接可以重新顯示檢索結(jié)果。點(diǎn)擊ClearHistory按鍵可以清除History和Preiew/Index中的信息。最多存貯檢索式數(shù)為100個(gè)，檢索式的存貯時(shí)間為1小時(shí)。五、PubMed輔助檢索工具（三）3.History:五、PubMed輔助檢索工具（三）網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件五、PubMed輔助檢索工具（四）4.Clipboard：剪貼板或文件夾。用于用戶將檢索選中記錄的暫時(shí)保存，方便用戶集中打印、下載或索取原文。剪貼板中可存的最多記錄為500條，如果一小時(shí)內(nèi)無(wú)作何操作，記錄將自動(dòng)消失。

將文獻(xiàn)添加到Clipboard

在檢索結(jié)果界面點(diǎn)擊記錄左側(cè)的復(fù)選框，再點(diǎn)AddClip。被添加到Clipboard中的記錄，檢索記錄的數(shù)字將變成綠色。五、PubMed輔助檢索工具（四）4.Clipboard網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件五、PubMed輔助檢索工具（五）5.

Details：了解PubMed通過(guò)自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能、句法規(guī)則轉(zhuǎn)換出的實(shí)際檢索策略和調(diào)整、保存檢索策略。在檢索框下面，顯示出檢索結(jié)果的總數(shù)?？梢栽跈z索框中修改檢索策略，再點(diǎn)擊Search按鍵重新執(zhí)行檢索。點(diǎn)URL按鈕，檢索策略將顯示在URL框中，再用瀏覽器的書(shū)簽收藏功能保存該策略。五、PubMed輔助檢索工具（五）5.Details：了網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件六、特別檢索服務(wù)JournalBrowser：期刊瀏覽器MeSHBrowser：主題詞瀏覽器CitationMatcher：?jiǎn)纹?多篇引文匹配器

ClinicalQueries：臨床咨詢六、特別檢索服務(wù)JournalBrowser：期刊瀏覽器1.JournalBrowser：期刊瀏覽器

查找指定期刊上發(fā)表的文章?？煞謩e以期刊的全名或名稱某個(gè)詞、期刊名稱在MEDLINE的縮寫(xiě)或ISSN號(hào)來(lái)檢索；若點(diǎn)擊超鏈journalswithlinkstofull-textwebsites，可獲取與PubMed鏈接提供全文的期刊名單。1.JournalBrowser：期刊瀏覽器網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件2.MeSHBrowser：主題詞瀏覽器

幫助用戶查找MeSH詞進(jìn)行檢索，瀏覽器提供了每個(gè)主題詞的信息和層次結(jié)構(gòu)，此外，用戶可以直接選用副主題詞來(lái)限制主題詞的主要領(lǐng)域。如果輸入的詞在MeSH詞表中沒(méi)有，MeSH瀏覽器將顯示相關(guān)的MeSH詞。2.MeSHBrowser：主題詞瀏覽器幫網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件3.CitationMatcher

單篇/多篇引文匹配器

單篇引文匹配器可通過(guò)已知的刊名、日期、卷、期、論文首頁(yè)碼、作者名等任一項(xiàng)信息查找論文的題錄。經(jīng)常用于核對(duì)參考文獻(xiàn)的著錄細(xì)節(jié)。

多篇引文匹配器是給出版商用的，一般用戶不使用。3.CitationMatcher

單篇/多篇引文匹配器網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件4.ClinicalQueries臨床咨詢(一)為了幫助臨床醫(yī)生更有效地獲取PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中一般疾病的病因?qū)W、預(yù)后、診斷、預(yù)防以及治療等方面的信息，PubMed系統(tǒng)設(shè)置了Clinicalqueries功能項(xiàng)。該項(xiàng)具備特殊的過(guò)濾器裝置能將上述主題文獻(xiàn)集中提供檢索，這樣可以濾除部分不相關(guān)或相關(guān)性差的文獻(xiàn)。

4.ClinicalQueries臨床咨詢(一)4.ClinicalQueries臨床咨詢（二）

治療（therapy)研究范疇診斷(diagnosis)

(Category)病因(etiology)預(yù)后(prognosis)強(qiáng)調(diào)程度靈敏度Sensitivity(Emphasis)專(zhuān)指度Specificity4.ClinicalQueries臨床咨詢（二）網(wǎng)上醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)課件七、檢索結(jié)果的處理（一）顯示檢索結(jié)果(Display)：PubMed可用6種不同的格式顯示檢索結(jié)果，默認(rèn)Summary格式?？赏ㄟ^(guò)Display下拉菜單選擇其它顯示方式：Brief，Abstract，Citation，MEDLINEandASN.1等，可以根據(jù)需要進(jìn)行選擇。點(diǎn)擊Text鍵，系統(tǒng)顯示記錄的純文本形式。

點(diǎn)擊Show鍵，可選擇每頁(yè)顯示的記錄條數(shù)。

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